109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0541 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_0541  beta-lactamase-like  100 
 
 		 356 aa  725    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.804556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0123  beta-lactamase-like protein  34.18 
 
 		 366 aa  165  1.0000000000000001e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.480569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1080  beta-lactamase domain-containing protein  33.24 
 
 		 372 aa  148  2.0000000000000003e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0270  beta-lactamase domain protein  32.42 
 
 		 353 aa  146  4.0000000000000006e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1613  beta-lactamase domain-containing protein  22.72 
 
 		 420 aa  99  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1574  Zn-dependent hydrolase  24.71 
 
 		 436 aa  97.8  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000156356  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1613  metallo-beta-lactamase family protein  24.27 
 
 		 436 aa  97.1  4e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.631531  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1737  metallo-beta-lactamase family protein  23.89 
 
 		 419 aa  94  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3588  metallo-beta-lactamase family protein  24.61 
 
 		 419 aa  94  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1788  metallo-beta-lactamase family protein  26.24 
 
 		 419 aa  94  4e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1565  zinc-dependent hydrolase  26.54 
 
 		 436 aa  93.2  6e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1814  metallo-beta-lactamase family protein  27.31 
 
 		 419 aa  92  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1868  metallo-beta-lactamase family protein  25.48 
 
 		 419 aa  90.9  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1755  metallo-beta-lactamase family protein  24.02 
 
 		 419 aa  90.9  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1727  beta-lactamase domain-containing protein  28.02 
 
 		 646 aa  75.5  0.000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0637994 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3129  beta-lactamase domain protein  29.84 
 
 		 634 aa  65.9  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.43915 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0122  KH-domain/beta-lactamase-domain protein  27.13 
 
 		 647 aa  63.5  0.000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1047  beta-lactamase domain-containing protein  25 
 
 		 426 aa  63.5  0.000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2254  beta-lactamase domain-containing protein  26.53 
 
 		 642 aa  62.8  0.000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.311245 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1817  KH-domain/beta-lactamase-domain protein  26.64 
 
 		 635 aa  62.4  0.00000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1199  beta-lactamase domain-containing protein  23.12 
 
 		 630 aa  62  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0390608  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0193  cleavage and polyadenylation specificity factor  26.83 
 
 		 637 aa  60.8  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.209182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0082  beta-lactamase domain-containing protein  26.42 
 
 		 635 aa  61.2  0.00000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0309  beta-lactamase domain-containing protein  27.24 
 
 		 639 aa  61.2  0.00000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0966  beta-lactamase domain protein  29.15 
 
 		 641 aa  58.2  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2598  KH-domain/beta-lactamase-domain protein  29.15 
 
 		 644 aa  57  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0197  beta-lactamase domain-containing protein  24.88 
 
 		 422 aa  57  0.0000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.904798  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0626  beta-lactamase domain-containing protein  26.58 
 
 		 422 aa  56.2  0.0000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1292  beta-lactamase domain-containing protein  26.58 
 
 		 422 aa  55.8  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.358627  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0019  beta-lactamase-like protein  26.32 
 
 		 813 aa  55.1  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0030  beta-lactamase domain-containing protein  25.6 
 
 		 634 aa  54.7  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33504  predicted protein  27.06 
 
 		 767 aa  54.7  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.174633 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0064  beta-lactamase domain-containing protein  24.7 
 
 		 635 aa  54.7  0.000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1572  beta-lactamase domain-containing protein  27.35 
 
 		 635 aa  54.7  0.000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.342192  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1385  beta-lactamase domain-containing protein  26.02 
 
 		 639 aa  54.3  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.741277  normal  0.763255 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0060  beta-lactamase domain-containing protein  23.51 
 
 		 634 aa  54.3  0.000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.287706  normal  0.0538773 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0777  beta-lactamase domain protein  26.42 
 
 		 630 aa  54.3  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.867846  normal  0.0104567 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1014  ADP-ribosylation/crystallin J1  27.13 
 
 		 636 aa  53.9  0.000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.5583 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0049  beta-lactamase domain-containing protein  28.05 
 
 		 635 aa  53.9  0.000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2698  beta-lactamase domain protein  27.94 
 
 		 641 aa  53.9  0.000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.132267  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1107  beta-lactamase domain-containing protein  23.51 
 
 		 640 aa  53.1  0.000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.519523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0845  beta-lactamase-like  25.57 
 
 		 629 aa  52.4  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.554835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1382  beta-lactamase-like protein  23.64 
 
 		 455 aa  52  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1333  beta-lactamase domain-containing protein  25.57 
 
 		 557 aa  52  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0558  beta-lactamase domain-containing protein  23.3 
 
 		 430 aa  51.2  0.00002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00303127 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0455  beta-lactamase domain-containing protein  24.79 
 
 		 636 aa  52  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.263173 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0375  beta-lactamase-like protein  25.61 
 
 		 636 aa  50.8  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000359908  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0882  beta-lactamase domain-containing protein  27.35 
 
 		 635 aa  51.2  0.00003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.28665  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2052  beta-lactamase domain protein  27.53 
 
 		 640 aa  51.2  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1028  beta-lactamase domain-containing protein  24.87 
 
 		 616 aa  50.4  0.00004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1382  beta-lactamase domain-containing protein  25.75 
 
 		 482 aa  50.1  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0930  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  20.56 
 
 		 410 aa  50.1  0.00006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1753  hypothetical protein  25.55 
 
 		 480 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0222325  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0691  beta-lactamase domain-containing protein  22.31 
 
 		 421 aa  49.3  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1139  Beta-lactamase-like  37.36 
 
 		 257 aa  48.1  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000269692  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1566  beta-lactamase domain-containing protein  24.82 
 
 		 441 aa  48.1  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0665026  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1721  beta-lactamase domain-containing protein  26.94 
 
 		 635 aa  48.5  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.959276 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0190  beta-lactamase domain-containing protein  26.94 
 
 		 635 aa  48.5  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0192  beta-lactamase domain-containing protein  21.26 
 
 		 455 aa  47.8  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0325  KH-domain/beta-lactamase-domain protein  24.49 
 
 		 644 aa  47.8  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.04093  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3460  beta-lactamase domain-containing protein  23.02 
 
 		 452 aa  47  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.857931  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1171  beta-lactamase domain protein  24.42 
 
 		 555 aa  47  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000121599  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1069  hypothetical protein  30.25 
 
 		 555 aa  46.6  0.0006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000100194  normal  0.0563275 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1749  beta-lactamase domain-containing protein  22.63 
 
 		 428 aa  47  0.0006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00852065 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4103  beta-lactamase-like  25.34 
 
 		 539 aa  46.6  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.352914 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1883  beta-lactamase domain protein  24.34 
 
 		 456 aa  46.6  0.0007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2449  beta-lactamase domain-containing protein  23.49 
 
 		 583 aa  46.2  0.0008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0351233  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001774  metallo-beta-lactamase family protein RNA-specific  26.46 
 
 		 441 aa  45.4  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.122303  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0096  beta-lactamase-like  24.15 
 
 		 411 aa  45.4  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.619146  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1728  beta-lactamase domain-containing protein  21.37 
 
 		 425 aa  46.2  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.254192  decreased coverage  0.00045837 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2642  hypothetical protein  27.96 
 
 		 455 aa  46.2  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1299  beta-lactamase domain protein  27.27 
 
 		 470 aa  45.8  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.591175  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0478  beta-lactamase domain protein  32.18 
 
 		 572 aa  44.7  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1548  beta-lactamase domain-containing protein  22.46 
 
 		 425 aa  45.1  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00297769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4381  beta-lactamase domain protein  25.19 
 
 		 454 aa  45.1  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.496128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3231  beta-lactamase domain protein  27.01 
 
 		 549 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1938  beta-lactamase domain protein  22.79 
 
 		 821 aa  45.4  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.199019  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4513  beta-lactamase domain protein  25.19 
 
 		 454 aa  45.1  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0937857  normal  0.557779 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2889  beta-lactamase domain protein  27.01 
 
 		 549 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02710  hypothetical protein  24.88 
 
 		 773 aa  44.7  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1816  beta-lactamase domain-containing protein  35.29 
 
 		 559 aa  44.3  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000137497  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0554  beta-lactamase domain-containing protein  24.91 
 
 		 464 aa  44.3  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.199142  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3405  beta-lactamase domain protein  35.56 
 
 		 264 aa  44.3  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0106326  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1522  metallo-beta-lactamase family protein  24.43 
 
 		 557 aa  44.3  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0439193  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2820  beta-lactamase domain-containing protein  40 
 
 		 521 aa  43.9  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1707  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  24.43 
 
 		 557 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1730  metallo-beta-lactamase family protein  23.86 
 
 		 557 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.744262  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3833  metallo-beta-lactamase family protein  22.89 
 
 		 556 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000419922  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3648  metallo-beta-lactamase family protein  22.89 
 
 		 556 aa  43.5  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1494  Zn-dependent hydrolase  24.43 
 
 		 557 aa  43.5  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000794402  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3538  metallo-beta-lactamase family protein  22.89 
 
 		 556 aa  43.5  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0178756  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3556  metallo-beta-lactamase family protein  22.89 
 
 		 556 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3933  metallo-beta-lactamase family protein  22.89 
 
 		 556 aa  43.5  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00612119  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1856  beta-lactamase domain-containing protein  25.86 
 
 		 488 aa  43.5  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.510486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3845  metallo-beta-lactamase family protein  22.89 
 
 		 556 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000592634  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1403  metallo-beta-lactamase family protein  22.89 
 
 		 556 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0055609  hitchhiker  0.000000000000158477 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3809  metallo-beta-lactamase family protein  22.89 
 
 		 556 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2993599999999999e-37 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3567  beta-lactamase domain-containing protein  22.89 
 
 		 556 aa  43.5  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00558369  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3896  metallo-beta-lactamase family protein  22.89 
 
 		 556 aa  43.5  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0341705  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1070  beta-lactamase-like protein  42.86 
 
 		 262 aa  43.1  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.941364 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>