230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2303 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2303  Na+/H+ antiporter family protein  100 
 
 		 382 aa  748    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1089  Na+/H+ antiporter NhaA  83.25 
 
 		 382 aa  632  1e-180  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00816034  hitchhiker  0.0000107975 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1573  Na+/H+ antiporter NhaA  70.6 
 
 		 382 aa  549  1e-155  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0071  Na+/H+ antiporter NhaA  71.13 
 
 		 382 aa  526  1e-148  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2987  Na+/H+ antiporter NhaA  67.72 
 
 		 382 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000224561  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0902  Na+/H+ antiporter NhaA  70.17 
 
 		 385 aa  512  1e-144  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.75198e-32 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1821  Na+/H+ antiporter NhaA  68.18 
 
 		 378 aa  506  9.999999999999999e-143  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.130379  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3397  Na+/H+ antiporter NhaA  63.68 
 
 		 389 aa  508  9.999999999999999e-143  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0458674  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3343  Na+/H+ antiporter NhaA  67.68 
 
 		 385 aa  502  1e-141  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3369  Na+/H+ antiporter NhaA  65.53 
 
 		 386 aa  477  1e-133  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3655  Na+/H+ antiporter NhaA  42.04 
 
 		 420 aa  278  1e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.287299 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0585  Na+/H+ antiporter NhaA  35 
 
 		 423 aa  151  2e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3958  sodium-proton antiporter, NhaA family  33.26 
 
 		 453 aa  138  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.529436 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1868  Na+/H+ antiporter NhaA  32.79 
 
 		 453 aa  134  3e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.138297 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10430  Na+/H+ antiporter NhaA  31.87 
 
 		 444 aa  129  6e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.745936  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3059  Na+/H+ antiporter NhaA  32.49 
 
 		 452 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5554  Na+/H+ antiporter NhaA  32.41 
 
 		 451 aa  124  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.477487  normal  0.958846 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003767  Na+/H+ antiporter NhaA type  32.32 
 
 		 383 aa  122  9e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3264  sodium-proton antiporter NhaA  31.62 
 
 		 382 aa  120  3.9999999999999996e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000713954 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2853  Na+/H+ antiporter NhaA  31.8 
 
 		 455 aa  120  6e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7296  pH-dependent sodium/proton antiporter  32.64 
 
 		 399 aa  119  6e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.059957  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02646  pH-dependent sodium/proton antiporter  32.55 
 
 		 391 aa  120  6e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0214  Na+/H+ antiporter NhaA  30.05 
 
 		 439 aa  119  7e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.83663 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0893  Na+/H+ antiporter NhaA  32.76 
 
 		 470 aa  119  9e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5677  Na+/H+ antiporter NhaA  32.9 
 
 		 404 aa  119  9e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.575468  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05370  NA(+)/H(+) antiporter 1  29.44 
 
 		 435 aa  117  3.9999999999999997e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.765198  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2026  pH-dependent sodium/proton antiporter  31.5 
 
 		 382 aa  116  6.9999999999999995e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.470958  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1838  pH-dependent sodium/proton antiporter  30.03 
 
 		 400 aa  115  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0044  pH-dependent sodium/proton antiporter  32.49 
 
 		 388 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0043  pH-dependent sodium/proton antiporter  32.49 
 
 		 388 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0044  pH-dependent sodium/proton antiporter  32.49 
 
 		 388 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0043  pH-dependent sodium/proton antiporter  32.49 
 
 		 388 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.62168  normal  0.149849 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0042  pH-dependent sodium/proton antiporter  32.49 
 
 		 388 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.975088  hitchhiker  0.00613874 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2262  pH-dependent sodium/proton antiporter  30 
 
 		 436 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.50629  normal  0.0112773 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1649  Na+/H+ antiporter NhaA  31.11 
 
 		 468 aa  115  2.0000000000000002e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.349535  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2118  pH-dependent sodium/proton antiporter  29.77 
 
 		 436 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0195602 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5991  pH-dependent sodium/proton antiporter  32.77 
 
 		 399 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.688009  normal  0.157669 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6362  Na+/H+ antiporter NhaA  29.88 
 
 		 475 aa  114  4.0000000000000004e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0371  Na+/H+ antiporter NhaA  30.13 
 
 		 452 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2773  Na+/H+ antiporter NhaA  30.68 
 
 		 612 aa  113  5e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.461609 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0694  pH-dependent sodium/proton antiporter  32.84 
 
 		 398 aa  113  5e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000263731  hitchhiker  0.00301245 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2616  Na+/H+ antiporter NhaA  32.82 
 
 		 391 aa  112  8.000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.536675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0369  pH-dependent sodium/proton antiporter  30.93 
 
 		 399 aa  112  9e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0301682  hitchhiker  0.000785162 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2645  Na+/H+ antiporter NhaA  31.61 
 
 		 390 aa  112  1.0000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2123  pH-dependent sodium/proton antiporter  29.49 
 
 		 400 aa  112  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12160  Na+/H+ antiporter NhaA  32.99 
 
 		 436 aa  110  3e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4405  Na+/H+ antiporter NhaA  31.37 
 
 		 408 aa  110  3e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3578  Na+/H+ antiporter NhaA  31.89 
 
 		 388 aa  110  5e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00256476  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1696  Na+/H+ antiporter NhaA  33.06 
 
 		 600 aa  110  5e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1756  Na+/H+ antiporter NhaA  29.46 
 
 		 394 aa  109  8.000000000000001e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0842  pH-dependent sodium/proton antiporter  29.66 
 
 		 390 aa  108  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1390  Na+/H+ antiporter NhaA  30.02 
 
 		 396 aa  109  1e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.168803  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3089  Na+/H+ antiporter NhaA  30.1 
 
 		 406 aa  108  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.761361  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0017  pH-dependent sodium/proton antiporter  31.89 
 
 		 388 aa  108  1e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.453914  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00018  pH-dependent sodium/proton antiporter  31.89 
 
 		 388 aa  108  2e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.89758  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00019  hypothetical protein  31.89 
 
 		 388 aa  108  2e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.892896  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1488  Na+/H+ antiporter  29.55 
 
 		 386 aa  108  2e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27000  Na+/H+ antiporter NhaA  32.39 
 
 		 429 aa  108  2e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.358876  normal  0.743342 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3638  pH-dependent sodium/proton antiporter  31.89 
 
 		 388 aa  108  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0019  pH-dependent sodium/proton antiporter  31.89 
 
 		 388 aa  108  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.046286  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0017  pH-dependent sodium/proton antiporter  31.89 
 
 		 388 aa  108  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0869  putative Na+/H+ antiporter NhaA  29.66 
 
 		 419 aa  108  2e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0019  pH-dependent sodium/proton antiporter  31.89 
 
 		 388 aa  108  2e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0237343  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0016  pH-dependent sodium/proton antiporter  31.89 
 
 		 388 aa  108  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000467126  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1152  Na+/H+ antiporter NhaA  32.96 
 
 		 453 aa  108  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2582  Na+/H+ antiporter NhaA  32.06 
 
 		 393 aa  107  3e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1762  Na(+)/H(+) antiporter 1  30.21 
 
 		 464 aa  107  3e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4069  Na+/H+ antiporter NhaA  28.88 
 
 		 455 aa  107  4e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.16071 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1489  pH-dependent sodium/proton antiporter  27.74 
 
 		 384 aa  107  4e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1233  pH-dependent sodium/proton antiporter  30.14 
 
 		 382 aa  107  5e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000535639  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4950  Na+/H+ antiporter NhaA  30.95 
 
 		 465 aa  106  6e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.29184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2666  Na+/H+ antiporter NhaA  32.83 
 
 		 445 aa  105  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.657461  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3657  pH-dependent sodium/proton antiporter  31.58 
 
 		 398 aa  105  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.457018  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3828  Na+/H+ antiporter NhaA  30.37 
 
 		 457 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0371269 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3347  pH-dependent sodium/proton antiporter  34.41 
 
 		 407 aa  105  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00573  Na+/H+ antiporter, NhaA  29.62 
 
 		 424 aa  105  1e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2512  Na+/H+ antiporter NhaA  32.68 
 
 		 451 aa  104  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0116131  normal  0.0122824 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4197  Na+/H+ antiporter NhaA  32.35 
 
 		 401 aa  105  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.917396  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1390  pH-dependent sodium/proton antiporter  30 
 
 		 391 aa  105  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000519432  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1861  Na+/H+ antiporter NhaA  28.74 
 
 		 451 aa  104  3e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.995313  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2205  Na+/H+ antiporter NhaA  28.37 
 
 		 436 aa  104  3e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.29594  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6928  Na+/H+ antiporter NhaA  31.14 
 
 		 446 aa  104  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.126973  normal  0.148656 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1390  Na+/H+ antiporter NhaA  29.28 
 
 		 391 aa  103  4e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1802  cyclic nucleotide-binding protein  30.54 
 
 		 876 aa  103  4e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668239  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1189  pH-dependent sodium/proton antiporter  30.81 
 
 		 389 aa  103  4e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.685573  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6194  Na+/H+ antiporter NhaA  28.93 
 
 		 379 aa  103  5e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.219672 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1336  pH-dependent sodium/proton antiporter  30.46 
 
 		 389 aa  103  6e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3124  pH-dependent sodium/proton antiporter  30.81 
 
 		 389 aa  103  7e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.646901  normal  0.440513 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1233  pH-dependent sodium/proton antiporter  30.81 
 
 		 389 aa  103  7e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4842  Na+/H+ antiporter NhaA  30.81 
 
 		 413 aa  102  8e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1645  pH-dependent sodium/proton antiporter  29.91 
 
 		 389 aa  102  8e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0683  Kef-type K+ transport system membrane protein  28.65 
 
 		 472 aa  102  9e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1266  pH-dependent sodium/proton antiporter  30.56 
 
 		 389 aa  102  9e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4210  pH-dependent sodium/proton antiporter  31.86 
 
 		 392 aa  102  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.400142  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1826  pH-dependent sodium/proton antiporter  29.5 
 
 		 389 aa  101  2e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.243343  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3851  pH-dependent sodium/proton antiporter  31.77 
 
 		 398 aa  101  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.79655  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0405  Na+/H+ antiporter NhaA  31.58 
 
 		 437 aa  101  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3038  pH-dependent sodium/proton antiporter  30.3 
 
 		 389 aa  101  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.474949 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3610  Na+/H+ antiporter NhaA  33.33 
 
 		 413 aa  101  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.150292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3464  pH-dependent sodium/proton antiporter  32.58 
 
 		 394 aa  100  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000517181  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>