233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2293 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_2293  Na+/H+ antiporter NhaA  100 
 
 		 395 aa  761    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.193594 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2277  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.37 
 
 		 397 aa  284  2.0000000000000002e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00329368  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1390  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.83 
 
 		 391 aa  271  1e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000519432  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4533  sodium-proton antiporter NhaA  43.75 
 
 		 392 aa  265  1e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0407  Na+/H+ antiporter NhaA  41.54 
 
 		 425 aa  264  2e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2645  Na+/H+ antiporter NhaA  44.94 
 
 		 390 aa  261  1e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0364  pH-dependent sodium/proton antiporter  44.68 
 
 		 391 aa  260  2e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0732  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.34 
 
 		 409 aa  259  4e-68  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5174  sodium-proton antiporter NhaA  44.68 
 
 		 391 aa  259  7e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2941  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.9 
 
 		 394 aa  259  7e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.135486  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1390  Na+/H+ antiporter NhaA  39.01 
 
 		 391 aa  259  7e-68  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4283  pH-dependent sodium/proton antiporter  43.02 
 
 		 391 aa  258  1e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00018  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.86 
 
 		 388 aa  258  2e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.89758  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0019  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.86 
 
 		 388 aa  258  2e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.046286  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0017  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.86 
 
 		 388 aa  258  2e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4210  pH-dependent sodium/proton antiporter  43.9 
 
 		 392 aa  257  2e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.400142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0017  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.86 
 
 		 388 aa  258  2e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.453914  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3638  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.86 
 
 		 388 aa  258  2e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0842  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.05 
 
 		 390 aa  257  2e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0019  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.86 
 
 		 388 aa  258  2e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0237343  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00019  hypothetical protein  42.86 
 
 		 388 aa  258  2e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.892896  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0016  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.86 
 
 		 388 aa  258  2e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000467126  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0868  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.11 
 
 		 391 aa  255  9e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.128339 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3578  Na+/H+ antiporter NhaA  42.86 
 
 		 388 aa  254  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00256476  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0044  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.08 
 
 		 388 aa  255  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0042  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.08 
 
 		 388 aa  255  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.975088  hitchhiker  0.00613874 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0043  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.08 
 
 		 388 aa  255  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0043  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.08 
 
 		 388 aa  255  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.62168  normal  0.149849 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0044  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.08 
 
 		 388 aa  255  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0963  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.04 
 
 		 395 aa  254  2.0000000000000002e-66  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000193238  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1147  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.92 
 
 		 391 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1336  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.85 
 
 		 389 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7296  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.04 
 
 		 399 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.059957  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5991  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.52 
 
 		 399 aa  252  7e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.688009  normal  0.157669 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2616  Na+/H+ antiporter NhaA  42.37 
 
 		 391 aa  251  1e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.536675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2336  Na+/H+ antiporter NhaA  39.69 
 
 		 403 aa  251  1e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.000768129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3038  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.11 
 
 		 389 aa  250  3e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.474949 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1189  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.06 
 
 		 389 aa  250  3e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.685573  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1132  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.45 
 
 		 397 aa  250  4e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.422688  normal  0.012742 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2026  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.07 
 
 		 382 aa  249  4e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.470958  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1233  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.06 
 
 		 389 aa  249  4e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2582  Na+/H+ antiporter NhaA  41.48 
 
 		 393 aa  249  4e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3124  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.06 
 
 		 389 aa  249  4e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.646901  normal  0.440513 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1168  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.45 
 
 		 397 aa  250  4e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0515  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.84 
 
 		 393 aa  249  5e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1266  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.06 
 
 		 389 aa  249  5e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3264  sodium-proton antiporter NhaA  39.84 
 
 		 382 aa  249  8e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000713954 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2860  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.92 
 
 		 389 aa  249  8e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.611153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1233  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.16 
 
 		 382 aa  249  8e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000535639  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02646  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.28 
 
 		 391 aa  248  9e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1827  Na+/H+ antiporter NhaA  36.84 
 
 		 382 aa  248  1e-64  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2942  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.66 
 
 		 389 aa  248  1e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0919251  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1488  Na+/H+ antiporter  36.55 
 
 		 386 aa  248  2e-64  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0694  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.78 
 
 		 398 aa  247  3e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000263731  hitchhiker  0.00301245 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1646  Na+/H+ antiporter NhaA  36.84 
 
 		 382 aa  246  4e-64  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003767  Na+/H+ antiporter NhaA type  38.97 
 
 		 383 aa  246  6e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0600  Na+/H+ antiporter NhaA  40.67 
 
 		 424 aa  245  8e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.171137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6044  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.13 
 
 		 400 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.227636  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3958  sodium-proton antiporter, NhaA family  37.12 
 
 		 453 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.529436 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00573  Na+/H+ antiporter, NhaA  36.5 
 
 		 424 aa  244  1.9999999999999999e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3699  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.4 
 
 		 397 aa  243  3e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.262179 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3851  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.73 
 
 		 398 aa  244  3e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.79655  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0065  Na+/H+ antiporter NhaA  40.72 
 
 		 402 aa  243  3e-63  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000634714  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4598  Na+/H+ antiporter NhaA  41.65 
 
 		 408 aa  243  3.9999999999999997e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2016  Na+/H+ antiporter NhaA  37.6 
 
 		 382 aa  243  5e-63  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1868  Na+/H+ antiporter NhaA  37.12 
 
 		 453 aa  243  6e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.138297 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4405  Na+/H+ antiporter NhaA  38.08 
 
 		 408 aa  242  1e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0397  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.8 
 
 		 393 aa  241  2e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.311183  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3022  Na+/H+ antiporter NhaA  34.79 
 
 		 395 aa  241  2e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.396021  normal  0.0264038 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3464  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.53 
 
 		 394 aa  241  2e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000517181  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0406  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.8 
 
 		 420 aa  241  2e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.364642  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1756  Na+/H+ antiporter NhaA  36.07 
 
 		 394 aa  240  2.9999999999999997e-62  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3592  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.27 
 
 		 394 aa  239  4e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000151252  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3347  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.13 
 
 		 407 aa  240  4e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3059  Na+/H+ antiporter NhaA  36.43 
 
 		 452 aa  239  4e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1234  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.88 
 
 		 395 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.400812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1042  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.66 
 
 		 391 aa  239  5.999999999999999e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.12391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0795  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.01 
 
 		 394 aa  239  8e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000129218  normal  0.24433 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1390  Na+/H+ antiporter NhaA  38.9 
 
 		 396 aa  238  2e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.168803  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3657  pH-dependent sodium/proton antiporter  40 
 
 		 398 aa  238  2e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.457018  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2666  Na+/H+ antiporter NhaA  41.25 
 
 		 445 aa  237  3e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.657461  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0583  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.53 
 
 		 392 aa  236  4e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0187832  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0580  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.36 
 
 		 391 aa  236  7e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0119541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0128  Na+/H+ antiporter NhaA  42.48 
 
 		 399 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.124586  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1025  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.14 
 
 		 391 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0544  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.94 
 
 		 401 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3089  Na+/H+ antiporter NhaA  37.5 
 
 		 406 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.761361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0693  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.3 
 
 		 396 aa  233  4.0000000000000004e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.11155  normal  0.550501 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6194  Na+/H+ antiporter NhaA  36.95 
 
 		 379 aa  233  5e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.219672 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1762  Na(+)/H(+) antiporter 1  37.44 
 
 		 464 aa  233  6e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1826  pH-dependent sodium/proton antiporter  34.11 
 
 		 389 aa  232  7.000000000000001e-60  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.243343  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1645  pH-dependent sodium/proton antiporter  34.38 
 
 		 389 aa  232  7.000000000000001e-60  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2015  pH-dependent sodium/proton antiporter  34.64 
 
 		 389 aa  232  8.000000000000001e-60  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1784  Na+/H+ antiporter NhaA  34.36 
 
 		 444 aa  230  3e-59  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0585  Na+/H+ antiporter NhaA  39.13 
 
 		 423 aa  230  3e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5677  Na+/H+ antiporter NhaA  40.58 
 
 		 404 aa  230  4e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.575468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1928  Na+/H+ antiporter NhaA  41.73 
 
 		 376 aa  229  5e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1136  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.98 
 
 		 399 aa  229  7e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5554  Na+/H+ antiporter NhaA  37.29 
 
 		 451 aa  228  2e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.477487  normal  0.958846 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2307  Na+/H+ antiporter NhaA  36.3 
 
 		 455 aa  227  2e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>