233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7296 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_5991  pH-dependent sodium/proton antiporter  89.76 
 
 		 399 aa  640    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.688009  normal  0.157669 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7296  pH-dependent sodium/proton antiporter  100 
 
 		 399 aa  764    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.059957  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6044  pH-dependent sodium/proton antiporter  72.4 
 
 		 400 aa  490  1e-137  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.227636  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3347  pH-dependent sodium/proton antiporter  71.12 
 
 		 407 aa  483  1e-135  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3610  Na+/H+ antiporter NhaA  67.77 
 
 		 413 aa  461  1e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.150292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3287  Na+/H+ antiporter NhaA  68.02 
 
 		 413 aa  461  9.999999999999999e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0515  pH-dependent sodium/proton antiporter  62.86 
 
 		 393 aa  450  1e-125  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2616  Na+/H+ antiporter NhaA  61.52 
 
 		 391 aa  439  9.999999999999999e-123  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.536675  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0397  pH-dependent sodium/proton antiporter  62.3 
 
 		 393 aa  437  1e-121  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.311183  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4502  Na+/H+ antiporter NhaA  68.57 
 
 		 400 aa  435  1e-121  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3487  Na+/H+ antiporter NhaA  69.05 
 
 		 395 aa  435  1e-121  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.16157 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0406  pH-dependent sodium/proton antiporter  62.3 
 
 		 420 aa  436  1e-121  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.364642  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0407  Na+/H+ antiporter NhaA  59.22 
 
 		 425 aa  431  1e-120  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4210  pH-dependent sodium/proton antiporter  61.77 
 
 		 392 aa  430  1e-119  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.400142  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4533  sodium-proton antiporter NhaA  59.75 
 
 		 392 aa  420  1e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4598  Na+/H+ antiporter NhaA  64.46 
 
 		 408 aa  418  1e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0600  Na+/H+ antiporter NhaA  57.89 
 
 		 424 aa  396  1e-109  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.171137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0364  pH-dependent sodium/proton antiporter  59.54 
 
 		 391 aa  392  1e-108  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5174  sodium-proton antiporter NhaA  60.56 
 
 		 391 aa  388  1e-106  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1390  pH-dependent sodium/proton antiporter  52.74 
 
 		 391 aa  380  1e-104  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000519432  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02646  pH-dependent sodium/proton antiporter  50.52 
 
 		 391 aa  375  1e-103  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003767  Na+/H+ antiporter NhaA type  51.95 
 
 		 383 aa  377  1e-103  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2026  pH-dependent sodium/proton antiporter  52 
 
 		 382 aa  369  1e-101  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.470958  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5944  pH-dependent sodium/proton antiporter  61.4 
 
 		 396 aa  371  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.195827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1928  Na+/H+ antiporter NhaA  63.86 
 
 		 376 aa  370  1e-101  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0128  Na+/H+ antiporter NhaA  57.89 
 
 		 399 aa  366  1e-100  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.124586  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7108  pH-dependent sodium/proton antiporter  60.88 
 
 		 396 aa  366  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.937929  normal  0.0534187 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2430  pH-dependent sodium/proton antiporter  58.85 
 
 		 393 aa  368  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1390  Na+/H+ antiporter NhaA  52.7 
 
 		 396 aa  364  2e-99  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.168803  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1233  pH-dependent sodium/proton antiporter  51.76 
 
 		 382 aa  362  5.0000000000000005e-99  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000535639  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0842  pH-dependent sodium/proton antiporter  50.91 
 
 		 390 aa  362  7.0000000000000005e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3264  sodium-proton antiporter NhaA  52.62 
 
 		 382 aa  362  8e-99  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000713954 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2941  pH-dependent sodium/proton antiporter  50.76 
 
 		 394 aa  361  1e-98  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.135486  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4283  pH-dependent sodium/proton antiporter  53.74 
 
 		 391 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1234  pH-dependent sodium/proton antiporter  55.22 
 
 		 395 aa  349  4e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.400812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0732  pH-dependent sodium/proton antiporter  48.48 
 
 		 409 aa  348  7e-95  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1189  pH-dependent sodium/proton antiporter  51.43 
 
 		 389 aa  347  1e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.685573  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1042  pH-dependent sodium/proton antiporter  51.43 
 
 		 391 aa  347  2e-94  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.12391  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3124  pH-dependent sodium/proton antiporter  51.43 
 
 		 389 aa  347  3e-94  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.646901  normal  0.440513 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1233  pH-dependent sodium/proton antiporter  51.43 
 
 		 389 aa  347  3e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0693  pH-dependent sodium/proton antiporter  51.52 
 
 		 396 aa  347  3e-94  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.11155  normal  0.550501 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1266  pH-dependent sodium/proton antiporter  51.43 
 
 		 389 aa  346  4e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1336  pH-dependent sodium/proton antiporter  50.39 
 
 		 389 aa  343  4e-93  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3038  pH-dependent sodium/proton antiporter  50.91 
 
 		 389 aa  342  5e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.474949 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1132  pH-dependent sodium/proton antiporter  54.02 
 
 		 397 aa  341  1e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.422688  normal  0.012742 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2277  pH-dependent sodium/proton antiporter  48.99 
 
 		 397 aa  342  1e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00329368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1168  pH-dependent sodium/proton antiporter  54.02 
 
 		 397 aa  341  1e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1147  pH-dependent sodium/proton antiporter  50.13 
 
 		 391 aa  340  2e-92  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1390  Na+/H+ antiporter NhaA  46.37 
 
 		 391 aa  340  4e-92  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0043  pH-dependent sodium/proton antiporter  56.48 
 
 		 388 aa  340  4e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.62168  normal  0.149849 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0868  pH-dependent sodium/proton antiporter  49.23 
 
 		 391 aa  339  4e-92  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.128339 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0043  pH-dependent sodium/proton antiporter  56.48 
 
 		 388 aa  340  4e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0042  pH-dependent sodium/proton antiporter  56.48 
 
 		 388 aa  340  4e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.975088  hitchhiker  0.00613874 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0044  pH-dependent sodium/proton antiporter  56.48 
 
 		 388 aa  340  4e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0044  pH-dependent sodium/proton antiporter  56.48 
 
 		 388 aa  340  4e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2860  pH-dependent sodium/proton antiporter  50.39 
 
 		 389 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.611153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2942  pH-dependent sodium/proton antiporter  50.13 
 
 		 389 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0919251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00573  Na+/H+ antiporter, NhaA  48.83 
 
 		 424 aa  337  1.9999999999999998e-91  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1896  pH-dependent sodium/proton antiporter  47.09 
 
 		 400 aa  337  2.9999999999999997e-91  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0369  pH-dependent sodium/proton antiporter  54.19 
 
 		 399 aa  337  2.9999999999999997e-91  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0301682  hitchhiker  0.000785162 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1025  pH-dependent sodium/proton antiporter  52.08 
 
 		 391 aa  336  5e-91  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4197  Na+/H+ antiporter NhaA  48.98 
 
 		 401 aa  334  1e-90  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.917396  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1838  pH-dependent sodium/proton antiporter  51.41 
 
 		 400 aa  331  2e-89  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2582  Na+/H+ antiporter NhaA  51.92 
 
 		 393 aa  331  2e-89  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2123  pH-dependent sodium/proton antiporter  51.41 
 
 		 400 aa  330  2e-89  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1136  pH-dependent sodium/proton antiporter  50.79 
 
 		 399 aa  330  4e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00018  pH-dependent sodium/proton antiporter  51.71 
 
 		 388 aa  327  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.89758  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0016  pH-dependent sodium/proton antiporter  51.71 
 
 		 388 aa  327  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000467126  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0017  pH-dependent sodium/proton antiporter  51.71 
 
 		 388 aa  327  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.453914  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3638  pH-dependent sodium/proton antiporter  51.71 
 
 		 388 aa  327  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0019  pH-dependent sodium/proton antiporter  51.71 
 
 		 388 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.046286  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00019  hypothetical protein  51.71 
 
 		 388 aa  327  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.892896  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0019  pH-dependent sodium/proton antiporter  51.71 
 
 		 388 aa  327  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0237343  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0017  pH-dependent sodium/proton antiporter  51.71 
 
 		 388 aa  327  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3578  Na+/H+ antiporter NhaA  51.71 
 
 		 388 aa  325  8.000000000000001e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00256476  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2645  Na+/H+ antiporter NhaA  53.93 
 
 		 390 aa  320  3.9999999999999996e-86  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1756  Na+/H+ antiporter NhaA  45.5 
 
 		 394 aa  319  5e-86  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0580  pH-dependent sodium/proton antiporter  51.44 
 
 		 391 aa  318  9e-86  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0119541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3699  pH-dependent sodium/proton antiporter  48.22 
 
 		 397 aa  318  1e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.262179 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2307  Na+/H+ antiporter NhaA  45.12 
 
 		 455 aa  318  1e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1488  Na+/H+ antiporter  45.26 
 
 		 386 aa  315  6e-85  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0694  pH-dependent sodium/proton antiporter  48.55 
 
 		 398 aa  315  9.999999999999999e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000263731  hitchhiker  0.00301245 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3657  pH-dependent sodium/proton antiporter  48.65 
 
 		 398 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.457018  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3089  Na+/H+ antiporter NhaA  45.13 
 
 		 406 aa  312  5.999999999999999e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.761361  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3592  pH-dependent sodium/proton antiporter  52.01 
 
 		 394 aa  312  7.999999999999999e-84  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000151252  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3022  Na+/H+ antiporter NhaA  44.64 
 
 		 395 aa  311  1e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.396021  normal  0.0264038 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0583  pH-dependent sodium/proton antiporter  48.06 
 
 		 392 aa  311  1e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0187832  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3464  pH-dependent sodium/proton antiporter  51.03 
 
 		 394 aa  311  1e-83  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000517181  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3851  pH-dependent sodium/proton antiporter  47.03 
 
 		 398 aa  311  1e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.79655  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4405  Na+/H+ antiporter NhaA  46.31 
 
 		 408 aa  311  1e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0795  pH-dependent sodium/proton antiporter  51.7 
 
 		 394 aa  311  1e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000129218  normal  0.24433 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1762  Na(+)/H(+) antiporter 1  42.36 
 
 		 464 aa  308  1.0000000000000001e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0028  Na+/H+ antiporter NhaA  41.79 
 
 		 396 aa  308  1.0000000000000001e-82  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1861  Na+/H+ antiporter NhaA  45.1 
 
 		 451 aa  306  3e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.995313  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2205  Na+/H+ antiporter NhaA  45.29 
 
 		 436 aa  306  4.0000000000000004e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.29594  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1784  Na+/H+ antiporter NhaA  41.69 
 
 		 444 aa  303  3.0000000000000004e-81  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1827  Na+/H+ antiporter NhaA  42.45 
 
 		 382 aa  303  4.0000000000000003e-81  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0544  pH-dependent sodium/proton antiporter  45.61 
 
 		 401 aa  303  4.0000000000000003e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2336  Na+/H+ antiporter NhaA  46.46 
 
 		 403 aa  302  5.000000000000001e-81  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.000768129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1646  Na+/H+ antiporter NhaA  42.71 
 
 		 382 aa  302  6.000000000000001e-81  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>