233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_4283 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1132  pH-dependent sodium/proton antiporter  94.87 
 
 		 397 aa  682    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.422688  normal  0.012742 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4283  pH-dependent sodium/proton antiporter  100 
 
 		 391 aa  756    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1168  pH-dependent sodium/proton antiporter  95.64 
 
 		 397 aa  686    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1234  pH-dependent sodium/proton antiporter  86.05 
 
 		 395 aa  623  1e-177  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.400812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0868  pH-dependent sodium/proton antiporter  61.11 
 
 		 391 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.128339 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1390  Na+/H+ antiporter NhaA  59.58 
 
 		 396 aa  436  1e-121  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.168803  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1336  pH-dependent sodium/proton antiporter  58.99 
 
 		 389 aa  434  1e-120  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1147  pH-dependent sodium/proton antiporter  58.47 
 
 		 391 aa  432  1e-120  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3124  pH-dependent sodium/proton antiporter  58.2 
 
 		 389 aa  429  1e-119  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.646901  normal  0.440513 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3264  sodium-proton antiporter NhaA  56.96 
 
 		 382 aa  428  1e-119  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000713954 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2941  pH-dependent sodium/proton antiporter  58.47 
 
 		 394 aa  431  1e-119  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.135486  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2277  pH-dependent sodium/proton antiporter  58.23 
 
 		 397 aa  430  1e-119  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00329368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1233  pH-dependent sodium/proton antiporter  58.2 
 
 		 389 aa  429  1e-119  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1189  pH-dependent sodium/proton antiporter  58.2 
 
 		 389 aa  430  1e-119  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.685573  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1266  pH-dependent sodium/proton antiporter  58.2 
 
 		 389 aa  429  1e-119  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2860  pH-dependent sodium/proton antiporter  59.26 
 
 		 389 aa  425  1e-118  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.611153  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1390  pH-dependent sodium/proton antiporter  57.41 
 
 		 391 aa  425  1e-118  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000519432  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2942  pH-dependent sodium/proton antiporter  59.26 
 
 		 389 aa  424  1e-117  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0919251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3038  pH-dependent sodium/proton antiporter  58.73 
 
 		 389 aa  424  1e-117  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.474949 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1042  pH-dependent sodium/proton antiporter  58.47 
 
 		 391 aa  418  1e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.12391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0842  pH-dependent sodium/proton antiporter  56.17 
 
 		 390 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00573  Na+/H+ antiporter, NhaA  55.01 
 
 		 424 aa  414  9.999999999999999e-116  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4197  Na+/H+ antiporter NhaA  54.62 
 
 		 401 aa  409  1e-113  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.917396  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1136  pH-dependent sodium/proton antiporter  57.94 
 
 		 399 aa  410  1e-113  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1390  Na+/H+ antiporter NhaA  52.17 
 
 		 391 aa  395  1e-109  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02646  pH-dependent sodium/proton antiporter  53.9 
 
 		 391 aa  396  1e-109  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003767  Na+/H+ antiporter NhaA type  54.74 
 
 		 383 aa  394  1e-108  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0128  Na+/H+ antiporter NhaA  58.25 
 
 		 399 aa  392  1e-108  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.124586  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3699  pH-dependent sodium/proton antiporter  54.01 
 
 		 397 aa  392  1e-108  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.262179 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1025  pH-dependent sodium/proton antiporter  57.14 
 
 		 391 aa  394  1e-108  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0732  pH-dependent sodium/proton antiporter  50 
 
 		 409 aa  390  1e-107  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0963  pH-dependent sodium/proton antiporter  53.09 
 
 		 395 aa  388  1e-107  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000193238  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1756  Na+/H+ antiporter NhaA  52.48 
 
 		 394 aa  389  1e-107  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4533  sodium-proton antiporter NhaA  57.78 
 
 		 392 aa  386  1e-106  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0795  pH-dependent sodium/proton antiporter  56.32 
 
 		 394 aa  385  1e-106  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000129218  normal  0.24433 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3464  pH-dependent sodium/proton antiporter  55.38 
 
 		 394 aa  385  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000517181  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0693  pH-dependent sodium/proton antiporter  56.46 
 
 		 396 aa  387  1e-106  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.11155  normal  0.550501 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0694  pH-dependent sodium/proton antiporter  54.9 
 
 		 398 aa  386  1e-106  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000263731  hitchhiker  0.00301245 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3592  pH-dependent sodium/proton antiporter  55.38 
 
 		 394 aa  385  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000151252  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4210  pH-dependent sodium/proton antiporter  55.96 
 
 		 392 aa  383  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.400142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1896  pH-dependent sodium/proton antiporter  49.87 
 
 		 400 aa  383  1e-105  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1233  pH-dependent sodium/proton antiporter  53.95 
 
 		 382 aa  382  1e-105  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000535639  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2026  pH-dependent sodium/proton antiporter  52.65 
 
 		 382 aa  378  1e-104  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.470958  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0044  pH-dependent sodium/proton antiporter  55.88 
 
 		 388 aa  378  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1488  Na+/H+ antiporter  53.03 
 
 		 386 aa  377  1e-103  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0043  pH-dependent sodium/proton antiporter  55.88 
 
 		 388 aa  378  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.62168  normal  0.149849 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0583  pH-dependent sodium/proton antiporter  52.77 
 
 		 392 aa  377  1e-103  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0187832  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0044  pH-dependent sodium/proton antiporter  55.88 
 
 		 388 aa  378  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0042  pH-dependent sodium/proton antiporter  55.88 
 
 		 388 aa  378  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.975088  hitchhiker  0.00613874 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0043  pH-dependent sodium/proton antiporter  55.88 
 
 		 388 aa  378  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2778  pH-dependent sodium/proton antiporter  57.41 
 
 		 398 aa  374  1e-102  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3657  pH-dependent sodium/proton antiporter  54.5 
 
 		 398 aa  373  1e-102  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.457018  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00018  pH-dependent sodium/proton antiporter  56.42 
 
 		 388 aa  370  1e-101  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.89758  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0016  pH-dependent sodium/proton antiporter  56.42 
 
 		 388 aa  370  1e-101  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000467126  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0017  pH-dependent sodium/proton antiporter  56.42 
 
 		 388 aa  370  1e-101  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.453914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0019  pH-dependent sodium/proton antiporter  56.42 
 
 		 388 aa  370  1e-101  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0237343  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2582  Na+/H+ antiporter NhaA  54.17 
 
 		 393 aa  371  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0017  pH-dependent sodium/proton antiporter  56.15 
 
 		 388 aa  370  1e-101  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3638  pH-dependent sodium/proton antiporter  56.15 
 
 		 388 aa  370  1e-101  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5991  pH-dependent sodium/proton antiporter  54.52 
 
 		 399 aa  368  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.688009  normal  0.157669 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0019  pH-dependent sodium/proton antiporter  56.15 
 
 		 388 aa  370  1e-101  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.046286  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7296  pH-dependent sodium/proton antiporter  53.42 
 
 		 399 aa  369  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.059957  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00019  hypothetical protein  56.42 
 
 		 388 aa  370  1e-101  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.892896  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3578  Na+/H+ antiporter NhaA  56.15 
 
 		 388 aa  367  1e-100  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00256476  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3851  pH-dependent sodium/proton antiporter  52.86 
 
 		 398 aa  367  1e-100  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.79655  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0369  pH-dependent sodium/proton antiporter  56.25 
 
 		 399 aa  364  1e-99  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0301682  hitchhiker  0.000785162 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0580  pH-dependent sodium/proton antiporter  54.62 
 
 		 391 aa  361  1e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0119541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0028  Na+/H+ antiporter NhaA  46.68 
 
 		 396 aa  360  2e-98  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1838  pH-dependent sodium/proton antiporter  55.38 
 
 		 400 aa  358  7e-98  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0544  pH-dependent sodium/proton antiporter  53.44 
 
 		 401 aa  357  1.9999999999999998e-97  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4598  Na+/H+ antiporter NhaA  55.03 
 
 		 408 aa  356  2.9999999999999997e-97  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2123  pH-dependent sodium/proton antiporter  55.11 
 
 		 400 aa  356  3.9999999999999996e-97  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0407  Na+/H+ antiporter NhaA  51.29 
 
 		 425 aa  354  1e-96  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6044  pH-dependent sodium/proton antiporter  55.26 
 
 		 400 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.227636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0364  pH-dependent sodium/proton antiporter  55.15 
 
 		 391 aa  348  1e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2616  Na+/H+ antiporter NhaA  51.8 
 
 		 391 aa  348  1e-94  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.536675  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3347  pH-dependent sodium/proton antiporter  55.11 
 
 		 407 aa  347  3e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5174  sodium-proton antiporter NhaA  55.41 
 
 		 391 aa  345  6e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1646  Na+/H+ antiporter NhaA  48.5 
 
 		 382 aa  343  4e-93  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1827  Na+/H+ antiporter NhaA  48.91 
 
 		 382 aa  342  5.999999999999999e-93  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0600  Na+/H+ antiporter NhaA  51.9 
 
 		 424 aa  340  2e-92  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.171137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2016  Na+/H+ antiporter NhaA  48.5 
 
 		 382 aa  339  5e-92  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1489  pH-dependent sodium/proton antiporter  49.3 
 
 		 384 aa  338  9.999999999999999e-92  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3287  Na+/H+ antiporter NhaA  53.06 
 
 		 413 aa  335  9e-91  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3610  Na+/H+ antiporter NhaA  52.73 
 
 		 413 aa  333  2e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.150292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0515  pH-dependent sodium/proton antiporter  50.13 
 
 		 393 aa  333  3e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2771  Na+/H+ antiporter NhaA  46.3 
 
 		 450 aa  333  4e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00813597  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1826  pH-dependent sodium/proton antiporter  44.96 
 
 		 389 aa  328  1.0000000000000001e-88  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.243343  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0397  pH-dependent sodium/proton antiporter  50.64 
 
 		 393 aa  328  1.0000000000000001e-88  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.311183  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0406  pH-dependent sodium/proton antiporter  50.64 
 
 		 420 aa  328  1.0000000000000001e-88  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.364642  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0343  Na+/H+ antiporter NhaA  46.67 
 
 		 390 aa  327  3e-88  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00697449  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1645  pH-dependent sodium/proton antiporter  44.69 
 
 		 389 aa  325  6e-88  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2015  pH-dependent sodium/proton antiporter  44.69 
 
 		 389 aa  326  6e-88  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3089  Na+/H+ antiporter NhaA  46.21 
 
 		 406 aa  320  1.9999999999999998e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.761361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2336  Na+/H+ antiporter NhaA  51 
 
 		 403 aa  318  1e-85  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.000768129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3487  Na+/H+ antiporter NhaA  53.39 
 
 		 395 aa  317  3e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.16157 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4069  Na+/H+ antiporter NhaA  44.19 
 
 		 455 aa  315  9.999999999999999e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.16071 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1928  Na+/H+ antiporter NhaA  54.21 
 
 		 376 aa  315  9.999999999999999e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4405  Na+/H+ antiporter NhaA  44.44 
 
 		 408 aa  314  1.9999999999999998e-84  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2448  pH-dependent sodium/proton antiporter  48.28 
 
 		 382 aa  313  3.9999999999999997e-84  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>