230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0902 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3343  Na+/H+ antiporter NhaA  92.21 
 
 		 385 aa  697    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0902  Na+/H+ antiporter NhaA  100 
 
 		 385 aa  748    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.75198e-32 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2303  Na+/H+ antiporter family protein  70.17 
 
 		 382 aa  512  1e-144  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1089  Na+/H+ antiporter NhaA  68.27 
 
 		 382 aa  501  1e-140  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00816034  hitchhiker  0.0000107975 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1573  Na+/H+ antiporter NhaA  63.93 
 
 		 382 aa  483  1e-135  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3397  Na+/H+ antiporter NhaA  61.5 
 
 		 389 aa  472  1e-132  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0458674  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0071  Na+/H+ antiporter NhaA  66.13 
 
 		 382 aa  466  9.999999999999999e-131  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1821  Na+/H+ antiporter NhaA  66.03 
 
 		 378 aa  465  9.999999999999999e-131  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.130379  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2987  Na+/H+ antiporter NhaA  67.12 
 
 		 382 aa  463  1e-129  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000224561  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3369  Na+/H+ antiporter NhaA  64.94 
 
 		 386 aa  456  1e-127  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3655  Na+/H+ antiporter NhaA  40.94 
 
 		 420 aa  247  2e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.287299 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0585  Na+/H+ antiporter NhaA  36.34 
 
 		 423 aa  142  9.999999999999999e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3958  sodium-proton antiporter, NhaA family  34.65 
 
 		 453 aa  138  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.529436 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1868  Na+/H+ antiporter NhaA  35.4 
 
 		 453 aa  138  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.138297 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0893  Na+/H+ antiporter NhaA  35.06 
 
 		 470 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02646  pH-dependent sodium/proton antiporter  33.24 
 
 		 391 aa  133  5e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2853  Na+/H+ antiporter NhaA  33.85 
 
 		 455 aa  132  9e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003767  Na+/H+ antiporter NhaA type  33.14 
 
 		 383 aa  130  3e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3059  Na+/H+ antiporter NhaA  33.08 
 
 		 452 aa  131  3e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2773  Na+/H+ antiporter NhaA  32.32 
 
 		 612 aa  127  4.0000000000000003e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.461609 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10430  Na+/H+ antiporter NhaA  34.29 
 
 		 444 aa  125  9e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.745936  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5677  Na+/H+ antiporter NhaA  33.24 
 
 		 404 aa  121  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.575468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7296  pH-dependent sodium/proton antiporter  34.56 
 
 		 399 aa  120  3e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.059957  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0694  pH-dependent sodium/proton antiporter  34.2 
 
 		 398 aa  120  3e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000263731  hitchhiker  0.00301245 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2616  Na+/H+ antiporter NhaA  34.2 
 
 		 391 aa  120  3.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.536675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1233  pH-dependent sodium/proton antiporter  34.14 
 
 		 382 aa  119  7e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000535639  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2645  Na+/H+ antiporter NhaA  35.29 
 
 		 390 aa  118  1.9999999999999998e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0683  Kef-type K+ transport system membrane protein  30.81 
 
 		 472 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0214  Na+/H+ antiporter NhaA  29.76 
 
 		 439 aa  118  1.9999999999999998e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.83663 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07000  Na+/H+ antiporter NhaA  34.67 
 
 		 514 aa  116  5e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.107154  normal  0.0342501 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0017  pH-dependent sodium/proton antiporter  33.43 
 
 		 388 aa  116  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.453914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1152  Na+/H+ antiporter NhaA  34.71 
 
 		 453 aa  116  6.9999999999999995e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00018  pH-dependent sodium/proton antiporter  33.43 
 
 		 388 aa  116  7.999999999999999e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.89758  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0019  pH-dependent sodium/proton antiporter  33.43 
 
 		 388 aa  116  7.999999999999999e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0237343  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0019  pH-dependent sodium/proton antiporter  33.43 
 
 		 388 aa  116  7.999999999999999e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.046286  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0016  pH-dependent sodium/proton antiporter  33.43 
 
 		 388 aa  116  7.999999999999999e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000467126  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00019  hypothetical protein  33.43 
 
 		 388 aa  116  7.999999999999999e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.892896  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0017  pH-dependent sodium/proton antiporter  33.43 
 
 		 388 aa  116  7.999999999999999e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3638  pH-dependent sodium/proton antiporter  33.43 
 
 		 388 aa  116  7.999999999999999e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13458  putative Na+/H+ antiporter  30.05 
 
 		 427 aa  116  7.999999999999999e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.466525  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1336  pH-dependent sodium/proton antiporter  32.93 
 
 		 389 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1838  pH-dependent sodium/proton antiporter  32.34 
 
 		 400 aa  115  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0044  pH-dependent sodium/proton antiporter  32.29 
 
 		 388 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27000  Na+/H+ antiporter NhaA  33.43 
 
 		 429 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.358876  normal  0.743342 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0043  pH-dependent sodium/proton antiporter  32.29 
 
 		 388 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.62168  normal  0.149849 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0044  pH-dependent sodium/proton antiporter  32.29 
 
 		 388 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0043  pH-dependent sodium/proton antiporter  32.29 
 
 		 388 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1189  pH-dependent sodium/proton antiporter  32.71 
 
 		 389 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.685573  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0042  pH-dependent sodium/proton antiporter  32.29 
 
 		 388 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.975088  hitchhiker  0.00613874 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3124  pH-dependent sodium/proton antiporter  32.71 
 
 		 389 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.646901  normal  0.440513 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2277  pH-dependent sodium/proton antiporter  33.33 
 
 		 397 aa  114  2.0000000000000002e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00329368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0371  Na+/H+ antiporter NhaA  33.33 
 
 		 452 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1233  pH-dependent sodium/proton antiporter  32.71 
 
 		 389 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1266  pH-dependent sodium/proton antiporter  32.71 
 
 		 389 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3578  Na+/H+ antiporter NhaA  33.14 
 
 		 388 aa  113  5e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00256476  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2307  Na+/H+ antiporter NhaA  31.67 
 
 		 455 aa  113  5e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2123  pH-dependent sodium/proton antiporter  32.04 
 
 		 400 aa  113  6e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0369  pH-dependent sodium/proton antiporter  31.14 
 
 		 399 aa  113  6e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0301682  hitchhiker  0.000785162 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05370  NA(+)/H(+) antiporter 1  28.71 
 
 		 435 aa  112  1.0000000000000001e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.765198  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4662  Na+/H+ antiporter NhaA  30.17 
 
 		 438 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000933832 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1101  Na+/H+ antiporter NhaA  30.7 
 
 		 458 aa  111  2.0000000000000002e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0580  pH-dependent sodium/proton antiporter  31.59 
 
 		 391 aa  111  2.0000000000000002e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0119541  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2026  pH-dependent sodium/proton antiporter  31.09 
 
 		 382 aa  110  3e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.470958  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0869  putative Na+/H+ antiporter NhaA  30.88 
 
 		 419 aa  110  4.0000000000000004e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1762  Na(+)/H(+) antiporter 1  31.55 
 
 		 464 aa  110  4.0000000000000004e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6928  Na+/H+ antiporter NhaA  32.58 
 
 		 446 aa  110  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.126973  normal  0.148656 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0868  pH-dependent sodium/proton antiporter  35.15 
 
 		 391 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.128339 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1147  pH-dependent sodium/proton antiporter  31.9 
 
 		 391 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6362  Na+/H+ antiporter NhaA  32.35 
 
 		 475 aa  110  4.0000000000000004e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5991  pH-dependent sodium/proton antiporter  34.68 
 
 		 399 aa  110  5e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.688009  normal  0.157669 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3507  Na+/H+ antiporter NhaA  33.52 
 
 		 429 aa  110  5e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.486632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2860  pH-dependent sodium/proton antiporter  31.78 
 
 		 389 aa  110  6e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.611153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2942  pH-dependent sodium/proton antiporter  31.78 
 
 		 389 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0919251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4950  Na+/H+ antiporter NhaA  31.73 
 
 		 465 aa  108  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.29184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1390  pH-dependent sodium/proton antiporter  32.12 
 
 		 391 aa  109  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000519432  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3038  pH-dependent sodium/proton antiporter  31.46 
 
 		 389 aa  108  1e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.474949 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2512  Na+/H+ antiporter NhaA  34.62 
 
 		 451 aa  108  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0116131  normal  0.0122824 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1657  Na+/H+ antiporter NhaA  31.74 
 
 		 432 aa  108  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.017914 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4210  pH-dependent sodium/proton antiporter  33.24 
 
 		 392 aa  108  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.400142  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0583  pH-dependent sodium/proton antiporter  31.62 
 
 		 392 aa  108  2e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0187832  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6044  pH-dependent sodium/proton antiporter  34.82 
 
 		 400 aa  108  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.227636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12160  Na+/H+ antiporter NhaA  32.58 
 
 		 436 aa  108  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0688  Na+/H+ antiporter NhaA  32.25 
 
 		 389 aa  107  3e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1784  Na+/H+ antiporter NhaA  32.19 
 
 		 444 aa  107  5e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1861  Na+/H+ antiporter NhaA  28.78 
 
 		 451 aa  106  7e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.995313  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2205  Na+/H+ antiporter NhaA  28.78 
 
 		 436 aa  106  8e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.29594  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0544  pH-dependent sodium/proton antiporter  31.75 
 
 		 401 aa  105  9e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2771  Na+/H+ antiporter NhaA  31.41 
 
 		 450 aa  105  9e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00813597  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3657  pH-dependent sodium/proton antiporter  31.83 
 
 		 398 aa  105  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.457018  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0405  Na+/H+ antiporter NhaA  32.9 
 
 		 437 aa  105  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4533  sodium-proton antiporter NhaA  33.15 
 
 		 392 aa  105  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3264  sodium-proton antiporter NhaA  30.87 
 
 		 382 aa  105  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000713954 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1756  Na+/H+ antiporter NhaA  30.98 
 
 		 394 aa  104  2e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3592  pH-dependent sodium/proton antiporter  33.85 
 
 		 394 aa  105  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000151252  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0842  pH-dependent sodium/proton antiporter  31.62 
 
 		 390 aa  104  3e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5554  Na+/H+ antiporter NhaA  31.69 
 
 		 451 aa  104  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.477487  normal  0.958846 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3851  pH-dependent sodium/proton antiporter  31.3 
 
 		 398 aa  104  3e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.79655  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4069  Na+/H+ antiporter NhaA  30.56 
 
 		 455 aa  104  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.16071 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2941  pH-dependent sodium/proton antiporter  31.48 
 
 		 394 aa  104  3e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.135486  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0795  pH-dependent sodium/proton antiporter  33.85 
 
 		 394 aa  104  3e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000129218  normal  0.24433 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>