45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0123 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0123  beta-lactamase-like protein  100 
 
 
366 aa  758    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.480569  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0541  beta-lactamase-like  34.18 
 
 
356 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.804556  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0270  beta-lactamase domain protein  32.68 
 
 
353 aa  154  2e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1080  beta-lactamase domain-containing protein  29.34 
 
 
372 aa  132  1.0000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1755  metallo-beta-lactamase family protein  22.92 
 
 
419 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3588  metallo-beta-lactamase family protein  22.92 
 
 
419 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1613  metallo-beta-lactamase family protein  24.62 
 
 
436 aa  70.1  0.00000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.631531  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1574  Zn-dependent hydrolase  24.02 
 
 
436 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000156356  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1613  beta-lactamase domain-containing protein  22.31 
 
 
420 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1788  metallo-beta-lactamase family protein  24.02 
 
 
419 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1737  metallo-beta-lactamase family protein  22.88 
 
 
419 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1868  metallo-beta-lactamase family protein  25.6 
 
 
419 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1814  metallo-beta-lactamase family protein  26.4 
 
 
419 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1565  zinc-dependent hydrolase  27.6 
 
 
436 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1572  beta-lactamase domain-containing protein  26.09 
 
 
635 aa  62.4  0.00000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.342192  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0882  beta-lactamase domain-containing protein  26.09 
 
 
635 aa  61.2  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.28665  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1727  beta-lactamase domain-containing protein  27.27 
 
 
646 aa  58.9  0.0000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0637994 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0190  beta-lactamase domain-containing protein  25.65 
 
 
635 aa  58.5  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1721  beta-lactamase domain-containing protein  25.65 
 
 
635 aa  58.5  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.959276 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0309  beta-lactamase domain-containing protein  28 
 
 
639 aa  58.2  0.0000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0049  beta-lactamase domain-containing protein  23.58 
 
 
635 aa  54.7  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1028  beta-lactamase domain-containing protein  25 
 
 
616 aa  55.1  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0455  beta-lactamase domain-containing protein  28.05 
 
 
636 aa  53.5  0.000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.263173 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0064  beta-lactamase domain-containing protein  26.63 
 
 
635 aa  51.2  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1548  beta-lactamase domain-containing protein  25.79 
 
 
425 aa  50.1  0.00006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00297769  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1938  beta-lactamase domain protein  25.5 
 
 
821 aa  48.5  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.199019  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1728  beta-lactamase domain-containing protein  23.29 
 
 
425 aa  48.5  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.254192  decreased coverage  0.00045837 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0060  beta-lactamase domain-containing protein  25.63 
 
 
634 aa  48.5  0.0002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.287706  normal  0.0538773 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1107  beta-lactamase domain-containing protein  25.63 
 
 
640 aa  48.5  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.519523  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0122  KH-domain/beta-lactamase-domain protein  23.74 
 
 
647 aa  46.6  0.0007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0030  beta-lactamase domain-containing protein  26.15 
 
 
634 aa  46.6  0.0007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0019  beta-lactamase-like protein  24.66 
 
 
813 aa  46.2  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1989  beta-lactamase domain-containing protein  23.44 
 
 
422 aa  45.1  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.881158  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1448  beta-lactamase domain protein  28.85 
 
 
550 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1967  beta-lactamase-like  24.71 
 
 
454 aa  45.1  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.166456  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0193  cleavage and polyadenylation specificity factor  27.62 
 
 
637 aa  45.1  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.209182  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2254  beta-lactamase domain-containing protein  25.11 
 
 
642 aa  44.7  0.003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.311245 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1749  beta-lactamase domain-containing protein  23.44 
 
 
428 aa  43.9  0.005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00852065 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2932  metallo-beta-lactamase family protein  25.93 
 
 
263 aa  43.9  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3567  beta-lactamase domain-containing protein  28.57 
 
 
556 aa  43.5  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00558369  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2687  beta-lactamase domain protein  22.77 
 
 
591 aa  43.5  0.006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1600  beta-lactamase domain-containing protein  22.54 
 
 
421 aa  43.1  0.007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0760665 
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8808  beta-lactamase domain protein  25.49 
 
 
243 aa  43.1  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3896  metallo-beta-lactamase family protein  28.57 
 
 
556 aa  42.7  0.01  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0341705  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6115  beta-lactamase domain protein  25.49 
 
 
243 aa  42.7  0.01  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>