231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4405 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4405  Na+/H+ antiporter NhaA  100 
 
 
408 aa  805    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3089  Na+/H+ antiporter NhaA  63.73 
 
 
406 aa  508  1e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.761361  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3022  Na+/H+ antiporter NhaA  61.54 
 
 
395 aa  480  1e-134  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.396021  normal  0.0264038 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6194  Na+/H+ antiporter NhaA  50.81 
 
 
379 aa  355  7.999999999999999e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.219672 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0688  Na+/H+ antiporter NhaA  50.39 
 
 
389 aa  344  1e-93  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2941  pH-dependent sodium/proton antiporter  45.36 
 
 
394 aa  335  7.999999999999999e-91  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.135486  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3135  Na+/H+ antiporter NhaA  49.22 
 
 
398 aa  334  2e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1390  pH-dependent sodium/proton antiporter  46.67 
 
 
391 aa  333  4e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000519432  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0515  pH-dependent sodium/proton antiporter  47.58 
 
 
393 aa  330  3e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1876  Na+/H+ antiporter  47.75 
 
 
387 aa  328  9e-89  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00181634 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0842  pH-dependent sodium/proton antiporter  44.36 
 
 
390 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0043  pH-dependent sodium/proton antiporter  47.12 
 
 
388 aa  327  3e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.62168  normal  0.149849 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0042  pH-dependent sodium/proton antiporter  47.12 
 
 
388 aa  327  3e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.975088  hitchhiker  0.00613874 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0044  pH-dependent sodium/proton antiporter  47.12 
 
 
388 aa  327  3e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0043  pH-dependent sodium/proton antiporter  47.12 
 
 
388 aa  327  3e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0044  pH-dependent sodium/proton antiporter  47.12 
 
 
388 aa  327  3e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1147  pH-dependent sodium/proton antiporter  45.71 
 
 
391 aa  323  3e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0840  Na+/H+ antiporter NhaA  49.35 
 
 
381 aa  323  3e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3038  pH-dependent sodium/proton antiporter  46.49 
 
 
389 aa  322  8e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.474949 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1336  pH-dependent sodium/proton antiporter  46.23 
 
 
389 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3124  pH-dependent sodium/proton antiporter  45.45 
 
 
389 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.646901  normal  0.440513 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2860  pH-dependent sodium/proton antiporter  47.11 
 
 
389 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.611153  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1233  pH-dependent sodium/proton antiporter  45.45 
 
 
389 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1189  pH-dependent sodium/proton antiporter  45.45 
 
 
389 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.685573  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1266  pH-dependent sodium/proton antiporter  45.45 
 
 
389 aa  321  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7296  pH-dependent sodium/proton antiporter  46.31 
 
 
399 aa  320  3e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.059957  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0732  pH-dependent sodium/proton antiporter  45.97 
 
 
409 aa  320  3e-86  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2942  pH-dependent sodium/proton antiporter  46.84 
 
 
389 aa  320  3e-86  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0919251  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00018  pH-dependent sodium/proton antiporter  47.75 
 
 
388 aa  318  9e-86  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.89758  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00019  hypothetical protein  47.75 
 
 
388 aa  318  9e-86  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.892896  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0019  pH-dependent sodium/proton antiporter  47.48 
 
 
388 aa  318  9e-86  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.046286  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0016  pH-dependent sodium/proton antiporter  47.75 
 
 
388 aa  318  9e-86  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000467126  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0019  pH-dependent sodium/proton antiporter  47.75 
 
 
388 aa  318  9e-86  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0237343  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0017  pH-dependent sodium/proton antiporter  47.48 
 
 
388 aa  318  9e-86  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3638  pH-dependent sodium/proton antiporter  47.48 
 
 
388 aa  318  9e-86  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0868  pH-dependent sodium/proton antiporter  44.85 
 
 
391 aa  318  1e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.128339 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0017  pH-dependent sodium/proton antiporter  47.75 
 
 
388 aa  318  1e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.453914  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3578  Na+/H+ antiporter NhaA  47.48 
 
 
388 aa  315  7e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00256476  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0397  pH-dependent sodium/proton antiporter  46.67 
 
 
393 aa  315  7e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.311183  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0406  pH-dependent sodium/proton antiporter  46.67 
 
 
420 aa  315  8e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.364642  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2582  Na+/H+ antiporter NhaA  47.7 
 
 
393 aa  313  3.9999999999999997e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2771  Na+/H+ antiporter NhaA  43.06 
 
 
450 aa  312  5.999999999999999e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00813597  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2307  Na+/H+ antiporter NhaA  45.32 
 
 
455 aa  312  5.999999999999999e-84  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4283  pH-dependent sodium/proton antiporter  44.44 
 
 
391 aa  312  7.999999999999999e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3464  pH-dependent sodium/proton antiporter  47.35 
 
 
394 aa  311  1e-83  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000517181  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3592  pH-dependent sodium/proton antiporter  47.35 
 
 
394 aa  311  1e-83  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000151252  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2570  Na+/H+ antiporter NhaA  43.19 
 
 
472 aa  311  1e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2277  pH-dependent sodium/proton antiporter  46.65 
 
 
397 aa  311  2e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00329368  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0795  pH-dependent sodium/proton antiporter  47.09 
 
 
394 aa  311  2e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000129218  normal  0.24433 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0580  pH-dependent sodium/proton antiporter  47.24 
 
 
391 aa  310  4e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0119541  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2616  Na+/H+ antiporter NhaA  46.45 
 
 
391 aa  308  8e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.536675  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0583  pH-dependent sodium/proton antiporter  46.02 
 
 
392 aa  308  9e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0187832  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2205  Na+/H+ antiporter NhaA  43.19 
 
 
436 aa  306  4.0000000000000004e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.29594  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1390  Na+/H+ antiporter NhaA  42.97 
 
 
391 aa  306  5.0000000000000004e-82  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1861  Na+/H+ antiporter NhaA  43.19 
 
 
451 aa  306  5.0000000000000004e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.995313  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1896  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.38 
 
 
400 aa  303  4.0000000000000003e-81  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1488  Na+/H+ antiporter  44.2 
 
 
386 aa  303  5.000000000000001e-81  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0694  pH-dependent sodium/proton antiporter  44.59 
 
 
398 aa  302  7.000000000000001e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000263731  hitchhiker  0.00301245 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1390  Na+/H+ antiporter NhaA  43.96 
 
 
396 aa  302  8.000000000000001e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.168803  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1025  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.78 
 
 
391 aa  301  9e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0544  pH-dependent sodium/proton antiporter  45.64 
 
 
401 aa  300  2e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4598  Na+/H+ antiporter NhaA  45.32 
 
 
408 aa  301  2e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1168  pH-dependent sodium/proton antiporter  43.67 
 
 
397 aa  300  4e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1132  pH-dependent sodium/proton antiporter  43.67 
 
 
397 aa  299  5e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.422688  normal  0.012742 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1234  pH-dependent sodium/proton antiporter  44.94 
 
 
395 aa  298  1e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.400812  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5991  pH-dependent sodium/proton antiporter  44.47 
 
 
399 aa  297  2e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.688009  normal  0.157669 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3264  sodium-proton antiporter NhaA  45 
 
 
382 aa  297  2e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000713954 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4069  Na+/H+ antiporter NhaA  42.13 
 
 
455 aa  297  2e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.16071 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4210  pH-dependent sodium/proton antiporter  46 
 
 
392 aa  296  3e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.400142  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1233  pH-dependent sodium/proton antiporter  46.67 
 
 
382 aa  297  3e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000535639  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00573  Na+/H+ antiporter, NhaA  43.04 
 
 
424 aa  296  6e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1756  Na+/H+ antiporter NhaA  40.77 
 
 
394 aa  295  1e-78  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02646  pH-dependent sodium/proton antiporter  43.99 
 
 
391 aa  293  3e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0065  Na+/H+ antiporter NhaA  45.36 
 
 
402 aa  293  5e-78  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000634714  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1042  pH-dependent sodium/proton antiporter  43.81 
 
 
391 aa  293  5e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.12391  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4662  Na+/H+ antiporter NhaA  41.37 
 
 
438 aa  292  8e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000933832 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2026  pH-dependent sodium/proton antiporter  45.38 
 
 
382 aa  292  9e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.470958  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3851  pH-dependent sodium/proton antiporter  45.76 
 
 
398 aa  291  1e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.79655  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003767  Na+/H+ antiporter NhaA type  43.85 
 
 
383 aa  291  1e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4533  sodium-proton antiporter NhaA  45.25 
 
 
392 aa  291  2e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2989  Na+/H+ antiporter NhaA  41.82 
 
 
460 aa  290  2e-77  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0693  pH-dependent sodium/proton antiporter  43.15 
 
 
396 aa  290  3e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.11155  normal  0.550501 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3657  pH-dependent sodium/proton antiporter  45.17 
 
 
398 aa  289  6e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.457018  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3699  pH-dependent sodium/proton antiporter  43.01 
 
 
397 aa  289  6e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.262179 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0407  Na+/H+ antiporter NhaA  44.21 
 
 
425 aa  289  8e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3347  pH-dependent sodium/proton antiporter  49.68 
 
 
407 aa  288  9e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0963  pH-dependent sodium/proton antiporter  43.7 
 
 
395 aa  288  1e-76  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000193238  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2666  Na+/H+ antiporter NhaA  43.59 
 
 
445 aa  286  4e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.657461  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4197  Na+/H+ antiporter NhaA  42.3 
 
 
401 aa  286  5e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.917396  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1136  pH-dependent sodium/proton antiporter  44.47 
 
 
399 aa  285  8e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0028  Na+/H+ antiporter NhaA  39.47 
 
 
396 aa  284  2.0000000000000002e-75  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2645  Na+/H+ antiporter NhaA  45.89 
 
 
390 aa  283  5.000000000000001e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0585  Na+/H+ antiporter NhaA  40.79 
 
 
423 aa  283  5.000000000000001e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1826  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.1 
 
 
389 aa  282  6.000000000000001e-75  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.243343  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3610  Na+/H+ antiporter NhaA  46.55 
 
 
413 aa  281  1e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.150292  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0128  Na+/H+ antiporter NhaA  44.36 
 
 
399 aa  281  2e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.124586  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5944  pH-dependent sodium/proton antiporter  47.19 
 
 
396 aa  280  3e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.195827  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3287  Na+/H+ antiporter NhaA  45.99 
 
 
413 aa  280  3e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1762  Na(+)/H(+) antiporter 1  38.57 
 
 
464 aa  280  3e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1645  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.52 
 
 
389 aa  280  3e-74  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>