231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0880 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_0880  Na+/H+ antiporter NhaA  100 
 
 
401 aa  770    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.324088 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0261  Na+/H+ antiporter NhaA  57.07 
 
 
390 aa  355  1e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.947479  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3924  Na+/H+ antiporter NhaA  53.2 
 
 
402 aa  349  5e-95  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0288538  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0476  Na+/H+ antiporter NhaA  50.53 
 
 
408 aa  348  1e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6928  Na+/H+ antiporter NhaA  52.72 
 
 
446 aa  335  5.999999999999999e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.126973  normal  0.148656 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0345  Na+/H+ antiporter NhaA  51.16 
 
 
434 aa  321  1.9999999999999998e-86  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4510  Na+/H+ antiporter NhaA  47.21 
 
 
422 aa  315  9.999999999999999e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2262  pH-dependent sodium/proton antiporter  52.92 
 
 
436 aa  312  7.999999999999999e-84  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.50629  normal  0.0112773 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2118  pH-dependent sodium/proton antiporter  52.96 
 
 
436 aa  308  9e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0195602 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12160  Na+/H+ antiporter NhaA  48.94 
 
 
436 aa  307  2.0000000000000002e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2207  pH-dependent sodium/proton antiporter  50.51 
 
 
441 aa  305  7e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2253  pH-dependent sodium/proton antiporter  50.51 
 
 
450 aa  305  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.254168  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0066  Na+/H+ antiporter NhaA  48.24 
 
 
433 aa  303  5.000000000000001e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2196  pH-dependent sodium/proton antiporter  50.25 
 
 
450 aa  303  5.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.045378  normal  0.0524961 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2301  Na+/H+ antiporter NhaA  48.97 
 
 
414 aa  300  2e-80  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2105  Na+/H+ antiporter NhaA  48.81 
 
 
462 aa  300  3e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0405  Na+/H+ antiporter NhaA  49.74 
 
 
437 aa  297  2e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4842  Na+/H+ antiporter NhaA  46.5 
 
 
413 aa  297  3e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1152  Na+/H+ antiporter NhaA  47.13 
 
 
453 aa  291  1e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2920  Na+/H+ antiporter NhaA  50.43 
 
 
463 aa  290  4e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.410818  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2512  Na+/H+ antiporter NhaA  47.47 
 
 
451 aa  290  4e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0116131  normal  0.0122824 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2476  pH-dependent sodium/proton antiporter  50.25 
 
 
464 aa  289  7e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.946252  normal  0.639371 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1657  Na+/H+ antiporter NhaA  50.89 
 
 
432 aa  288  1e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.017914 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3924  pH-dependent sodium/proton antiporter  50.75 
 
 
447 aa  286  4e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00452006  normal  0.998293 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3507  Na+/H+ antiporter NhaA  47.64 
 
 
429 aa  278  9e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.486632  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27000  Na+/H+ antiporter NhaA  45.12 
 
 
429 aa  278  1e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.358876  normal  0.743342 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4630  Na+/H+ antiporter NhaA  49.48 
 
 
461 aa  278  1e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.726539  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0203  Na+/H+ antiporter NhaA  48.22 
 
 
434 aa  276  5e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0229594  normal  0.01526 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2583  pH-dependent sodium/proton antiporter  50.93 
 
 
442 aa  272  9e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.281476 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1390  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.49 
 
 
391 aa  269  7e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000519432  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3027  pH-dependent sodium/proton antiporter  44.72 
 
 
449 aa  268  1e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.751517 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0925  Na+/H+ antiporter NhaA  48.17 
 
 
436 aa  263  4e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5677  Na+/H+ antiporter NhaA  43.65 
 
 
404 aa  260  3e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.575468  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1233  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.18 
 
 
382 aa  260  3e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000535639  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0107  pH-dependent sodium/proton antiporter  45.48 
 
 
461 aa  259  6e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0868  pH-dependent sodium/proton antiporter  43.16 
 
 
391 aa  259  6e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.128339 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0042  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.04 
 
 
388 aa  258  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.975088  hitchhiker  0.00613874 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0044  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.04 
 
 
388 aa  258  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00573  Na+/H+ antiporter, NhaA  40.15 
 
 
424 aa  258  1e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0043  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.04 
 
 
388 aa  258  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.62168  normal  0.149849 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0043  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.04 
 
 
388 aa  258  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0044  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.04 
 
 
388 aa  258  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2941  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.4 
 
 
394 aa  257  3e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.135486  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1390  Na+/H+ antiporter NhaA  40.62 
 
 
396 aa  256  6e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.168803  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0065  Na+/H+ antiporter NhaA  39.69 
 
 
402 aa  253  3e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000634714  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003767  Na+/H+ antiporter NhaA type  39.13 
 
 
383 aa  251  1e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3851  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.74 
 
 
398 aa  251  1e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.79655  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02646  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.74 
 
 
391 aa  251  1e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2026  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.82 
 
 
382 aa  251  2e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.470958  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1336  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.09 
 
 
389 aa  250  3e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0580  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.09 
 
 
391 aa  249  4e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0119541  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3135  Na+/H+ antiporter NhaA  40.8 
 
 
398 aa  249  5e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0017  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.99 
 
 
388 aa  248  1e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.453914  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1147  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.55 
 
 
391 aa  248  1e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00018  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.99 
 
 
388 aa  248  2e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.89758  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00019  hypothetical protein  40.99 
 
 
388 aa  248  2e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.892896  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0016  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.99 
 
 
388 aa  248  2e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000467126  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0019  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.99 
 
 
388 aa  248  2e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0237343  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0017  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.73 
 
 
388 aa  248  2e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0019  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.73 
 
 
388 aa  248  2e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.046286  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3638  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.73 
 
 
388 aa  248  2e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1266  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.29 
 
 
389 aa  247  3e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1189  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.29 
 
 
389 aa  247  3e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.685573  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0842  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.85 
 
 
390 aa  247  3e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0407  Na+/H+ antiporter NhaA  41.48 
 
 
425 aa  246  4e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5991  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.29 
 
 
399 aa  246  4e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.688009  normal  0.157669 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1233  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.29 
 
 
389 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7296  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.05 
 
 
399 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.059957  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2616  Na+/H+ antiporter NhaA  41.93 
 
 
391 aa  246  4.9999999999999997e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.536675  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3124  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.29 
 
 
389 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.646901  normal  0.440513 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1488  Na+/H+ antiporter  37.3 
 
 
386 aa  246  6e-64  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2860  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.09 
 
 
389 aa  246  6e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.611153  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3038  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.09 
 
 
389 aa  246  6e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.474949 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1756  Na+/H+ antiporter NhaA  38.18 
 
 
394 aa  245  8e-64  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2942  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.82 
 
 
389 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0919251  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3657  pH-dependent sodium/proton antiporter  44.19 
 
 
398 aa  245  9.999999999999999e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.457018  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3578  Na+/H+ antiporter NhaA  40.73 
 
 
388 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00256476  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2570  Na+/H+ antiporter NhaA  39.24 
 
 
472 aa  243  3.9999999999999997e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1390  Na+/H+ antiporter NhaA  38.46 
 
 
391 aa  242  1e-62  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2573  Na+/H+ antiporter NhaA  49.24 
 
 
539 aa  239  5e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.109155  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4283  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.15 
 
 
391 aa  237  2e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0694  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.6 
 
 
398 aa  237  2e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000263731  hitchhiker  0.00301245 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1410  Na+/H+ antiporter NhaA  44.74 
 
 
442 aa  237  3e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0583  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.63 
 
 
392 aa  237  3e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0187832  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1876  Na+/H+ antiporter  37.76 
 
 
387 aa  236  5.0000000000000005e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00181634 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0683  Kef-type K+ transport system membrane protein  39.6 
 
 
472 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1646  Na+/H+ antiporter NhaA  36.97 
 
 
382 aa  234  1.0000000000000001e-60  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4405  Na+/H+ antiporter NhaA  37.31 
 
 
408 aa  234  1.0000000000000001e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1827  Na+/H+ antiporter NhaA  36.7 
 
 
382 aa  233  3e-60  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2778  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.29 
 
 
398 aa  234  3e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3089  Na+/H+ antiporter NhaA  39.95 
 
 
406 aa  233  4.0000000000000004e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.761361  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1025  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.21 
 
 
391 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1136  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.83 
 
 
399 aa  233  6e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1784  Na+/H+ antiporter NhaA  35.5 
 
 
444 aa  233  6e-60  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30430  Na+/H+ antiporter NhaA  43.13 
 
 
440 aa  232  7.000000000000001e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3059  Na+/H+ antiporter NhaA  38.81 
 
 
452 aa  232  8.000000000000001e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0688  Na+/H+ antiporter NhaA  40.59 
 
 
389 aa  232  9e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2016  Na+/H+ antiporter NhaA  36.97 
 
 
382 aa  231  1e-59  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1132  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.67 
 
 
397 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.422688  normal  0.012742 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0544  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.04 
 
 
401 aa  230  3e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>