230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3655 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_3655  Na+/H+ antiporter NhaA  100 
 
 
420 aa  832    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.287299 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3397  Na+/H+ antiporter NhaA  44.42 
 
 
389 aa  284  2.0000000000000002e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0458674  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2303  Na+/H+ antiporter family protein  42.04 
 
 
382 aa  278  1e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1089  Na+/H+ antiporter NhaA  42.28 
 
 
382 aa  269  8.999999999999999e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00816034  hitchhiker  0.0000107975 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2987  Na+/H+ antiporter NhaA  41.81 
 
 
382 aa  266  7e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000224561  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1573  Na+/H+ antiporter NhaA  40.86 
 
 
382 aa  259  8e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1821  Na+/H+ antiporter NhaA  45.01 
 
 
378 aa  258  1e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.130379  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3343  Na+/H+ antiporter NhaA  41.87 
 
 
385 aa  258  2e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3369  Na+/H+ antiporter NhaA  42.28 
 
 
386 aa  254  3e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0071  Na+/H+ antiporter NhaA  42.14 
 
 
382 aa  250  4e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0902  Na+/H+ antiporter NhaA  40.94 
 
 
385 aa  247  3e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.75198e-32 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0585  Na+/H+ antiporter NhaA  35.21 
 
 
423 aa  142  8e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10430  Na+/H+ antiporter NhaA  30.7 
 
 
444 aa  136  6.0000000000000005e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.745936  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02646  pH-dependent sodium/proton antiporter  33.69 
 
 
391 aa  134  3.9999999999999996e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003767  Na+/H+ antiporter NhaA type  32.35 
 
 
383 aa  128  2.0000000000000002e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2616  Na+/H+ antiporter NhaA  34.6 
 
 
391 aa  126  7e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.536675  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0214  Na+/H+ antiporter NhaA  32.74 
 
 
439 aa  126  8.000000000000001e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.83663 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5677  Na+/H+ antiporter NhaA  33.17 
 
 
404 aa  125  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.575468  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5554  Na+/H+ antiporter NhaA  30.57 
 
 
451 aa  124  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.477487  normal  0.958846 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2853  Na+/H+ antiporter NhaA  31.63 
 
 
455 aa  123  5e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6194  Na+/H+ antiporter NhaA  32.75 
 
 
379 aa  123  5e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.219672 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2645  Na+/H+ antiporter NhaA  36.49 
 
 
390 aa  123  5e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1152  Na+/H+ antiporter NhaA  33.16 
 
 
453 aa  123  6e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0044  pH-dependent sodium/proton antiporter  35.28 
 
 
388 aa  123  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0043  pH-dependent sodium/proton antiporter  35.28 
 
 
388 aa  123  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0043  pH-dependent sodium/proton antiporter  35.28 
 
 
388 aa  123  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.62168  normal  0.149849 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0042  pH-dependent sodium/proton antiporter  35.28 
 
 
388 aa  123  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.975088  hitchhiker  0.00613874 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27000  Na+/H+ antiporter NhaA  34.88 
 
 
429 aa  123  7e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.358876  normal  0.743342 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0044  pH-dependent sodium/proton antiporter  35.28 
 
 
388 aa  123  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2512  Na+/H+ antiporter NhaA  33.08 
 
 
451 aa  123  7e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0116131  normal  0.0122824 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4069  Na+/H+ antiporter NhaA  31.55 
 
 
455 aa  122  9.999999999999999e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.16071 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3059  Na+/H+ antiporter NhaA  31.1 
 
 
452 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2771  Na+/H+ antiporter NhaA  30.84 
 
 
450 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00813597  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4405  Na+/H+ antiporter NhaA  32.14 
 
 
408 aa  121  1.9999999999999998e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05370  NA(+)/H(+) antiporter 1  30.73 
 
 
435 aa  121  3e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.765198  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0869  putative Na+/H+ antiporter NhaA  29.28 
 
 
419 aa  120  4.9999999999999996e-26  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4283  pH-dependent sodium/proton antiporter  34.44 
 
 
391 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1390  Na+/H+ antiporter NhaA  34.23 
 
 
391 aa  120  6e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4510  Na+/H+ antiporter NhaA  30.57 
 
 
422 aa  120  6e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3264  sodium-proton antiporter NhaA  32.31 
 
 
382 aa  119  7e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000713954 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0371  Na+/H+ antiporter NhaA  30.13 
 
 
452 aa  120  7e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1563  pH-dependent sodium/proton antiporter  33.01 
 
 
421 aa  119  9.999999999999999e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.172648  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2941  pH-dependent sodium/proton antiporter  34.31 
 
 
394 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.135486  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5991  pH-dependent sodium/proton antiporter  31.58 
 
 
399 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.688009  normal  0.157669 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2277  pH-dependent sodium/proton antiporter  33.72 
 
 
397 aa  118  1.9999999999999998e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00329368  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3578  Na+/H+ antiporter NhaA  34.57 
 
 
388 aa  117  3e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00256476  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0694  pH-dependent sodium/proton antiporter  36.29 
 
 
398 aa  117  3.9999999999999997e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000263731  hitchhiker  0.00301245 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3464  pH-dependent sodium/proton antiporter  34.56 
 
 
394 aa  117  5e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000517181  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0515  pH-dependent sodium/proton antiporter  31.64 
 
 
393 aa  116  6.9999999999999995e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3592  pH-dependent sodium/proton antiporter  34.56 
 
 
394 aa  116  7.999999999999999e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000151252  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1868  Na+/H+ antiporter NhaA  30.62 
 
 
453 aa  116  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.138297 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00018  pH-dependent sodium/proton antiporter  34.29 
 
 
388 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.89758  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0017  pH-dependent sodium/proton antiporter  34.29 
 
 
388 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3638  pH-dependent sodium/proton antiporter  34.29 
 
 
388 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1489  pH-dependent sodium/proton antiporter  31.93 
 
 
384 aa  115  1.0000000000000001e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0017  pH-dependent sodium/proton antiporter  34.29 
 
 
388 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.453914  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0019  pH-dependent sodium/proton antiporter  34.29 
 
 
388 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0237343  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0016  pH-dependent sodium/proton antiporter  34.29 
 
 
388 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000467126  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0019  pH-dependent sodium/proton antiporter  34.29 
 
 
388 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.046286  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00019  hypothetical protein  34.29 
 
 
388 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.892896  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0795  pH-dependent sodium/proton antiporter  34.56 
 
 
394 aa  115  1.0000000000000001e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000129218  normal  0.24433 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1336  pH-dependent sodium/proton antiporter  33.72 
 
 
389 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1390  Na+/H+ antiporter NhaA  30.43 
 
 
396 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.168803  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1025  pH-dependent sodium/proton antiporter  33.01 
 
 
391 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0583  pH-dependent sodium/proton antiporter  31.86 
 
 
392 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0187832  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7296  pH-dependent sodium/proton antiporter  33.42 
 
 
399 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.059957  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1390  pH-dependent sodium/proton antiporter  34.12 
 
 
391 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000519432  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1147  pH-dependent sodium/proton antiporter  34.38 
 
 
391 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0580  pH-dependent sodium/proton antiporter  34.05 
 
 
391 aa  113  6e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0119541  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3958  sodium-proton antiporter, NhaA family  29.69 
 
 
453 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.529436 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1876  Na+/H+ antiporter  29.03 
 
 
387 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00181634 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1756  Na+/H+ antiporter NhaA  30.88 
 
 
394 aa  112  1.0000000000000001e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0345  Na+/H+ antiporter NhaA  31.41 
 
 
434 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0868  pH-dependent sodium/proton antiporter  34 
 
 
391 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.128339 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0544  pH-dependent sodium/proton antiporter  33.05 
 
 
401 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0683  Kef-type K+ transport system membrane protein  27.57 
 
 
472 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3022  Na+/H+ antiporter NhaA  32.12 
 
 
395 aa  111  3e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.396021  normal  0.0264038 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0893  Na+/H+ antiporter NhaA  32.64 
 
 
470 aa  110  3e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1233  pH-dependent sodium/proton antiporter  32.69 
 
 
382 aa  111  3e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000535639  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2026  pH-dependent sodium/proton antiporter  32.39 
 
 
382 aa  111  3e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.470958  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2860  pH-dependent sodium/proton antiporter  32.63 
 
 
389 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.611153  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2942  pH-dependent sodium/proton antiporter  32.63 
 
 
389 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0919251  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2570  Na+/H+ antiporter NhaA  29.48 
 
 
472 aa  110  4.0000000000000004e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0128  Na+/H+ antiporter NhaA  31.79 
 
 
399 aa  110  5e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.124586  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2307  Na+/H+ antiporter NhaA  30.23 
 
 
455 aa  110  7.000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1234  pH-dependent sodium/proton antiporter  34.6 
 
 
395 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.400812  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2016  Na+/H+ antiporter NhaA  30.03 
 
 
382 aa  109  7.000000000000001e-23  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2205  Na+/H+ antiporter NhaA  30.43 
 
 
436 aa  109  7.000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.29594  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4950  Na+/H+ antiporter NhaA  33.1 
 
 
465 aa  109  7.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.29184  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0065  Na+/H+ antiporter NhaA  29.74 
 
 
402 aa  109  7.000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000634714  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0222  Na+/H+ antiporter NhaA  28.67 
 
 
475 aa  109  8.000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1861  Na+/H+ antiporter NhaA  30.43 
 
 
451 aa  109  9.000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.995313  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1480  Na+/H+ antiporter NhaA  30.91 
 
 
450 aa  109  9.000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.627445  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4598  Na+/H+ antiporter NhaA  33.06 
 
 
408 aa  109  1e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3851  pH-dependent sodium/proton antiporter  33.24 
 
 
398 aa  109  1e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.79655  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0842  pH-dependent sodium/proton antiporter  31.38 
 
 
390 aa  109  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1827  Na+/H+ antiporter NhaA  29.76 
 
 
382 aa  108  2e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5174  sodium-proton antiporter NhaA  32.4 
 
 
391 aa  108  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3699  pH-dependent sodium/proton antiporter  30.42 
 
 
397 aa  108  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.262179 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3038  pH-dependent sodium/proton antiporter  32.01 
 
 
389 aa  108  2e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.474949 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>