225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_0939 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_0939  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  100 
 
 		 148 aa  302  1.0000000000000001e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2406  hypothetical protein  68.92 
 
 		 148 aa  197  3e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.888596  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3037  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  48.91 
 
 		 140 aa  114  3e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0850205  normal  0.0637493 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2417  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  41.01 
 
 		 141 aa  109  1.0000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.229432 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1756  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 164 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1606  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  46.1 
 
 		 151 aa  105  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2073  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  43.26 
 
 		 144 aa  105  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.163094  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2863  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  45.77 
 
 		 151 aa  104  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.858803 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1784  Rrf2 family protein  47.1 
 
 		 153 aa  103  9e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.121065  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1505  Rrf2 family protein  47.1 
 
 		 153 aa  103  9e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.080544  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1174  Rrf2 family protein  47.1 
 
 		 153 aa  103  9e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.246229  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1372  putative transcriptional regulator  47.1 
 
 		 153 aa  103  9e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.102116  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1376  putative transcriptional regulator  47.1 
 
 		 153 aa  103  9e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.135782  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0457  Rrf2 family protein  47.1 
 
 		 153 aa  103  9e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00405  hypothetical protein  44.93 
 
 		 143 aa  103  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00113675  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2648  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  45.45 
 
 		 150 aa  102  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.68692 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2862  Rrf2 family protein  46.38 
 
 		 154 aa  102  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.246618  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4634  rrf2 family protein  46.97 
 
 		 143 aa  101  4e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0619  rrf2 family protein  46.97 
 
 		 143 aa  101  4e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4403  rrf2 family protein  46.97 
 
 		 143 aa  101  4e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4243  Rrf2 family protein; transcriptional regulator  46.97 
 
 		 143 aa  101  4e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.112784  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4255  Rrf2 family protein; transcriptional regulator  46.97 
 
 		 143 aa  101  4e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4743  rrf2 family protein  46.97 
 
 		 143 aa  101  4e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4636  rrf2 family protein  46.97 
 
 		 143 aa  101  4e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4616  rrf2 family protein  46.97 
 
 		 143 aa  101  4e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4620  rrf2 family protein  46.97 
 
 		 143 aa  101  4e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1088  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  46.32 
 
 		 151 aa  100  8e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3208  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  46.97 
 
 		 143 aa  100  9e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1088  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  46.32 
 
 		 151 aa  99.8  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.683076  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4313  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  46.04 
 
 		 151 aa  99.4  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0000750143  normal  0.208214 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4336  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  44.6 
 
 		 143 aa  99.4  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1178  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 151 aa  99  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000716661  normal  0.224139 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2124  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  38.97 
 
 		 148 aa  98.6  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0725  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 151 aa  98.2  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.241075  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1205  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 151 aa  98.2  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2098  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  46.97 
 
 		 151 aa  98.2  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.607265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2093  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  40.44 
 
 		 144 aa  97.8  4e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0872269  normal  0.332036 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3614  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  43.7 
 
 		 137 aa  94.4  4e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0184881  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1586  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 151 aa  91.3  4e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0540164 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0680  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  37.14 
 
 		 140 aa  90.1  8e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00302729  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0695  Rrf2 family protein  46.03 
 
 		 141 aa  88.6  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000561607  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1056  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  36.91 
 
 		 150 aa  85.9  2e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1726  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  37.98 
 
 		 135 aa  85.9  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.992938 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1746  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 139 aa  85.1  3e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.488716  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2649  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  44.12 
 
 		 151 aa  84.3  5e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000442413  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1447  RRF2 family protein  38.41 
 
 		 138 aa  82.4  0.000000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0587227  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2001  rrf2 family protein  37.41 
 
 		 143 aa  82  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.301895  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3422  rrf2 family protein  37.04 
 
 		 143 aa  82  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000049923 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1779  rrf2 family protein  37.04 
 
 		 143 aa  81.3  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000236415  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1758  RRF2 family protein  37.04 
 
 		 143 aa  81.3  0.000000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1736  RRF2 family protein  37.04 
 
 		 143 aa  81.3  0.000000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.582231  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1953  rrf2 family protein  37.04 
 
 		 143 aa  81.3  0.000000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000194706 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1921  rrf2 family protein  37.04 
 
 		 143 aa  80.9  0.000000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.581876  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1917  rrf2 family protein  37.04 
 
 		 143 aa  81.3  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0431103  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2022  rrf2 family protein  37.04 
 
 		 143 aa  80.9  0.000000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000169778  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0848  transcriptional regulator superfamily  38.13 
 
 		 137 aa  80.1  0.00000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.264832  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1225  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  40 
 
 		 148 aa  78.6  0.00000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0259707  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4008  protein of unknown function UPF0074  34.81 
 
 		 187 aa  78.6  0.00000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1791  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  35.46 
 
 		 143 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000874227  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0676  hypothetical protein  38.03 
 
 		 139 aa  77.8  0.00000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0801  hypothetical protein  37.5 
 
 		 144 aa  77.4  0.00000000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1079  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  35.07 
 
 		 136 aa  77.4  0.00000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.7621  normal  0.359746 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5127  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 141 aa  77  0.00000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1321  Rrf2 family protein  39.57 
 
 		 149 aa  76.6  0.0000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3895  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  37.86 
 
 		 151 aa  71.2  0.000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.146711  normal  0.812213 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3265  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 173 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26060  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  36.5 
 
 		 146 aa  65.9  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.523636  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3421  rrf2 family protein  31.34 
 
 		 137 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.194081  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3200  rrf2 family protein  31.34 
 
 		 137 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0491107  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3108  transcriptional regulator  31.34 
 
 		 137 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3453  rrf2 family protein  31.34 
 
 		 137 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.756851  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1837  rrf2 family protein  30.6 
 
 		 137 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.886033  normal  0.370465 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3419  rrf2 family protein  31.34 
 
 		 137 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3180  transcriptional regulator  31.34 
 
 		 137 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0130627  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2464  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  29.86 
 
 		 146 aa  64.3  0.0000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000267209  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3431  rrf2 family protein  31.34 
 
 		 137 aa  63.9  0.0000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3409  rrf2 family protein  31.34 
 
 		 137 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000108147  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1422  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 156 aa  62.8  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.968203 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0641  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 174 aa  62.4  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.974192 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1052  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 155 aa  62  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.816275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0924  hypothetical protein  29.71 
 
 		 142 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.945125  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5019  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  26.12 
 
 		 135 aa  61.2  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0401266  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09960  hypothetical protein  29.71 
 
 		 142 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2538  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 137 aa  60.5  0.000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000724795  normal  0.769901 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2256  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 136 aa  59.7  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.214948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2591  transcriptional regulator  29.55 
 
 		 156 aa  58.9  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00374583 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3156  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  32.69 
 
 		 180 aa  58.9  0.00000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.22058 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5149  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  39.26 
 
 		 142 aa  58.2  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.20189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2165  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 152 aa  58.2  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00710337  normal  0.480622 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3567  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 152 aa  58.2  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00720162 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4541  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 161 aa  57  0.00000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.417251  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2816  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  27.54 
 
 		 136 aa  57  0.00000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18410  predicted transcriptional regulator  36.15 
 
 		 152 aa  55.8  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.199021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3952  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  26.81 
 
 		 146 aa  55.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.274037  normal  0.692006 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5306  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 146 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0368  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 152 aa  56.2  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.172949 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3487  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 146 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.740376  hitchhiker  0.00818158 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6236  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  28.99 
 
 		 165 aa  55.5  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2051  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 138 aa  55.5  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.482177 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2760  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  34.02 
 
 		 145 aa  55.1  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>