230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1573 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_1573  Na+/H+ antiporter NhaA  100 
 
 		 382 aa  759    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0071  Na+/H+ antiporter NhaA  74.87 
 
 		 382 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2303  Na+/H+ antiporter family protein  70.6 
 
 		 382 aa  549  1e-155  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1089  Na+/H+ antiporter NhaA  68.5 
 
 		 382 aa  534  1e-150  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00816034  hitchhiker  0.0000107975 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3397  Na+/H+ antiporter NhaA  63.52 
 
 		 389 aa  498  1e-140  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0458674  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3343  Na+/H+ antiporter NhaA  63.93 
 
 		 385 aa  485  1e-136  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0902  Na+/H+ antiporter NhaA  63.93 
 
 		 385 aa  483  1e-135  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.75198e-32 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2987  Na+/H+ antiporter NhaA  63.25 
 
 		 382 aa  482  1e-135  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000224561  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1821  Na+/H+ antiporter NhaA  65.07 
 
 		 378 aa  482  1e-135  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.130379  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3369  Na+/H+ antiporter NhaA  65 
 
 		 386 aa  473  1e-132  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3655  Na+/H+ antiporter NhaA  40.86 
 
 		 420 aa  259  7e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.287299 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0585  Na+/H+ antiporter NhaA  35.44 
 
 		 423 aa  152  8e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6362  Na+/H+ antiporter NhaA  32.86 
 
 		 475 aa  132  1.0000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3958  sodium-proton antiporter, NhaA family  33.74 
 
 		 453 aa  129  6e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.529436 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10430  Na+/H+ antiporter NhaA  32.54 
 
 		 444 aa  129  1.0000000000000001e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.745936  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3059  Na+/H+ antiporter NhaA  33.09 
 
 		 452 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1868  Na+/H+ antiporter NhaA  34.47 
 
 		 453 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.138297 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0893  Na+/H+ antiporter NhaA  34.52 
 
 		 470 aa  127  4.0000000000000003e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7296  pH-dependent sodium/proton antiporter  33.25 
 
 		 399 aa  124  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.059957  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5677  Na+/H+ antiporter NhaA  34.41 
 
 		 404 aa  120  3.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.575468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5991  pH-dependent sodium/proton antiporter  32.79 
 
 		 399 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.688009  normal  0.157669 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02646  pH-dependent sodium/proton antiporter  32.95 
 
 		 391 aa  118  1.9999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5554  Na+/H+ antiporter NhaA  30.68 
 
 		 451 aa  116  6e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.477487  normal  0.958846 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003767  Na+/H+ antiporter NhaA type  31.99 
 
 		 383 aa  115  8.999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3610  Na+/H+ antiporter NhaA  36.22 
 
 		 413 aa  114  3e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.150292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2853  Na+/H+ antiporter NhaA  32.59 
 
 		 455 aa  113  5e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0044  pH-dependent sodium/proton antiporter  31.15 
 
 		 388 aa  112  9e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0043  pH-dependent sodium/proton antiporter  31.15 
 
 		 388 aa  112  9e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0043  pH-dependent sodium/proton antiporter  31.15 
 
 		 388 aa  112  9e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.62168  normal  0.149849 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0044  pH-dependent sodium/proton antiporter  31.15 
 
 		 388 aa  112  9e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0042  pH-dependent sodium/proton antiporter  31.15 
 
 		 388 aa  112  9e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.975088  hitchhiker  0.00613874 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3287  Na+/H+ antiporter NhaA  35.68 
 
 		 413 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2616  Na+/H+ antiporter NhaA  32.21 
 
 		 391 aa  111  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.536675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1838  pH-dependent sodium/proton antiporter  32.12 
 
 		 400 aa  111  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3264  sodium-proton antiporter NhaA  32.94 
 
 		 382 aa  111  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000713954 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2336  Na+/H+ antiporter NhaA  32.38 
 
 		 403 aa  111  2.0000000000000002e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.000768129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0369  pH-dependent sodium/proton antiporter  33.33 
 
 		 399 aa  111  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0301682  hitchhiker  0.000785162 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4210  pH-dependent sodium/proton antiporter  33.52 
 
 		 392 aa  110  3e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.400142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2773  Na+/H+ antiporter NhaA  30.17 
 
 		 612 aa  110  3e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.461609 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6044  pH-dependent sodium/proton antiporter  33.24 
 
 		 400 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.227636  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4533  sodium-proton antiporter NhaA  33.8 
 
 		 392 aa  110  5e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2123  pH-dependent sodium/proton antiporter  32.12 
 
 		 400 aa  110  5e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12160  Na+/H+ antiporter NhaA  33.25 
 
 		 436 aa  110  5e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6194  Na+/H+ antiporter NhaA  29 
 
 		 379 aa  109  6e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.219672 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4405  Na+/H+ antiporter NhaA  32.84 
 
 		 408 aa  110  6e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3578  Na+/H+ antiporter NhaA  32.7 
 
 		 388 aa  109  8.000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00256476  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3657  pH-dependent sodium/proton antiporter  32.73 
 
 		 398 aa  109  9.000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.457018  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2771  Na+/H+ antiporter NhaA  30.6 
 
 		 450 aa  108  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00813597  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0017  pH-dependent sodium/proton antiporter  32.7 
 
 		 388 aa  108  1e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.453914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1928  Na+/H+ antiporter NhaA  35.06 
 
 		 376 aa  108  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00018  pH-dependent sodium/proton antiporter  32.7 
 
 		 388 aa  108  2e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.89758  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0019  pH-dependent sodium/proton antiporter  32.7 
 
 		 388 aa  108  2e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0237343  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0017  pH-dependent sodium/proton antiporter  32.7 
 
 		 388 aa  108  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00019  hypothetical protein  32.7 
 
 		 388 aa  108  2e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.892896  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0019  pH-dependent sodium/proton antiporter  32.7 
 
 		 388 aa  108  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.046286  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3638  pH-dependent sodium/proton antiporter  32.7 
 
 		 388 aa  108  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2026  pH-dependent sodium/proton antiporter  31.43 
 
 		 382 aa  108  2e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.470958  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0016  pH-dependent sodium/proton antiporter  32.7 
 
 		 388 aa  108  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000467126  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0515  pH-dependent sodium/proton antiporter  32.21 
 
 		 393 aa  107  3e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0694  pH-dependent sodium/proton antiporter  32.84 
 
 		 398 aa  107  3e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000263731  hitchhiker  0.00301245 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0214  Na+/H+ antiporter NhaA  27.4 
 
 		 439 aa  107  4e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.83663 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1410  Na+/H+ antiporter NhaA  32.76 
 
 		 442 aa  107  4e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2293  Na+/H+ antiporter NhaA  33.02 
 
 		 395 aa  107  5e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.193594 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1233  pH-dependent sodium/proton antiporter  30.26 
 
 		 382 aa  106  6e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000535639  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3851  pH-dependent sodium/proton antiporter  31.95 
 
 		 398 aa  106  7e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.79655  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2645  Na+/H+ antiporter NhaA  31.74 
 
 		 390 aa  106  8e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3022  Na+/H+ antiporter NhaA  30 
 
 		 395 aa  105  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.396021  normal  0.0264038 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3089  Na+/H+ antiporter NhaA  32.04 
 
 		 406 aa  105  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.761361  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7108  pH-dependent sodium/proton antiporter  34.32 
 
 		 396 aa  105  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.937929  normal  0.0534187 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3347  pH-dependent sodium/proton antiporter  34.02 
 
 		 407 aa  105  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6928  Na+/H+ antiporter NhaA  32.08 
 
 		 446 aa  104  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.126973  normal  0.148656 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5944  pH-dependent sodium/proton antiporter  34.05 
 
 		 396 aa  105  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.195827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0693  pH-dependent sodium/proton antiporter  32.86 
 
 		 396 aa  104  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.11155  normal  0.550501 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2277  pH-dependent sodium/proton antiporter  32.34 
 
 		 397 aa  105  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00329368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0371  Na+/H+ antiporter NhaA  30.05 
 
 		 452 aa  104  2e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0065  Na+/H+ antiporter NhaA  31.2 
 
 		 402 aa  104  3e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000634714  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4950  Na+/H+ antiporter NhaA  32.68 
 
 		 465 aa  103  4e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.29184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2666  Na+/H+ antiporter NhaA  32.02 
 
 		 445 aa  103  5e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.657461  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05370  NA(+)/H(+) antiporter 1  26.9 
 
 		 435 aa  103  7e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.765198  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1101  Na+/H+ antiporter NhaA  29.58 
 
 		 458 aa  102  8e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07000  Na+/H+ antiporter NhaA  29.95 
 
 		 514 aa  102  9e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.107154  normal  0.0342501 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13458  putative Na+/H+ antiporter  27.55 
 
 		 427 aa  102  1e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.466525  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3464  pH-dependent sodium/proton antiporter  31.94 
 
 		 394 aa  102  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000517181  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3828  Na+/H+ antiporter NhaA  32.98 
 
 		 457 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0371269 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0963  pH-dependent sodium/proton antiporter  29.52 
 
 		 395 aa  102  1e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000193238  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0869  putative Na+/H+ antiporter NhaA  28.37 
 
 		 419 aa  101  2e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3592  pH-dependent sodium/proton antiporter  31.94 
 
 		 394 aa  101  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000151252  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27000  Na+/H+ antiporter NhaA  31.01 
 
 		 429 aa  101  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.358876  normal  0.743342 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1756  Na+/H+ antiporter NhaA  31.03 
 
 		 394 aa  101  3e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0795  pH-dependent sodium/proton antiporter  31.94 
 
 		 394 aa  101  3e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000129218  normal  0.24433 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2118  pH-dependent sodium/proton antiporter  31.23 
 
 		 436 aa  101  3e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0195602 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0880  Na+/H+ antiporter NhaA  30.65 
 
 		 401 aa  100  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.324088 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2414  Na+/H+ antiporter NhaA  33.01 
 
 		 426 aa  100  5e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0173976 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2570  Na+/H+ antiporter NhaA  31.84 
 
 		 472 aa  100  5e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1762  Na(+)/H(+) antiporter 1  28.99 
 
 		 464 aa  100  6e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2262  pH-dependent sodium/proton antiporter  31.83 
 
 		 436 aa  99.8  7e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.50629  normal  0.0112773 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1390  pH-dependent sodium/proton antiporter  29.72 
 
 		 391 aa  99.8  7e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000519432  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1390  Na+/H+ antiporter NhaA  30.92 
 
 		 391 aa  99.8  8e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2582  Na+/H+ antiporter NhaA  31.72 
 
 		 393 aa  99.4  9e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1189  pH-dependent sodium/proton antiporter  30.33 
 
 		 389 aa  99.4  1e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.685573  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>