230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1410 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1410  Na+/H+ antiporter NhaA  100 
 
 		 442 aa  843    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27000  Na+/H+ antiporter NhaA  59.06 
 
 		 429 aa  432  1e-120  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.358876  normal  0.743342 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0925  Na+/H+ antiporter NhaA  58.16 
 
 		 436 aa  369  1e-101  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12160  Na+/H+ antiporter NhaA  54.03 
 
 		 436 aa  360  2e-98  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2105  Na+/H+ antiporter NhaA  54.3 
 
 		 462 aa  349  6e-95  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0345  Na+/H+ antiporter NhaA  49.42 
 
 		 434 aa  344  2e-93  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6928  Na+/H+ antiporter NhaA  50.58 
 
 		 446 aa  343  4e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.126973  normal  0.148656 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1152  Na+/H+ antiporter NhaA  51.48 
 
 		 453 aa  330  4e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2262  pH-dependent sodium/proton antiporter  53.4 
 
 		 436 aa  328  8e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.50629  normal  0.0112773 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2920  Na+/H+ antiporter NhaA  54.44 
 
 		 463 aa  329  8e-89  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.410818  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2512  Na+/H+ antiporter NhaA  51.12 
 
 		 451 aa  328  1.0000000000000001e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0116131  normal  0.0122824 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2118  pH-dependent sodium/proton antiporter  53.85 
 
 		 436 aa  327  3e-88  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0195602 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2207  pH-dependent sodium/proton antiporter  50.59 
 
 		 441 aa  325  1e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2253  pH-dependent sodium/proton antiporter  50.59 
 
 		 450 aa  325  1e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.254168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2196  pH-dependent sodium/proton antiporter  50.35 
 
 		 450 aa  323  3e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.045378  normal  0.0524961 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4510  Na+/H+ antiporter NhaA  47.7 
 
 		 422 aa  316  4e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3027  pH-dependent sodium/proton antiporter  46.03 
 
 		 449 aa  313  3.9999999999999997e-84  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.751517 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0405  Na+/H+ antiporter NhaA  51.34 
 
 		 437 aa  313  4.999999999999999e-84  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3924  pH-dependent sodium/proton antiporter  50.72 
 
 		 447 aa  312  7.999999999999999e-84  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00452006  normal  0.998293 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4630  Na+/H+ antiporter NhaA  52.74 
 
 		 461 aa  311  1e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.726539  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2583  pH-dependent sodium/proton antiporter  52.79 
 
 		 442 aa  311  2e-83  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.281476 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2476  pH-dependent sodium/proton antiporter  50.77 
 
 		 464 aa  308  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.946252  normal  0.639371 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3507  Na+/H+ antiporter NhaA  50.48 
 
 		 429 aa  305  8.000000000000001e-82  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.486632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1657  Na+/H+ antiporter NhaA  48.84 
 
 		 432 aa  299  5e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.017914 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0107  pH-dependent sodium/proton antiporter  48.78 
 
 		 461 aa  298  1e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2301  Na+/H+ antiporter NhaA  48.82 
 
 		 414 aa  296  4e-79  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0203  Na+/H+ antiporter NhaA  50.25 
 
 		 434 aa  284  2.0000000000000002e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0229594  normal  0.01526 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0476  Na+/H+ antiporter NhaA  44.61 
 
 		 408 aa  274  2.0000000000000002e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0880  Na+/H+ antiporter NhaA  45.03 
 
 		 401 aa  269  8e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.324088 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0066  Na+/H+ antiporter NhaA  44.84 
 
 		 433 aa  268  2e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0261  Na+/H+ antiporter NhaA  45.09 
 
 		 390 aa  255  1.0000000000000001e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.947479  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30430  Na+/H+ antiporter NhaA  44.33 
 
 		 440 aa  249  6e-65  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0683  Kef-type K+ transport system membrane protein  38.05 
 
 		 472 aa  248  1e-64  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0869  putative Na+/H+ antiporter NhaA  41.01 
 
 		 419 aa  243  5e-63  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5677  Na+/H+ antiporter NhaA  42.37 
 
 		 404 aa  241  2e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.575468  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1488  Na+/H+ antiporter  37.5 
 
 		 386 aa  241  2e-62  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3924  Na+/H+ antiporter NhaA  40.55 
 
 		 402 aa  241  2e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0288538  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1238  Na+/H+ antiporter NhaA  49.85 
 
 		 431 aa  237  3e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4842  Na+/H+ antiporter NhaA  41.91 
 
 		 413 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003767  Na+/H+ antiporter NhaA type  38.54 
 
 		 383 aa  233  5e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2573  Na+/H+ antiporter NhaA  47.8 
 
 		 539 aa  233  5e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.109155  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1233  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.69 
 
 		 382 aa  232  8.000000000000001e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000535639  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1266  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.67 
 
 		 389 aa  232  1e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3124  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.4 
 
 		 389 aa  231  2e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.646901  normal  0.440513 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1233  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.4 
 
 		 389 aa  231  2e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1189  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.4 
 
 		 389 aa  231  2e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.685573  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02646  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.54 
 
 		 391 aa  230  3e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1336  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.4 
 
 		 389 aa  229  6e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1147  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.67 
 
 		 391 aa  228  1e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4197  Na+/H+ antiporter NhaA  38.99 
 
 		 401 aa  228  2e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.917396  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0028  Na+/H+ antiporter NhaA  36.99 
 
 		 396 aa  228  2e-58  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0868  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.93 
 
 		 391 aa  227  3e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.128339 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0043  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.44 
 
 		 388 aa  226  4e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.62168  normal  0.149849 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0043  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.44 
 
 		 388 aa  226  4e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3038  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.2 
 
 		 389 aa  226  4e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.474949 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0042  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.44 
 
 		 388 aa  226  4e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.975088  hitchhiker  0.00613874 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0044  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.44 
 
 		 388 aa  226  4e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0044  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.44 
 
 		 388 aa  226  4e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2860  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.93 
 
 		 389 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.611153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2771  Na+/H+ antiporter NhaA  37.53 
 
 		 450 aa  226  7e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00813597  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1390  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.92 
 
 		 391 aa  226  8e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000519432  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2277  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.88 
 
 		 397 aa  226  8e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00329368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2942  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.67 
 
 		 389 aa  225  1e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0919251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2026  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.21 
 
 		 382 aa  224  3e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.470958  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3657  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.33 
 
 		 398 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.457018  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3264  sodium-proton antiporter NhaA  36.84 
 
 		 382 aa  223  7e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000713954 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2941  pH-dependent sodium/proton antiporter  36.53 
 
 		 394 aa  223  7e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.135486  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4283  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.18 
 
 		 391 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0585  Na+/H+ antiporter NhaA  40.29 
 
 		 423 aa  221  9.999999999999999e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00018  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.44 
 
 		 388 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.89758  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3578  Na+/H+ antiporter NhaA  40.44 
 
 		 388 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00256476  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0016  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.44 
 
 		 388 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000467126  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00019  hypothetical protein  40.44 
 
 		 388 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.892896  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0017  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.44 
 
 		 388 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3638  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.44 
 
 		 388 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0019  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.44 
 
 		 388 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0237343  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0019  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.44 
 
 		 388 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.046286  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0017  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.17 
 
 		 388 aa  220  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.453914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0732  pH-dependent sodium/proton antiporter  36.18 
 
 		 409 aa  220  3.9999999999999997e-56  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2582  Na+/H+ antiporter NhaA  40.28 
 
 		 393 aa  220  5e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3851  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.92 
 
 		 398 aa  219  7e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.79655  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3091  Na+/H+ antiporter NhaA  49.85 
 
 		 447 aa  219  1e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.904983  hitchhiker  0.000017266 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0963  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.04 
 
 		 395 aa  217  2.9999999999999998e-55  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000193238  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1645  pH-dependent sodium/proton antiporter  36.1 
 
 		 389 aa  217  4e-55  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2666  Na+/H+ antiporter NhaA  42.64 
 
 		 445 aa  217  4e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.657461  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0580  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.53 
 
 		 391 aa  216  5e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0119541  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00573  Na+/H+ antiporter, NhaA  37.31 
 
 		 424 aa  216  5.9999999999999996e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3464  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.44 
 
 		 394 aa  214  1.9999999999999998e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000517181  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1025  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.6 
 
 		 391 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2015  pH-dependent sodium/proton antiporter  35.56 
 
 		 389 aa  214  2.9999999999999995e-54  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1826  pH-dependent sodium/proton antiporter  35.56 
 
 		 389 aa  213  3.9999999999999995e-54  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.243343  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3592  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.15 
 
 		 394 aa  213  3.9999999999999995e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000151252  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0795  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.87 
 
 		 394 aa  213  5.999999999999999e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000129218  normal  0.24433 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2307  Na+/H+ antiporter NhaA  36.96 
 
 		 455 aa  213  7e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1390  Na+/H+ antiporter NhaA  39.18 
 
 		 396 aa  212  1e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.168803  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1390  Na+/H+ antiporter NhaA  35.08 
 
 		 391 aa  211  1e-53  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0544  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.66 
 
 		 401 aa  211  1e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1132  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.48 
 
 		 397 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.422688  normal  0.012742 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2016  Na+/H+ antiporter NhaA  36.44 
 
 		 382 aa  211  3e-53  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1827  Na+/H+ antiporter NhaA  36.17 
 
 		 382 aa  210  4e-53  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>