More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_3313 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_3313  type II secretion system protein  100 
 
 		 401 aa  796    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1301  general secretion pathway protein F  44.06 
 
 		 408 aa  313  4.999999999999999e-84  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1472  general secretion pathway protein F  43.67 
 
 		 408 aa  305  1.0000000000000001e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.655662  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4249  general secretion pathway protein F  42.25 
 
 		 403 aa  295  1e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0204352 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0099  general secretion pathway protein F  40.3 
 
 		 396 aa  295  1e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0005  general secretion pathway protein F  47.23 
 
 		 407 aa  292  8e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.138499 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4589  general secretion pathway protein F  43.15 
 
 		 413 aa  288  1e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2858  general secretion pathway protein F  43.1 
 
 		 408 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1414  general secretion pathway protein F  43.35 
 
 		 408 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3565  general secretion pathway protein F  40.1 
 
 		 407 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3617  general secretion pathway protein F  38.92 
 
 		 406 aa  283  5.000000000000001e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0155  general secretion pathway protein F  39.36 
 
 		 407 aa  281  2e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0573694 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0155  general secretion pathway protein F  39.36 
 
 		 407 aa  281  2e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0151  general secretion pathway protein F  39.36 
 
 		 407 aa  281  2e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4204  general secretion pathway protein F  39.36 
 
 		 407 aa  281  2e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0107  general secretion pathway protein F  40 
 
 		 410 aa  280  3e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0146  general secretion pathway protein F  39.17 
 
 		 407 aa  279  7e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0123  general secretion pathway protein F  39.22 
 
 		 407 aa  273  3e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2304  general secretion pathway protein F  38.56 
 
 		 406 aa  273  3e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0233  general secretion pathway protein F  38.24 
 
 		 406 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2922  general secretion pathway protein F  38.37 
 
 		 405 aa  272  9e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4732  general secretion pathway protein F  38.82 
 
 		 407 aa  271  1e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0181431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00603  general secretion pathway protein F  37.06 
 
 		 406 aa  267  2e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0153  general secretion pathway protein F  39.01 
 
 		 407 aa  265  8e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0158  general secretion pathway protein F  38.52 
 
 		 407 aa  264  3e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0153  general secretion pathway protein F  38.52 
 
 		 407 aa  264  3e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4356  general secretion pathway protein F  37.89 
 
 		 407 aa  263  4e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03178  general secretory pathway component, cryptic  39.46 
 
 		 398 aa  260  4e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0386  general secretion pathway protein F  39.46 
 
 		 398 aa  260  4e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3521  general secretion pathway protein F  39.46 
 
 		 398 aa  260  4e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.373913  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0386  general secretion pathway protein F  39.46 
 
 		 398 aa  260  4e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.120721 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03129  hypothetical protein  39.46 
 
 		 398 aa  260  4e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03958  general secretion pathway protein F  39.16 
 
 		 408 aa  255  9e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3267  general secretion pathway protein F  34.08 
 
 		 400 aa  254  1.0000000000000001e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000471586  hitchhiker  0.0000000000000079941 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0168  general secretion pathway protein F  39.85 
 
 		 407 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3136  general secretion pathway protein F  39.3 
 
 		 407 aa  253  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0955  general secretion pathway protein F  33.58 
 
 		 400 aa  253  6e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.110988  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02836  hypothetical type II secretion protein GspF  39.05 
 
 		 407 aa  251  1e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000156909  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02786  hypothetical protein  39.05 
 
 		 407 aa  251  1e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000209561  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001890  general secretion pathway protein F  37.66 
 
 		 405 aa  251  1e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3425  general secretion pathway protein F  38.81 
 
 		 407 aa  251  2e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3245  general secretion pathway protein GspF  38.81 
 
 		 407 aa  250  4e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.750263 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0171  general secretion pathway protein F  37.78 
 
 		 407 aa  249  6e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1006  type II secretion system protein  33.58 
 
 		 400 aa  249  6e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1350  general secretion pathway protein F  36.57 
 
 		 403 aa  246  6e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.534213  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3410  general secretion pathway protein GspF  38.56 
 
 		 407 aa  244  9.999999999999999e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24010  general secretion pathway protein F  39.31 
 
 		 405 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2031  general secretion pathway protein F  39.26 
 
 		 405 aa  240  4e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4499  putative general secretory pathway protein F  35.22 
 
 		 405 aa  231  2e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.151931 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3938  general secretion pathway protein F  35.22 
 
 		 405 aa  230  3e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.147565 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0227  general secretion pathway protein F  34.87 
 
 		 404 aa  229  5e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0728  general secretion pathway protein F  32.43 
 
 		 409 aa  229  6e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.164597  normal  0.206561 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4823  putative type II secretion system protein  35.47 
 
 		 404 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0274243  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3072  general secretion pathway protein F  35.22 
 
 		 405 aa  226  6e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000734436 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0009  general secretion pathway protein F  35.22 
 
 		 405 aa  225  1e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2392  general secretion pathway protein F  35.8 
 
 		 404 aa  225  1e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000517266 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55430  putative type II secretion system protein  35.22 
 
 		 404 aa  225  1e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000716105  normal  0.0429131 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1888  general secretion pathway protein F  34.98 
 
 		 405 aa  224  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.266018  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2664  general secretion pathway protein F  34.98 
 
 		 405 aa  224  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2784  general secretion pathway protein F  34.98 
 
 		 405 aa  224  2e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3516  general secretion pathway protein F  34.98 
 
 		 405 aa  224  2e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.632046  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0222  general secretion pathway protein F  34.98 
 
 		 405 aa  224  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0009  general secretion pathway protein F  34.98 
 
 		 405 aa  224  2e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0009  general secretion pathway protein F  34.98 
 
 		 405 aa  224  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0061  general secretion pathway protein F  35.05 
 
 		 405 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2924  general secretion pathway protein F  39.36 
 
 		 405 aa  219  5e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.646431  normal  0.200315 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2209  general secretion pathway protein F  36.57 
 
 		 399 aa  219  5e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.616736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0684  general secretion pathway protein F  32.44 
 
 		 409 aa  218  1e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0256  general secretion pathway protein F  36.97 
 
 		 400 aa  218  2e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.726784 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3116  general secretory pathway F transmembrane protein  36.32 
 
 		 403 aa  217  2.9999999999999998e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.205783  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0143  general secretion pathway protein F  36.59 
 
 		 407 aa  216  5e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3242  general secretion pathway protein F  33.91 
 
 		 405 aa  216  7e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.458785 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0079  general secretion pathway protein F  33.91 
 
 		 405 aa  216  8e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0010  general secretion pathway protein F  33.91 
 
 		 405 aa  216  8e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0060  general secretion pathway protein F  33.91 
 
 		 405 aa  216  8e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.211909  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3173  general secretion pathway protein F  33.09 
 
 		 403 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.131882  normal  0.0228377 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3054  general secretion pathway protein F  36.07 
 
 		 403 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3429  general secretion pathway protein F  35.56 
 
 		 405 aa  214  1.9999999999999998e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000239637 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5703  general secretion pathway protein F  33.5 
 
 		 408 aa  214  1.9999999999999998e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0555477  normal  0.0587373 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3401  general secretion pathway protein F  36.09 
 
 		 403 aa  213  4.9999999999999996e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.54461 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0719  general secretion pathway protein F  32.44 
 
 		 409 aa  213  4.9999999999999996e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.975907  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0718  general secretion pathway protein F  32.44 
 
 		 409 aa  213  4.9999999999999996e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0060  general secretion pathway protein F  33.66 
 
 		 405 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0050  general secretion pathway protein F  33.66 
 
 		 405 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.899692  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1045  general secretion pathway protein F  34.65 
 
 		 409 aa  212  1e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2610  general secretion pathway protein F  31.86 
 
 		 412 aa  212  1e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.555556  normal  0.906322 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1317  type II secretory pathway protein LspF  34.17 
 
 		 399 aa  210  3e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2182  general secretion pathway protein F  35.4 
 
 		 399 aa  210  3e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2371  general secretion pathway protein F  35.77 
 
 		 410 aa  209  5e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.371859  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1414  general secretion pathway protein F  38.14 
 
 		 405 aa  209  7e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0648646  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1314  type II secretory pathway protein LspF  34.17 
 
 		 399 aa  208  1e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3394  general secretion pathway protein F  36.15 
 
 		 405 aa  208  1e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.955056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1071  general secretion pathway protein F  33.99 
 
 		 405 aa  207  2e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.545064 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1045  general secretion pathway protein F  37.84 
 
 		 400 aa  206  7e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2680  type II secretion system protein  29.53 
 
 		 405 aa  203  3e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1048  general secretion pathway protein F  38.18 
 
 		 400 aa  203  4e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.506119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1904  general secretion pathway protein F  36.65 
 
 		 401 aa  203  4e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1390  type II secretion system protein  30.48 
 
 		 404 aa  203  4e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.387943  normal  0.0225351 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1089  general secretion pathway protein F  38.18 
 
 		 400 aa  203  4e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.419193  normal  0.264325 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3578  TonB-dependent siderophore receptor  34.71 
 
 		 411 aa  203  5e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.477901 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>