233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4950 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4950  Na+/H+ antiporter NhaA  100 
 
 		 465 aa  904    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.29184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0893  Na+/H+ antiporter NhaA  57.79 
 
 		 470 aa  523  1e-147  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2414  Na+/H+ antiporter NhaA  59.31 
 
 		 426 aa  435  1e-121  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0173976 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1802  cyclic nucleotide-binding protein  49.88 
 
 		 876 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668239  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1513  Na+/H+ antiporter NhaA  46.51 
 
 		 624 aa  339  7e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0531977  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5677  Na+/H+ antiporter NhaA  44.53 
 
 		 404 aa  325  9e-88  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.575468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1867  Na+/H+ antiporter NhaA  46.19 
 
 		 616 aa  317  2e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2962  Na+/H+ antiporter NhaA  48.36 
 
 		 481 aa  312  9e-84  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0667  Na+/H+ antiporter NhaA  43.5 
 
 		 617 aa  311  1e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.74457  normal  0.729695 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3517  Na+/H+ antiporter NhaA  42.79 
 
 		 630 aa  306  5.0000000000000004e-82  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.761621 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2771  Na+/H+ antiporter NhaA  42.96 
 
 		 450 aa  305  9.000000000000001e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00813597  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2570  Na+/H+ antiporter NhaA  40.47 
 
 		 472 aa  302  8.000000000000001e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0475  Na+/H+ antiporter NhaA  43.01 
 
 		 613 aa  301  1e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0486  Na+/H+ antiporter NhaA  43.01 
 
 		 613 aa  301  2e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.913429  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0497  Na+/H+ antiporter NhaA  43.01 
 
 		 613 aa  301  2e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.573213 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1696  Na+/H+ antiporter NhaA  44.32 
 
 		 600 aa  299  8e-80  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2307  Na+/H+ antiporter NhaA  40.58 
 
 		 455 aa  298  1e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1784  Na+/H+ antiporter NhaA  36.81 
 
 		 444 aa  296  6e-79  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0238  Na+/H+ antiporter NhaA  41.61 
 
 		 617 aa  296  7e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3059  Na+/H+ antiporter NhaA  43.13 
 
 		 452 aa  293  3e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5554  Na+/H+ antiporter NhaA  41.11 
 
 		 451 aa  291  2e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.477487  normal  0.958846 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1042  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.71 
 
 		 391 aa  290  4e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.12391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1868  Na+/H+ antiporter NhaA  42 
 
 		 453 aa  290  6e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.138297 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3958  sodium-proton antiporter, NhaA family  42.89 
 
 		 453 aa  289  7e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.529436 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2941  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.76 
 
 		 394 aa  289  8e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.135486  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1861  Na+/H+ antiporter NhaA  40.05 
 
 		 451 aa  288  2e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.995313  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2205  Na+/H+ antiporter NhaA  40.05 
 
 		 436 aa  287  2e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.29594  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1025  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.92 
 
 		 391 aa  286  7e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1336  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.16 
 
 		 389 aa  285  8e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1136  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.3 
 
 		 399 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4662  Na+/H+ antiporter NhaA  36.64 
 
 		 438 aa  283  3.0000000000000004e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000933832 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0694  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.95 
 
 		 398 aa  283  5.000000000000001e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000263731  hitchhiker  0.00301245 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0732  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.7 
 
 		 409 aa  282  1e-74  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1147  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.34 
 
 		 391 aa  281  2e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1649  Na+/H+ antiporter NhaA  41.92 
 
 		 468 aa  279  7e-74  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.349535  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3038  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.68 
 
 		 389 aa  279  9e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.474949 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2666  Na+/H+ antiporter NhaA  43.1 
 
 		 445 aa  277  2e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.657461  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10430  Na+/H+ antiporter NhaA  39.52 
 
 		 444 aa  276  4e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.745936  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0842  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.29 
 
 		 390 aa  277  4e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1189  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.13 
 
 		 389 aa  277  4e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.685573  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4533  sodium-proton antiporter NhaA  41.69 
 
 		 392 aa  276  5e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2853  Na+/H+ antiporter NhaA  41.2 
 
 		 455 aa  276  5e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4283  pH-dependent sodium/proton antiporter  43.54 
 
 		 391 aa  276  5e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2616  Na+/H+ antiporter NhaA  41.95 
 
 		 391 aa  276  6e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.536675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0868  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.52 
 
 		 391 aa  276  6e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.128339 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05370  NA(+)/H(+) antiporter 1  36.24 
 
 		 435 aa  276  6e-73  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.765198  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3124  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.13 
 
 		 389 aa  276  6e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.646901  normal  0.440513 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1233  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.13 
 
 		 389 aa  276  6e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2942  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.44 
 
 		 389 aa  276  7e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0919251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1266  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.89 
 
 		 389 aa  276  7e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2860  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.44 
 
 		 389 aa  275  9e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.611153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1390  Na+/H+ antiporter NhaA  36.47 
 
 		 391 aa  275  1.0000000000000001e-72  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1762  Na(+)/H(+) antiporter 1  37.1 
 
 		 464 aa  275  2.0000000000000002e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02646  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.44 
 
 		 391 aa  274  2.0000000000000002e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1233  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.76 
 
 		 382 aa  275  2.0000000000000002e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000535639  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3828  Na+/H+ antiporter NhaA  40.72 
 
 		 457 aa  274  3e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0371269 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3464  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.99 
 
 		 394 aa  273  5.000000000000001e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000517181  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7296  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.25 
 
 		 399 aa  273  7e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.059957  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3592  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.75 
 
 		 394 aa  272  1e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000151252  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0795  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.35 
 
 		 394 aa  272  1e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000129218  normal  0.24433 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1390  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.32 
 
 		 391 aa  271  2e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000519432  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4210  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.86 
 
 		 392 aa  271  2e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.400142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003767  Na+/H+ antiporter NhaA type  38.2 
 
 		 383 aa  271  2e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4069  Na+/H+ antiporter NhaA  38.13 
 
 		 455 aa  270  2.9999999999999997e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.16071 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0042  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.38 
 
 		 388 aa  270  4e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.975088  hitchhiker  0.00613874 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0043  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.38 
 
 		 388 aa  270  4e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.62168  normal  0.149849 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0044  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.38 
 
 		 388 aa  270  4e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0044  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.38 
 
 		 388 aa  270  4e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3123  Na+/H+ antiporter NhaA  39.9 
 
 		 449 aa  270  4e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.158144  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0043  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.38 
 
 		 388 aa  270  4e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3215  Na+/H+ antiporter NhaA  40.24 
 
 		 456 aa  270  5e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2456  Na+/H+ antiporter  38.89 
 
 		 438 aa  269  5.9999999999999995e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00270708  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7481  putative sodium/proton antiporter  42.64 
 
 		 629 aa  269  5.9999999999999995e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6362  Na+/H+ antiporter NhaA  38.72 
 
 		 475 aa  268  1e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1132  pH-dependent sodium/proton antiporter  43.8 
 
 		 397 aa  268  2e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.422688  normal  0.012742 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00573  Na+/H+ antiporter, NhaA  38.95 
 
 		 424 aa  268  2e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0585  Na+/H+ antiporter NhaA  42.19 
 
 		 423 aa  268  2e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0407  Na+/H+ antiporter NhaA  39.47 
 
 		 425 aa  268  2e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1168  pH-dependent sodium/proton antiporter  43.8 
 
 		 397 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3610  Na+/H+ antiporter NhaA  42.79 
 
 		 413 aa  266  8e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.150292  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00018  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.36 
 
 		 388 aa  265  1e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.89758  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0019  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.36 
 
 		 388 aa  265  1e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0237343  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0016  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.36 
 
 		 388 aa  265  1e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000467126  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3638  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.12 
 
 		 388 aa  265  1e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0017  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.12 
 
 		 388 aa  265  1e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0017  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.36 
 
 		 388 aa  265  1e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.453914  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00019  hypothetical protein  41.36 
 
 		 388 aa  265  1e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.892896  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0144  Na+/H+ antiporter NhaA  37.7 
 
 		 446 aa  265  1e-69  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.174095  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0019  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.12 
 
 		 388 aa  265  1e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.046286  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1658  Na+/H+ antiporter NhaA  40.29 
 
 		 652 aa  264  2e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.245406 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2713  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.1 
 
 		 430 aa  263  4e-69  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.532059  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3287  Na+/H+ antiporter NhaA  43.38 
 
 		 413 aa  263  6e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1537  Na+/H+ antiporter NhaA  37.5 
 
 		 624 aa  263  6.999999999999999e-69  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.192352  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3578  Na+/H+ antiporter NhaA  41.12 
 
 		 388 aa  262  8.999999999999999e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00256476  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2645  Na+/H+ antiporter NhaA  43.15 
 
 		 390 aa  262  1e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1876  Na+/H+ antiporter  36.3 
 
 		 387 aa  262  1e-68  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00181634 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51740  Na+/H+ antiporter NhaA  40.62 
 
 		 446 aa  260  3e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.9845  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3699  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.8 
 
 		 397 aa  261  3e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.262179 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0065  Na+/H+ antiporter NhaA  36.84 
 
 		 402 aa  260  3e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000634714  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3135  Na+/H+ antiporter NhaA  37.5 
 
 		 398 aa  261  3e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>