233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_3657 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_3851  pH-dependent sodium/proton antiporter  92.96 
 
 		 398 aa  698    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.79655  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3657  pH-dependent sodium/proton antiporter  100 
 
 		 398 aa  773    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.457018  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0583  pH-dependent sodium/proton antiporter  69.77 
 
 		 392 aa  523  1e-147  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0187832  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0544  pH-dependent sodium/proton antiporter  70.84 
 
 		 401 aa  519  1e-146  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3592  pH-dependent sodium/proton antiporter  64.47 
 
 		 394 aa  456  1e-127  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000151252  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0795  pH-dependent sodium/proton antiporter  64.72 
 
 		 394 aa  456  1e-127  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000129218  normal  0.24433 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3464  pH-dependent sodium/proton antiporter  64.47 
 
 		 394 aa  455  1e-127  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000517181  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0043  pH-dependent sodium/proton antiporter  62.08 
 
 		 388 aa  441  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0043  pH-dependent sodium/proton antiporter  62.08 
 
 		 388 aa  441  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.62168  normal  0.149849 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0042  pH-dependent sodium/proton antiporter  62.08 
 
 		 388 aa  441  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.975088  hitchhiker  0.00613874 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0044  pH-dependent sodium/proton antiporter  62.08 
 
 		 388 aa  441  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0044  pH-dependent sodium/proton antiporter  62.08 
 
 		 388 aa  441  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0694  pH-dependent sodium/proton antiporter  62.44 
 
 		 398 aa  437  1e-121  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000263731  hitchhiker  0.00301245 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00018  pH-dependent sodium/proton antiporter  61.78 
 
 		 388 aa  429  1e-119  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.89758  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0016  pH-dependent sodium/proton antiporter  61.78 
 
 		 388 aa  429  1e-119  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000467126  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0019  pH-dependent sodium/proton antiporter  61.78 
 
 		 388 aa  429  1e-119  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.046286  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3638  pH-dependent sodium/proton antiporter  61.78 
 
 		 388 aa  429  1e-119  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0017  pH-dependent sodium/proton antiporter  61.78 
 
 		 388 aa  429  1e-119  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.453914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0019  pH-dependent sodium/proton antiporter  61.78 
 
 		 388 aa  429  1e-119  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0237343  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00019  hypothetical protein  61.78 
 
 		 388 aa  429  1e-119  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.892896  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0017  pH-dependent sodium/proton antiporter  61.78 
 
 		 388 aa  429  1e-119  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3578  Na+/H+ antiporter NhaA  61.26 
 
 		 388 aa  426  1e-118  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00256476  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0580  pH-dependent sodium/proton antiporter  60.91 
 
 		 391 aa  422  1e-117  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0119541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2941  pH-dependent sodium/proton antiporter  55.87 
 
 		 394 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.135486  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0868  pH-dependent sodium/proton antiporter  55.3 
 
 		 391 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.128339 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1336  pH-dependent sodium/proton antiporter  54.78 
 
 		 389 aa  395  1e-109  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3038  pH-dependent sodium/proton antiporter  56.33 
 
 		 389 aa  397  1e-109  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.474949 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1147  pH-dependent sodium/proton antiporter  55.3 
 
 		 391 aa  395  1e-109  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1233  pH-dependent sodium/proton antiporter  54.78 
 
 		 389 aa  393  1e-108  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3124  pH-dependent sodium/proton antiporter  54.78 
 
 		 389 aa  393  1e-108  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.646901  normal  0.440513 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1189  pH-dependent sodium/proton antiporter  54.78 
 
 		 389 aa  394  1e-108  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.685573  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1266  pH-dependent sodium/proton antiporter  54.52 
 
 		 389 aa  392  1e-108  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1233  pH-dependent sodium/proton antiporter  56.63 
 
 		 382 aa  393  1e-108  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000535639  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2860  pH-dependent sodium/proton antiporter  55.81 
 
 		 389 aa  390  1e-107  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.611153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2942  pH-dependent sodium/proton antiporter  55.56 
 
 		 389 aa  389  1e-107  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0919251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003767  Na+/H+ antiporter NhaA type  56.33 
 
 		 383 aa  385  1e-106  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1025  pH-dependent sodium/proton antiporter  56.07 
 
 		 391 aa  384  1e-105  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0963  pH-dependent sodium/proton antiporter  55.85 
 
 		 395 aa  379  1e-104  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000193238  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02646  pH-dependent sodium/proton antiporter  55.58 
 
 		 391 aa  381  1e-104  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1390  Na+/H+ antiporter NhaA  53.25 
 
 		 391 aa  379  1e-104  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1042  pH-dependent sodium/proton antiporter  54.52 
 
 		 391 aa  379  1e-104  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.12391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1136  pH-dependent sodium/proton antiporter  53.27 
 
 		 399 aa  375  1e-103  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2026  pH-dependent sodium/proton antiporter  53.75 
 
 		 382 aa  371  1e-102  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.470958  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1390  pH-dependent sodium/proton antiporter  53.79 
 
 		 391 aa  373  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000519432  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4283  pH-dependent sodium/proton antiporter  54.35 
 
 		 391 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0842  pH-dependent sodium/proton antiporter  54.15 
 
 		 390 aa  374  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1390  Na+/H+ antiporter NhaA  54.83 
 
 		 396 aa  370  1e-101  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.168803  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1132  pH-dependent sodium/proton antiporter  53.58 
 
 		 397 aa  365  1e-100  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.422688  normal  0.012742 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1168  pH-dependent sodium/proton antiporter  53.58 
 
 		 397 aa  365  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1234  pH-dependent sodium/proton antiporter  54.38 
 
 		 395 aa  363  2e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.400812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2778  pH-dependent sodium/proton antiporter  55.7 
 
 		 398 aa  362  7.0000000000000005e-99  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0732  pH-dependent sodium/proton antiporter  47.98 
 
 		 409 aa  353  4e-96  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1488  Na+/H+ antiporter  51.05 
 
 		 386 aa  352  5.9999999999999994e-96  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2277  pH-dependent sodium/proton antiporter  50.25 
 
 		 397 aa  351  1e-95  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00329368  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00573  Na+/H+ antiporter, NhaA  50 
 
 		 424 aa  350  2e-95  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3264  sodium-proton antiporter NhaA  49.47 
 
 		 382 aa  348  8e-95  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000713954 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4197  Na+/H+ antiporter NhaA  51.45 
 
 		 401 aa  346  5e-94  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.917396  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2616  Na+/H+ antiporter NhaA  51.56 
 
 		 391 aa  342  1e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.536675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1756  Na+/H+ antiporter NhaA  47.61 
 
 		 394 aa  336  3.9999999999999995e-91  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0369  pH-dependent sodium/proton antiporter  52.11 
 
 		 399 aa  333  2e-90  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0301682  hitchhiker  0.000785162 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2582  Na+/H+ antiporter NhaA  52.66 
 
 		 393 aa  333  3e-90  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0407  Na+/H+ antiporter NhaA  50.64 
 
 		 425 aa  332  6e-90  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1896  pH-dependent sodium/proton antiporter  45.77 
 
 		 400 aa  325  6e-88  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7296  pH-dependent sodium/proton antiporter  48.57 
 
 		 399 aa  325  9e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.059957  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0128  Na+/H+ antiporter NhaA  52.07 
 
 		 399 aa  325  1e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.124586  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4533  sodium-proton antiporter NhaA  51.81 
 
 		 392 aa  324  2e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1827  Na+/H+ antiporter NhaA  46.72 
 
 		 382 aa  322  5e-87  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2123  pH-dependent sodium/proton antiporter  48.7 
 
 		 400 aa  322  7e-87  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1838  pH-dependent sodium/proton antiporter  48.45 
 
 		 400 aa  320  1.9999999999999998e-86  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3089  Na+/H+ antiporter NhaA  47.63 
 
 		 406 aa  320  1.9999999999999998e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.761361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1646  Na+/H+ antiporter NhaA  46.46 
 
 		 382 aa  320  1.9999999999999998e-86  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2771  Na+/H+ antiporter NhaA  44.95 
 
 		 450 aa  319  6e-86  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00813597  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0693  pH-dependent sodium/proton antiporter  50 
 
 		 396 aa  319  6e-86  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.11155  normal  0.550501 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4210  pH-dependent sodium/proton antiporter  55.59 
 
 		 392 aa  318  7.999999999999999e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.400142  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3135  Na+/H+ antiporter NhaA  51.7 
 
 		 398 aa  318  9e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1826  pH-dependent sodium/proton antiporter  45.31 
 
 		 389 aa  318  1e-85  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.243343  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2016  Na+/H+ antiporter NhaA  46.46 
 
 		 382 aa  317  2e-85  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0515  pH-dependent sodium/proton antiporter  48.19 
 
 		 393 aa  317  3e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1645  pH-dependent sodium/proton antiporter  45.31 
 
 		 389 aa  317  3e-85  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2015  pH-dependent sodium/proton antiporter  45.31 
 
 		 389 aa  317  3e-85  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5991  pH-dependent sodium/proton antiporter  51.21 
 
 		 399 aa  316  4e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.688009  normal  0.157669 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3699  pH-dependent sodium/proton antiporter  47.14 
 
 		 397 aa  314  9.999999999999999e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.262179 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6044  pH-dependent sodium/proton antiporter  53.5 
 
 		 400 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.227636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0028  Na+/H+ antiporter NhaA  41.88 
 
 		 396 aa  309  5e-83  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0364  pH-dependent sodium/proton antiporter  49.87 
 
 		 391 aa  305  6e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3022  Na+/H+ antiporter NhaA  44.76 
 
 		 395 aa  305  8.000000000000001e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.396021  normal  0.0264038 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1489  pH-dependent sodium/proton antiporter  46.83 
 
 		 384 aa  302  6.000000000000001e-81  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5174  sodium-proton antiporter NhaA  49.35 
 
 		 391 aa  301  1e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4598  Na+/H+ antiporter NhaA  48.83 
 
 		 408 aa  301  1e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3347  pH-dependent sodium/proton antiporter  46.52 
 
 		 407 aa  301  2e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0397  pH-dependent sodium/proton antiporter  45.64 
 
 		 393 aa  298  1e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.311183  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0065  Na+/H+ antiporter NhaA  47.31 
 
 		 402 aa  298  1e-79  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000634714  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0406  pH-dependent sodium/proton antiporter  45.64 
 
 		 420 aa  298  2e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.364642  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2307  Na+/H+ antiporter NhaA  43.06 
 
 		 455 aa  295  9e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3610  Na+/H+ antiporter NhaA  50 
 
 		 413 aa  294  2e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.150292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3287  Na+/H+ antiporter NhaA  50.26 
 
 		 413 aa  294  2e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4069  Na+/H+ antiporter NhaA  41.84 
 
 		 455 aa  293  3e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.16071 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4405  Na+/H+ antiporter NhaA  44.24 
 
 		 408 aa  293  3e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0688  Na+/H+ antiporter NhaA  47.37 
 
 		 389 aa  293  5e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3059  Na+/H+ antiporter NhaA  42.55 
 
 		 452 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>