233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2666 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2666  Na+/H+ antiporter NhaA  100 
 
 		 445 aa  855    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.657461  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2307  Na+/H+ antiporter NhaA  55.02 
 
 		 455 aa  434  1e-120  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4069  Na+/H+ antiporter NhaA  52.09 
 
 		 455 aa  415  9.999999999999999e-116  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.16071 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2771  Na+/H+ antiporter NhaA  51.83 
 
 		 450 aa  403  1e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00813597  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4662  Na+/H+ antiporter NhaA  48.01 
 
 		 438 aa  376  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000933832 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1784  Na+/H+ antiporter NhaA  45.52 
 
 		 444 aa  367  1e-100  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2456  Na+/H+ antiporter  52.25 
 
 		 438 aa  363  4e-99  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00270708  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1762  Na(+)/H(+) antiporter 1  47.7 
 
 		 464 aa  356  5.999999999999999e-97  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2713  pH-dependent sodium/proton antiporter  52.11 
 
 		 430 aa  355  1e-96  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.532059  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2570  Na+/H+ antiporter NhaA  48.2 
 
 		 472 aa  354  2e-96  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13458  putative Na+/H+ antiporter  42.69 
 
 		 427 aa  347  3e-94  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.466525  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2941  pH-dependent sodium/proton antiporter  47.99 
 
 		 394 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.135486  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2989  Na+/H+ antiporter NhaA  50.57 
 
 		 460 aa  343  2.9999999999999997e-93  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3059  Na+/H+ antiporter NhaA  45.79 
 
 		 452 aa  342  1e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6194  Na+/H+ antiporter NhaA  43.29 
 
 		 379 aa  342  1e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.219672 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0065  Na+/H+ antiporter NhaA  49.76 
 
 		 402 aa  337  3.9999999999999995e-91  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000634714  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05370  NA(+)/H(+) antiporter 1  42.59 
 
 		 435 aa  334  2e-90  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.765198  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0144  Na+/H+ antiporter NhaA  45.95 
 
 		 446 aa  333  5e-90  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.174095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0868  pH-dependent sodium/proton antiporter  47.28 
 
 		 391 aa  332  8e-90  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.128339 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2205  Na+/H+ antiporter NhaA  46.17 
 
 		 436 aa  331  1e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.29594  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3022  Na+/H+ antiporter NhaA  43.36 
 
 		 395 aa  331  2e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.396021  normal  0.0264038 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1861  Na+/H+ antiporter NhaA  46.17 
 
 		 451 aa  331  2e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.995313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1868  Na+/H+ antiporter NhaA  46.21 
 
 		 453 aa  331  2e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.138297 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3958  sodium-proton antiporter, NhaA family  46.21 
 
 		 453 aa  330  4e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.529436 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3135  Na+/H+ antiporter NhaA  45.87 
 
 		 398 aa  330  4e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1649  Na+/H+ antiporter NhaA  46.54 
 
 		 468 aa  329  5.0000000000000004e-89  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.349535  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1336  pH-dependent sodium/proton antiporter  46.34 
 
 		 389 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1563  pH-dependent sodium/proton antiporter  54.1 
 
 		 421 aa  328  1.0000000000000001e-88  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.172648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4144  Na+/H+ antiporter NhaA  43.86 
 
 		 472 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.375457  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6362  Na+/H+ antiporter NhaA  46.68 
 
 		 475 aa  326  4.0000000000000003e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10430  Na+/H+ antiporter NhaA  44.37 
 
 		 444 aa  325  7e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.745936  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3038  pH-dependent sodium/proton antiporter  46.81 
 
 		 389 aa  324  2e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.474949 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1390  Na+/H+ antiporter NhaA  45.85 
 
 		 396 aa  323  3e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.168803  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4283  pH-dependent sodium/proton antiporter  48.71 
 
 		 391 aa  323  4e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2860  pH-dependent sodium/proton antiporter  46.5 
 
 		 389 aa  322  6e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.611153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2942  pH-dependent sodium/proton antiporter  46.26 
 
 		 389 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0919251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02646  pH-dependent sodium/proton antiporter  44.68 
 
 		 391 aa  320  3e-86  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00573  Na+/H+ antiporter, NhaA  45.11 
 
 		 424 aa  320  3.9999999999999996e-86  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3123  Na+/H+ antiporter NhaA  46.08 
 
 		 449 aa  320  3.9999999999999996e-86  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.158144  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1233  pH-dependent sodium/proton antiporter  44.92 
 
 		 389 aa  319  5e-86  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3124  pH-dependent sodium/proton antiporter  44.92 
 
 		 389 aa  319  5e-86  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.646901  normal  0.440513 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1147  pH-dependent sodium/proton antiporter  46.1 
 
 		 391 aa  320  5e-86  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1266  pH-dependent sodium/proton antiporter  44.68 
 
 		 389 aa  319  7.999999999999999e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003767  Na+/H+ antiporter NhaA type  46.41 
 
 		 383 aa  318  9e-86  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0128  Na+/H+ antiporter NhaA  49.77 
 
 		 399 aa  318  1e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.124586  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3215  Na+/H+ antiporter NhaA  46.71 
 
 		 456 aa  318  1e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2568  Na+/H+ antiporter NhaA  51.9 
 
 		 424 aa  318  2e-85  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1189  pH-dependent sodium/proton antiporter  44.68 
 
 		 389 aa  317  2e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.685573  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3089  Na+/H+ antiporter NhaA  43.75 
 
 		 406 aa  317  2e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.761361  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0043  pH-dependent sodium/proton antiporter  47.09 
 
 		 388 aa  314  1.9999999999999998e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0042  pH-dependent sodium/proton antiporter  47.09 
 
 		 388 aa  314  1.9999999999999998e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.975088  hitchhiker  0.00613874 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0044  pH-dependent sodium/proton antiporter  47.09 
 
 		 388 aa  314  1.9999999999999998e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0044  pH-dependent sodium/proton antiporter  47.09 
 
 		 388 aa  314  1.9999999999999998e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0043  pH-dependent sodium/proton antiporter  47.09 
 
 		 388 aa  314  1.9999999999999998e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.62168  normal  0.149849 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5554  Na+/H+ antiporter NhaA  44.55 
 
 		 451 aa  314  2.9999999999999996e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.477487  normal  0.958846 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4533  sodium-proton antiporter NhaA  47.49 
 
 		 392 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1480  Na+/H+ antiporter NhaA  43.29 
 
 		 450 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.627445  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4210  pH-dependent sodium/proton antiporter  47.49 
 
 		 392 aa  311  1e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.400142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0842  pH-dependent sodium/proton antiporter  44.24 
 
 		 390 aa  312  1e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1132  pH-dependent sodium/proton antiporter  48.24 
 
 		 397 aa  311  2e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.422688  normal  0.012742 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0585  Na+/H+ antiporter NhaA  46.36 
 
 		 423 aa  310  2e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2277  pH-dependent sodium/proton antiporter  44.58 
 
 		 397 aa  310  2.9999999999999997e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00329368  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1390  pH-dependent sodium/proton antiporter  44.71 
 
 		 391 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000519432  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00018  pH-dependent sodium/proton antiporter  47.66 
 
 		 388 aa  310  4e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.89758  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0019  pH-dependent sodium/proton antiporter  47.66 
 
 		 388 aa  310  4e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0237343  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3638  pH-dependent sodium/proton antiporter  47.66 
 
 		 388 aa  310  4e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00019  hypothetical protein  47.66 
 
 		 388 aa  310  4e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.892896  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0017  pH-dependent sodium/proton antiporter  47.66 
 
 		 388 aa  310  4e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3828  Na+/H+ antiporter NhaA  45.68 
 
 		 457 aa  310  4e-83  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0371269 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0019  pH-dependent sodium/proton antiporter  47.66 
 
 		 388 aa  310  4e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.046286  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0016  pH-dependent sodium/proton antiporter  47.66 
 
 		 388 aa  310  4e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000467126  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0017  pH-dependent sodium/proton antiporter  47.43 
 
 		 388 aa  309  5e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.453914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1390  Na+/H+ antiporter NhaA  41.92 
 
 		 391 aa  309  5e-83  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1168  pH-dependent sodium/proton antiporter  48 
 
 		 397 aa  310  5e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7296  pH-dependent sodium/proton antiporter  48.17 
 
 		 399 aa  309  5.9999999999999995e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.059957  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4405  Na+/H+ antiporter NhaA  43.59 
 
 		 408 aa  309  8e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07000  Na+/H+ antiporter NhaA  45.97 
 
 		 514 aa  308  1.0000000000000001e-82  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.107154  normal  0.0342501 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5991  pH-dependent sodium/proton antiporter  50.6 
 
 		 399 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.688009  normal  0.157669 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2616  Na+/H+ antiporter NhaA  46.26 
 
 		 391 aa  307  2.0000000000000002e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.536675  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3578  Na+/H+ antiporter NhaA  47.43 
 
 		 388 aa  307  3e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00256476  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0732  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.49 
 
 		 409 aa  306  3e-82  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1234  pH-dependent sodium/proton antiporter  47.09 
 
 		 395 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.400812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1802  cyclic nucleotide-binding protein  46.41 
 
 		 876 aa  306  7e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668239  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1025  pH-dependent sodium/proton antiporter  44.44 
 
 		 391 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0688  Na+/H+ antiporter NhaA  43.12 
 
 		 389 aa  301  1e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3699  pH-dependent sodium/proton antiporter  43.42 
 
 		 397 aa  301  1e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.262179 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1233  pH-dependent sodium/proton antiporter  44.26 
 
 		 382 aa  301  1e-80  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000535639  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3287  Na+/H+ antiporter NhaA  49.07 
 
 		 413 aa  300  2e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2026  pH-dependent sodium/proton antiporter  44.98 
 
 		 382 aa  300  3e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.470958  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0407  Na+/H+ antiporter NhaA  45.02 
 
 		 425 aa  300  4e-80  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2979  Na+/H+ antiporter NhaA  46.62 
 
 		 443 aa  298  1e-79  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2853  Na+/H+ antiporter NhaA  44.55 
 
 		 455 aa  298  1e-79  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3610  Na+/H+ antiporter NhaA  48.6 
 
 		 413 aa  297  2e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.150292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0214  Na+/H+ antiporter NhaA  41.76 
 
 		 439 aa  297  2e-79  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.83663 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0222  Na+/H+ antiporter NhaA  42.04 
 
 		 475 aa  298  2e-79  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2773  Na+/H+ antiporter NhaA  45.73 
 
 		 612 aa  297  3e-79  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.461609 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0580  pH-dependent sodium/proton antiporter  46.08 
 
 		 391 aa  296  6e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0119541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1042  pH-dependent sodium/proton antiporter  44.68 
 
 		 391 aa  295  8e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.12391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1756  Na+/H+ antiporter NhaA  39.67 
 
 		 394 aa  295  1e-78  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51740  Na+/H+ antiporter NhaA  43.55 
 
 		 446 aa  293  4e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.9845  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>