47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_17020 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_17020  Prophage CP4-57 regulatory , AlpA-like protein  100 
 
 		 77 aa  158  3e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1777  phage transcriptional regulator, AlpA  47.06 
 
 		 73 aa  58.9  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.235945 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0384  phage transcriptional regulator, AlpA  49.23 
 
 		 65 aa  58.5  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000580996 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3522  phage transcriptional regulator, AlpA  48.48 
 
 		 65 aa  57.8  0.00000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1618  phage transcriptional regulator, AlpA  38.75 
 
 		 83 aa  56.2  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.939169  normal  0.0191928 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1159  phage transcriptional regulator, AlpA  41.27 
 
 		 62 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0925485  normal  0.345427 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1598  phage transcriptional regulator, AlpA  44.44 
 
 		 79 aa  55.5  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0771353  normal  0.422154 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1260  phage transcriptional regulator, AlpA  46.15 
 
 		 67 aa  54.3  0.0000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0868  prophage regulatory protein AlpA  38.16 
 
 		 93 aa  52.4  0.000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0624005  normal  0.678014 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4755  phage transcriptional regulator, AlpA  40.62 
 
 		 60 aa  50.8  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0381  phage transcriptional regulator, AlpA  40 
 
 		 66 aa  47.4  0.00007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000563179 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0668  hypothetical protein  39.34 
 
 		 65 aa  46.2  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.778257  hitchhiker  0.000000528136 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1406  putative transcriptional regulator  43.75 
 
 		 76 aa  46.6  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1382  transcriptional regulator  36.49 
 
 		 68 aa  46.6  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0962  putative bacteriophage DNA-binding transcription regulator protein  40.62 
 
 		 88 aa  45.8  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.907406 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4842  phage transcriptional regulator, AlpA  41.94 
 
 		 86 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.257562 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1496  phage transcriptional regulator, AlpA  40.32 
 
 		 64 aa  45.1  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0316  phage DNA binding protein  40.32 
 
 		 86 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.370656 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2907  hypothetical protein  43.28 
 
 		 69 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00184004 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1156  phage transcriptional regulator, AlpA  37.7 
 
 		 71 aa  44.7  0.0004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0893  AlpA family protein  36.92 
 
 		 66 aa  44.7  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3863  AlpA family protein  36.92 
 
 		 66 aa  44.7  0.0005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0520497  hitchhiker  0.0087856 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0948  phage transcriptional regulator, AlpA  36.92 
 
 		 66 aa  44.7  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0412  Phage transcriptional regulator, AlpA  37.5 
 
 		 75 aa  44.3  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.338686  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1765  phage transcriptional regulator, AlpA  36.92 
 
 		 70 aa  43.9  0.0007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.993884  normal  0.447996 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3698  prophage CP4-57 regulatory protein (AlpA)  41.38 
 
 		 70 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3709  phage transcriptional regulator, AlpA  43.75 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1363  AlpA family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 66 aa  43.1  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.129507  hitchhiker  0.00109178 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1700  phage transcriptional regulator, AlpA  42.11 
 
 		 64 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.843747  normal  0.0591517 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2372  prophage CP4-57 regulatory  35.94 
 
 		 67 aa  43.5  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.296006  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3697  phage transcriptional regulator, AlpA  43.75 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0664555  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3550  phage transcriptional regulator, AlpA  43.75 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0716  phage transcriptional regulator, AlpA  39.68 
 
 		 86 aa  42.7  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1687  phage transcriptional regulator, AlpA  37.1 
 
 		 64 aa  42.7  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02082  phage transcriptional regulator, AlpA  34.38 
 
 		 70 aa  42.4  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.376453  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1258  phage transcriptional regulator, AlpA  34.85 
 
 		 61 aa  42.4  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.496683 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2950  hypothetical protein  33.87 
 
 		 103 aa  42.7  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.058037  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2960  phage DNA binding protein  38.71 
 
 		 88 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.630956  hitchhiker  0.00000157452 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3413  phage transcriptional regulator, AlpA  45.45 
 
 		 71 aa  42  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00533865 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3106  phage transcriptional regulator, AlpA  37.1 
 
 		 88 aa  41.6  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.19989 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2904  phage transcriptional regulator, AlpA  42.62 
 
 		 68 aa  42  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.438187 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2358  phage transcriptional regulator, AlpA  35.82 
 
 		 86 aa  41.6  0.003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0201012  normal  0.0278403 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3196  AlpA family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 78 aa  41.2  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2796  phage transcriptional regulator, AlpA  31.03 
 
 		 109 aa  40.4  0.008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3275  phage transcriptional regulator, AlpA  39.68 
 
 		 86 aa  40.4  0.008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2916  hypothetical protein  36.07 
 
 		 71 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0151072 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1511  phage transcriptional regulator, AlpA  31.82 
 
 		 81 aa  40  0.01  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>