230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3397 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3397  Na+/H+ antiporter NhaA  100 
 
 
389 aa  762    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0458674  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2303  Na+/H+ antiporter family protein  63.68 
 
 
382 aa  508  9.999999999999999e-143  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1089  Na+/H+ antiporter NhaA  63.52 
 
 
382 aa  502  1e-141  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00816034  hitchhiker  0.0000107975 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1573  Na+/H+ antiporter NhaA  63.52 
 
 
382 aa  498  1e-140  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3343  Na+/H+ antiporter NhaA  62.03 
 
 
385 aa  478  1e-134  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0071  Na+/H+ antiporter NhaA  65.26 
 
 
382 aa  477  1e-133  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2987  Na+/H+ antiporter NhaA  64.47 
 
 
382 aa  474  1e-132  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000224561  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0902  Na+/H+ antiporter NhaA  61.5 
 
 
385 aa  472  1e-132  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.75198e-32 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3369  Na+/H+ antiporter NhaA  62.76 
 
 
386 aa  462  1e-129  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1821  Na+/H+ antiporter NhaA  61.87 
 
 
378 aa  458  9.999999999999999e-129  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.130379  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3655  Na+/H+ antiporter NhaA  44.42 
 
 
420 aa  284  2.0000000000000002e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.287299 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0585  Na+/H+ antiporter NhaA  36.06 
 
 
423 aa  162  1e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3059  Na+/H+ antiporter NhaA  33.64 
 
 
452 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3958  sodium-proton antiporter, NhaA family  32.01 
 
 
453 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.529436 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1868  Na+/H+ antiporter NhaA  31.54 
 
 
453 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.138297 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02646  pH-dependent sodium/proton antiporter  33.15 
 
 
391 aa  141  1.9999999999999998e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003767  Na+/H+ antiporter NhaA type  33.15 
 
 
383 aa  140  4.999999999999999e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10430  Na+/H+ antiporter NhaA  30.47 
 
 
444 aa  137  3.0000000000000003e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.745936  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6362  Na+/H+ antiporter NhaA  33.41 
 
 
475 aa  137  3.0000000000000003e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5677  Na+/H+ antiporter NhaA  33.99 
 
 
404 aa  137  4e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.575468  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2853  Na+/H+ antiporter NhaA  30.14 
 
 
455 aa  135  9.999999999999999e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2026  pH-dependent sodium/proton antiporter  33.33 
 
 
382 aa  131  2.0000000000000002e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.470958  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1838  pH-dependent sodium/proton antiporter  32.39 
 
 
400 aa  131  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1189  pH-dependent sodium/proton antiporter  32.27 
 
 
389 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.685573  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2123  pH-dependent sodium/proton antiporter  32.39 
 
 
400 aa  130  3e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3124  pH-dependent sodium/proton antiporter  32.27 
 
 
389 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.646901  normal  0.440513 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7296  pH-dependent sodium/proton antiporter  33.16 
 
 
399 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.059957  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1266  pH-dependent sodium/proton antiporter  32.27 
 
 
389 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1233  pH-dependent sodium/proton antiporter  32.27 
 
 
389 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1336  pH-dependent sodium/proton antiporter  31.6 
 
 
389 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5991  pH-dependent sodium/proton antiporter  33.51 
 
 
399 aa  127  3e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.688009  normal  0.157669 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0369  pH-dependent sodium/proton antiporter  31.85 
 
 
399 aa  127  3e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0301682  hitchhiker  0.000785162 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5554  Na+/H+ antiporter NhaA  30.94 
 
 
451 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.477487  normal  0.958846 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1233  pH-dependent sodium/proton antiporter  31.46 
 
 
382 aa  125  1e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000535639  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1390  Na+/H+ antiporter NhaA  30.6 
 
 
391 aa  123  5e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3038  pH-dependent sodium/proton antiporter  30.45 
 
 
389 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.474949 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2616  Na+/H+ antiporter NhaA  30.95 
 
 
391 aa  121  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.536675  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2860  pH-dependent sodium/proton antiporter  30.58 
 
 
389 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.611153  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2942  pH-dependent sodium/proton antiporter  30.83 
 
 
389 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0919251  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0043  pH-dependent sodium/proton antiporter  31.32 
 
 
388 aa  120  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0043  pH-dependent sodium/proton antiporter  31.32 
 
 
388 aa  120  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.62168  normal  0.149849 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0044  pH-dependent sodium/proton antiporter  31.32 
 
 
388 aa  120  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0044  pH-dependent sodium/proton antiporter  31.32 
 
 
388 aa  120  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0042  pH-dependent sodium/proton antiporter  31.32 
 
 
388 aa  120  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.975088  hitchhiker  0.00613874 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0371  Na+/H+ antiporter NhaA  30.89 
 
 
452 aa  119  7.999999999999999e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2941  pH-dependent sodium/proton antiporter  30.5 
 
 
394 aa  119  9e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.135486  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4950  Na+/H+ antiporter NhaA  31.69 
 
 
465 aa  118  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.29184  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0694  pH-dependent sodium/proton antiporter  31.67 
 
 
398 aa  118  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000263731  hitchhiker  0.00301245 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1147  pH-dependent sodium/proton antiporter  30.71 
 
 
391 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1025  pH-dependent sodium/proton antiporter  31.28 
 
 
391 aa  117  3e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3264  sodium-proton antiporter NhaA  30.87 
 
 
382 aa  116  5e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000713954 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00573  Na+/H+ antiporter, NhaA  28.47 
 
 
424 aa  117  5e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4210  pH-dependent sodium/proton antiporter  32.86 
 
 
392 aa  116  6e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.400142  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2773  Na+/H+ antiporter NhaA  29.21 
 
 
612 aa  116  6e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.461609 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3578  Na+/H+ antiporter NhaA  30.33 
 
 
388 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00256476  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6928  Na+/H+ antiporter NhaA  31.06 
 
 
446 aa  115  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.126973  normal  0.148656 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0580  pH-dependent sodium/proton antiporter  31.55 
 
 
391 aa  115  1.0000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0119541  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12160  Na+/H+ antiporter NhaA  30.05 
 
 
436 aa  115  2.0000000000000002e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0683  Kef-type K+ transport system membrane protein  30.17 
 
 
472 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6044  pH-dependent sodium/proton antiporter  32.27 
 
 
400 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.227636  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0893  Na+/H+ antiporter NhaA  30.92 
 
 
470 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0842  pH-dependent sodium/proton antiporter  28.93 
 
 
390 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1390  pH-dependent sodium/proton antiporter  28.87 
 
 
391 aa  114  3e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000519432  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0868  pH-dependent sodium/proton antiporter  31.5 
 
 
391 aa  114  3e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.128339 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1649  Na+/H+ antiporter NhaA  28.71 
 
 
468 aa  114  3e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.349535  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00018  pH-dependent sodium/proton antiporter  30.6 
 
 
388 aa  113  5e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.89758  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4533  sodium-proton antiporter NhaA  31.41 
 
 
392 aa  113  5e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0017  pH-dependent sodium/proton antiporter  30.6 
 
 
388 aa  113  5e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3517  Na+/H+ antiporter NhaA  29.53 
 
 
630 aa  113  5e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.761621 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00019  hypothetical protein  30.6 
 
 
388 aa  113  5e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.892896  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0016  pH-dependent sodium/proton antiporter  30.6 
 
 
388 aa  113  5e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000467126  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0017  pH-dependent sodium/proton antiporter  30.6 
 
 
388 aa  113  5e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.453914  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0019  pH-dependent sodium/proton antiporter  30.6 
 
 
388 aa  113  5e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0237343  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3638  pH-dependent sodium/proton antiporter  30.6 
 
 
388 aa  113  5e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0019  pH-dependent sodium/proton antiporter  30.6 
 
 
388 aa  113  5e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.046286  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1042  pH-dependent sodium/proton antiporter  30.98 
 
 
391 aa  113  7.000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.12391  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0583  pH-dependent sodium/proton antiporter  30.38 
 
 
392 aa  112  8.000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0187832  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1826  pH-dependent sodium/proton antiporter  31.05 
 
 
389 aa  112  9e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.243343  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3828  Na+/H+ antiporter NhaA  32.65 
 
 
457 aa  112  9e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0371269 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2015  pH-dependent sodium/proton antiporter  31.44 
 
 
389 aa  112  1.0000000000000001e-23  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4197  Na+/H+ antiporter NhaA  30.41 
 
 
401 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.917396  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0214  Na+/H+ antiporter NhaA  29.48 
 
 
439 aa  112  1.0000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.83663 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4283  pH-dependent sodium/proton antiporter  31.38 
 
 
391 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3347  pH-dependent sodium/proton antiporter  32.75 
 
 
407 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1645  pH-dependent sodium/proton antiporter  31.05 
 
 
389 aa  111  2.0000000000000002e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2666  Na+/H+ antiporter NhaA  32 
 
 
445 aa  111  3e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.657461  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05370  NA(+)/H(+) antiporter 1  28.08 
 
 
435 aa  110  4.0000000000000004e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.765198  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0688  Na+/H+ antiporter NhaA  31.97 
 
 
389 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4842  Na+/H+ antiporter NhaA  29.69 
 
 
413 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0869  putative Na+/H+ antiporter NhaA  29.81 
 
 
419 aa  110  4.0000000000000004e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6194  Na+/H+ antiporter NhaA  31.4 
 
 
379 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.219672 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3699  pH-dependent sodium/proton antiporter  30.5 
 
 
397 aa  110  5e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.262179 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0963  pH-dependent sodium/proton antiporter  31.45 
 
 
395 aa  110  5e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000193238  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2016  Na+/H+ antiporter NhaA  28.12 
 
 
382 aa  110  6e-23  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0405  Na+/H+ antiporter NhaA  30.59 
 
 
437 aa  109  7.000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1234  pH-dependent sodium/proton antiporter  30.68 
 
 
395 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.400812  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1802  cyclic nucleotide-binding protein  30.2 
 
 
876 aa  109  7.000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668239  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4662  Na+/H+ antiporter NhaA  28.5 
 
 
438 aa  109  9.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000933832 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1861  Na+/H+ antiporter NhaA  29.95 
 
 
451 aa  108  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.995313  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2205  Na+/H+ antiporter NhaA  29.95 
 
 
436 aa  108  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.29594  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>