100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_0270 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_0270  beta-lactamase domain protein  100 
 
 
353 aa  719    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1080  beta-lactamase domain-containing protein  42.44 
 
 
372 aa  242  6e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0123  beta-lactamase-like protein  32.68 
 
 
366 aa  154  2e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.480569  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0541  beta-lactamase-like  32.42 
 
 
356 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.804556  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1574  Zn-dependent hydrolase  25.07 
 
 
436 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000156356  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1613  beta-lactamase domain-containing protein  23.31 
 
 
420 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1613  metallo-beta-lactamase family protein  25.07 
 
 
436 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.631531  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1565  zinc-dependent hydrolase  24.28 
 
 
436 aa  70.1  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1737  metallo-beta-lactamase family protein  24.8 
 
 
419 aa  70.1  0.00000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5264  beta-lactamase domain-containing protein  27.35 
 
 
830 aa  68.2  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3588  metallo-beta-lactamase family protein  23.82 
 
 
419 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1788  metallo-beta-lactamase family protein  24.35 
 
 
419 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1814  metallo-beta-lactamase family protein  23.1 
 
 
419 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1755  metallo-beta-lactamase family protein  25.29 
 
 
419 aa  63.9  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1868  metallo-beta-lactamase family protein  23.36 
 
 
419 aa  63.9  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0309  beta-lactamase domain-containing protein  26.61 
 
 
639 aa  62  0.00000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1385  beta-lactamase domain-containing protein  27.72 
 
 
639 aa  61.2  0.00000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.741277  normal  0.763255 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0777  beta-lactamase domain protein  26.13 
 
 
630 aa  57.8  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.867846  normal  0.0104567 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1733  Metal-dependent hydrolase of the beta-lactamase superfamily III-like protein  31.02 
 
 
250 aa  55.8  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.649744 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0455  beta-lactamase domain-containing protein  26.96 
 
 
636 aa  54.7  0.000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.263173 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1359  beta-lactamase domain protein  31.07 
 
 
246 aa  55.1  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0845  beta-lactamase-like  25.44 
 
 
629 aa  54.7  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.554835  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1572  beta-lactamase domain-containing protein  27.69 
 
 
635 aa  54.3  0.000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.342192  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0966  beta-lactamase domain protein  25.61 
 
 
641 aa  53.9  0.000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0019  beta-lactamase-like protein  25.53 
 
 
813 aa  53.9  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1185  beta-lactamase domain-containing protein  24.48 
 
 
447 aa  53.5  0.000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.0000645588  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2692  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  25.27 
 
 
450 aa  53.5  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0719706  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5649  beta-lactamase domain-containing protein  30 
 
 
248 aa  53.1  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.704721  normal  0.90669 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0384  hypothetical protein  30.81 
 
 
250 aa  52.8  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0581145  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1600  beta-lactamase domain-containing protein  23.73 
 
 
421 aa  52.8  0.00001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0760665 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2598  KH-domain/beta-lactamase-domain protein  25.61 
 
 
644 aa  52  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0941  beta-lactamase domain-containing protein  29.73 
 
 
251 aa  52  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.504318 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1989  beta-lactamase domain-containing protein  21.91 
 
 
422 aa  50.8  0.00004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.881158  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2254  beta-lactamase domain-containing protein  25 
 
 
642 aa  50.4  0.00004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.311245 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1199  beta-lactamase domain-containing protein  24.15 
 
 
630 aa  50.4  0.00005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0390608  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3866  beta-lactamase domain protein  47.62 
 
 
249 aa  50.4  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1817  KH-domain/beta-lactamase-domain protein  25.77 
 
 
635 aa  50.4  0.00005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1284  beta-lactamase domain-containing protein  25.36 
 
 
467 aa  50.1  0.00006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.818199 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1566  beta-lactamase domain-containing protein  25.52 
 
 
441 aa  49.7  0.00007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0665026  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0325  KH-domain/beta-lactamase-domain protein  24.56 
 
 
644 aa  49.7  0.00007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.04093  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3813  beta-lactamase domain-containing protein  30.99 
 
 
571 aa  49.7  0.00008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.656943  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2210  hypothetical protein  22.79 
 
 
452 aa  48.9  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38530  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  25 
 
 
468 aa  49.3  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0506935  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2698  beta-lactamase domain protein  25.09 
 
 
641 aa  49.3  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.132267  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3231  beta-lactamase domain protein  28.71 
 
 
549 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1721  beta-lactamase domain-containing protein  28.72 
 
 
635 aa  49.3  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.959276 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0446  beta-lactamase domain-containing protein  24.89 
 
 
428 aa  48.9  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.279355  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2889  beta-lactamase domain protein  28.71 
 
 
549 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0190  beta-lactamase domain-containing protein  28.72 
 
 
635 aa  49.3  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2366  hypothetical protein  30.89 
 
 
268 aa  49.3  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2205  beta-lactamase domain protein  30.14 
 
 
246 aa  48.5  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17570  hypothetical protein  23.91 
 
 
467 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1526  hypothetical protein  24.28 
 
 
467 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.2328  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2182  hypothetical protein  22.45 
 
 
452 aa  48.5  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2679  metallo-beta-lactamase family protein  25.36 
 
 
462 aa  47.8  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.947149  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2304  beta-lactamase domain protein  25.36 
 
 
462 aa  47.8  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.73146  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3534  beta-lactamase domain protein  38.16 
 
 
264 aa  47.4  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0882  beta-lactamase domain-containing protein  28.21 
 
 
635 aa  47.4  0.0003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.28665  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1107  beta-lactamase domain-containing protein  24.73 
 
 
640 aa  47.4  0.0003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.519523  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0082  beta-lactamase domain-containing protein  23.32 
 
 
635 aa  47.4  0.0004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0049  beta-lactamase domain-containing protein  25.64 
 
 
635 aa  47.4  0.0004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4103  beta-lactamase-like  25.99 
 
 
539 aa  47.4  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.352914 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1028  beta-lactamase domain-containing protein  23.91 
 
 
616 aa  47.4  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1852  putative mRNA 3-end processing factor  28.57 
 
 
337 aa  47.4  0.0004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.681251  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0351  beta-lactamase domain-containing protein  22.08 
 
 
472 aa  47.4  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.766684  normal  0.755187 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1292  beta-lactamase domain-containing protein  24.17 
 
 
422 aa  47  0.0005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.358627  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0691  beta-lactamase domain-containing protein  27.01 
 
 
421 aa  47  0.0005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0558  beta-lactamase domain-containing protein  27.49 
 
 
430 aa  47  0.0005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00303127 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1341  beta-lactamase domain protein  26.04 
 
 
465 aa  46.6  0.0006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5275  beta-lactamase domain protein  30.06 
 
 
263 aa  47  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0626  beta-lactamase domain-containing protein  24.17 
 
 
422 aa  47  0.0006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1539  beta-lactamase domain-containing protein  32.28 
 
 
421 aa  46.6  0.0007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000502709 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5599  beta-lactamase domain protein  23.67 
 
 
477 aa  46.6  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0190943  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2046  beta-lactamase domain-containing protein  23.74 
 
 
461 aa  46.2  0.0009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2052  beta-lactamase domain protein  24.39 
 
 
640 aa  45.8  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0197  beta-lactamase domain-containing protein  27.48 
 
 
422 aa  45.4  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.904798  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1883  beta-lactamase domain protein  32.94 
 
 
456 aa  45.8  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3129  beta-lactamase domain protein  24.75 
 
 
634 aa  45.8  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.43915 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1727  beta-lactamase domain-containing protein  25 
 
 
646 aa  45.8  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0637994 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0193  cleavage and polyadenylation specificity factor  23.2 
 
 
637 aa  45.8  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.209182  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0871  beta-lactamase-like  29.31 
 
 
270 aa  45.1  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1061  metallo-beta-lactamase family protein  23.3 
 
 
468 aa  44.7  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01524  Beta-lactamase-like:RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  24.72 
 
 
455 aa  45.1  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0060  beta-lactamase domain-containing protein  24 
 
 
634 aa  45.4  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.287706  normal  0.0538773 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1043  putative mRNA 3-end processing factor  28 
 
 
319 aa  45.1  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0008566 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1014  ADP-ribosylation/crystallin J1  23.61 
 
 
636 aa  45.1  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.5583 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0030  beta-lactamase domain-containing protein  25.96 
 
 
634 aa  45.4  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0768  beta-lactamase domain protein  21.83 
 
 
451 aa  44.3  0.003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000108746  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1749  beta-lactamase domain-containing protein  24.21 
 
 
428 aa  44.3  0.003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00852065 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2454  Beta-lactamase-like  26.42 
 
 
319 aa  44.3  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3291  metallo-beta-lactamase family protein  34.94 
 
 
455 aa  43.9  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.119615  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2467  beta-lactamase domain-containing protein  34.94 
 
 
455 aa  43.9  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.941259  normal  0.38784 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1938  beta-lactamase domain protein  22.18 
 
 
821 aa  43.5  0.006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.199019  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3493  metallo-beta-lactamase family protein  23.42 
 
 
468 aa  43.5  0.006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.828376  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7555  beta-lactamase domain protein  28.5 
 
 
257 aa  43.5  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.731763  normal  0.770498 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0554  beta-lactamase domain-containing protein  24.9 
 
 
464 aa  43.1  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.199142  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0064  beta-lactamase domain-containing protein  22.76 
 
 
635 aa  43.1  0.007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3769  Beta-lactamase-like  27.98 
 
 
326 aa  42.7  0.009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2308  hypothetical protein  26.56 
 
 
339 aa  42.7  0.01  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.146289  normal  0.484856 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3460  beta-lactamase domain-containing protein  21.91 
 
 
452 aa  42.7  0.01  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.857931  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>