231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0840 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0840  Na+/H+ antiporter NhaA  100 
 
 
381 aa  746    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1876  Na+/H+ antiporter  62.67 
 
 
387 aa  468  1.0000000000000001e-131  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00181634 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0688  Na+/H+ antiporter NhaA  58.75 
 
 
389 aa  427  1e-118  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3135  Na+/H+ antiporter NhaA  59.56 
 
 
398 aa  415  9.999999999999999e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3022  Na+/H+ antiporter NhaA  51.32 
 
 
395 aa  353  2e-96  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.396021  normal  0.0264038 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3089  Na+/H+ antiporter NhaA  50 
 
 
406 aa  342  4e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.761361  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6194  Na+/H+ antiporter NhaA  48.02 
 
 
379 aa  330  2e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.219672 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4405  Na+/H+ antiporter NhaA  49.35 
 
 
408 aa  322  9.000000000000001e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2771  Na+/H+ antiporter NhaA  41.76 
 
 
450 aa  305  7e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00813597  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2307  Na+/H+ antiporter NhaA  41.47 
 
 
455 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1390  pH-dependent sodium/proton antiporter  43.33 
 
 
391 aa  303  5.000000000000001e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000519432  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02646  pH-dependent sodium/proton antiporter  45.26 
 
 
391 aa  303  5.000000000000001e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4210  pH-dependent sodium/proton antiporter  46.05 
 
 
392 aa  301  9e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.400142  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1189  pH-dependent sodium/proton antiporter  44.96 
 
 
389 aa  300  3e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.685573  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1233  pH-dependent sodium/proton antiporter  44.96 
 
 
389 aa  299  5e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3124  pH-dependent sodium/proton antiporter  44.96 
 
 
389 aa  299  5e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.646901  normal  0.440513 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1266  pH-dependent sodium/proton antiporter  44.96 
 
 
389 aa  299  5e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4533  sodium-proton antiporter NhaA  45.8 
 
 
392 aa  298  8e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2026  pH-dependent sodium/proton antiporter  45.19 
 
 
382 aa  298  1e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.470958  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1147  pH-dependent sodium/proton antiporter  45.22 
 
 
391 aa  298  1e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0842  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.56 
 
 
390 aa  295  1e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003767  Na+/H+ antiporter NhaA type  43.86 
 
 
383 aa  295  1e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1233  pH-dependent sodium/proton antiporter  44.36 
 
 
382 aa  294  2e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000535639  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1784  Na+/H+ antiporter NhaA  41.69 
 
 
444 aa  293  4e-78  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2941  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.86 
 
 
394 aa  293  4e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.135486  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1336  pH-dependent sodium/proton antiporter  43.93 
 
 
389 aa  292  7e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2616  Na+/H+ antiporter NhaA  44.3 
 
 
391 aa  292  7e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.536675  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0065  Na+/H+ antiporter NhaA  44.87 
 
 
402 aa  291  1e-77  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000634714  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1390  Na+/H+ antiporter NhaA  42.97 
 
 
391 aa  290  2e-77  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3038  pH-dependent sodium/proton antiporter  43.93 
 
 
389 aa  291  2e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.474949 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2942  pH-dependent sodium/proton antiporter  44.19 
 
 
389 aa  289  5.0000000000000004e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0919251  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1025  pH-dependent sodium/proton antiporter  43.93 
 
 
391 aa  289  6e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2860  pH-dependent sodium/proton antiporter  43.93 
 
 
389 aa  288  1e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.611153  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0868  pH-dependent sodium/proton antiporter  43.23 
 
 
391 aa  286  4e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.128339 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0042  pH-dependent sodium/proton antiporter  43.16 
 
 
388 aa  286  5e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.975088  hitchhiker  0.00613874 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0043  pH-dependent sodium/proton antiporter  43.16 
 
 
388 aa  286  5e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.62168  normal  0.149849 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0044  pH-dependent sodium/proton antiporter  43.16 
 
 
388 aa  286  5e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0043  pH-dependent sodium/proton antiporter  43.16 
 
 
388 aa  286  5e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0044  pH-dependent sodium/proton antiporter  43.16 
 
 
388 aa  286  5e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0515  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.63 
 
 
393 aa  285  8e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1827  Na+/H+ antiporter NhaA  44.06 
 
 
382 aa  285  1.0000000000000001e-75  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2016  Na+/H+ antiporter NhaA  45.01 
 
 
382 aa  283  4.0000000000000003e-75  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1646  Na+/H+ antiporter NhaA  44.09 
 
 
382 aa  282  8.000000000000001e-75  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00018  pH-dependent sodium/proton antiporter  43.26 
 
 
388 aa  281  9e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.89758  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3638  pH-dependent sodium/proton antiporter  43.26 
 
 
388 aa  281  9e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0017  pH-dependent sodium/proton antiporter  43.26 
 
 
388 aa  281  9e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00019  hypothetical protein  43.26 
 
 
388 aa  281  9e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.892896  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0016  pH-dependent sodium/proton antiporter  43.26 
 
 
388 aa  281  9e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000467126  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0019  pH-dependent sodium/proton antiporter  43.26 
 
 
388 aa  281  9e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.046286  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0017  pH-dependent sodium/proton antiporter  43.26 
 
 
388 aa  282  9e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.453914  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0019  pH-dependent sodium/proton antiporter  43.26 
 
 
388 aa  281  9e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0237343  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4598  Na+/H+ antiporter NhaA  42.18 
 
 
408 aa  281  1e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3578  Na+/H+ antiporter NhaA  43.01 
 
 
388 aa  279  7e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00256476  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4069  Na+/H+ antiporter NhaA  39.91 
 
 
455 aa  276  3e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.16071 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1762  Na(+)/H(+) antiporter 1  39.49 
 
 
464 aa  276  4e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0583  pH-dependent sodium/proton antiporter  43.59 
 
 
392 aa  276  6e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0187832  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0580  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.97 
 
 
391 aa  275  6e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0119541  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00573  Na+/H+ antiporter, NhaA  42.97 
 
 
424 aa  276  6e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1488  Na+/H+ antiporter  42.08 
 
 
386 aa  275  1.0000000000000001e-72  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2205  Na+/H+ antiporter NhaA  39.95 
 
 
436 aa  274  1.0000000000000001e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.29594  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1136  pH-dependent sodium/proton antiporter  44.42 
 
 
399 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1861  Na+/H+ antiporter NhaA  39.49 
 
 
451 aa  274  2.0000000000000002e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.995313  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0732  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.67 
 
 
409 aa  273  3e-72  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1042  pH-dependent sodium/proton antiporter  43.93 
 
 
391 aa  272  6e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.12391  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3699  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.71 
 
 
397 aa  271  2e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.262179 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3851  pH-dependent sodium/proton antiporter  46.41 
 
 
398 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.79655  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2666  Na+/H+ antiporter NhaA  40.38 
 
 
445 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.657461  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2570  Na+/H+ antiporter NhaA  38.23 
 
 
472 aa  270  2.9999999999999997e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4662  Na+/H+ antiporter NhaA  40.6 
 
 
438 aa  270  5e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000933832 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1756  Na+/H+ antiporter NhaA  41.78 
 
 
394 aa  269  5.9999999999999995e-71  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3657  pH-dependent sodium/proton antiporter  46.13 
 
 
398 aa  268  8.999999999999999e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.457018  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0544  pH-dependent sodium/proton antiporter  45.59 
 
 
401 aa  268  8.999999999999999e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0364  pH-dependent sodium/proton antiporter  44.14 
 
 
391 aa  268  1e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3347  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.14 
 
 
407 aa  267  2e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1390  Na+/H+ antiporter NhaA  40.79 
 
 
396 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.168803  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2277  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.8 
 
 
397 aa  267  2.9999999999999995e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00329368  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0407  Na+/H+ antiporter NhaA  40.62 
 
 
425 aa  266  4e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0397  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.78 
 
 
393 aa  265  1e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.311183  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0406  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.78 
 
 
420 aa  265  1e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.364642  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2123  pH-dependent sodium/proton antiporter  44.79 
 
 
400 aa  264  2e-69  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0369  pH-dependent sodium/proton antiporter  46.59 
 
 
399 aa  264  2e-69  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0301682  hitchhiker  0.000785162 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7296  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.11 
 
 
399 aa  263  3e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.059957  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1838  pH-dependent sodium/proton antiporter  44.79 
 
 
400 aa  263  3e-69  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2456  Na+/H+ antiporter  42.18 
 
 
438 aa  263  3e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00270708  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0694  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.24 
 
 
398 aa  263  3e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000263731  hitchhiker  0.00301245 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3592  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.39 
 
 
394 aa  263  4.999999999999999e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000151252  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5174  sodium-proton antiporter NhaA  43.32 
 
 
391 aa  262  8e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5991  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.27 
 
 
399 aa  262  8e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.688009  normal  0.157669 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3464  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.39 
 
 
394 aa  262  8.999999999999999e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000517181  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7108  pH-dependent sodium/proton antiporter  44.92 
 
 
396 aa  260  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.937929  normal  0.0534187 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0795  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.65 
 
 
394 aa  261  2e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000129218  normal  0.24433 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3610  Na+/H+ antiporter NhaA  42.55 
 
 
413 aa  261  2e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.150292  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5944  pH-dependent sodium/proton antiporter  44.92 
 
 
396 aa  260  3e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.195827  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3287  Na+/H+ antiporter NhaA  42.28 
 
 
413 aa  259  6e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2430  pH-dependent sodium/proton antiporter  43.01 
 
 
393 aa  256  5e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0585  Na+/H+ antiporter NhaA  38.17 
 
 
423 aa  256  6e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1896  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.85 
 
 
400 aa  256  6e-67  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1480  Na+/H+ antiporter NhaA  37.05 
 
 
450 aa  256  7e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.627445  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6044  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.07 
 
 
400 aa  255  7e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.227636  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2582  Na+/H+ antiporter NhaA  40.84 
 
 
393 aa  255  8e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>