231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_3215 on replicon NC_009467
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009467  Acry_3123  Na+/H+ antiporter NhaA  98.42 
 
 		 449 aa  852    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.158144  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3215  Na+/H+ antiporter NhaA  100 
 
 		 456 aa  894    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3160  Na+/H+ antiporter NhaA  100 
 
 		 326 aa  600  1e-170  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0144  Na+/H+ antiporter NhaA  59.1 
 
 		 446 aa  521  1e-146  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.174095  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51740  Na+/H+ antiporter NhaA  56.95 
 
 		 446 aa  473  1e-132  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.9845  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1649  Na+/H+ antiporter NhaA  43.37 
 
 		 468 aa  339  7e-92  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.349535  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3059  Na+/H+ antiporter NhaA  44.47 
 
 		 452 aa  323  3e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1868  Na+/H+ antiporter NhaA  44.08 
 
 		 453 aa  318  1e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.138297 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2771  Na+/H+ antiporter NhaA  43.85 
 
 		 450 aa  317  4e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00813597  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3958  sodium-proton antiporter, NhaA family  42.69 
 
 		 453 aa  316  5e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.529436 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4069  Na+/H+ antiporter NhaA  42.19 
 
 		 455 aa  303  3.0000000000000004e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.16071 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2307  Na+/H+ antiporter NhaA  42.27 
 
 		 455 aa  300  3e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1784  Na+/H+ antiporter NhaA  39.91 
 
 		 444 aa  299  8e-80  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5554  Na+/H+ antiporter NhaA  43.54 
 
 		 451 aa  298  1e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.477487  normal  0.958846 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2666  Na+/H+ antiporter NhaA  47.2 
 
 		 445 aa  298  2e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.657461  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2853  Na+/H+ antiporter NhaA  42.14 
 
 		 455 aa  294  2e-78  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0065  Na+/H+ antiporter NhaA  42.18 
 
 		 402 aa  288  2e-76  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000634714  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3828  Na+/H+ antiporter NhaA  42.25 
 
 		 457 aa  287  2e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0371269 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0585  Na+/H+ antiporter NhaA  41.5 
 
 		 423 aa  286  5.999999999999999e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2570  Na+/H+ antiporter NhaA  39.46 
 
 		 472 aa  282  7.000000000000001e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1861  Na+/H+ antiporter NhaA  40.77 
 
 		 451 aa  281  1e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.995313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0893  Na+/H+ antiporter NhaA  39.55 
 
 		 470 aa  281  2e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2205  Na+/H+ antiporter NhaA  40.87 
 
 		 436 aa  280  3e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.29594  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1390  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.3 
 
 		 391 aa  280  5e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000519432  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1563  pH-dependent sodium/proton antiporter  45.56 
 
 		 421 aa  276  5e-73  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.172648  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2989  Na+/H+ antiporter NhaA  42.73 
 
 		 460 aa  276  7e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2962  Na+/H+ antiporter NhaA  42.93 
 
 		 481 aa  273  4.0000000000000004e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6362  Na+/H+ antiporter NhaA  41.39 
 
 		 475 aa  272  8.000000000000001e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10430  Na+/H+ antiporter NhaA  40.52 
 
 		 444 aa  271  1e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.745936  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2414  Na+/H+ antiporter NhaA  43.7 
 
 		 426 aa  270  2.9999999999999997e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0173976 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0842  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.44 
 
 		 390 aa  269  5.9999999999999995e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4662  Na+/H+ antiporter NhaA  37.06 
 
 		 438 aa  266  5.999999999999999e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000933832 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3162  Na+/H+ antiporter NhaA  99.28 
 
 		 145 aa  265  1e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.716261  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2277  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.79 
 
 		 397 aa  264  2e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00329368  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0044  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.77 
 
 		 388 aa  262  8.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0043  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.77 
 
 		 388 aa  262  8.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.62168  normal  0.149849 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0043  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.77 
 
 		 388 aa  262  8.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0044  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.77 
 
 		 388 aa  262  8.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0042  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.77 
 
 		 388 aa  262  8.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.975088  hitchhiker  0.00613874 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4950  Na+/H+ antiporter NhaA  40.24 
 
 		 465 aa  261  2e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.29184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1762  Na(+)/H(+) antiporter 1  37.22 
 
 		 464 aa  261  2e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0732  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.92 
 
 		 409 aa  260  3e-68  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2568  Na+/H+ antiporter NhaA  42.52 
 
 		 424 aa  259  7e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3022  Na+/H+ antiporter NhaA  35.61 
 
 		 395 aa  259  7e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.396021  normal  0.0264038 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0371  Na+/H+ antiporter NhaA  38.41 
 
 		 452 aa  259  8e-68  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4283  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.05 
 
 		 391 aa  259  8e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1802  cyclic nucleotide-binding protein  39.09 
 
 		 876 aa  258  1e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668239  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2713  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.46 
 
 		 430 aa  258  2e-67  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.532059  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05370  NA(+)/H(+) antiporter 1  37.44 
 
 		 435 aa  258  2e-67  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.765198  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1480  Na+/H+ antiporter NhaA  35.65 
 
 		 450 aa  256  4e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.627445  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4144  Na+/H+ antiporter NhaA  37.06 
 
 		 472 aa  256  4e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.375457  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00018  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.47 
 
 		 388 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.89758  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00019  hypothetical protein  37.47 
 
 		 388 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.892896  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1390  Na+/H+ antiporter NhaA  34.92 
 
 		 391 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0017  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.47 
 
 		 388 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0016  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.47 
 
 		 388 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000467126  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0019  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.47 
 
 		 388 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0237343  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3638  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.47 
 
 		 388 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0019  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.47 
 
 		 388 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.046286  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2456  Na+/H+ antiporter  39.76 
 
 		 438 aa  254  3e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00270708  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0017  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.23 
 
 		 388 aa  253  3e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.453914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1234  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.41 
 
 		 395 aa  253  6e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.400812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00573  Na+/H+ antiporter, NhaA  37.05 
 
 		 424 aa  253  7e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3578  Na+/H+ antiporter NhaA  37.23 
 
 		 388 aa  251  1e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00256476  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4405  Na+/H+ antiporter NhaA  38.72 
 
 		 408 aa  252  1e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2941  pH-dependent sodium/proton antiporter  36.3 
 
 		 394 aa  251  2e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.135486  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07000  Na+/H+ antiporter NhaA  36.92 
 
 		 514 aa  251  3e-65  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.107154  normal  0.0342501 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3089  Na+/H+ antiporter NhaA  35.8 
 
 		 406 aa  250  4e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.761361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1513  Na+/H+ antiporter NhaA  39.05 
 
 		 624 aa  249  1e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0531977  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0128  Na+/H+ antiporter NhaA  40.23 
 
 		 399 aa  248  2e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.124586  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1390  Na+/H+ antiporter NhaA  36.93 
 
 		 396 aa  247  4e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.168803  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1189  pH-dependent sodium/proton antiporter  36.3 
 
 		 389 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.685573  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1266  pH-dependent sodium/proton antiporter  36.3 
 
 		 389 aa  246  6e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3124  pH-dependent sodium/proton antiporter  36.3 
 
 		 389 aa  246  8e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.646901  normal  0.440513 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1233  pH-dependent sodium/proton antiporter  36.3 
 
 		 389 aa  246  8e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1336  pH-dependent sodium/proton antiporter  36.06 
 
 		 389 aa  246  9e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1147  pH-dependent sodium/proton antiporter  36.3 
 
 		 391 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13458  putative Na+/H+ antiporter  35.02 
 
 		 427 aa  245  9.999999999999999e-64  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.466525  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6194  Na+/H+ antiporter NhaA  36.02 
 
 		 379 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.219672 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0694  pH-dependent sodium/proton antiporter  35.92 
 
 		 398 aa  244  1.9999999999999999e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000263731  hitchhiker  0.00301245 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1132  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.08 
 
 		 397 aa  244  3e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.422688  normal  0.012742 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3135  Na+/H+ antiporter NhaA  36.79 
 
 		 398 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7481  putative sodium/proton antiporter  37.06 
 
 		 629 aa  243  3.9999999999999997e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1168  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.83 
 
 		 397 aa  243  6e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0963  pH-dependent sodium/proton antiporter  35.65 
 
 		 395 aa  243  7e-63  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000193238  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0583  pH-dependent sodium/proton antiporter  36.94 
 
 		 392 aa  243  7.999999999999999e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0187832  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3464  pH-dependent sodium/proton antiporter  36.43 
 
 		 394 aa  241  1e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000517181  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3592  pH-dependent sodium/proton antiporter  36.43 
 
 		 394 aa  241  2e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000151252  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3038  pH-dependent sodium/proton antiporter  36.3 
 
 		 389 aa  241  2e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.474949 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0868  pH-dependent sodium/proton antiporter  35.36 
 
 		 391 aa  241  2e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.128339 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0795  pH-dependent sodium/proton antiporter  36.19 
 
 		 394 aa  240  2.9999999999999997e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000129218  normal  0.24433 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0840  Na+/H+ antiporter NhaA  37.85 
 
 		 381 aa  241  2.9999999999999997e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1867  Na+/H+ antiporter NhaA  39.51 
 
 		 616 aa  239  5.999999999999999e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3851  pH-dependent sodium/proton antiporter  36.75 
 
 		 398 aa  239  5.999999999999999e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.79655  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0580  pH-dependent sodium/proton antiporter  36.39 
 
 		 391 aa  239  5.999999999999999e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0119541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1896  pH-dependent sodium/proton antiporter  34.69 
 
 		 400 aa  239  6.999999999999999e-62  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0688  Na+/H+ antiporter NhaA  36.36 
 
 		 389 aa  239  6.999999999999999e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0667  Na+/H+ antiporter NhaA  38.77 
 
 		 617 aa  239  6.999999999999999e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.74457  normal  0.729695 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1136  pH-dependent sodium/proton antiporter  35.75 
 
 		 399 aa  239  9e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2942  pH-dependent sodium/proton antiporter  36.06 
 
 		 389 aa  238  2e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0919251  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>