232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0214 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_0214  Na+/H+ antiporter NhaA  100 
 
 		 439 aa  865    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.83663 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4662  Na+/H+ antiporter NhaA  46.96 
 
 		 438 aa  334  2e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000933832 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2307  Na+/H+ antiporter NhaA  45.63 
 
 		 455 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2771  Na+/H+ antiporter NhaA  44.55 
 
 		 450 aa  317  4e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00813597  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4069  Na+/H+ antiporter NhaA  41.61 
 
 		 455 aa  294  3e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.16071 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1480  Na+/H+ antiporter NhaA  41.92 
 
 		 450 aa  291  1e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.627445  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2205  Na+/H+ antiporter NhaA  42.56 
 
 		 436 aa  289  5.0000000000000004e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.29594  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1861  Na+/H+ antiporter NhaA  42.56 
 
 		 451 aa  289  6e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.995313  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2989  Na+/H+ antiporter NhaA  43.99 
 
 		 460 aa  286  7e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3022  Na+/H+ antiporter NhaA  42.25 
 
 		 395 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.396021  normal  0.0264038 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1762  Na(+)/H(+) antiporter 1  43.91 
 
 		 464 aa  284  2.0000000000000002e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1784  Na+/H+ antiporter NhaA  42.28 
 
 		 444 aa  284  3.0000000000000004e-75  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0222  Na+/H+ antiporter NhaA  42.76 
 
 		 475 aa  283  5.000000000000001e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2666  Na+/H+ antiporter NhaA  41.26 
 
 		 445 aa  278  1e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.657461  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05370  NA(+)/H(+) antiporter 1  39.19 
 
 		 435 aa  276  5e-73  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.765198  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1189  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.1 
 
 		 389 aa  272  1e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.685573  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3124  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.1 
 
 		 389 aa  271  2e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.646901  normal  0.440513 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1233  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.1 
 
 		 389 aa  271  2e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1266  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.86 
 
 		 389 aa  271  2e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0688  Na+/H+ antiporter NhaA  41.83 
 
 		 389 aa  270  2.9999999999999997e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07000  Na+/H+ antiporter NhaA  37.53 
 
 		 514 aa  269  8e-71  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.107154  normal  0.0342501 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0042  pH-dependent sodium/proton antiporter  44.72 
 
 		 388 aa  267  2.9999999999999995e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.975088  hitchhiker  0.00613874 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1336  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.39 
 
 		 389 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0043  pH-dependent sodium/proton antiporter  44.72 
 
 		 388 aa  267  2.9999999999999995e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.62168  normal  0.149849 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0044  pH-dependent sodium/proton antiporter  44.72 
 
 		 388 aa  267  2.9999999999999995e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0043  pH-dependent sodium/proton antiporter  44.72 
 
 		 388 aa  267  2.9999999999999995e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0044  pH-dependent sodium/proton antiporter  44.72 
 
 		 388 aa  267  2.9999999999999995e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2570  Na+/H+ antiporter NhaA  38.37 
 
 		 472 aa  266  4e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3089  Na+/H+ antiporter NhaA  41.87 
 
 		 406 aa  266  5e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.761361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1756  Na+/H+ antiporter NhaA  40.61 
 
 		 394 aa  265  1e-69  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3059  Na+/H+ antiporter NhaA  39.37 
 
 		 452 aa  265  2e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13458  putative Na+/H+ antiporter  39 
 
 		 427 aa  264  3e-69  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.466525  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00018  pH-dependent sodium/proton antiporter  45.83 
 
 		 388 aa  263  4e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.89758  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00019  hypothetical protein  45.83 
 
 		 388 aa  263  4e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.892896  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0016  pH-dependent sodium/proton antiporter  45.83 
 
 		 388 aa  263  4e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000467126  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0019  pH-dependent sodium/proton antiporter  45.83 
 
 		 388 aa  263  4e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0237343  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3638  pH-dependent sodium/proton antiporter  45.83 
 
 		 388 aa  263  4e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0019  pH-dependent sodium/proton antiporter  45.83 
 
 		 388 aa  263  4e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.046286  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0017  pH-dependent sodium/proton antiporter  45.83 
 
 		 388 aa  263  4e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.453914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0017  pH-dependent sodium/proton antiporter  45.83 
 
 		 388 aa  263  4e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3135  Na+/H+ antiporter NhaA  41.61 
 
 		 398 aa  263  4.999999999999999e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2941  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.5 
 
 		 394 aa  263  4.999999999999999e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.135486  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6194  Na+/H+ antiporter NhaA  39.19 
 
 		 379 aa  263  4.999999999999999e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.219672 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2277  pH-dependent sodium/proton antiporter  40 
 
 		 397 aa  261  1e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00329368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2979  Na+/H+ antiporter NhaA  43.08 
 
 		 443 aa  261  2e-68  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7296  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.79 
 
 		 399 aa  261  2e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.059957  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3578  Na+/H+ antiporter NhaA  45.56 
 
 		 388 aa  260  3e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00256476  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4533  sodium-proton antiporter NhaA  44.29 
 
 		 392 aa  260  3e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1649  Na+/H+ antiporter NhaA  39.28 
 
 		 468 aa  260  3e-68  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.349535  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2942  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.91 
 
 		 389 aa  259  9e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0919251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3038  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.68 
 
 		 389 aa  259  9e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.474949 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6362  Na+/H+ antiporter NhaA  40.05 
 
 		 475 aa  259  9e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4210  pH-dependent sodium/proton antiporter  43.16 
 
 		 392 aa  258  1e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.400142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2860  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.68 
 
 		 389 aa  257  2e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.611153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1390  Na+/H+ antiporter NhaA  40.9 
 
 		 391 aa  257  3e-67  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1025  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.13 
 
 		 391 aa  257  4e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0407  Na+/H+ antiporter NhaA  40.57 
 
 		 425 aa  256  5e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4405  Na+/H+ antiporter NhaA  38.6 
 
 		 408 aa  256  5e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10430  Na+/H+ antiporter NhaA  38.28 
 
 		 444 aa  256  7e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.745936  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0868  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.56 
 
 		 391 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.128339 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1147  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.91 
 
 		 391 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02646  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.67 
 
 		 391 aa  254  2.0000000000000002e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0065  Na+/H+ antiporter NhaA  39.39 
 
 		 402 aa  253  4.0000000000000004e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000634714  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0732  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.53 
 
 		 409 aa  253  5.000000000000001e-66  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0842  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.81 
 
 		 390 aa  253  5.000000000000001e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2026  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.98 
 
 		 382 aa  253  6e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.470958  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3958  sodium-proton antiporter, NhaA family  38.41 
 
 		 453 aa  252  8.000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.529436 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003767  Na+/H+ antiporter NhaA type  41.4 
 
 		 383 aa  252  1e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1868  Na+/H+ antiporter NhaA  38.16 
 
 		 453 aa  252  1e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.138297 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2616  Na+/H+ antiporter NhaA  41 
 
 		 391 aa  252  1e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.536675  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1390  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.86 
 
 		 391 aa  251  2e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000519432  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5554  Na+/H+ antiporter NhaA  38.68 
 
 		 451 aa  249  8e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.477487  normal  0.958846 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1136  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.14 
 
 		 399 aa  248  1e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0583  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.48 
 
 		 392 aa  248  1e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0187832  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3264  sodium-proton antiporter NhaA  40.14 
 
 		 382 aa  248  2e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000713954 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2456  Na+/H+ antiporter  39.05 
 
 		 438 aa  247  3e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00270708  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1042  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.15 
 
 		 391 aa  247  3e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.12391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4283  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.54 
 
 		 391 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2582  Na+/H+ antiporter NhaA  41.37 
 
 		 393 aa  246  8e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4950  Na+/H+ antiporter NhaA  38.06 
 
 		 465 aa  245  9.999999999999999e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.29184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1233  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.53 
 
 		 382 aa  245  9.999999999999999e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000535639  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0580  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.86 
 
 		 391 aa  244  1.9999999999999999e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0119541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0694  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.97 
 
 		 398 aa  243  3e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000263731  hitchhiker  0.00301245 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3699  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.45 
 
 		 397 aa  244  3e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.262179 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4144  Na+/H+ antiporter NhaA  35.89 
 
 		 472 aa  243  6e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.375457  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3851  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.44 
 
 		 398 aa  242  7.999999999999999e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.79655  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5174  sodium-proton antiporter NhaA  41.04 
 
 		 391 aa  241  1e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2853  Na+/H+ antiporter NhaA  38.52 
 
 		 455 aa  241  2.9999999999999997e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4598  Na+/H+ antiporter NhaA  42.39 
 
 		 408 aa  240  2.9999999999999997e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2713  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.8 
 
 		 430 aa  240  4e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.532059  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0544  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.82 
 
 		 401 aa  240  4e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5991  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.82 
 
 		 399 aa  240  4e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.688009  normal  0.157669 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1390  Na+/H+ antiporter NhaA  39.13 
 
 		 396 aa  239  5e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.168803  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6044  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.27 
 
 		 400 aa  239  5.999999999999999e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.227636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0343  Na+/H+ antiporter NhaA  38.35 
 
 		 390 aa  239  8e-62  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00697449  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00573  Na+/H+ antiporter, NhaA  37.5 
 
 		 424 aa  238  1e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0963  pH-dependent sodium/proton antiporter  36.89 
 
 		 395 aa  238  1e-61  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000193238  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0840  Na+/H+ antiporter NhaA  40.4 
 
 		 381 aa  238  1e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1877  Na+/H+ antiporter  36.36 
 
 		 452 aa  238  2e-61  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2336  Na+/H+ antiporter NhaA  38.37 
 
 		 403 aa  237  3e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.000768129  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>