153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_0734 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007577  PMT9312_0734  hypothetical protein  100 
 
 		 328 aa  668    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.536853  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07841  RNA processing exonuclease  95.12 
 
 		 328 aa  641    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.160717  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07841  beta-lactamase fold exonuclease  94.82 
 
 		 328 aa  638    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.110589  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08581  RNA processing exonuclease  69.02 
 
 		 330 aa  467  9.999999999999999e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0814782  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1042  exonuclease  39.81 
 
 		 328 aa  297  1e-79  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.251284  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1460  exonuclease involved in mRNA processing  39.88 
 
 		 328 aa  279  5e-74  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.562175  normal  0.133127 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3872  hypothetical protein  41.53 
 
 		 348 aa  270  2e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.187912 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3523  RNA procession exonuclease  39.18 
 
 		 349 aa  269  4e-71  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4134  hypothetical protein  40.95 
 
 		 348 aa  267  2e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4860  putative mRNA 3-end processing factor  37.89 
 
 		 375 aa  267  2e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2561  putative mRNA 3-end processing factor  38.78 
 
 		 332 aa  263  2e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3043  putative mRNA 3-end processing factor  37.26 
 
 		 346 aa  264  2e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0285628  normal  0.582199 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2916  mRNA 3'-end processing factor  35.78 
 
 		 362 aa  255  6e-67  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2959  mRNA 3'-end processing factor  36.42 
 
 		 332 aa  255  9e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.624115  hitchhiker  0.0000489273 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0305  putative mRNA 3-end processing factor  35.62 
 
 		 366 aa  254  1.0000000000000001e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3896  hypothetical protein  34.88 
 
 		 368 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.170406  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0310  putative mRNA 3-end processing factor  36.31 
 
 		 366 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.169646 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1582  RNA procession exonuclease-like protein  37.7 
 
 		 332 aa  254  2.0000000000000002e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02275  hypothetical protein  37.93 
 
 		 347 aa  253  4.0000000000000004e-66  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0374  putative mRNA 3-end processing factor  35.09 
 
 		 371 aa  251  8.000000000000001e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1519  hypothetical protein  37.06 
 
 		 340 aa  251  1e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.244581 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6856  hypothetical protein  36.22 
 
 		 340 aa  249  4e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.166328 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1212  hypothetical protein  38.54 
 
 		 344 aa  248  9e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.766488 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3335  RNA procession exonuclease  36.54 
 
 		 383 aa  248  1e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1106  RNA processing exonuclease  38.54 
 
 		 338 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.599734 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1146  RNA procession exonuclease-like protein  38.54 
 
 		 338 aa  242  7e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.39024 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5293  putative exonuclease involved in mRNA processing  39.24 
 
 		 382 aa  242  7.999999999999999e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4681  putative exonuclease involved in mRNA processing  37.3 
 
 		 350 aa  241  9e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.388572  normal  0.0823984 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4306  RNA procession exonuclease-like protein  38.54 
 
 		 338 aa  239  4e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2196  RNA procession exonuclease-like protein  38.22 
 
 		 335 aa  239  4e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.260801  hitchhiker  0.00381998 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1314  putative exonuclease involved in mRNA processing  37.14 
 
 		 383 aa  237  2e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0772701  normal  0.174474 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01738  mRNA 3'-end processing factor  37.3 
 
 		 340 aa  238  2e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1135  RNA procession exonuclease-like protein  36.31 
 
 		 338 aa  236  4e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.775803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1754  RNA procession exonuclease-like protein  40.06 
 
 		 351 aa  235  8e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0552  hypothetical protein  35.94 
 
 		 347 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1072  putative mRNA 3-end processing factor  36.2 
 
 		 344 aa  234  2.0000000000000002e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0686869 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2414  hypothetical protein  35.96 
 
 		 383 aa  231  2e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1077  putative mRNA 3-end processing factor  35.96 
 
 		 383 aa  231  2e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0750  putative mRNA 3-end processing factor  36.59 
 
 		 356 aa  230  3e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.398364 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2587  hypothetical protein  36.19 
 
 		 342 aa  230  3e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136385 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0794  putative mRNA 3-end processing factor  36.74 
 
 		 349 aa  229  5e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.682803 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0799  putative metallo-hydrolase/oxidoreductase  36.42 
 
 		 348 aa  226  6e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.187593  normal  0.0112138 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0150  exonuclease of the beta-lactamase fold involved in RNA processing-like protein  35.94 
 
 		 355 aa  225  1e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1568  RNA procession exonuclease-like protein  35.67 
 
 		 358 aa  224  1e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.359999 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0871  putative metallo-hydrolase/oxidoreductase  36.45 
 
 		 348 aa  223  3e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0130781  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2665  putative mRNA 3-end processing factor  36.1 
 
 		 335 aa  223  4e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.14848 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4616  putative mRNA 3-end processing factor  35.46 
 
 		 351 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0260  putative mRNA 3-end processing factor  32.12 
 
 		 344 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00946134 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1540  putative mRNA 3-end processing factor  32.23 
 
 		 345 aa  220  3e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0289  putative mRNA 3-end processing factor  32 
 
 		 337 aa  219  3.9999999999999997e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.640549 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0629  putative mRNA 3-end processing factor  32.24 
 
 		 365 aa  215  9e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.88354  decreased coverage  0.00579405 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3431  putative mRNA 3-end processing factor  31.83 
 
 		 352 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.194998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3978  RNA procession exonuclease-like protein  33.66 
 
 		 371 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.107304  normal  0.652273 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4896  putative mRNA 3-end processing factor  32.91 
 
 		 335 aa  212  5.999999999999999e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00669  RNA procession exonuclease-like protein  33.77 
 
 		 338 aa  210  3e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0461  hypothetical protein  35.33 
 
 		 390 aa  209  5e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0913  putative exonuclease protein involved in mRNA processing  33.02 
 
 		 336 aa  208  8e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.228952 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3560  putative mRNA 3-end processing factor  31.53 
 
 		 352 aa  208  9e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.146642  normal  0.26456 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3236  putative mRNA 3-end processing factor  31.53 
 
 		 352 aa  207  1e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.193513 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1471  putative mRNA 3-end processing factor  32.48 
 
 		 348 aa  207  2e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0801  putative exonuclease protein involved in mRNA processing  33.23 
 
 		 336 aa  207  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.157265 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4043  putative mRNA 3-end processing factor  34.91 
 
 		 337 aa  206  3e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1612  RNA procession exonuclease-like protein  31.76 
 
 		 354 aa  206  6e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2803  putative mRNA 3-end processing factor  33.75 
 
 		 338 aa  205  7e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.196277 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6008  hypothetical protein  31.11 
 
 		 337 aa  204  1e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3692  putative mRNA 3-end processing factor  31.23 
 
 		 351 aa  204  2e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0031  putative mRNA 3-end processing factor  32.15 
 
 		 334 aa  199  3.9999999999999996e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.321442  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0411  putative exonuclease protein involved in mRNA processing  29.49 
 
 		 329 aa  199  7e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.894409 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0067  putative mRNA 3-end processing factor  30.03 
 
 		 357 aa  186  4e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1406  RNA procession exonuclease-like protein  32.14 
 
 		 313 aa  159  6e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0847473 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0072  putative mRNA 3'-end processing factor  26.4 
 
 		 330 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0060  putative mRNA 3'-end processing factor  26.4 
 
 		 330 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0055  putative mRNA 3'-end processing factor  26.09 
 
 		 330 aa  139  7e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0057  putative mRNA 3'-end processing factor  26.56 
 
 		 330 aa  139  7e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.251824 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3148  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  27.07 
 
 		 1017 aa  135  7.000000000000001e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.331414  normal  0.459978 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1113  hypothetical protein  27.41 
 
 		 321 aa  97.4  3e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.704257 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1883  putative mRNA 3-end processing factor  25.62 
 
 		 327 aa  88.6  1e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.115808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1043  putative mRNA 3-end processing factor  27.59 
 
 		 319 aa  87.8  3e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0008566 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1313  beta-lactamase domain-containing protein  23.99 
 
 		 315 aa  87  4e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.143027  normal  0.259963 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0973  putative mRNA 3-end processing factor  24.46 
 
 		 314 aa  80.1  0.00000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.289039 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2687  beta-lactamase domain protein  25.24 
 
 		 591 aa  76.3  0.0000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1132  hypothetical protein  25.9 
 
 		 328 aa  74.7  0.000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.00888  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0788  putative mRNA 3-end processing factor  22.7 
 
 		 317 aa  67.8  0.0000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0149  RNA procession exonuclease-like protein  23.91 
 
 		 327 aa  62.4  0.000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0104249 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0621  beta-lactamase domain-containing protein  23.97 
 
 		 317 aa  60.8  0.00000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1361  beta-lactamase domain protein  27.54 
 
 		 422 aa  58.2  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1938  beta-lactamase domain protein  25.79 
 
 		 821 aa  57.8  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.199019  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0201  hypothetical protein  28.1 
 
 		 452 aa  56.2  0.0000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.384627 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0446  beta-lactamase domain-containing protein  24.07 
 
 		 428 aa  56.2  0.0000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.279355  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2308  hypothetical protein  23.65 
 
 		 339 aa  56.2  0.0000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.146289  normal  0.484856 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1852  putative mRNA 3-end processing factor  23.61 
 
 		 337 aa  54.7  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.681251  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4513  beta-lactamase domain protein  24.73 
 
 		 454 aa  54.3  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0937857  normal  0.557779 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2210  hypothetical protein  34.48 
 
 		 452 aa  53.9  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2182  hypothetical protein  34.48 
 
 		 452 aa  53.9  0.000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4381  beta-lactamase domain protein  24.73 
 
 		 454 aa  54.3  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.496128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4121  beta-lactamase domain-containing protein  21.43 
 
 		 457 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.729695 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1210  beta-lactamase-like  27.14 
 
 		 453 aa  53.9  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.856378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89936  predicted protein  30.25 
 
 		 793 aa  53.5  0.000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.731556  normal  0.295472 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1600  beta-lactamase domain-containing protein  22.61 
 
 		 421 aa  53.1  0.000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0760665 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0192  beta-lactamase domain-containing protein  33.94 
 
 		 455 aa  53.1  0.000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>