233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1762 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1762  Na(+)/H(+) antiporter 1  100 
 
 		 464 aa  932    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1784  Na+/H+ antiporter NhaA  49.77 
 
 		 444 aa  439  9.999999999999999e-123  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2307  Na+/H+ antiporter NhaA  47.02 
 
 		 455 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1861  Na+/H+ antiporter NhaA  46.4 
 
 		 451 aa  367  1e-100  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.995313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2771  Na+/H+ antiporter NhaA  46.88 
 
 		 450 aa  367  1e-100  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00813597  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2570  Na+/H+ antiporter NhaA  44.8 
 
 		 472 aa  365  1e-100  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2205  Na+/H+ antiporter NhaA  46.58 
 
 		 436 aa  363  3e-99  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.29594  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4144  Na+/H+ antiporter NhaA  41.23 
 
 		 472 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.375457  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1480  Na+/H+ antiporter NhaA  41.53 
 
 		 450 aa  350  4e-95  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.627445  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0222  Na+/H+ antiporter NhaA  40.58 
 
 		 475 aa  342  8e-93  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2666  Na+/H+ antiporter NhaA  47.96 
 
 		 445 aa  336  3.9999999999999995e-91  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.657461  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4662  Na+/H+ antiporter NhaA  45.02 
 
 		 438 aa  335  1e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000933832 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2456  Na+/H+ antiporter  44.88 
 
 		 438 aa  332  6e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00270708  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4069  Na+/H+ antiporter NhaA  43.25 
 
 		 455 aa  330  2e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.16071 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7296  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.36 
 
 		 399 aa  322  6e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.059957  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2941  pH-dependent sodium/proton antiporter  44.08 
 
 		 394 aa  315  8e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.135486  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2713  pH-dependent sodium/proton antiporter  44.58 
 
 		 430 aa  315  9.999999999999999e-85  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.532059  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5991  pH-dependent sodium/proton antiporter  44.5 
 
 		 399 aa  311  1e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.688009  normal  0.157669 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0043  pH-dependent sodium/proton antiporter  44.58 
 
 		 388 aa  311  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0044  pH-dependent sodium/proton antiporter  44.58 
 
 		 388 aa  311  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0043  pH-dependent sodium/proton antiporter  44.58 
 
 		 388 aa  311  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.62168  normal  0.149849 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0044  pH-dependent sodium/proton antiporter  44.58 
 
 		 388 aa  311  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0042  pH-dependent sodium/proton antiporter  44.58 
 
 		 388 aa  311  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.975088  hitchhiker  0.00613874 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1649  Na+/H+ antiporter NhaA  40.9 
 
 		 468 aa  310  2.9999999999999997e-83  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.349535  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3089  Na+/H+ antiporter NhaA  39.58 
 
 		 406 aa  307  2.0000000000000002e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.761361  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00018  pH-dependent sodium/proton antiporter  44.58 
 
 		 388 aa  306  4.0000000000000004e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.89758  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00019  hypothetical protein  44.58 
 
 		 388 aa  306  4.0000000000000004e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.892896  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0019  pH-dependent sodium/proton antiporter  44.58 
 
 		 388 aa  306  4.0000000000000004e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0237343  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0016  pH-dependent sodium/proton antiporter  44.58 
 
 		 388 aa  306  4.0000000000000004e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000467126  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3638  pH-dependent sodium/proton antiporter  44.58 
 
 		 388 aa  306  4.0000000000000004e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0017  pH-dependent sodium/proton antiporter  44.58 
 
 		 388 aa  306  4.0000000000000004e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0019  pH-dependent sodium/proton antiporter  44.58 
 
 		 388 aa  306  4.0000000000000004e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.046286  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3828  Na+/H+ antiporter NhaA  40.89 
 
 		 457 aa  306  5.0000000000000004e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0371269 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0688  Na+/H+ antiporter NhaA  42.69 
 
 		 389 aa  306  6e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0017  pH-dependent sodium/proton antiporter  44.58 
 
 		 388 aa  306  7e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.453914  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3578  Na+/H+ antiporter NhaA  44.58 
 
 		 388 aa  303  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00256476  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1390  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.84 
 
 		 391 aa  304  3.0000000000000004e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000519432  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07000  Na+/H+ antiporter NhaA  42.65 
 
 		 514 aa  303  5.000000000000001e-81  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.107154  normal  0.0342501 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00573  Na+/H+ antiporter, NhaA  41.94 
 
 		 424 aa  302  8.000000000000001e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0583  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.92 
 
 		 392 aa  301  2e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0187832  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0065  Na+/H+ antiporter NhaA  41.98 
 
 		 402 aa  301  2e-80  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000634714  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1390  Na+/H+ antiporter NhaA  40.47 
 
 		 391 aa  301  2e-80  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3022  Na+/H+ antiporter NhaA  39.72 
 
 		 395 aa  301  2e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.396021  normal  0.0264038 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13458  putative Na+/H+ antiporter  40.55 
 
 		 427 aa  300  3e-80  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.466525  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003767  Na+/H+ antiporter NhaA type  43.36 
 
 		 383 aa  300  3e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2989  Na+/H+ antiporter NhaA  40.13 
 
 		 460 aa  299  6e-80  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02646  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.89 
 
 		 391 aa  297  2e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2568  Na+/H+ antiporter NhaA  43.06 
 
 		 424 aa  296  4e-79  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1042  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.82 
 
 		 391 aa  294  2e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.12391  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2026  pH-dependent sodium/proton antiporter  43.13 
 
 		 382 aa  293  4e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.470958  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05370  NA(+)/H(+) antiporter 1  40 
 
 		 435 aa  293  4e-78  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.765198  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0842  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.52 
 
 		 390 aa  293  4e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3657  pH-dependent sodium/proton antiporter  43.2 
 
 		 398 aa  292  9e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.457018  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1896  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.44 
 
 		 400 aa  292  9e-78  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0214  Na+/H+ antiporter NhaA  43.99 
 
 		 439 aa  292  1e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.83663 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1189  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.75 
 
 		 389 aa  291  2e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.685573  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1025  pH-dependent sodium/proton antiporter  43.69 
 
 		 391 aa  290  3e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1266  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.75 
 
 		 389 aa  290  3e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3124  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.75 
 
 		 389 aa  290  3e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.646901  normal  0.440513 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1233  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.75 
 
 		 389 aa  290  3e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10430  Na+/H+ antiporter NhaA  38.39 
 
 		 444 aa  290  4e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.745936  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3851  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.72 
 
 		 398 aa  290  4e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.79655  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0868  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.13 
 
 		 391 aa  290  4e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.128339 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0893  Na+/H+ antiporter NhaA  38.51 
 
 		 470 aa  289  6e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2582  Na+/H+ antiporter NhaA  42.72 
 
 		 393 aa  289  7e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3059  Na+/H+ antiporter NhaA  38.41 
 
 		 452 aa  289  7e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3135  Na+/H+ antiporter NhaA  39.95 
 
 		 398 aa  289  9e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1336  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.88 
 
 		 389 aa  288  1e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4533  sodium-proton antiporter NhaA  42.79 
 
 		 392 aa  288  1e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0544  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.27 
 
 		 401 aa  288  1e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1756  Na+/H+ antiporter NhaA  42.38 
 
 		 394 aa  288  1e-76  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6362  Na+/H+ antiporter NhaA  39.68 
 
 		 475 aa  288  1e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0407  Na+/H+ antiporter NhaA  39.91 
 
 		 425 aa  286  4e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4283  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.03 
 
 		 391 aa  286  5.999999999999999e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0580  pH-dependent sodium/proton antiporter  44.06 
 
 		 391 aa  286  5.999999999999999e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0119541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2942  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.88 
 
 		 389 aa  286  7e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0919251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0128  Na+/H+ antiporter NhaA  43.97 
 
 		 399 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.124586  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2860  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.88 
 
 		 389 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.611153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3038  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.65 
 
 		 389 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.474949 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3699  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.71 
 
 		 397 aa  284  2.0000000000000002e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.262179 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5554  Na+/H+ antiporter NhaA  39.2 
 
 		 451 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.477487  normal  0.958846 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4405  Na+/H+ antiporter NhaA  38.57 
 
 		 408 aa  284  2.0000000000000002e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1233  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.34 
 
 		 382 aa  285  2.0000000000000002e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000535639  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2616  Na+/H+ antiporter NhaA  41.88 
 
 		 391 aa  284  2.0000000000000002e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.536675  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3958  sodium-proton antiporter, NhaA family  37.39 
 
 		 453 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.529436 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0144  Na+/H+ antiporter NhaA  37.73 
 
 		 446 aa  283  3.0000000000000004e-75  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.174095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0369  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.46 
 
 		 399 aa  283  5.000000000000001e-75  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0301682  hitchhiker  0.000785162 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3464  pH-dependent sodium/proton antiporter  43.8 
 
 		 394 aa  283  6.000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000517181  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1136  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.92 
 
 		 399 aa  282  7.000000000000001e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1868  Na+/H+ antiporter NhaA  37.73 
 
 		 453 aa  282  7.000000000000001e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.138297 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4210  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.4 
 
 		 392 aa  282  9e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.400142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1147  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.26 
 
 		 391 aa  282  9e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3592  pH-dependent sodium/proton antiporter  43.54 
 
 		 394 aa  281  1e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000151252  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6194  Na+/H+ antiporter NhaA  38.34 
 
 		 379 aa  281  2e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.219672 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2277  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.09 
 
 		 397 aa  281  2e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00329368  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0795  pH-dependent sodium/proton antiporter  43.29 
 
 		 394 aa  281  2e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000129218  normal  0.24433 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1132  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.48 
 
 		 397 aa  277  2e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.422688  normal  0.012742 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1838  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.67 
 
 		 400 aa  278  2e-73  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0694  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.94 
 
 		 398 aa  277  3e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000263731  hitchhiker  0.00301245 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1168  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.48 
 
 		 397 aa  277  3e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>