230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1821 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_1821  Na+/H+ antiporter NhaA  100 
 
 		 378 aa  743    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.130379  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2987  Na+/H+ antiporter NhaA  72.87 
 
 		 382 aa  542  1e-153  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000224561  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2303  Na+/H+ antiporter family protein  68.18 
 
 		 382 aa  522  1e-147  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1089  Na+/H+ antiporter NhaA  68.78 
 
 		 382 aa  508  1e-143  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00816034  hitchhiker  0.0000107975 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1573  Na+/H+ antiporter NhaA  65.07 
 
 		 382 aa  498  1e-140  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0902  Na+/H+ antiporter NhaA  66.03 
 
 		 385 aa  481  1e-134  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.75198e-32 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3343  Na+/H+ antiporter NhaA  65.21 
 
 		 385 aa  478  1e-133  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3397  Na+/H+ antiporter NhaA  61.87 
 
 		 389 aa  476  1e-133  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0458674  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3369  Na+/H+ antiporter NhaA  66.22 
 
 		 386 aa  472  1e-132  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0071  Na+/H+ antiporter NhaA  63.56 
 
 		 382 aa  467  9.999999999999999e-131  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3655  Na+/H+ antiporter NhaA  45.01 
 
 		 420 aa  273  5.000000000000001e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.287299 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0585  Na+/H+ antiporter NhaA  35.2 
 
 		 423 aa  147  3e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0893  Na+/H+ antiporter NhaA  34.22 
 
 		 470 aa  140  3e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3958  sodium-proton antiporter, NhaA family  31.79 
 
 		 453 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.529436 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1868  Na+/H+ antiporter NhaA  32.25 
 
 		 453 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.138297 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3059  Na+/H+ antiporter NhaA  32.2 
 
 		 452 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3828  Na+/H+ antiporter NhaA  32.94 
 
 		 457 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0371269 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1152  Na+/H+ antiporter NhaA  34.65 
 
 		 453 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10430  Na+/H+ antiporter NhaA  31.18 
 
 		 444 aa  127  3e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.745936  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3264  sodium-proton antiporter NhaA  32.2 
 
 		 382 aa  125  1e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000713954 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2512  Na+/H+ antiporter NhaA  34.65 
 
 		 451 aa  123  4e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0116131  normal  0.0122824 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27000  Na+/H+ antiporter NhaA  34.11 
 
 		 429 aa  122  9e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.358876  normal  0.743342 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0044  pH-dependent sodium/proton antiporter  32.83 
 
 		 388 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2853  Na+/H+ antiporter NhaA  31.51 
 
 		 455 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2645  Na+/H+ antiporter NhaA  32.55 
 
 		 390 aa  121  1.9999999999999998e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0043  pH-dependent sodium/proton antiporter  32.83 
 
 		 388 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0043  pH-dependent sodium/proton antiporter  32.83 
 
 		 388 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.62168  normal  0.149849 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12160  Na+/H+ antiporter NhaA  34.34 
 
 		 436 aa  121  1.9999999999999998e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5554  Na+/H+ antiporter NhaA  29.54 
 
 		 451 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.477487  normal  0.958846 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0044  pH-dependent sodium/proton antiporter  32.83 
 
 		 388 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0042  pH-dependent sodium/proton antiporter  32.83 
 
 		 388 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.975088  hitchhiker  0.00613874 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1838  pH-dependent sodium/proton antiporter  29.91 
 
 		 400 aa  120  3e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3578  Na+/H+ antiporter NhaA  33.13 
 
 		 388 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00256476  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5677  Na+/H+ antiporter NhaA  31.71 
 
 		 404 aa  120  3.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.575468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2123  pH-dependent sodium/proton antiporter  29.91 
 
 		 400 aa  120  4.9999999999999996e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02646  pH-dependent sodium/proton antiporter  30.42 
 
 		 391 aa  119  7e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00018  pH-dependent sodium/proton antiporter  32.24 
 
 		 388 aa  119  7.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.89758  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0017  pH-dependent sodium/proton antiporter  32.24 
 
 		 388 aa  119  7.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0019  pH-dependent sodium/proton antiporter  32.24 
 
 		 388 aa  119  7.999999999999999e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.046286  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3638  pH-dependent sodium/proton antiporter  32.24 
 
 		 388 aa  119  7.999999999999999e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0016  pH-dependent sodium/proton antiporter  32.24 
 
 		 388 aa  119  7.999999999999999e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000467126  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00019  hypothetical protein  32.24 
 
 		 388 aa  119  7.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.892896  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0019  pH-dependent sodium/proton antiporter  32.24 
 
 		 388 aa  119  7.999999999999999e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0237343  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0017  pH-dependent sodium/proton antiporter  32.24 
 
 		 388 aa  119  9e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.453914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003767  Na+/H+ antiporter NhaA type  29.53 
 
 		 383 aa  117  1.9999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3089  Na+/H+ antiporter NhaA  35.08 
 
 		 406 aa  117  3e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.761361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2277  pH-dependent sodium/proton antiporter  31.79 
 
 		 397 aa  117  5e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00329368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2666  Na+/H+ antiporter NhaA  31.99 
 
 		 445 aa  116  7.999999999999999e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.657461  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6362  Na+/H+ antiporter NhaA  30.22 
 
 		 475 aa  115  8.999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1233  pH-dependent sodium/proton antiporter  29.4 
 
 		 382 aa  114  2.0000000000000002e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000535639  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1861  Na+/H+ antiporter NhaA  33.69 
 
 		 451 aa  115  2.0000000000000002e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.995313  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2205  Na+/H+ antiporter NhaA  33.69 
 
 		 436 aa  114  3e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.29594  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00573  Na+/H+ antiporter, NhaA  28.11 
 
 		 424 aa  114  3e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2773  Na+/H+ antiporter NhaA  32.78 
 
 		 612 aa  114  3e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.461609 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2307  Na+/H+ antiporter NhaA  30.24 
 
 		 455 aa  113  5e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6194  Na+/H+ antiporter NhaA  29.17 
 
 		 379 aa  112  7.000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.219672 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0842  pH-dependent sodium/proton antiporter  30.4 
 
 		 390 aa  112  8.000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2616  Na+/H+ antiporter NhaA  32.14 
 
 		 391 aa  112  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.536675  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1336  pH-dependent sodium/proton antiporter  29.87 
 
 		 389 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0694  pH-dependent sodium/proton antiporter  31.69 
 
 		 398 aa  112  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000263731  hitchhiker  0.00301245 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0476  Na+/H+ antiporter NhaA  30.39 
 
 		 408 aa  111  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5991  pH-dependent sodium/proton antiporter  32.66 
 
 		 399 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.688009  normal  0.157669 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3464  pH-dependent sodium/proton antiporter  31.18 
 
 		 394 aa  110  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000517181  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4950  Na+/H+ antiporter NhaA  29.78 
 
 		 465 aa  110  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.29184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0683  Kef-type K+ transport system membrane protein  28.18 
 
 		 472 aa  110  3e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3657  pH-dependent sodium/proton antiporter  30.96 
 
 		 398 aa  110  3e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.457018  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1390  Na+/H+ antiporter NhaA  28.53 
 
 		 391 aa  110  3e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0369  pH-dependent sodium/proton antiporter  28.52 
 
 		 399 aa  110  3e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0301682  hitchhiker  0.000785162 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2026  pH-dependent sodium/proton antiporter  29.75 
 
 		 382 aa  110  4.0000000000000004e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.470958  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05370  NA(+)/H(+) antiporter 1  28.3 
 
 		 435 aa  110  5e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.765198  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3592  pH-dependent sodium/proton antiporter  31.18 
 
 		 394 aa  110  6e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000151252  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3851  pH-dependent sodium/proton antiporter  30.81 
 
 		 398 aa  109  7.000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.79655  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0795  pH-dependent sodium/proton antiporter  31.18 
 
 		 394 aa  109  7.000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000129218  normal  0.24433 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1147  pH-dependent sodium/proton antiporter  30 
 
 		 391 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3022  Na+/H+ antiporter NhaA  28.4 
 
 		 395 aa  109  8.000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.396021  normal  0.0264038 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1189  pH-dependent sodium/proton antiporter  29.75 
 
 		 389 aa  109  8.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.685573  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0688  Na+/H+ antiporter NhaA  32.51 
 
 		 389 aa  108  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1784  Na+/H+ antiporter NhaA  30.1 
 
 		 444 aa  108  1e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3124  pH-dependent sodium/proton antiporter  29.75 
 
 		 389 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.646901  normal  0.440513 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2262  pH-dependent sodium/proton antiporter  31.37 
 
 		 436 aa  108  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.50629  normal  0.0112773 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1649  Na+/H+ antiporter NhaA  28.57 
 
 		 468 aa  108  1e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.349535  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1233  pH-dependent sodium/proton antiporter  29.75 
 
 		 389 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1266  pH-dependent sodium/proton antiporter  29.75 
 
 		 389 aa  109  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1234  pH-dependent sodium/proton antiporter  32.84 
 
 		 395 aa  107  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.400812  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0544  pH-dependent sodium/proton antiporter  32.16 
 
 		 401 aa  107  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4662  Na+/H+ antiporter NhaA  30.75 
 
 		 438 aa  108  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000933832 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0065  Na+/H+ antiporter NhaA  32.94 
 
 		 402 aa  108  2e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000634714  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4197  Na+/H+ antiporter NhaA  30.54 
 
 		 401 aa  108  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.917396  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2570  Na+/H+ antiporter NhaA  29.92 
 
 		 472 aa  108  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3038  pH-dependent sodium/proton antiporter  29.25 
 
 		 389 aa  108  2e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.474949 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0869  putative Na+/H+ antiporter NhaA  27 
 
 		 419 aa  108  2e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7296  pH-dependent sodium/proton antiporter  31.37 
 
 		 399 aa  108  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.059957  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0371  Na+/H+ antiporter NhaA  29.41 
 
 		 452 aa  108  2e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1762  Na(+)/H(+) antiporter 1  30.62 
 
 		 464 aa  107  3e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2942  pH-dependent sodium/proton antiporter  29 
 
 		 389 aa  107  3e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0919251  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1826  pH-dependent sodium/proton antiporter  32.03 
 
 		 389 aa  107  4e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.243343  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0066  Na+/H+ antiporter NhaA  29.6 
 
 		 433 aa  107  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13458  putative Na+/H+ antiporter  28.3 
 
 		 427 aa  107  4e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.466525  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7481  putative sodium/proton antiporter  31.67 
 
 		 629 aa  107  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2860  pH-dependent sodium/proton antiporter  29 
 
 		 389 aa  107  4e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.611153  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>