230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3369 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_3369  Na+/H+ antiporter NhaA  100 
 
 
386 aa  764    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2303  Na+/H+ antiporter family protein  65.53 
 
 
382 aa  512  1e-144  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1573  Na+/H+ antiporter NhaA  65 
 
 
382 aa  508  1e-143  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1089  Na+/H+ antiporter NhaA  65.26 
 
 
382 aa  504  1e-141  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00816034  hitchhiker  0.0000107975 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3397  Na+/H+ antiporter NhaA  62.76 
 
 
389 aa  497  1e-139  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0458674  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2987  Na+/H+ antiporter NhaA  65 
 
 
382 aa  497  1e-139  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000224561  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3343  Na+/H+ antiporter NhaA  65.44 
 
 
385 aa  494  1e-139  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0902  Na+/H+ antiporter NhaA  65.44 
 
 
385 aa  491  9.999999999999999e-139  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.75198e-32 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1821  Na+/H+ antiporter NhaA  66.22 
 
 
378 aa  489  1e-137  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.130379  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0071  Na+/H+ antiporter NhaA  64.47 
 
 
382 aa  486  1e-136  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3655  Na+/H+ antiporter NhaA  42.28 
 
 
420 aa  288  1e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.287299 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0585  Na+/H+ antiporter NhaA  35.48 
 
 
423 aa  157  3e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0893  Na+/H+ antiporter NhaA  35.28 
 
 
470 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10430  Na+/H+ antiporter NhaA  31.93 
 
 
444 aa  144  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.745936  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3059  Na+/H+ antiporter NhaA  33.92 
 
 
452 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02646  pH-dependent sodium/proton antiporter  33.82 
 
 
391 aa  141  1.9999999999999998e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1868  Na+/H+ antiporter NhaA  33.91 
 
 
453 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.138297 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3958  sodium-proton antiporter, NhaA family  33.42 
 
 
453 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.529436 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2773  Na+/H+ antiporter NhaA  33.33 
 
 
612 aa  138  2e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.461609 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003767  Na+/H+ antiporter NhaA type  32.65 
 
 
383 aa  136  8e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2853  Na+/H+ antiporter NhaA  31.98 
 
 
455 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07000  Na+/H+ antiporter NhaA  34.7 
 
 
514 aa  134  3e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.107154  normal  0.0342501 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0065  Na+/H+ antiporter NhaA  34.15 
 
 
402 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000634714  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2771  Na+/H+ antiporter NhaA  34.41 
 
 
450 aa  130  3e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00813597  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7296  pH-dependent sodium/proton antiporter  35.69 
 
 
399 aa  129  8.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.059957  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05370  NA(+)/H(+) antiporter 1  30.17 
 
 
435 aa  129  1.0000000000000001e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.765198  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5677  Na+/H+ antiporter NhaA  32.82 
 
 
404 aa  129  1.0000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.575468  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2645  Na+/H+ antiporter NhaA  34.47 
 
 
390 aa  128  1.0000000000000001e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2277  pH-dependent sodium/proton antiporter  31.38 
 
 
397 aa  128  1.0000000000000001e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00329368  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0515  pH-dependent sodium/proton antiporter  33.72 
 
 
393 aa  127  3e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5991  pH-dependent sodium/proton antiporter  33.88 
 
 
399 aa  127  3e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.688009  normal  0.157669 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1233  pH-dependent sodium/proton antiporter  33.74 
 
 
382 aa  125  1e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000535639  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2205  Na+/H+ antiporter NhaA  31.68 
 
 
436 aa  124  2e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.29594  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1861  Na+/H+ antiporter NhaA  31.68 
 
 
451 aa  124  2e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.995313  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2616  Na+/H+ antiporter NhaA  33.07 
 
 
391 aa  124  3e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.536675  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00573  Na+/H+ antiporter, NhaA  32.79 
 
 
424 aa  124  3e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2666  Na+/H+ antiporter NhaA  33.83 
 
 
445 aa  124  3e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.657461  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2026  pH-dependent sodium/proton antiporter  33.14 
 
 
382 aa  124  3e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.470958  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4950  Na+/H+ antiporter NhaA  32.53 
 
 
465 aa  123  4e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.29184  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2941  pH-dependent sodium/proton antiporter  34.53 
 
 
394 aa  123  5e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.135486  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0369  pH-dependent sodium/proton antiporter  31.83 
 
 
399 aa  122  8e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0301682  hitchhiker  0.000785162 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3347  pH-dependent sodium/proton antiporter  36.53 
 
 
407 aa  122  9e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1189  pH-dependent sodium/proton antiporter  33.51 
 
 
389 aa  122  9e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.685573  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0842  pH-dependent sodium/proton antiporter  32.41 
 
 
390 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1233  pH-dependent sodium/proton antiporter  33.51 
 
 
389 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3124  pH-dependent sodium/proton antiporter  33.51 
 
 
389 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.646901  normal  0.440513 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1266  pH-dependent sodium/proton antiporter  33.51 
 
 
389 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3610  Na+/H+ antiporter NhaA  35.36 
 
 
413 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.150292  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1838  pH-dependent sodium/proton antiporter  33.23 
 
 
400 aa  121  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4283  pH-dependent sodium/proton antiporter  33.66 
 
 
391 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3287  Na+/H+ antiporter NhaA  35.36 
 
 
413 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7108  pH-dependent sodium/proton antiporter  36.13 
 
 
396 aa  120  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.937929  normal  0.0534187 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2570  Na+/H+ antiporter NhaA  32.32 
 
 
472 aa  121  3e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0694  pH-dependent sodium/proton antiporter  34.74 
 
 
398 aa  120  3e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000263731  hitchhiker  0.00301245 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5554  Na+/H+ antiporter NhaA  29.91 
 
 
451 aa  121  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.477487  normal  0.958846 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1336  pH-dependent sodium/proton antiporter  32.71 
 
 
389 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1756  Na+/H+ antiporter NhaA  32.9 
 
 
394 aa  120  3.9999999999999996e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0371  Na+/H+ antiporter NhaA  30.46 
 
 
452 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13458  putative Na+/H+ antiporter  28.79 
 
 
427 aa  120  3.9999999999999996e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.466525  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5944  pH-dependent sodium/proton antiporter  36.13 
 
 
396 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.195827  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1390  Na+/H+ antiporter NhaA  31.72 
 
 
391 aa  120  4.9999999999999996e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0406  pH-dependent sodium/proton antiporter  33.68 
 
 
420 aa  119  6e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.364642  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0397  pH-dependent sodium/proton antiporter  33.68 
 
 
393 aa  119  7e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.311183  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1152  Na+/H+ antiporter NhaA  33.05 
 
 
453 aa  119  7.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4210  pH-dependent sodium/proton antiporter  34.66 
 
 
392 aa  119  9e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.400142  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6362  Na+/H+ antiporter NhaA  30.88 
 
 
475 aa  119  9e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4533  sodium-proton antiporter NhaA  33.33 
 
 
392 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1390  Na+/H+ antiporter NhaA  33.96 
 
 
396 aa  119  9.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.168803  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1762  Na(+)/H(+) antiporter 1  31.88 
 
 
464 aa  118  9.999999999999999e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2123  pH-dependent sodium/proton antiporter  32.63 
 
 
400 aa  118  9.999999999999999e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2512  Na+/H+ antiporter NhaA  32.49 
 
 
451 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0116131  normal  0.0122824 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0261  Na+/H+ antiporter NhaA  31.01 
 
 
390 aa  118  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.947479  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1390  pH-dependent sodium/proton antiporter  33.33 
 
 
391 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000519432  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0214  Na+/H+ antiporter NhaA  27.97 
 
 
439 aa  117  3e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.83663 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1649  Na+/H+ antiporter NhaA  31.18 
 
 
468 aa  117  3e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.349535  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3089  Na+/H+ antiporter NhaA  32.75 
 
 
406 aa  117  3.9999999999999997e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.761361  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1827  Na+/H+ antiporter NhaA  30.4 
 
 
382 aa  116  7.999999999999999e-25  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1784  Na+/H+ antiporter NhaA  32.12 
 
 
444 aa  116  7.999999999999999e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3828  Na+/H+ antiporter NhaA  30.53 
 
 
457 aa  116  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0371269 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0044  pH-dependent sodium/proton antiporter  32.51 
 
 
388 aa  116  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0042  pH-dependent sodium/proton antiporter  32.51 
 
 
388 aa  116  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.975088  hitchhiker  0.00613874 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0043  pH-dependent sodium/proton antiporter  32.51 
 
 
388 aa  116  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.62168  normal  0.149849 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1646  Na+/H+ antiporter NhaA  31.08 
 
 
382 aa  115  8.999999999999998e-25  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0044  pH-dependent sodium/proton antiporter  32.51 
 
 
388 aa  116  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0043  pH-dependent sodium/proton antiporter  32.51 
 
 
388 aa  116  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3699  pH-dependent sodium/proton antiporter  34.08 
 
 
397 aa  115  1.0000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.262179 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2860  pH-dependent sodium/proton antiporter  32.4 
 
 
389 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.611153  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2942  pH-dependent sodium/proton antiporter  32.4 
 
 
389 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0919251  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2962  Na+/H+ antiporter NhaA  32.66 
 
 
481 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0407  Na+/H+ antiporter NhaA  32.79 
 
 
425 aa  114  2.0000000000000002e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1147  pH-dependent sodium/proton antiporter  31.58 
 
 
391 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6194  Na+/H+ antiporter NhaA  30.09 
 
 
379 aa  114  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.219672 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3038  pH-dependent sodium/proton antiporter  31.4 
 
 
389 aa  114  3e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.474949 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4405  Na+/H+ antiporter NhaA  33.69 
 
 
408 aa  114  3e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2979  Na+/H+ antiporter NhaA  31.06 
 
 
443 aa  114  4.0000000000000004e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1042  pH-dependent sodium/proton antiporter  33.51 
 
 
391 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.12391  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2307  Na+/H+ antiporter NhaA  30.37 
 
 
455 aa  113  5e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4598  Na+/H+ antiporter NhaA  35.29 
 
 
408 aa  113  5e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4069  Na+/H+ antiporter NhaA  31.65 
 
 
455 aa  113  5e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.16071 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2016  Na+/H+ antiporter NhaA  31.08 
 
 
382 aa  113  5e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>