31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_0152 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008542  Bcen2424_0152  phage transcriptional regulator, AlpA  100 
 
 		 380 aa  778    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.221406  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1765  phage transcriptional regulator, AlpA  44.26 
 
 		 70 aa  54.7  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.993884  normal  0.447996 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2822  transcriptional regulator  39.47 
 
 		 98 aa  50.1  0.00007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.15617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2277  prophage CP4-57 regulatory  39.71 
 
 		 71 aa  50.1  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.19411 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2358  phage transcriptional regulator, AlpA  33.33 
 
 		 86 aa  49.7  0.00009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0201012  normal  0.0278403 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2950  hypothetical protein  41.18 
 
 		 103 aa  48.5  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.058037  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1689  phage transcriptional regulator, AlpA  40 
 
 		 71 aa  48.1  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.211878  hitchhiker  0.00954058 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1424  phage transcriptional regulator, AlpA  38.81 
 
 		 61 aa  48.1  0.0003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.435044  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1777  phage transcriptional regulator, AlpA  37.88 
 
 		 73 aa  47  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.235945 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6373  phage transcriptional regulator, AlpA  37.31 
 
 		 71 aa  47  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0267057  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0384  phage transcriptional regulator, AlpA  40.91 
 
 		 65 aa  46.6  0.0007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000580996 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0993  phage transcriptional regulator, AlpA  38.24 
 
 		 68 aa  46.6  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.000350598  decreased coverage  0.00000494305 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3522  phage transcriptional regulator, AlpA  39.39 
 
 		 65 aa  46.2  0.0008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004310  phage transcriptional regulator AlpA  40 
 
 		 66 aa  45.8  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.207831  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0434  putative prophage CP4-57 regulatory protein  38.81 
 
 		 72 aa  45.4  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0988805  normal  0.918772 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1051  phage transcriptional regulator, AlpA  34.29 
 
 		 70 aa  45.8  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.698345  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0150  phage transcriptional regulator, AlpA  36.76 
 
 		 71 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4521  phage transcriptional regulator, AlpA  38.24 
 
 		 71 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.243833 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2372  prophage CP4-57 regulatory  40 
 
 		 67 aa  44.7  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.296006  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0443  phage transcriptional regulator, AlpA  40 
 
 		 66 aa  44.3  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.614779 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1260  phage transcriptional regulator, AlpA  37.88 
 
 		 67 aa  44.3  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3216  phage transcriptional regulator, AlpA  40 
 
 		 68 aa  44.3  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1618  phage transcriptional regulator, AlpA  35.48 
 
 		 83 aa  44.3  0.004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.939169  normal  0.0191928 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0102  phage transcriptional regulator, AlpA  35.29 
 
 		 71 aa  43.9  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.11769 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1598  phage transcriptional regulator, AlpA  32.39 
 
 		 79 aa  43.5  0.006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0771353  normal  0.422154 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0273  phage transcriptional regulator, AlpA  36.76 
 
 		 71 aa  43.1  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.334205  normal  0.0643219 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2652  phage transcriptional regulator, AlpA  36.76 
 
 		 71 aa  43.1  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1143  phage transcriptional regulator, AlpA  33.33 
 
 		 68 aa  43.1  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.21173  hitchhiker  0.0000168687 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2390  prophage CP4-57 regulatory protein (AlpA)  32.84 
 
 		 78 aa  42.7  0.009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.179728  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1700  phage transcriptional regulator, AlpA  36.07 
 
 		 64 aa  43.1  0.009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.843747  normal  0.0591517 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1687  phage transcriptional regulator, AlpA  38.57 
 
 		 64 aa  43.1  0.009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>