107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_1852 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007955  Mbur_1852  putative mRNA 3-end processing factor  100 
 
 		 337 aa  703    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.681251  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2308  hypothetical protein  61.31 
 
 		 339 aa  434  1e-121  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.146289  normal  0.484856 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1132  hypothetical protein  49.24 
 
 		 328 aa  314  9.999999999999999e-85  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.00888  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1883  putative mRNA 3-end processing factor  27.41 
 
 		 327 aa  89  1e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.115808  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00669  RNA procession exonuclease-like protein  30.25 
 
 		 338 aa  87  5e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0799  putative metallo-hydrolase/oxidoreductase  28.57 
 
 		 348 aa  86.3  7e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.187593  normal  0.0112138 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4043  putative mRNA 3-end processing factor  29.23 
 
 		 337 aa  83.6  0.000000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1043  putative mRNA 3-end processing factor  29.67 
 
 		 319 aa  83.6  0.000000000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0008566 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6008  hypothetical protein  33.9 
 
 		 337 aa  82  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1313  beta-lactamase domain-containing protein  27.33 
 
 		 315 aa  80.5  0.00000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.143027  normal  0.259963 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0913  putative exonuclease protein involved in mRNA processing  35.87 
 
 		 336 aa  80.5  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.228952 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0973  putative mRNA 3-end processing factor  28.29 
 
 		 314 aa  79.7  0.00000000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.289039 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0794  putative mRNA 3-end processing factor  27.16 
 
 		 349 aa  79.7  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.682803 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0461  hypothetical protein  28.82 
 
 		 390 aa  78.6  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4616  putative mRNA 3-end processing factor  27.95 
 
 		 351 aa  79  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0801  putative exonuclease protein involved in mRNA processing  35.96 
 
 		 336 aa  79  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.157265 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0067  putative mRNA 3-end processing factor  28.01 
 
 		 357 aa  78.2  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0289  putative mRNA 3-end processing factor  27.76 
 
 		 337 aa  77.8  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.640549 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0031  putative mRNA 3-end processing factor  33.17 
 
 		 334 aa  78.6  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.321442  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3431  putative mRNA 3-end processing factor  30.03 
 
 		 352 aa  77.4  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.194998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0629  putative mRNA 3-end processing factor  28.91 
 
 		 365 aa  76.6  0.0000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.88354  decreased coverage  0.00579405 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0260  putative mRNA 3-end processing factor  29.61 
 
 		 344 aa  76.3  0.0000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00946134 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0871  putative metallo-hydrolase/oxidoreductase  28.33 
 
 		 348 aa  75.9  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0130781  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3978  RNA procession exonuclease-like protein  27.17 
 
 		 371 aa  74.7  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.107304  normal  0.652273 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2803  putative mRNA 3-end processing factor  35.71 
 
 		 338 aa  74.7  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.196277 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0552  hypothetical protein  32.29 
 
 		 347 aa  74.3  0.000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3692  putative mRNA 3-end processing factor  29.78 
 
 		 351 aa  73.6  0.000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0750  putative mRNA 3-end processing factor  32.32 
 
 		 356 aa  73.6  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.398364 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1471  putative mRNA 3-end processing factor  32.63 
 
 		 348 aa  73.6  0.000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1072  putative mRNA 3-end processing factor  28.06 
 
 		 344 aa  73.6  0.000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0686869 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1540  putative mRNA 3-end processing factor  28.57 
 
 		 345 aa  73.2  0.000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0411  putative exonuclease protein involved in mRNA processing  27.54 
 
 		 329 aa  71.6  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.894409 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0788  putative mRNA 3-end processing factor  29.3 
 
 		 317 aa  71.2  0.00000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3236  putative mRNA 3-end processing factor  28.38 
 
 		 352 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.193513 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3560  putative mRNA 3-end processing factor  28.05 
 
 		 352 aa  69.7  0.00000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.146642  normal  0.26456 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4896  putative mRNA 3-end processing factor  26.8 
 
 		 335 aa  69.3  0.00000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1612  RNA procession exonuclease-like protein  26.33 
 
 		 354 aa  62  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0096  beta-lactamase-like  25.58 
 
 		 411 aa  58.2  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.619146  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1568  RNA procession exonuclease-like protein  32.61 
 
 		 358 aa  58.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.359999 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1406  RNA procession exonuclease-like protein  26.81 
 
 		 313 aa  58.5  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0847473 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1582  RNA procession exonuclease-like protein  31.06 
 
 		 332 aa  57.4  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1938  beta-lactamase domain protein  26.57 
 
 		 821 aa  57.4  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.199019  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07841  beta-lactamase fold exonuclease  23.96 
 
 		 328 aa  57.4  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.110589  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1460  exonuclease involved in mRNA processing  31.32 
 
 		 328 aa  55.8  0.0000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.562175  normal  0.133127 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2609  mRNA 3-end processing factor  23.42 
 
 		 397 aa  55.5  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.299083 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0734  hypothetical protein  23.61 
 
 		 328 aa  54.7  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.536853  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2561  putative mRNA 3-end processing factor  27.56 
 
 		 332 aa  54.3  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3523  RNA procession exonuclease  25.33 
 
 		 349 aa  53.9  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2665  putative mRNA 3-end processing factor  27.36 
 
 		 335 aa  53.1  0.000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.14848 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07841  RNA processing exonuclease  23.61 
 
 		 328 aa  52  0.00001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.160717  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5293  putative exonuclease involved in mRNA processing  28.9 
 
 		 382 aa  51.6  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0150  exonuclease of the beta-lactamase fold involved in RNA processing-like protein  27.78 
 
 		 355 aa  51.2  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1519  hypothetical protein  29.11 
 
 		 340 aa  50.8  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.244581 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00990  Endoribonuclease ysh1 (EC 3.1.27.-)(mRNA 3'-end-processing protein ysh1) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BEP0]  26.67 
 
 		 884 aa  50.4  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2916  mRNA 3'-end processing factor  27.68 
 
 		 362 aa  50.4  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4860  putative mRNA 3-end processing factor  29.7 
 
 		 375 aa  50.4  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6856  hypothetical protein  24.58 
 
 		 340 aa  50.1  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.166328 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1042  exonuclease  29.35 
 
 		 328 aa  49.7  0.00007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.251284  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1077  putative mRNA 3-end processing factor  31.85 
 
 		 383 aa  49.7  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4103  beta-lactamase-like  30.05 
 
 		 539 aa  49.3  0.00009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.352914 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1028  beta-lactamase domain-containing protein  26 
 
 		 616 aa  49.3  0.00009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3335  RNA procession exonuclease  27.85 
 
 		 383 aa  49.3  0.00009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2414  hypothetical protein  31.85 
 
 		 383 aa  49.3  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0374  putative mRNA 3-end processing factor  30.91 
 
 		 371 aa  48.9  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5264  beta-lactamase domain-containing protein  24.4 
 
 		 830 aa  48.9  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4134  hypothetical protein  29.27 
 
 		 348 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1314  putative exonuclease involved in mRNA processing  26.16 
 
 		 383 aa  48.5  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0772701  normal  0.174474 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08581  RNA processing exonuclease  21.99 
 
 		 330 aa  48.1  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0814782  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1292  beta-lactamase domain-containing protein  24.29 
 
 		 422 aa  47.4  0.0003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.358627  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1796  beta-lactamase domain protein  25.37 
 
 		 414 aa  47.8  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02275  hypothetical protein  23.91 
 
 		 347 aa  47.4  0.0004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1728  beta-lactamase domain-containing protein  27.64 
 
 		 425 aa  47  0.0004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.254192  decreased coverage  0.00045837 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2196  RNA procession exonuclease-like protein  27.17 
 
 		 335 aa  47  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.260801  hitchhiker  0.00381998 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0626  beta-lactamase domain-containing protein  24.29 
 
 		 422 aa  47.4  0.0004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0270  beta-lactamase domain protein  28.57 
 
 		 353 aa  47.4  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3148  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  23.95 
 
 		 1017 aa  46.6  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.331414  normal  0.459978 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0621  beta-lactamase domain-containing protein  28.49 
 
 		 317 aa  46.2  0.0008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1600  beta-lactamase domain-containing protein  24.26 
 
 		 421 aa  46.2  0.0008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0760665 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3043  putative mRNA 3-end processing factor  26.86 
 
 		 346 aa  46.2  0.0008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0285628  normal  0.582199 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0828  beta-lactamase domain-containing protein  25.69 
 
 		 476 aa  45.4  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0969398  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89936  predicted protein  27.12 
 
 		 793 aa  45.8  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.731556  normal  0.295472 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0197  beta-lactamase domain-containing protein  23.81 
 
 		 422 aa  45.8  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.904798  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2587  hypothetical protein  29.17 
 
 		 342 aa  45.4  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136385 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1135  RNA procession exonuclease-like protein  26.29 
 
 		 338 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.775803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3402  beta-lactamase domain protein  23.92 
 
 		 429 aa  45.4  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2889  beta-lactamase domain protein  24.75 
 
 		 549 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1212  hypothetical protein  27.16 
 
 		 344 aa  45.1  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.766488 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1266  beta-lactamase-like protein  29.37 
 
 		 469 aa  44.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.23851  normal  0.0118241 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0025  beta-lactamase domain-containing protein  20.36 
 
 		 432 aa  45.1  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4681  putative exonuclease involved in mRNA processing  28.76 
 
 		 350 aa  45.1  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.388572  normal  0.0823984 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0238  beta-lactamase domain protein  28.23 
 
 		 468 aa  44.7  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.465693 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3231  beta-lactamase domain protein  24.75 
 
 		 549 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0305  putative mRNA 3-end processing factor  27.71 
 
 		 366 aa  45.1  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1893  beta-lactamase domain protein  25.26 
 
 		 411 aa  45.1  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.411885  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33504  predicted protein  31.25 
 
 		 767 aa  44.3  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.174633 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1754  RNA procession exonuclease-like protein  28.83 
 
 		 351 aa  44.3  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1146  RNA procession exonuclease-like protein  29.01 
 
 		 338 aa  44.7  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.39024 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1113  hypothetical protein  26.07 
 
 		 321 aa  44.3  0.003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.704257 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0310  putative mRNA 3-end processing factor  27.71 
 
 		 366 aa  43.9  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.169646 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1106  RNA processing exonuclease  27.95 
 
 		 338 aa  43.5  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.599734 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>