232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_1101 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_1101  Na+/H+ antiporter NhaA  100 
 
 		 458 aa  921    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07000  Na+/H+ antiporter NhaA  45.18 
 
 		 514 aa  373  1e-102  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.107154  normal  0.0342501 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2773  Na+/H+ antiporter NhaA  47.44 
 
 		 612 aa  369  1e-101  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.461609 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2979  Na+/H+ antiporter NhaA  44.95 
 
 		 443 aa  307  2.0000000000000002e-82  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3059  Na+/H+ antiporter NhaA  39.36 
 
 		 452 aa  278  1e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2771  Na+/H+ antiporter NhaA  38.61 
 
 		 450 aa  277  3e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00813597  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4069  Na+/H+ antiporter NhaA  40 
 
 		 455 aa  275  1.0000000000000001e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.16071 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5554  Na+/H+ antiporter NhaA  37.38 
 
 		 451 aa  270  4e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.477487  normal  0.958846 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1868  Na+/H+ antiporter NhaA  37.16 
 
 		 453 aa  269  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.138297 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3958  sodium-proton antiporter, NhaA family  37.53 
 
 		 453 aa  269  8.999999999999999e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.529436 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00573  Na+/H+ antiporter, NhaA  37.3 
 
 		 424 aa  264  2e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2570  Na+/H+ antiporter NhaA  37.22 
 
 		 472 aa  264  3e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0688  Na+/H+ antiporter NhaA  38.22 
 
 		 389 aa  259  1e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0583  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.9 
 
 		 392 aa  258  1e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0187832  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3089  Na+/H+ antiporter NhaA  34.43 
 
 		 406 aa  257  2e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.761361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1876  Na+/H+ antiporter  36.47 
 
 		 387 aa  257  3e-67  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00181634 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05370  NA(+)/H(+) antiporter 1  36.07 
 
 		 435 aa  257  4e-67  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.765198  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1390  Na+/H+ antiporter NhaA  37.18 
 
 		 391 aa  256  7e-67  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1877  Na+/H+ antiporter  37.62 
 
 		 452 aa  255  1.0000000000000001e-66  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10430  Na+/H+ antiporter NhaA  36.03 
 
 		 444 aa  254  3e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.745936  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2853  Na+/H+ antiporter NhaA  40.2 
 
 		 455 aa  254  3e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2666  Na+/H+ antiporter NhaA  38.64 
 
 		 445 aa  253  5.000000000000001e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.657461  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6194  Na+/H+ antiporter NhaA  34.83 
 
 		 379 aa  252  7e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.219672 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2307  Na+/H+ antiporter NhaA  37.01 
 
 		 455 aa  252  9.000000000000001e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1784  Na+/H+ antiporter NhaA  35.75 
 
 		 444 aa  252  1e-65  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1756  Na+/H+ antiporter NhaA  35.25 
 
 		 394 aa  252  1e-65  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4283  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.54 
 
 		 391 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0544  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.81 
 
 		 401 aa  251  2e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1390  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.53 
 
 		 391 aa  251  3e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000519432  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1147  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.2 
 
 		 391 aa  251  3e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0868  pH-dependent sodium/proton antiporter  35.55 
 
 		 391 aa  248  2e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.128339 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1132  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.8 
 
 		 397 aa  246  4e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.422688  normal  0.012742 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2205  Na+/H+ antiporter NhaA  37.53 
 
 		 436 aa  247  4e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.29594  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1861  Na+/H+ antiporter NhaA  37.53 
 
 		 451 aa  247  4e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.995313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4197  Na+/H+ antiporter NhaA  37.87 
 
 		 401 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.917396  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0732  pH-dependent sodium/proton antiporter  36.51 
 
 		 409 aa  244  1.9999999999999999e-63  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1168  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.54 
 
 		 397 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0028  Na+/H+ antiporter NhaA  36.79 
 
 		 396 aa  241  2e-62  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4405  Na+/H+ antiporter NhaA  35.68 
 
 		 408 aa  241  2e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1762  Na(+)/H(+) antiporter 1  36.38 
 
 		 464 aa  240  2.9999999999999997e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0144  Na+/H+ antiporter NhaA  36.78 
 
 		 446 aa  239  8e-62  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.174095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3264  sodium-proton antiporter NhaA  37.8 
 
 		 382 aa  239  9e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000713954 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1537  Na+/H+ antiporter NhaA  36.15 
 
 		 624 aa  238  2e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.192352  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2941  pH-dependent sodium/proton antiporter  34.83 
 
 		 394 aa  237  3e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.135486  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3038  pH-dependent sodium/proton antiporter  35.87 
 
 		 389 aa  237  3e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.474949 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1336  pH-dependent sodium/proton antiporter  35.93 
 
 		 389 aa  237  4e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2568  Na+/H+ antiporter NhaA  38.53 
 
 		 424 aa  237  4e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3592  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.82 
 
 		 394 aa  237  4e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000151252  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2616  Na+/H+ antiporter NhaA  38.81 
 
 		 391 aa  236  5.0000000000000005e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.536675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3022  Na+/H+ antiporter NhaA  34.2 
 
 		 395 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.396021  normal  0.0264038 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0795  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.56 
 
 		 394 aa  236  6e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000129218  normal  0.24433 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3464  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.56 
 
 		 394 aa  236  8e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000517181  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3828  Na+/H+ antiporter NhaA  37.29 
 
 		 457 aa  235  9e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0371269 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3135  Na+/H+ antiporter NhaA  36.84 
 
 		 398 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4662  Na+/H+ antiporter NhaA  37.02 
 
 		 438 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000933832 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2582  Na+/H+ antiporter NhaA  37.78 
 
 		 393 aa  234  3e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2860  pH-dependent sodium/proton antiporter  35.39 
 
 		 389 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.611153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2942  pH-dependent sodium/proton antiporter  35.39 
 
 		 389 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0919251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0043  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.86 
 
 		 388 aa  233  5e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0043  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.86 
 
 		 388 aa  233  5e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.62168  normal  0.149849 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0044  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.86 
 
 		 388 aa  233  5e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0044  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.86 
 
 		 388 aa  233  5e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0042  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.86 
 
 		 388 aa  233  5e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.975088  hitchhiker  0.00613874 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7296  pH-dependent sodium/proton antiporter  36.95 
 
 		 399 aa  233  5e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.059957  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00018  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.6 
 
 		 388 aa  233  6e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.89758  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3638  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.6 
 
 		 388 aa  233  6e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00019  hypothetical protein  37.6 
 
 		 388 aa  233  6e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.892896  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0019  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.6 
 
 		 388 aa  233  6e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.046286  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0016  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.6 
 
 		 388 aa  233  6e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000467126  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0017  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.6 
 
 		 388 aa  233  6e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1025  pH-dependent sodium/proton antiporter  36.58 
 
 		 391 aa  233  6e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0019  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.6 
 
 		 388 aa  233  6e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0237343  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1563  pH-dependent sodium/proton antiporter  36.82 
 
 		 421 aa  233  7.000000000000001e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.172648  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0017  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.6 
 
 		 388 aa  233  7.000000000000001e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.453914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1234  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.01 
 
 		 395 aa  233  8.000000000000001e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.400812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3851  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.56 
 
 		 398 aa  231  1e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.79655  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1136  pH-dependent sodium/proton antiporter  36.71 
 
 		 399 aa  232  1e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1189  pH-dependent sodium/proton antiporter  35.46 
 
 		 389 aa  232  1e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.685573  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1233  pH-dependent sodium/proton antiporter  35.46 
 
 		 389 aa  231  2e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3287  Na+/H+ antiporter NhaA  40.91 
 
 		 413 aa  231  2e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0842  pH-dependent sodium/proton antiporter  36.52 
 
 		 390 aa  231  2e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3610  Na+/H+ antiporter NhaA  39.13 
 
 		 413 aa  231  2e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.150292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1266  pH-dependent sodium/proton antiporter  35.22 
 
 		 389 aa  231  2e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1042  pH-dependent sodium/proton antiporter  35.93 
 
 		 391 aa  231  2e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.12391  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3124  pH-dependent sodium/proton antiporter  35.46 
 
 		 389 aa  231  2e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.646901  normal  0.440513 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0065  Na+/H+ antiporter NhaA  36.78 
 
 		 402 aa  230  4e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000634714  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0371  Na+/H+ antiporter NhaA  34.38 
 
 		 452 aa  230  4e-59  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1488  Na+/H+ antiporter  32.87 
 
 		 386 aa  229  5e-59  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3578  Na+/H+ antiporter NhaA  37.34 
 
 		 388 aa  229  6e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00256476  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2989  Na+/H+ antiporter NhaA  38.95 
 
 		 460 aa  228  1e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4144  Na+/H+ antiporter NhaA  33.78 
 
 		 472 aa  229  1e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.375457  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0369  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.54 
 
 		 399 aa  228  1e-58  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0301682  hitchhiker  0.000785162 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3215  Na+/H+ antiporter NhaA  34.6 
 
 		 456 aa  228  1e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0694  pH-dependent sodium/proton antiporter  36.48 
 
 		 398 aa  228  2e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000263731  hitchhiker  0.00301245 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1896  pH-dependent sodium/proton antiporter  33.56 
 
 		 400 aa  228  2e-58  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2277  pH-dependent sodium/proton antiporter  34.77 
 
 		 397 aa  228  2e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00329368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0580  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.95 
 
 		 391 aa  228  2e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0119541  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4533  sodium-proton antiporter NhaA  40.33 
 
 		 392 aa  227  3e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5991  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.01 
 
 		 399 aa  227  3e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.688009  normal  0.157669 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2016  Na+/H+ antiporter NhaA  34.11 
 
 		 382 aa  227  3e-58  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>