27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_2902 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_2902  phage transcriptional regulator, AlpA  100 
 
 		 69 aa  141  2e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3781  hypothetical protein  73.53 
 
 		 75 aa  106  9.000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.650876 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2017  hypothetical protein  50.82 
 
 		 86 aa  75.5  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.425283  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3752  phage transcriptional regulator, AlpA  55.56 
 
 		 93 aa  65.5  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.433172  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0922  phage transcriptional regulator, AlpA  55.93 
 
 		 78 aa  62  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.124152  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0941  AlpA family transcriptional regulator  49.18 
 
 		 74 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.30814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2683  phage transcriptional regulator, AlpA  47.69 
 
 		 77 aa  60.1  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000806139  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0386  DNA-binding protein, putative  62.26 
 
 		 82 aa  57.4  0.00000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0315  prophage CP4-57 regulatory  60 
 
 		 98 aa  55.5  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0347  phage transcriptional regulator, AlpA  43.75 
 
 		 81 aa  53.5  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.24522 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2339  phage transcriptional regulator, AlpA  40.98 
 
 		 73 aa  52.8  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0551  phage transcriptional regulator, AlpA  50.94 
 
 		 80 aa  51.2  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1468  phage transcriptional regulator, AlpA  39.29 
 
 		 136 aa  46.6  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0978574  normal  0.521864 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1511  phage transcriptional regulator, AlpA  42.59 
 
 		 81 aa  45.8  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1265  phage transcriptional regulator, AlpA  37.5 
 
 		 127 aa  45.8  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.637502  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3481  phage transcriptional regulator, AlpA  35.71 
 
 		 127 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1058  phage transcriptional regulator, AlpA  33.85 
 
 		 88 aa  43.1  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4006  AlpA family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 88 aa  43.1  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0048  phage transcriptional regulator, AlpA  33.85 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3275  phage transcriptional regulator, AlpA  36.67 
 
 		 86 aa  42.7  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1173  phage transcriptional regulator, AlpA  35.09 
 
 		 94 aa  42  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.436282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3562  phage transcriptional regulator, AlpA  35.09 
 
 		 94 aa  42  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3362  phage transcriptional regulator, AlpA  33.93 
 
 		 117 aa  40.8  0.006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.253587  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1133  phage transcriptional regulator, AlpA  35.71 
 
 		 129 aa  40.8  0.006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0932  phage transcriptional regulator, AlpA  37.25 
 
 		 76 aa  40.8  0.006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.412381  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2186  prophage CP4-57 regulatory protein (AlpA)  33.96 
 
 		 85 aa  40.4  0.007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0232094  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0716  phage transcriptional regulator, AlpA  36.67 
 
 		 86 aa  40.4  0.008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>