231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0345 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0345  Na+/H+ antiporter NhaA  100 
 
 		 434 aa  832    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2105  Na+/H+ antiporter NhaA  71.13 
 
 		 462 aa  540  9.999999999999999e-153  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4630  Na+/H+ antiporter NhaA  68.76 
 
 		 461 aa  528  1e-149  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.726539  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2207  pH-dependent sodium/proton antiporter  66.44 
 
 		 441 aa  518  1e-146  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2253  pH-dependent sodium/proton antiporter  66.44 
 
 		 450 aa  518  1e-146  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.254168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2196  pH-dependent sodium/proton antiporter  66.67 
 
 		 450 aa  519  1e-146  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.045378  normal  0.0524961 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2920  Na+/H+ antiporter NhaA  70.9 
 
 		 463 aa  514  1e-144  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.410818  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2476  pH-dependent sodium/proton antiporter  65.81 
 
 		 464 aa  511  1e-143  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.946252  normal  0.639371 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3924  pH-dependent sodium/proton antiporter  64.92 
 
 		 447 aa  504  9.999999999999999e-143  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00452006  normal  0.998293 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2583  pH-dependent sodium/proton antiporter  68.68 
 
 		 442 aa  490  1e-137  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.281476 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12160  Na+/H+ antiporter NhaA  61.4 
 
 		 436 aa  486  1e-136  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6928  Na+/H+ antiporter NhaA  62 
 
 		 446 aa  487  1e-136  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.126973  normal  0.148656 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3027  pH-dependent sodium/proton antiporter  60.97 
 
 		 449 aa  479  1e-134  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.751517 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2262  pH-dependent sodium/proton antiporter  63.22 
 
 		 436 aa  472  1e-132  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.50629  normal  0.0112773 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0203  Na+/H+ antiporter NhaA  62.96 
 
 		 434 aa  474  1e-132  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0229594  normal  0.01526 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2118  pH-dependent sodium/proton antiporter  63.45 
 
 		 436 aa  469  1.0000000000000001e-131  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0195602 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3507  Na+/H+ antiporter NhaA  62.56 
 
 		 429 aa  466  9.999999999999999e-131  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.486632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0405  Na+/H+ antiporter NhaA  63.76 
 
 		 437 aa  467  9.999999999999999e-131  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1657  Na+/H+ antiporter NhaA  63.62 
 
 		 432 aa  461  1e-129  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.017914 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0107  pH-dependent sodium/proton antiporter  58.81 
 
 		 461 aa  458  9.999999999999999e-129  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1152  Na+/H+ antiporter NhaA  57.28 
 
 		 453 aa  452  1.0000000000000001e-126  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2512  Na+/H+ antiporter NhaA  58.56 
 
 		 451 aa  443  1e-123  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0116131  normal  0.0122824 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4510  Na+/H+ antiporter NhaA  52.8 
 
 		 422 aa  375  1e-103  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2301  Na+/H+ antiporter NhaA  52.39 
 
 		 414 aa  358  9e-98  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0066  Na+/H+ antiporter NhaA  50.24 
 
 		 433 aa  357  2.9999999999999997e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2573  Na+/H+ antiporter NhaA  54.99 
 
 		 539 aa  342  5.999999999999999e-93  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.109155  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27000  Na+/H+ antiporter NhaA  51.67 
 
 		 429 aa  336  3.9999999999999995e-91  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.358876  normal  0.743342 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0476  Na+/H+ antiporter NhaA  50.63 
 
 		 408 aa  334  2e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30430  Na+/H+ antiporter NhaA  50.49 
 
 		 440 aa  327  2.0000000000000001e-88  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0880  Na+/H+ antiporter NhaA  51.16 
 
 		 401 aa  321  1.9999999999999998e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.324088 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1238  Na+/H+ antiporter NhaA  54.88 
 
 		 431 aa  319  5e-86  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1410  Na+/H+ antiporter NhaA  49.53 
 
 		 442 aa  315  9.999999999999999e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3924  Na+/H+ antiporter NhaA  46.62 
 
 		 402 aa  301  1e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0288538  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0261  Na+/H+ antiporter NhaA  49.87 
 
 		 390 aa  301  2e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.947479  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4842  Na+/H+ antiporter NhaA  47.95 
 
 		 413 aa  300  4e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0925  Na+/H+ antiporter NhaA  49.61 
 
 		 436 aa  287  2.9999999999999996e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5677  Na+/H+ antiporter NhaA  47.26 
 
 		 404 aa  277  3e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.575468  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3091  Na+/H+ antiporter NhaA  54.96 
 
 		 447 aa  273  3e-72  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.904983  hitchhiker  0.000017266 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00573  Na+/H+ antiporter, NhaA  41.34 
 
 		 424 aa  259  9e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1756  Na+/H+ antiporter NhaA  38.65 
 
 		 394 aa  256  5e-67  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2307  Na+/H+ antiporter NhaA  38.94 
 
 		 455 aa  256  5e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1390  Na+/H+ antiporter NhaA  42.56 
 
 		 396 aa  256  6e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.168803  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1390  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.78 
 
 		 391 aa  255  9e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000519432  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0732  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.02 
 
 		 409 aa  255  1.0000000000000001e-66  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3264  sodium-proton antiporter NhaA  39.84 
 
 		 382 aa  254  2.0000000000000002e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000713954 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3022  Na+/H+ antiporter NhaA  39.41 
 
 		 395 aa  253  6e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.396021  normal  0.0264038 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7296  pH-dependent sodium/proton antiporter  43.08 
 
 		 399 aa  253  6e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.059957  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2941  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.15 
 
 		 394 aa  250  4e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.135486  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1147  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.27 
 
 		 391 aa  249  5e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0407  Na+/H+ antiporter NhaA  40.87 
 
 		 425 aa  249  8e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0842  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.8 
 
 		 390 aa  248  1e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2277  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.95 
 
 		 397 aa  248  1e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00329368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1896  pH-dependent sodium/proton antiporter  36.32 
 
 		 400 aa  248  1e-64  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2582  Na+/H+ antiporter NhaA  41.03 
 
 		 393 aa  247  2e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0044  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.07 
 
 		 388 aa  246  4.9999999999999997e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0044  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.07 
 
 		 388 aa  246  4.9999999999999997e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0043  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.07 
 
 		 388 aa  246  4.9999999999999997e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0042  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.07 
 
 		 388 aa  246  4.9999999999999997e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.975088  hitchhiker  0.00613874 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0043  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.07 
 
 		 388 aa  246  4.9999999999999997e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.62168  normal  0.149849 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0028  Na+/H+ antiporter NhaA  37.27 
 
 		 396 aa  245  9.999999999999999e-64  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0694  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.64 
 
 		 398 aa  245  9.999999999999999e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000263731  hitchhiker  0.00301245 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3089  Na+/H+ antiporter NhaA  38.27 
 
 		 406 aa  245  9.999999999999999e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.761361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0364  pH-dependent sodium/proton antiporter  43.67 
 
 		 391 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4197  Na+/H+ antiporter NhaA  39.75 
 
 		 401 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.917396  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4283  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.6 
 
 		 391 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1336  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.95 
 
 		 389 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02646  pH-dependent sodium/proton antiporter  36.59 
 
 		 391 aa  241  1e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5991  pH-dependent sodium/proton antiporter  43.62 
 
 		 399 aa  242  1e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.688009  normal  0.157669 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0868  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.11 
 
 		 391 aa  242  1e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.128339 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0795  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.2 
 
 		 394 aa  241  1e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000129218  normal  0.24433 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3464  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.45 
 
 		 394 aa  242  1e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000517181  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3038  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.21 
 
 		 389 aa  241  2e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.474949 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3592  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.2 
 
 		 394 aa  241  2e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000151252  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003767  Na+/H+ antiporter NhaA type  37.17 
 
 		 383 aa  240  2.9999999999999997e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1168  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.42 
 
 		 397 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1488  Na+/H+ antiporter  36.46 
 
 		 386 aa  240  2.9999999999999997e-62  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1266  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.42 
 
 		 389 aa  240  4e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1189  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.42 
 
 		 389 aa  240  5e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.685573  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1233  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.4 
 
 		 382 aa  239  5e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000535639  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1233  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.42 
 
 		 389 aa  239  5.999999999999999e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3124  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.42 
 
 		 389 aa  239  5.999999999999999e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.646901  normal  0.440513 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1132  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.18 
 
 		 397 aa  239  8e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.422688  normal  0.012742 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6044  pH-dependent sodium/proton antiporter  43.23 
 
 		 400 aa  239  9e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.227636  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4533  sodium-proton antiporter NhaA  43.16 
 
 		 392 aa  237  2e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5174  sodium-proton antiporter NhaA  44.27 
 
 		 391 aa  238  2e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2026  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.71 
 
 		 382 aa  237  3e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.470958  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00018  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.91 
 
 		 388 aa  237  4e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.89758  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3638  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.91 
 
 		 388 aa  237  4e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0017  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.91 
 
 		 388 aa  236  4e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.453914  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00019  hypothetical protein  41.91 
 
 		 388 aa  237  4e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.892896  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0019  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.91 
 
 		 388 aa  237  4e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.046286  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0017  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.91 
 
 		 388 aa  237  4e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0016  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.91 
 
 		 388 aa  237  4e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000467126  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0019  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.91 
 
 		 388 aa  237  4e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0237343  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3347  pH-dependent sodium/proton antiporter  43.5 
 
 		 407 aa  236  6e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4598  Na+/H+ antiporter NhaA  40.54 
 
 		 408 aa  236  7e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2942  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.42 
 
 		 389 aa  236  7e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0919251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4950  Na+/H+ antiporter NhaA  40.18 
 
 		 465 aa  235  1.0000000000000001e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.29184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2860  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.42 
 
 		 389 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.611153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0693  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.16 
 
 		 396 aa  234  2.0000000000000002e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.11155  normal  0.550501 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>