230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6362 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_6362  Na+/H+ antiporter NhaA  100 
 
 		 475 aa  940    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10430  Na+/H+ antiporter NhaA  46.44 
 
 		 444 aa  387  1e-106  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.745936  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3059  Na+/H+ antiporter NhaA  46.21 
 
 		 452 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5554  Na+/H+ antiporter NhaA  46.99 
 
 		 451 aa  365  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.477487  normal  0.958846 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2853  Na+/H+ antiporter NhaA  46.19 
 
 		 455 aa  362  1e-98  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3958  sodium-proton antiporter, NhaA family  46.39 
 
 		 453 aa  358  9e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.529436 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1868  Na+/H+ antiporter NhaA  45.92 
 
 		 453 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.138297 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0585  Na+/H+ antiporter NhaA  45.11 
 
 		 423 aa  337  2.9999999999999997e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2307  Na+/H+ antiporter NhaA  43.05 
 
 		 455 aa  335  1e-90  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2771  Na+/H+ antiporter NhaA  44.69 
 
 		 450 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00813597  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1649  Na+/H+ antiporter NhaA  44.14 
 
 		 468 aa  328  1.0000000000000001e-88  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.349535  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0371  Na+/H+ antiporter NhaA  41 
 
 		 452 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1784  Na+/H+ antiporter NhaA  41.01 
 
 		 444 aa  317  2e-85  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2666  Na+/H+ antiporter NhaA  47.22 
 
 		 445 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.657461  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4069  Na+/H+ antiporter NhaA  40.99 
 
 		 455 aa  305  9.000000000000001e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.16071 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4662  Na+/H+ antiporter NhaA  40.5 
 
 		 438 aa  303  6.000000000000001e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000933832 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05370  NA(+)/H(+) antiporter 1  39.21 
 
 		 435 aa  296  5e-79  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.765198  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1762  Na(+)/H(+) antiporter 1  39.68 
 
 		 464 aa  288  2e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3123  Na+/H+ antiporter NhaA  41.1 
 
 		 449 aa  283  4.0000000000000003e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.158144  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2205  Na+/H+ antiporter NhaA  40.19 
 
 		 436 aa  281  1e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.29594  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1861  Na+/H+ antiporter NhaA  40.19 
 
 		 451 aa  282  1e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.995313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3215  Na+/H+ antiporter NhaA  41.39 
 
 		 456 aa  279  7e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1802  cyclic nucleotide-binding protein  41.92 
 
 		 876 aa  276  8e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668239  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0065  Na+/H+ antiporter NhaA  41.06 
 
 		 402 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000634714  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1390  Na+/H+ antiporter NhaA  38.3 
 
 		 391 aa  275  2.0000000000000002e-72  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0893  Na+/H+ antiporter NhaA  37.91 
 
 		 470 aa  274  3e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07000  Na+/H+ antiporter NhaA  38.41 
 
 		 514 aa  273  5.000000000000001e-72  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.107154  normal  0.0342501 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0842  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.37 
 
 		 390 aa  273  6e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0144  Na+/H+ antiporter NhaA  36.64 
 
 		 446 aa  273  6e-72  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.174095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2941  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.96 
 
 		 394 aa  272  9e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.135486  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2456  Na+/H+ antiporter  41.96 
 
 		 438 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00270708  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2570  Na+/H+ antiporter NhaA  36.36 
 
 		 472 aa  270  2.9999999999999997e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1390  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.89 
 
 		 391 aa  270  5e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000519432  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3828  Na+/H+ antiporter NhaA  41.45 
 
 		 457 aa  270  5.9999999999999995e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0371269 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4144  Na+/H+ antiporter NhaA  36.1 
 
 		 472 aa  268  1e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.375457  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4950  Na+/H+ antiporter NhaA  38.72 
 
 		 465 aa  268  2e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.29184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2962  Na+/H+ antiporter NhaA  42.34 
 
 		 481 aa  266  5e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0043  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.66 
 
 		 388 aa  266  8.999999999999999e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.62168  normal  0.149849 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0042  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.66 
 
 		 388 aa  266  8.999999999999999e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.975088  hitchhiker  0.00613874 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0044  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.66 
 
 		 388 aa  266  8.999999999999999e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0043  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.66 
 
 		 388 aa  266  8.999999999999999e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0044  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.66 
 
 		 388 aa  266  8.999999999999999e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1480  Na+/H+ antiporter NhaA  37.44 
 
 		 450 aa  265  1e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.627445  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1189  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.69 
 
 		 389 aa  265  2e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.685573  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1390  Na+/H+ antiporter NhaA  39.13 
 
 		 396 aa  264  3e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.168803  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1563  pH-dependent sodium/proton antiporter  44.22 
 
 		 421 aa  264  3e-69  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.172648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2713  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.61 
 
 		 430 aa  263  4.999999999999999e-69  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.532059  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3124  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.69 
 
 		 389 aa  263  6e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.646901  normal  0.440513 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1233  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.69 
 
 		 389 aa  263  6e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4210  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.32 
 
 		 392 aa  263  6.999999999999999e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.400142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1266  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.46 
 
 		 389 aa  262  8e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2568  Na+/H+ antiporter NhaA  43.74 
 
 		 424 aa  262  1e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0214  Na+/H+ antiporter NhaA  40.05 
 
 		 439 aa  262  1e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.83663 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13458  putative Na+/H+ antiporter  37.24 
 
 		 427 aa  262  1e-68  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.466525  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3578  Na+/H+ antiporter NhaA  40.69 
 
 		 388 aa  261  2e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00256476  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2773  Na+/H+ antiporter NhaA  39.4 
 
 		 612 aa  261  2e-68  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.461609 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0868  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.93 
 
 		 391 aa  261  2e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.128339 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6194  Na+/H+ antiporter NhaA  37.82 
 
 		 379 aa  261  2e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.219672 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00018  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.69 
 
 		 388 aa  260  4e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.89758  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0016  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.69 
 
 		 388 aa  260  4e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000467126  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0017  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.69 
 
 		 388 aa  260  4e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0019  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.69 
 
 		 388 aa  260  4e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.046286  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3638  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.69 
 
 		 388 aa  260  4e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0019  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.69 
 
 		 388 aa  260  4e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0237343  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00019  hypothetical protein  40.69 
 
 		 388 aa  260  4e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.892896  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0017  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.69 
 
 		 388 aa  259  5.0000000000000005e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.453914  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1336  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.69 
 
 		 389 aa  259  6e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3038  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.69 
 
 		 389 aa  259  6e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.474949 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4533  sodium-proton antiporter NhaA  39.86 
 
 		 392 aa  259  7e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5677  Na+/H+ antiporter NhaA  37.35 
 
 		 404 aa  258  2e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.575468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3022  Na+/H+ antiporter NhaA  39.2 
 
 		 395 aa  257  3e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.396021  normal  0.0264038 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3089  Na+/H+ antiporter NhaA  38.7 
 
 		 406 aa  256  7e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.761361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2860  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.96 
 
 		 389 aa  256  7e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.611153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1147  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.69 
 
 		 391 aa  256  7e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2942  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.73 
 
 		 389 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0919251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0963  pH-dependent sodium/proton antiporter  38 
 
 		 395 aa  254  2.0000000000000002e-66  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000193238  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0222  Na+/H+ antiporter NhaA  35.84 
 
 		 475 aa  254  3e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1042  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.12 
 
 		 391 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.12391  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3135  Na+/H+ antiporter NhaA  38.99 
 
 		 398 aa  253  6e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02646  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.53 
 
 		 391 aa  253  8.000000000000001e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2414  Na+/H+ antiporter NhaA  38.5 
 
 		 426 aa  252  9.000000000000001e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0173976 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1025  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.01 
 
 		 391 aa  249  6e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2277  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.02 
 
 		 397 aa  249  7e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00329368  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1488  Na+/H+ antiporter  36.24 
 
 		 386 aa  249  8e-65  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51740  Na+/H+ antiporter NhaA  35.94 
 
 		 446 aa  248  1e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.9845  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1756  Na+/H+ antiporter NhaA  35.58 
 
 		 394 aa  247  3e-64  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1136  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.77 
 
 		 399 aa  247  4e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2979  Na+/H+ antiporter NhaA  41.52 
 
 		 443 aa  247  4e-64  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0583  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.67 
 
 		 392 aa  244  1.9999999999999999e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0187832  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1827  Na+/H+ antiporter NhaA  34.93 
 
 		 382 aa  244  1.9999999999999999e-63  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3129  Na+/H+ antiporter NhaA  41.86 
 
 		 422 aa  245  1.9999999999999999e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7296  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.05 
 
 		 399 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.059957  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0580  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.71 
 
 		 391 aa  243  3.9999999999999997e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0119541  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2026  pH-dependent sodium/proton antiporter  36.68 
 
 		 382 aa  243  7.999999999999999e-63  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.470958  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003767  Na+/H+ antiporter NhaA type  38 
 
 		 383 aa  243  7.999999999999999e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1646  Na+/H+ antiporter NhaA  34.69 
 
 		 382 aa  242  9e-63  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2616  Na+/H+ antiporter NhaA  38.66 
 
 		 391 aa  241  1e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.536675  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1877  Na+/H+ antiporter  35.18 
 
 		 452 aa  241  2e-62  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0694  pH-dependent sodium/proton antiporter  36.53 
 
 		 398 aa  241  2e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000263731  hitchhiker  0.00301245 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0407  Na+/H+ antiporter NhaA  36.13 
 
 		 425 aa  241  2e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>