231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_10430 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_10430  Na+/H+ antiporter NhaA  100 
 
 
444 aa  863    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.745936  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3958  sodium-proton antiporter, NhaA family  65.99 
 
 
453 aa  558  1e-158  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.529436 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1868  Na+/H+ antiporter NhaA  65.99 
 
 
453 aa  557  1e-157  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.138297 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3059  Na+/H+ antiporter NhaA  66.36 
 
 
452 aa  544  1e-153  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2853  Na+/H+ antiporter NhaA  64.55 
 
 
455 aa  530  1e-149  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5554  Na+/H+ antiporter NhaA  62.68 
 
 
451 aa  503  1e-141  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.477487  normal  0.958846 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0371  Na+/H+ antiporter NhaA  55.33 
 
 
452 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0585  Na+/H+ antiporter NhaA  56.82 
 
 
423 aa  413  1e-114  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6362  Na+/H+ antiporter NhaA  46.44 
 
 
475 aa  376  1e-103  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3129  Na+/H+ antiporter NhaA  56.09 
 
 
422 aa  339  7e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3856  Na+/H+ antiporter NhaA  55.85 
 
 
416 aa  334  2e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2771  Na+/H+ antiporter NhaA  44.02 
 
 
450 aa  322  7e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00813597  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1649  Na+/H+ antiporter NhaA  41.79 
 
 
468 aa  317  3e-85  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.349535  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4069  Na+/H+ antiporter NhaA  42.27 
 
 
455 aa  311  1e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.16071 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2666  Na+/H+ antiporter NhaA  44.17 
 
 
445 aa  301  1e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.657461  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2307  Na+/H+ antiporter NhaA  40.97 
 
 
455 aa  300  2e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0842  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.97 
 
 
390 aa  296  3e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1784  Na+/H+ antiporter NhaA  37.27 
 
 
444 aa  295  2e-78  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1390  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.52 
 
 
391 aa  286  4e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000519432  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02646  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.79 
 
 
391 aa  286  4e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07000  Na+/H+ antiporter NhaA  38.96 
 
 
514 aa  285  9e-76  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.107154  normal  0.0342501 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0694  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.4 
 
 
398 aa  285  1.0000000000000001e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000263731  hitchhiker  0.00301245 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1390  Na+/H+ antiporter NhaA  36.49 
 
 
391 aa  283  3.0000000000000004e-75  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4662  Na+/H+ antiporter NhaA  38.5 
 
 
438 aa  283  5.000000000000001e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000933832 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003767  Na+/H+ antiporter NhaA type  41.33 
 
 
383 aa  283  5.000000000000001e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0144  Na+/H+ antiporter NhaA  39.21 
 
 
446 aa  282  6.000000000000001e-75  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.174095  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0042  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.45 
 
 
388 aa  282  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.975088  hitchhiker  0.00613874 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0044  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.45 
 
 
388 aa  282  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0044  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.45 
 
 
388 aa  282  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0043  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.45 
 
 
388 aa  282  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2570  Na+/H+ antiporter NhaA  41.65 
 
 
472 aa  282  1e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0043  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.45 
 
 
388 aa  282  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.62168  normal  0.149849 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3464  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.01 
 
 
394 aa  280  4e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000517181  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0893  Na+/H+ antiporter NhaA  41.81 
 
 
470 aa  280  5e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3592  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.78 
 
 
394 aa  279  6e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000151252  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00018  pH-dependent sodium/proton antiporter  43.65 
 
 
388 aa  278  1e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.89758  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3638  pH-dependent sodium/proton antiporter  43.41 
 
 
388 aa  278  1e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1762  Na(+)/H(+) antiporter 1  38.39 
 
 
464 aa  278  1e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0017  pH-dependent sodium/proton antiporter  43.41 
 
 
388 aa  278  1e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0019  pH-dependent sodium/proton antiporter  43.41 
 
 
388 aa  278  1e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.046286  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0016  pH-dependent sodium/proton antiporter  43.65 
 
 
388 aa  278  1e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000467126  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0019  pH-dependent sodium/proton antiporter  43.65 
 
 
388 aa  278  1e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0237343  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0017  pH-dependent sodium/proton antiporter  43.65 
 
 
388 aa  278  1e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.453914  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00019  hypothetical protein  43.65 
 
 
388 aa  278  1e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.892896  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3578  Na+/H+ antiporter NhaA  43.65 
 
 
388 aa  278  2e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00256476  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5677  Na+/H+ antiporter NhaA  42.59 
 
 
404 aa  277  2e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.575468  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1189  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.43 
 
 
389 aa  277  2e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.685573  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2989  Na+/H+ antiporter NhaA  42.34 
 
 
460 aa  277  3e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0065  Na+/H+ antiporter NhaA  40.14 
 
 
402 aa  277  3e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000634714  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1266  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.43 
 
 
389 aa  276  4e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3124  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.43 
 
 
389 aa  276  5e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.646901  normal  0.440513 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1233  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.43 
 
 
389 aa  276  5e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2205  Na+/H+ antiporter NhaA  41.47 
 
 
436 aa  276  7e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.29594  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1861  Na+/H+ antiporter NhaA  41.47 
 
 
451 aa  275  9e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.995313  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0795  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.47 
 
 
394 aa  275  9e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000129218  normal  0.24433 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3828  Na+/H+ antiporter NhaA  41.9 
 
 
457 aa  274  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0371269 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51740  Na+/H+ antiporter NhaA  42.28 
 
 
446 aa  274  3e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.9845  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2941  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.61 
 
 
394 aa  273  5.000000000000001e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.135486  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3123  Na+/H+ antiporter NhaA  39.54 
 
 
449 aa  272  8.000000000000001e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.158144  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1390  Na+/H+ antiporter NhaA  40 
 
 
396 aa  272  9e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.168803  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1336  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.47 
 
 
389 aa  272  1e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3215  Na+/H+ antiporter NhaA  40.52 
 
 
456 aa  271  1e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05370  NA(+)/H(+) antiporter 1  35.86 
 
 
435 aa  271  2e-71  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.765198  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1233  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.04 
 
 
382 aa  270  5e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000535639  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1147  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.71 
 
 
391 aa  269  7e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0407  Na+/H+ antiporter NhaA  40.52 
 
 
425 aa  268  1e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13458  putative Na+/H+ antiporter  36.13 
 
 
427 aa  268  1e-70  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.466525  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4533  sodium-proton antiporter NhaA  41.46 
 
 
392 aa  266  7e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3657  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.18 
 
 
398 aa  266  8e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.457018  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3135  Na+/H+ antiporter NhaA  39.95 
 
 
398 aa  265  8.999999999999999e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3022  Na+/H+ antiporter NhaA  37.67 
 
 
395 aa  265  1e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.396021  normal  0.0264038 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2616  Na+/H+ antiporter NhaA  42.19 
 
 
391 aa  265  1e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.536675  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2456  Na+/H+ antiporter  42.38 
 
 
438 aa  265  1e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00270708  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3089  Na+/H+ antiporter NhaA  38.41 
 
 
406 aa  265  2e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.761361  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2773  Na+/H+ antiporter NhaA  40 
 
 
612 aa  264  2e-69  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.461609 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2277  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.47 
 
 
397 aa  264  2e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00329368  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1756  Na+/H+ antiporter NhaA  36.05 
 
 
394 aa  264  3e-69  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0732  pH-dependent sodium/proton antiporter  36.57 
 
 
409 aa  264  3e-69  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6194  Na+/H+ antiporter NhaA  38.64 
 
 
379 aa  262  8e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.219672 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4210  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.78 
 
 
392 aa  262  8.999999999999999e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.400142  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0364  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.09 
 
 
391 aa  262  1e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2026  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.11 
 
 
382 aa  262  1e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.470958  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4950  Na+/H+ antiporter NhaA  39.52 
 
 
465 aa  261  1e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.29184  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0580  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.13 
 
 
391 aa  262  1e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0119541  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0128  Na+/H+ antiporter NhaA  41.36 
 
 
399 aa  261  2e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.124586  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3851  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.2 
 
 
398 aa  261  3e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.79655  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1563  pH-dependent sodium/proton antiporter  44.47 
 
 
421 aa  260  3e-68  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.172648  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0868  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.68 
 
 
391 aa  260  3e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.128339 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2713  pH-dependent sodium/proton antiporter  44.85 
 
 
430 aa  260  4e-68  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.532059  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3038  pH-dependent sodium/proton antiporter  39 
 
 
389 aa  260  4e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.474949 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0963  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.41 
 
 
395 aa  259  5.0000000000000005e-68  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000193238  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1025  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.53 
 
 
391 aa  259  6e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2860  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.47 
 
 
389 aa  259  7e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.611153  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3264  sodium-proton antiporter NhaA  38.29 
 
 
382 aa  259  8e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000713954 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2942  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.23 
 
 
389 aa  258  1e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0919251  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1488  Na+/H+ antiporter  35.97 
 
 
386 aa  258  2e-67  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5174  sodium-proton antiporter NhaA  42.09 
 
 
391 aa  256  4e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2582  Na+/H+ antiporter NhaA  41.23 
 
 
393 aa  256  5e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1136  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.08 
 
 
399 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0583  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.95 
 
 
392 aa  253  3e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0187832  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>