68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1080 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_1080  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 372 aa  725    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0270  beta-lactamase domain protein  42.73 
 
 		 353 aa  246  4e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0541  beta-lactamase-like  33.53 
 
 		 356 aa  155  9e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.804556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0123  beta-lactamase-like protein  30.97 
 
 		 366 aa  137  2e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.480569  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1814  metallo-beta-lactamase family protein  23.13 
 
 		 419 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1868  metallo-beta-lactamase family protein  22.25 
 
 		 419 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1755  metallo-beta-lactamase family protein  22.61 
 
 		 419 aa  73.2  0.000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3588  metallo-beta-lactamase family protein  22.58 
 
 		 419 aa  72.8  0.000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1613  metallo-beta-lactamase family protein  22.41 
 
 		 436 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.631531  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1574  Zn-dependent hydrolase  22.41 
 
 		 436 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000156356  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1565  zinc-dependent hydrolase  22.66 
 
 		 436 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1737  metallo-beta-lactamase family protein  22.14 
 
 		 419 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1788  metallo-beta-lactamase family protein  22.72 
 
 		 419 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1613  beta-lactamase domain-containing protein  22.99 
 
 		 420 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2254  beta-lactamase domain-containing protein  24.68 
 
 		 642 aa  57.8  0.0000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.311245 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1938  beta-lactamase domain protein  26.67 
 
 		 821 aa  56.6  0.0000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.199019  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1566  beta-lactamase domain-containing protein  27 
 
 		 441 aa  56.2  0.0000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0665026  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0193  cleavage and polyadenylation specificity factor  24.63 
 
 		 637 aa  54.3  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.209182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0309  beta-lactamase domain-containing protein  23.9 
 
 		 639 aa  54.3  0.000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0351  beta-lactamase domain-containing protein  26.74 
 
 		 472 aa  52  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.766684  normal  0.755187 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1967  beta-lactamase-like  26.01 
 
 		 454 aa  52  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.166456  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1817  KH-domain/beta-lactamase-domain protein  22.71 
 
 		 635 aa  51.6  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5264  beta-lactamase domain-containing protein  27.03 
 
 		 830 aa  49.3  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0039  metallo-beta-lactamase family protein  27.98 
 
 		 544 aa  48.9  0.0001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1199  beta-lactamase domain-containing protein  23.64 
 
 		 630 aa  48.5  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0390608  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2297  beta-lactamase domain-containing protein  29.8 
 
 		 452 aa  48.9  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.168183  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0768  beta-lactamase domain protein  22.95 
 
 		 451 aa  48.5  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000108746  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1382  beta-lactamase-like protein  27.45 
 
 		 455 aa  48.1  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0878  beta-lactamase domain protein  38.16 
 
 		 261 aa  47.8  0.0003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1883  beta-lactamase domain protein  37.14 
 
 		 456 aa  47.8  0.0003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3425  metallo-beta-lactamase superfamily protein  24.58 
 
 		 451 aa  47.4  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0060  beta-lactamase domain-containing protein  26.94 
 
 		 634 aa  47.4  0.0004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.287706  normal  0.0538773 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0966  beta-lactamase domain protein  26.16 
 
 		 641 aa  47.4  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2033  beta-lactamase domain protein  23.73 
 
 		 536 aa  47  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0777  beta-lactamase domain protein  23.55 
 
 		 630 aa  47.4  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.867846  normal  0.0104567 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1385  beta-lactamase domain-containing protein  24.82 
 
 		 639 aa  47.4  0.0005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.741277  normal  0.763255 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0851  beta-lactamase domain protein  19.77 
 
 		 464 aa  46.2  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2580  beta-lactamase domain protein  28.28 
 
 		 454 aa  46.2  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0554  beta-lactamase domain-containing protein  25.88 
 
 		 464 aa  46.2  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.199142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2474  beta-lactamase-like protein  25.58 
 
 		 473 aa  45.8  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.766773  normal  0.305499 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1107  beta-lactamase domain-containing protein  26.94 
 
 		 640 aa  46.2  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.519523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0455  beta-lactamase domain-containing protein  22.52 
 
 		 636 aa  45.8  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.263173 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4121  beta-lactamase domain-containing protein  26.43 
 
 		 457 aa  45.8  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.729695 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0064  beta-lactamase domain-containing protein  24.69 
 
 		 635 aa  46.2  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1749  beta-lactamase domain-containing protein  26.47 
 
 		 428 aa  45.8  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00852065 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3227  beta-lactamase domain-containing protein  28.28 
 
 		 454 aa  46.2  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.500383  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0076  ribonuclease Z  32.67 
 
 		 310 aa  45.1  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.887393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2383  beta-lactamase domain-containing protein  64.52 
 
 		 556 aa  45.4  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2698  beta-lactamase domain protein  26.37 
 
 		 641 aa  45.1  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.132267  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4543  ribonuclease Z  34.92 
 
 		 301 aa  44.7  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1988  beta-lactamase domain-containing protein  58.33 
 
 		 557 aa  44.7  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.91694 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2534  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  58.33 
 
 		 557 aa  44.7  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.316819  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1194  beta-lactamase domain-containing protein  58.33 
 
 		 557 aa  44.7  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.496445  normal  0.175299 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2397  metallo-beta-lactamase  42.31 
 
 		 283 aa  44.7  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2691  beta-lactamase domain-containing protein  26.9 
 
 		 452 aa  44.3  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.770917  normal  0.585542 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2598  KH-domain/beta-lactamase-domain protein  24.89 
 
 		 644 aa  44.3  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0966  metallo-beta-lactamase family protein  27.22 
 
 		 540 aa  44.3  0.004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0845  beta-lactamase-like  33.73 
 
 		 629 aa  43.9  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.554835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0375  beta-lactamase-like protein  24 
 
 		 636 aa  43.9  0.005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000359908  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0691  beta-lactamase domain-containing protein  22.5 
 
 		 421 aa  43.9  0.005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3129  beta-lactamase domain protein  26.19 
 
 		 634 aa  43.9  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.43915 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0540  Ribonuclease Z  41.51 
 
 		 307 aa  43.5  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10313  ribonuclease Z  32.31 
 
 		 301 aa  43.9  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1508  beta-lactamase domain-containing protein  28.16 
 
 		 452 aa  43.5  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.872448  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0201  hypothetical protein  24.15 
 
 		 452 aa  43.1  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.384627 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0882  beta-lactamase domain-containing protein  25.38 
 
 		 635 aa  43.1  0.009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.28665  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2041  beta-lactamase domain-containing protein  25.39 
 
 		 461 aa  42.7  0.01  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00175331 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0197  beta-lactamase domain-containing protein  24.44 
 
 		 422 aa  42.7  0.01  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.904798  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>