232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0222 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_1480  Na+/H+ antiporter NhaA  69.13 
 
 		 450 aa  643    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.627445  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0222  Na+/H+ antiporter NhaA  100 
 
 		 475 aa  956    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1784  Na+/H+ antiporter NhaA  44.04 
 
 		 444 aa  343  5e-93  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1762  Na(+)/H(+) antiporter 1  40.58 
 
 		 464 aa  331  2e-89  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2771  Na+/H+ antiporter NhaA  41.23 
 
 		 450 aa  325  9e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00813597  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4144  Na+/H+ antiporter NhaA  39.74 
 
 		 472 aa  317  3e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.375457  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2307  Na+/H+ antiporter NhaA  40.55 
 
 		 455 aa  311  1e-83  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1861  Na+/H+ antiporter NhaA  40.7 
 
 		 451 aa  301  2e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.995313  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2205  Na+/H+ antiporter NhaA  40.7 
 
 		 436 aa  301  2e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.29594  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4662  Na+/H+ antiporter NhaA  40.27 
 
 		 438 aa  283  6.000000000000001e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000933832 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2570  Na+/H+ antiporter NhaA  36.62 
 
 		 472 aa  282  1e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4069  Na+/H+ antiporter NhaA  40.14 
 
 		 455 aa  280  3e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.16071 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0893  Na+/H+ antiporter NhaA  38.69 
 
 		 470 aa  279  7e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0214  Na+/H+ antiporter NhaA  42.76 
 
 		 439 aa  276  4e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.83663 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2989  Na+/H+ antiporter NhaA  41.26 
 
 		 460 aa  275  9e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13458  putative Na+/H+ antiporter  38.39 
 
 		 427 aa  275  1.0000000000000001e-72  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.466525  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3022  Na+/H+ antiporter NhaA  36.87 
 
 		 395 aa  268  1e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.396021  normal  0.0264038 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2666  Na+/H+ antiporter NhaA  41.69 
 
 		 445 aa  266  4e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.657461  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2713  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.68 
 
 		 430 aa  263  4e-69  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.532059  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05370  NA(+)/H(+) antiporter 1  35.99 
 
 		 435 aa  258  2e-67  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.765198  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0043  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.69 
 
 		 388 aa  257  3e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.62168  normal  0.149849 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0042  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.69 
 
 		 388 aa  257  3e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.975088  hitchhiker  0.00613874 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0043  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.69 
 
 		 388 aa  257  3e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0044  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.69 
 
 		 388 aa  257  3e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0044  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.69 
 
 		 388 aa  257  3e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1390  Na+/H+ antiporter NhaA  37.79 
 
 		 391 aa  256  4e-67  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00573  Na+/H+ antiporter, NhaA  37.36 
 
 		 424 aa  255  1.0000000000000001e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1649  Na+/H+ antiporter NhaA  36.5 
 
 		 468 aa  254  3e-66  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.349535  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0842  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.94 
 
 		 390 aa  254  4.0000000000000004e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0667  Na+/H+ antiporter NhaA  37.05 
 
 		 617 aa  253  5.000000000000001e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.74457  normal  0.729695 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7296  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.08 
 
 		 399 aa  253  6e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.059957  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3089  Na+/H+ antiporter NhaA  36.83 
 
 		 406 aa  251  2e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.761361  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3059  Na+/H+ antiporter NhaA  37.44 
 
 		 452 aa  249  6e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2456  Na+/H+ antiporter  39.12 
 
 		 438 aa  249  6e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00270708  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3828  Na+/H+ antiporter NhaA  37 
 
 		 457 aa  249  7e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0371269 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4210  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.18 
 
 		 392 aa  248  2e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.400142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2941  pH-dependent sodium/proton antiporter  35.09 
 
 		 394 aa  248  2e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.135486  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1390  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.39 
 
 		 391 aa  247  4e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000519432  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0065  Na+/H+ antiporter NhaA  37.79 
 
 		 402 aa  247  4e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000634714  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1802  cyclic nucleotide-binding protein  36.78 
 
 		 876 aa  247  4e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668239  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3264  sodium-proton antiporter NhaA  38.61 
 
 		 382 aa  246  6e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000713954 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2026  pH-dependent sodium/proton antiporter  35.98 
 
 		 382 aa  246  6.999999999999999e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.470958  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00018  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.83 
 
 		 388 aa  245  9.999999999999999e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.89758  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0016  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.83 
 
 		 388 aa  245  9.999999999999999e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000467126  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0019  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.83 
 
 		 388 aa  245  9.999999999999999e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0237343  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0017  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.83 
 
 		 388 aa  245  9.999999999999999e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.453914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0017  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.83 
 
 		 388 aa  245  9.999999999999999e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0019  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.83 
 
 		 388 aa  245  9.999999999999999e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.046286  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00019  hypothetical protein  38.83 
 
 		 388 aa  245  9.999999999999999e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.892896  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3638  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.83 
 
 		 388 aa  245  9.999999999999999e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1488  Na+/H+ antiporter  37.73 
 
 		 386 aa  244  1.9999999999999999e-63  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0238  Na+/H+ antiporter NhaA  36.56 
 
 		 617 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4533  sodium-proton antiporter NhaA  40.91 
 
 		 392 aa  244  3e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1390  Na+/H+ antiporter NhaA  36.98 
 
 		 396 aa  244  3e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.168803  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02646  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.35 
 
 		 391 aa  243  3.9999999999999997e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5991  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.05 
 
 		 399 aa  243  5e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.688009  normal  0.157669 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003767  Na+/H+ antiporter NhaA type  37.35 
 
 		 383 aa  243  5e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4405  Na+/H+ antiporter NhaA  37.53 
 
 		 408 aa  243  5e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1826  pH-dependent sodium/proton antiporter  34.85 
 
 		 389 aa  243  7e-63  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.243343  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1266  pH-dependent sodium/proton antiporter  36.53 
 
 		 389 aa  243  7e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1189  pH-dependent sodium/proton antiporter  36.3 
 
 		 389 aa  243  7e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.685573  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3578  Na+/H+ antiporter NhaA  38.58 
 
 		 388 aa  243  7.999999999999999e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00256476  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2015  pH-dependent sodium/proton antiporter  34.93 
 
 		 389 aa  242  7.999999999999999e-63  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3124  pH-dependent sodium/proton antiporter  36.3 
 
 		 389 aa  242  1e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.646901  normal  0.440513 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1233  pH-dependent sodium/proton antiporter  36.3 
 
 		 389 aa  242  1e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4950  Na+/H+ antiporter NhaA  34.18 
 
 		 465 aa  241  2e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.29184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1233  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.3 
 
 		 382 aa  240  4e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000535639  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2568  Na+/H+ antiporter NhaA  39.76 
 
 		 424 aa  240  5e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1896  pH-dependent sodium/proton antiporter  35 
 
 		 400 aa  239  8e-62  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0144  Na+/H+ antiporter NhaA  36.54 
 
 		 446 aa  239  9e-62  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.174095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6362  Na+/H+ antiporter NhaA  35.84 
 
 		 475 aa  239  1e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1645  pH-dependent sodium/proton antiporter  34.25 
 
 		 389 aa  238  1e-61  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3135  Na+/H+ antiporter NhaA  36.3 
 
 		 398 aa  237  4e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0583  pH-dependent sodium/proton antiporter  36.32 
 
 		 392 aa  236  5.0000000000000005e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0187832  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3215  Na+/H+ antiporter NhaA  35.33 
 
 		 456 aa  236  7e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3123  Na+/H+ antiporter NhaA  35.33 
 
 		 449 aa  236  9e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.158144  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1042  pH-dependent sodium/proton antiporter  36.3 
 
 		 391 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.12391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0515  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.47 
 
 		 393 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1646  Na+/H+ antiporter NhaA  37.62 
 
 		 382 aa  235  2.0000000000000002e-60  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2962  Na+/H+ antiporter NhaA  38.69 
 
 		 481 aa  235  2.0000000000000002e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1336  pH-dependent sodium/proton antiporter  35.36 
 
 		 389 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2016  Na+/H+ antiporter NhaA  37.8 
 
 		 382 aa  233  5e-60  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3038  pH-dependent sodium/proton antiporter  35.83 
 
 		 389 aa  233  5e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.474949 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1756  Na+/H+ antiporter NhaA  36.41 
 
 		 394 aa  233  6e-60  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1147  pH-dependent sodium/proton antiporter  35.36 
 
 		 391 aa  233  7.000000000000001e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07000  Na+/H+ antiporter NhaA  34.43 
 
 		 514 aa  231  1e-59  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.107154  normal  0.0342501 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5677  Na+/H+ antiporter NhaA  36.32 
 
 		 404 aa  232  1e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.575468  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1827  Na+/H+ antiporter NhaA  37.38 
 
 		 382 aa  231  2e-59  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2645  Na+/H+ antiporter NhaA  39.65 
 
 		 390 aa  231  2e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0585  Na+/H+ antiporter NhaA  33.62 
 
 		 423 aa  231  2e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4197  Na+/H+ antiporter NhaA  36.32 
 
 		 401 aa  231  2e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.917396  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1025  pH-dependent sodium/proton antiporter  35.27 
 
 		 391 aa  231  2e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0688  Na+/H+ antiporter NhaA  34.89 
 
 		 389 aa  229  7e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6194  Na+/H+ antiporter NhaA  35.78 
 
 		 379 aa  229  7e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.219672 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10430  Na+/H+ antiporter NhaA  35.27 
 
 		 444 aa  229  7e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.745936  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0732  pH-dependent sodium/proton antiporter  35.51 
 
 		 409 aa  229  7e-59  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2860  pH-dependent sodium/proton antiporter  35.83 
 
 		 389 aa  229  8e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.611153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0868  pH-dependent sodium/proton antiporter  34.97 
 
 		 391 aa  229  8e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.128339 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2414  Na+/H+ antiporter NhaA  36.71 
 
 		 426 aa  229  1e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0173976 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1876  Na+/H+ antiporter  35.24 
 
 		 387 aa  228  2e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00181634 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>