230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0261 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0261  Na+/H+ antiporter NhaA  100 
 
 		 390 aa  726    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.947479  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3924  Na+/H+ antiporter NhaA  59.35 
 
 		 402 aa  436  1e-121  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0288538  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0880  Na+/H+ antiporter NhaA  57.07 
 
 		 401 aa  368  1e-100  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.324088 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0476  Na+/H+ antiporter NhaA  54.34 
 
 		 408 aa  355  5e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2301  Na+/H+ antiporter NhaA  48.4 
 
 		 414 aa  324  2e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12160  Na+/H+ antiporter NhaA  48.46 
 
 		 436 aa  323  4e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0066  Na+/H+ antiporter NhaA  48.43 
 
 		 433 aa  319  3.9999999999999996e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2118  pH-dependent sodium/proton antiporter  52.16 
 
 		 436 aa  316  4e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0195602 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0345  Na+/H+ antiporter NhaA  49.87 
 
 		 434 aa  314  1.9999999999999998e-84  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2262  pH-dependent sodium/proton antiporter  51.15 
 
 		 436 aa  312  5.999999999999999e-84  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.50629  normal  0.0112773 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4510  Na+/H+ antiporter NhaA  46.55 
 
 		 422 aa  309  5e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6928  Na+/H+ antiporter NhaA  48.73 
 
 		 446 aa  308  1.0000000000000001e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.126973  normal  0.148656 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2512  Na+/H+ antiporter NhaA  48.12 
 
 		 451 aa  298  7e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0116131  normal  0.0122824 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0405  Na+/H+ antiporter NhaA  51.16 
 
 		 437 aa  297  2e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4842  Na+/H+ antiporter NhaA  49.74 
 
 		 413 aa  297  2e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2196  pH-dependent sodium/proton antiporter  49.88 
 
 		 450 aa  296  3e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.045378  normal  0.0524961 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1152  Na+/H+ antiporter NhaA  47.25 
 
 		 453 aa  297  3e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2207  pH-dependent sodium/proton antiporter  49.63 
 
 		 441 aa  295  8e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2253  pH-dependent sodium/proton antiporter  49.63 
 
 		 450 aa  295  8e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.254168  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3507  Na+/H+ antiporter NhaA  49.87 
 
 		 429 aa  294  1e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.486632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2105  Na+/H+ antiporter NhaA  49.36 
 
 		 462 aa  290  4e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2476  pH-dependent sodium/proton antiporter  50.76 
 
 		 464 aa  287  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.946252  normal  0.639371 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3924  pH-dependent sodium/proton antiporter  50.12 
 
 		 447 aa  286  4e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00452006  normal  0.998293 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1488  Na+/H+ antiporter  42.63 
 
 		 386 aa  284  2.0000000000000002e-75  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0203  Na+/H+ antiporter NhaA  49.25 
 
 		 434 aa  284  2.0000000000000002e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0229594  normal  0.01526 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1390  pH-dependent sodium/proton antiporter  43.19 
 
 		 391 aa  283  3.0000000000000004e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000519432  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2941  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.56 
 
 		 394 aa  282  6.000000000000001e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.135486  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2920  Na+/H+ antiporter NhaA  50.14 
 
 		 463 aa  282  8.000000000000001e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.410818  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0868  pH-dependent sodium/proton antiporter  44.77 
 
 		 391 aa  280  3e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.128339 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0842  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.75 
 
 		 390 aa  280  5e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3027  pH-dependent sodium/proton antiporter  46.23 
 
 		 449 aa  279  6e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.751517 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1657  Na+/H+ antiporter NhaA  50.14 
 
 		 432 aa  277  2e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.017914 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1189  pH-dependent sodium/proton antiporter  43.82 
 
 		 389 aa  276  3e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.685573  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1233  pH-dependent sodium/proton antiporter  43.82 
 
 		 389 aa  275  7e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5677  Na+/H+ antiporter NhaA  48.86 
 
 		 404 aa  275  7e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.575468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3124  pH-dependent sodium/proton antiporter  43.82 
 
 		 389 aa  275  7e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.646901  normal  0.440513 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1266  pH-dependent sodium/proton antiporter  43.82 
 
 		 389 aa  275  8e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1390  Na+/H+ antiporter NhaA  44.3 
 
 		 396 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.168803  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2026  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.82 
 
 		 382 aa  273  4.0000000000000004e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.470958  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1336  pH-dependent sodium/proton antiporter  43.73 
 
 		 389 aa  272  6e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2860  pH-dependent sodium/proton antiporter  43.82 
 
 		 389 aa  271  1e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.611153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4630  Na+/H+ antiporter NhaA  48.97 
 
 		 461 aa  271  2e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.726539  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02646  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.93 
 
 		 391 aa  270  2e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2942  pH-dependent sodium/proton antiporter  43.55 
 
 		 389 aa  270  2e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0919251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3038  pH-dependent sodium/proton antiporter  44.12 
 
 		 389 aa  270  4e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.474949 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1147  pH-dependent sodium/proton antiporter  43.16 
 
 		 391 aa  269  5e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1233  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.13 
 
 		 382 aa  266  4e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000535639  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27000  Na+/H+ antiporter NhaA  46.25 
 
 		 429 aa  266  5.999999999999999e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.358876  normal  0.743342 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2307  Na+/H+ antiporter NhaA  40.69 
 
 		 455 aa  265  8.999999999999999e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4533  sodium-proton antiporter NhaA  44.5 
 
 		 392 aa  264  2e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0583  pH-dependent sodium/proton antiporter  43.47 
 
 		 392 aa  263  3e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0187832  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003767  Na+/H+ antiporter NhaA type  41.03 
 
 		 383 aa  262  6e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1784  Na+/H+ antiporter NhaA  38.64 
 
 		 444 aa  262  6.999999999999999e-69  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4210  pH-dependent sodium/proton antiporter  43.51 
 
 		 392 aa  261  1e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.400142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0107  pH-dependent sodium/proton antiporter  44.03 
 
 		 461 aa  260  3e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1756  Na+/H+ antiporter NhaA  38.17 
 
 		 394 aa  259  4e-68  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0042  pH-dependent sodium/proton antiporter  46.37 
 
 		 388 aa  259  6e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.975088  hitchhiker  0.00613874 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0043  pH-dependent sodium/proton antiporter  46.37 
 
 		 388 aa  259  6e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.62168  normal  0.149849 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0043  pH-dependent sodium/proton antiporter  46.37 
 
 		 388 aa  259  6e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0044  pH-dependent sodium/proton antiporter  46.37 
 
 		 388 aa  259  6e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0044  pH-dependent sodium/proton antiporter  46.37 
 
 		 388 aa  259  6e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2616  Na+/H+ antiporter NhaA  42.33 
 
 		 391 aa  259  7e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.536675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1136  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.84 
 
 		 399 aa  259  7e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4662  Na+/H+ antiporter NhaA  39 
 
 		 438 aa  257  2e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000933832 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1238  Na+/H+ antiporter NhaA  51.51 
 
 		 431 aa  257  2e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1025  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.67 
 
 		 391 aa  257  3e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3022  Na+/H+ antiporter NhaA  38.73 
 
 		 395 aa  257  3e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.396021  normal  0.0264038 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0580  pH-dependent sodium/proton antiporter  45.53 
 
 		 391 aa  256  5e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0119541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1390  Na+/H+ antiporter NhaA  39.31 
 
 		 391 aa  256  7e-67  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7296  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.82 
 
 		 399 aa  255  7e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.059957  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0065  Na+/H+ antiporter NhaA  42.2 
 
 		 402 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000634714  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2583  pH-dependent sodium/proton antiporter  50.13 
 
 		 442 aa  254  2.0000000000000002e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.281476 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3851  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.94 
 
 		 398 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.79655  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0364  pH-dependent sodium/proton antiporter  43.68 
 
 		 391 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0544  pH-dependent sodium/proton antiporter  47.17 
 
 		 401 aa  253  4.0000000000000004e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3135  Na+/H+ antiporter NhaA  40.66 
 
 		 398 aa  253  5.000000000000001e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1042  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.86 
 
 		 391 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.12391  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00018  pH-dependent sodium/proton antiporter  43.34 
 
 		 388 aa  252  1e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.89758  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0017  pH-dependent sodium/proton antiporter  43.34 
 
 		 388 aa  252  1e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0019  pH-dependent sodium/proton antiporter  43.34 
 
 		 388 aa  252  1e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.046286  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0407  Na+/H+ antiporter NhaA  41.58 
 
 		 425 aa  251  1e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0963  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.41 
 
 		 395 aa  251  1e-65  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000193238  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0017  pH-dependent sodium/proton antiporter  43.34 
 
 		 388 aa  252  1e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.453914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0016  pH-dependent sodium/proton antiporter  43.34 
 
 		 388 aa  252  1e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000467126  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0019  pH-dependent sodium/proton antiporter  43.34 
 
 		 388 aa  252  1e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0237343  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1802  cyclic nucleotide-binding protein  43.56 
 
 		 876 aa  251  1e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668239  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00019  hypothetical protein  43.34 
 
 		 388 aa  252  1e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.892896  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3638  pH-dependent sodium/proton antiporter  43.34 
 
 		 388 aa  252  1e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0694  pH-dependent sodium/proton antiporter  43.39 
 
 		 398 aa  250  3e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000263731  hitchhiker  0.00301245 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6044  pH-dependent sodium/proton antiporter  44.24 
 
 		 400 aa  249  5e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.227636  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00573  Na+/H+ antiporter, NhaA  40 
 
 		 424 aa  248  9e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3578  Na+/H+ antiporter NhaA  42.82 
 
 		 388 aa  248  1e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00256476  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5174  sodium-proton antiporter NhaA  43.42 
 
 		 391 aa  248  1e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3264  sodium-proton antiporter NhaA  39.11 
 
 		 382 aa  248  1e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000713954 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4069  Na+/H+ antiporter NhaA  39.57 
 
 		 455 aa  248  1e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.16071 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4283  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.83 
 
 		 391 aa  248  2e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0732  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.12 
 
 		 409 aa  246  4e-64  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3657  pH-dependent sodium/proton antiporter  43.5 
 
 		 398 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.457018  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2962  Na+/H+ antiporter NhaA  44.58 
 
 		 481 aa  246  6e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1827  Na+/H+ antiporter NhaA  37.67 
 
 		 382 aa  244  9.999999999999999e-64  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>