53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_1618 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007969  Pcryo_1618  phage transcriptional regulator, AlpA  100 
 
 		 83 aa  172  9.999999999999999e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.939169  normal  0.0191928 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0868  prophage regulatory protein AlpA  73.49 
 
 		 93 aa  130  5e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0624005  normal  0.678014 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2358  phage transcriptional regulator, AlpA  49.23 
 
 		 86 aa  74.3  0.0000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0201012  normal  0.0278403 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17020  Prophage CP4-57 regulatory , AlpA-like protein  38.75 
 
 		 77 aa  56.2  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1051  phage transcriptional regulator, AlpA  40.98 
 
 		 70 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.698345  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1765  phage transcriptional regulator, AlpA  39.66 
 
 		 70 aa  53.5  0.0000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.993884  normal  0.447996 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0384  phage transcriptional regulator, AlpA  46.88 
 
 		 65 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000580996 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2822  transcriptional regulator  40.62 
 
 		 98 aa  52.4  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.15617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3522  phage transcriptional regulator, AlpA  44.62 
 
 		 65 aa  52.4  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3275  phage transcriptional regulator, AlpA  42.86 
 
 		 86 aa  51.6  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1777  phage transcriptional regulator, AlpA  43.08 
 
 		 73 aa  52  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.235945 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0716  phage transcriptional regulator, AlpA  42.86 
 
 		 86 aa  50.4  0.000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1689  phage transcriptional regulator, AlpA  43.64 
 
 		 71 aa  50.4  0.000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.211878  hitchhiker  0.00954058 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1260  phage transcriptional regulator, AlpA  43.75 
 
 		 67 aa  50.1  0.000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1496  phage transcriptional regulator, AlpA  42.86 
 
 		 64 aa  49.7  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0316  phage DNA binding protein  35.29 
 
 		 86 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.370656 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1687  phage transcriptional regulator, AlpA  42.86 
 
 		 64 aa  48.5  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0381  phage transcriptional regulator, AlpA  44.44 
 
 		 66 aa  48.1  0.00005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000563179 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0962  putative bacteriophage DNA-binding transcription regulator protein  41.27 
 
 		 88 aa  47.4  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.907406 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4755  phage transcriptional regulator, AlpA  37.5 
 
 		 60 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1258  phage transcriptional regulator, AlpA  36.92 
 
 		 61 aa  47  0.00008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.496683 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4842  phage transcriptional regulator, AlpA  35.29 
 
 		 86 aa  47  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.257562 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1406  putative transcriptional regulator  38.1 
 
 		 76 aa  46.6  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1382  transcriptional regulator  40 
 
 		 68 aa  46.2  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2950  hypothetical protein  34.38 
 
 		 103 aa  46.2  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.058037  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3698  prophage CP4-57 regulatory protein (AlpA)  38.98 
 
 		 70 aa  45.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3429  DNA-binding protein, putative  39.34 
 
 		 80 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000259221  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0653  phage transcriptional regulator, AlpA  38.24 
 
 		 75 aa  44.3  0.0006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0437376  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0152  phage transcriptional regulator, AlpA  35.48 
 
 		 380 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.221406  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3106  phage transcriptional regulator, AlpA  38.1 
 
 		 88 aa  43.5  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.19989 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1700  phage transcriptional regulator, AlpA  44.64 
 
 		 64 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.843747  normal  0.0591517 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1598  phage transcriptional regulator, AlpA  35.82 
 
 		 79 aa  43.5  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0771353  normal  0.422154 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2960  phage DNA binding protein  37.5 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.630956  hitchhiker  0.00000157452 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1159  phage transcriptional regulator, AlpA  34.92 
 
 		 62 aa  42.7  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0925485  normal  0.345427 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3120  phage transcriptional regulator, AlpA  36.51 
 
 		 86 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1156  phage transcriptional regulator, AlpA  33.87 
 
 		 71 aa  42  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3427  phage transcriptional regulator, AlpA  34.38 
 
 		 70 aa  41.6  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3709  phage transcriptional regulator, AlpA  39.68 
 
 		 67 aa  42  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2362  phage transcriptional regulator, AlpA  39.68 
 
 		 76 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.566785 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3697  phage transcriptional regulator, AlpA  39.68 
 
 		 67 aa  42  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0664555  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3550  phage transcriptional regulator, AlpA  39.68 
 
 		 67 aa  42  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1058  phage transcriptional regulator, AlpA  34.92 
 
 		 88 aa  41.6  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4006  AlpA family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 88 aa  41.6  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04065  phage transcriptional regulator, AlpA  33.9 
 
 		 80 aa  41.2  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2784  phage transcriptional regulator, AlpA  32.31 
 
 		 66 aa  41.2  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.834885  normal  0.857348 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3413  phage transcriptional regulator, AlpA  41.07 
 
 		 71 aa  41.2  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00533865 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0048  phage transcriptional regulator, AlpA  34.92 
 
 		 88 aa  41.2  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2677  transcriptional regulator  34.43 
 
 		 70 aa  40.8  0.006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1935  phage transcriptional regulator, AlpA  33.33 
 
 		 75 aa  40.8  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0932  phage transcriptional regulator, AlpA  34.18 
 
 		 76 aa  40.4  0.008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.412381  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0412  Phage transcriptional regulator, AlpA  34.43 
 
 		 75 aa  40.4  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.338686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0340  phage transcriptional regulator, AlpA  32.31 
 
 		 75 aa  40.4  0.009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0683  phage transcriptional regulator, AlpA  34.92 
 
 		 69 aa  40.4  0.009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>