233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3287 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_3610  Na+/H+ antiporter NhaA  97.82 
 
 		 413 aa  733    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.150292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3287  Na+/H+ antiporter NhaA  100 
 
 		 413 aa  792    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3487  Na+/H+ antiporter NhaA  82.32 
 
 		 395 aa  553  1e-156  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.16157 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7296  pH-dependent sodium/proton antiporter  68.02 
 
 		 399 aa  490  1e-137  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.059957  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5991  pH-dependent sodium/proton antiporter  69.29 
 
 		 399 aa  463  1e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.688009  normal  0.157669 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4502  Na+/H+ antiporter NhaA  70.76 
 
 		 400 aa  456  1e-127  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6044  pH-dependent sodium/proton antiporter  67.89 
 
 		 400 aa  455  1e-127  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.227636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0515  pH-dependent sodium/proton antiporter  60.1 
 
 		 393 aa  448  1e-125  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0397  pH-dependent sodium/proton antiporter  61.18 
 
 		 393 aa  441  1e-123  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.311183  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0406  pH-dependent sodium/proton antiporter  61.18 
 
 		 420 aa  441  1e-123  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.364642  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3347  pH-dependent sodium/proton antiporter  59.75 
 
 		 407 aa  436  1e-121  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2616  Na+/H+ antiporter NhaA  59.74 
 
 		 391 aa  419  1e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.536675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0407  Na+/H+ antiporter NhaA  60.57 
 
 		 425 aa  417  9.999999999999999e-116  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4533  sodium-proton antiporter NhaA  62.4 
 
 		 392 aa  412  1e-114  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4210  pH-dependent sodium/proton antiporter  61.83 
 
 		 392 aa  404  1e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.400142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4598  Na+/H+ antiporter NhaA  60.15 
 
 		 408 aa  402  1e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2430  pH-dependent sodium/proton antiporter  60.67 
 
 		 393 aa  383  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0600  Na+/H+ antiporter NhaA  59.03 
 
 		 424 aa  384  1e-105  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.171137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1928  Na+/H+ antiporter NhaA  64.59 
 
 		 376 aa  380  1e-104  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5944  pH-dependent sodium/proton antiporter  60.91 
 
 		 396 aa  376  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.195827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0364  pH-dependent sodium/proton antiporter  60.05 
 
 		 391 aa  377  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7108  pH-dependent sodium/proton antiporter  60.41 
 
 		 396 aa  372  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.937929  normal  0.0534187 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5174  sodium-proton antiporter NhaA  60.67 
 
 		 391 aa  370  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1390  pH-dependent sodium/proton antiporter  53.03 
 
 		 391 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000519432  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02646  pH-dependent sodium/proton antiporter  51.05 
 
 		 391 aa  357  1.9999999999999998e-97  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0842  pH-dependent sodium/proton antiporter  51.81 
 
 		 390 aa  355  8.999999999999999e-97  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0732  pH-dependent sodium/proton antiporter  49.74 
 
 		 409 aa  351  2e-95  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4283  pH-dependent sodium/proton antiporter  53.06 
 
 		 391 aa  350  2e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2941  pH-dependent sodium/proton antiporter  50.52 
 
 		 394 aa  350  4e-95  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.135486  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003767  Na+/H+ antiporter NhaA type  50.66 
 
 		 383 aa  349  6e-95  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4197  Na+/H+ antiporter NhaA  51.8 
 
 		 401 aa  348  1e-94  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.917396  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1189  pH-dependent sodium/proton antiporter  50.13 
 
 		 389 aa  346  5e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.685573  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1233  pH-dependent sodium/proton antiporter  50.13 
 
 		 389 aa  345  8.999999999999999e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3124  pH-dependent sodium/proton antiporter  50.13 
 
 		 389 aa  345  8.999999999999999e-94  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.646901  normal  0.440513 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1233  pH-dependent sodium/proton antiporter  51.88 
 
 		 382 aa  345  8.999999999999999e-94  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000535639  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1266  pH-dependent sodium/proton antiporter  50.13 
 
 		 389 aa  344  1e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2026  pH-dependent sodium/proton antiporter  50.92 
 
 		 382 aa  343  2e-93  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.470958  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3038  pH-dependent sodium/proton antiporter  50.88 
 
 		 389 aa  343  4e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.474949 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2860  pH-dependent sodium/proton antiporter  51.03 
 
 		 389 aa  343  5e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.611153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3264  sodium-proton antiporter NhaA  51.19 
 
 		 382 aa  341  1e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000713954 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2942  pH-dependent sodium/proton antiporter  50.77 
 
 		 389 aa  341  1e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0919251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1390  Na+/H+ antiporter NhaA  51.15 
 
 		 396 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.168803  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1336  pH-dependent sodium/proton antiporter  49.62 
 
 		 389 aa  339  4e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1234  pH-dependent sodium/proton antiporter  51.76 
 
 		 395 aa  340  4e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.400812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0128  Na+/H+ antiporter NhaA  55.1 
 
 		 399 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.124586  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1147  pH-dependent sodium/proton antiporter  48.87 
 
 		 391 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1390  Na+/H+ antiporter NhaA  47.8 
 
 		 391 aa  337  1.9999999999999998e-91  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00573  Na+/H+ antiporter, NhaA  48.72 
 
 		 424 aa  337  1.9999999999999998e-91  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1132  pH-dependent sodium/proton antiporter  51.77 
 
 		 397 aa  336  5.999999999999999e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.422688  normal  0.012742 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1168  pH-dependent sodium/proton antiporter  51.9 
 
 		 397 aa  334  1e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3699  pH-dependent sodium/proton antiporter  49.62 
 
 		 397 aa  331  1e-89  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.262179 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2277  pH-dependent sodium/proton antiporter  49.61 
 
 		 397 aa  331  1e-89  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00329368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0693  pH-dependent sodium/proton antiporter  49.62 
 
 		 396 aa  330  2e-89  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.11155  normal  0.550501 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1042  pH-dependent sodium/proton antiporter  50.91 
 
 		 391 aa  331  2e-89  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.12391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2645  Na+/H+ antiporter NhaA  56.15 
 
 		 390 aa  330  3e-89  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0868  pH-dependent sodium/proton antiporter  48.83 
 
 		 391 aa  330  4e-89  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.128339 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1025  pH-dependent sodium/proton antiporter  51.04 
 
 		 391 aa  326  4.0000000000000003e-88  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2582  Na+/H+ antiporter NhaA  51.71 
 
 		 393 aa  326  4.0000000000000003e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0694  pH-dependent sodium/proton antiporter  50.78 
 
 		 398 aa  322  7e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000263731  hitchhiker  0.00301245 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3022  Na+/H+ antiporter NhaA  44.96 
 
 		 395 aa  318  9e-86  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.396021  normal  0.0264038 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2771  Na+/H+ antiporter NhaA  44.12 
 
 		 450 aa  318  2e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00813597  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1136  pH-dependent sodium/proton antiporter  49.74 
 
 		 399 aa  317  3e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0043  pH-dependent sodium/proton antiporter  52.25 
 
 		 388 aa  316  5e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0369  pH-dependent sodium/proton antiporter  53.67 
 
 		 399 aa  316  5e-85  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0301682  hitchhiker  0.000785162 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0042  pH-dependent sodium/proton antiporter  52.25 
 
 		 388 aa  316  5e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.975088  hitchhiker  0.00613874 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0043  pH-dependent sodium/proton antiporter  52.25 
 
 		 388 aa  316  5e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.62168  normal  0.149849 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0044  pH-dependent sodium/proton antiporter  52.25 
 
 		 388 aa  316  5e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0044  pH-dependent sodium/proton antiporter  52.25 
 
 		 388 aa  316  5e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3592  pH-dependent sodium/proton antiporter  51.17 
 
 		 394 aa  313  3.9999999999999997e-84  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000151252  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0795  pH-dependent sodium/proton antiporter  50.91 
 
 		 394 aa  312  5.999999999999999e-84  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000129218  normal  0.24433 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3464  pH-dependent sodium/proton antiporter  51.17 
 
 		 394 aa  312  9e-84  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000517181  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1896  pH-dependent sodium/proton antiporter  44.36 
 
 		 400 aa  311  1e-83  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4069  Na+/H+ antiporter NhaA  43.76 
 
 		 455 aa  310  2e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.16071 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0580  pH-dependent sodium/proton antiporter  52.17 
 
 		 391 aa  311  2e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0119541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3851  pH-dependent sodium/proton antiporter  49.59 
 
 		 398 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.79655  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3657  pH-dependent sodium/proton antiporter  50.14 
 
 		 398 aa  310  4e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.457018  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00018  pH-dependent sodium/proton antiporter  52.25 
 
 		 388 aa  309  5e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.89758  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0019  pH-dependent sodium/proton antiporter  52.25 
 
 		 388 aa  309  5e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.046286  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0017  pH-dependent sodium/proton antiporter  52.25 
 
 		 388 aa  309  5e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3638  pH-dependent sodium/proton antiporter  52.25 
 
 		 388 aa  309  5e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0019  pH-dependent sodium/proton antiporter  52.25 
 
 		 388 aa  309  5e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0237343  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0016  pH-dependent sodium/proton antiporter  52.25 
 
 		 388 aa  309  5e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000467126  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00019  hypothetical protein  52.25 
 
 		 388 aa  309  5e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.892896  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0017  pH-dependent sodium/proton antiporter  52.25 
 
 		 388 aa  309  6.999999999999999e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.453914  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0963  pH-dependent sodium/proton antiporter  45.59 
 
 		 395 aa  308  9e-83  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000193238  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2123  pH-dependent sodium/proton antiporter  50.65 
 
 		 400 aa  306  3e-82  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1876  Na+/H+ antiporter  44.68 
 
 		 387 aa  306  3e-82  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00181634 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3578  Na+/H+ antiporter NhaA  51.99 
 
 		 388 aa  306  4.0000000000000004e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00256476  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1838  pH-dependent sodium/proton antiporter  49.61 
 
 		 400 aa  306  6e-82  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2307  Na+/H+ antiporter NhaA  43.45 
 
 		 455 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0065  Na+/H+ antiporter NhaA  46.06 
 
 		 402 aa  300  3e-80  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000634714  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6194  Na+/H+ antiporter NhaA  44.47 
 
 		 379 aa  299  5e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.219672 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1488  Na+/H+ antiporter  44.68 
 
 		 386 aa  299  7e-80  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0544  pH-dependent sodium/proton antiporter  47.79 
 
 		 401 aa  298  1e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2778  pH-dependent sodium/proton antiporter  50.94 
 
 		 398 aa  298  1e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2336  Na+/H+ antiporter NhaA  47.15 
 
 		 403 aa  298  1e-79  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.000768129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1756  Na+/H+ antiporter NhaA  43.85 
 
 		 394 aa  298  1e-79  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4405  Na+/H+ antiporter NhaA  45.99 
 
 		 408 aa  297  3e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1861  Na+/H+ antiporter NhaA  43.62 
 
 		 451 aa  296  5e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.995313  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2205  Na+/H+ antiporter NhaA  43.62 
 
 		 436 aa  295  7e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.29594  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>