149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCE_2001 on replicon NC_003909
Organism: Bacillus cereus ATCC 10987



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_2001  rrf2 family protein  100 
 
 
143 aa  294  2e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.301895  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1779  rrf2 family protein  97.2 
 
 
143 aa  289  1e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000236415  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1758  RRF2 family protein  97.2 
 
 
143 aa  289  1e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1736  RRF2 family protein  97.2 
 
 
143 aa  289  1e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.582231  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1917  rrf2 family protein  97.2 
 
 
143 aa  289  1e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0431103  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1953  rrf2 family protein  97.2 
 
 
143 aa  289  1e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000194706 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2022  rrf2 family protein  96.5 
 
 
143 aa  288  2e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000169778  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1921  rrf2 family protein  96.5 
 
 
143 aa  288  2e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.581876  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3422  rrf2 family protein  95.1 
 
 
143 aa  283  7e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000049923 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1791  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  94.41 
 
 
143 aa  281  3.0000000000000004e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000874227  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3208  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  60.56 
 
 
143 aa  177  4e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4634  rrf2 family protein  59.57 
 
 
143 aa  176  9e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0619  rrf2 family protein  59.57 
 
 
143 aa  176  9e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4403  rrf2 family protein  59.57 
 
 
143 aa  176  9e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4243  Rrf2 family protein; transcriptional regulator  59.57 
 
 
143 aa  176  9e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.112784  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4255  Rrf2 family protein; transcriptional regulator  59.57 
 
 
143 aa  176  9e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4743  rrf2 family protein  59.57 
 
 
143 aa  176  9e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4616  rrf2 family protein  59.57 
 
 
143 aa  176  9e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4620  rrf2 family protein  59.57 
 
 
143 aa  176  9e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4636  rrf2 family protein  59.57 
 
 
143 aa  176  9e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4336  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  58.87 
 
 
143 aa  172  9.999999999999999e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3614  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  54.74 
 
 
137 aa  154  5.0000000000000005e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0184881  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0680  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  45 
 
 
140 aa  127  5.0000000000000004e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00302729  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2649  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  47.1 
 
 
151 aa  123  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000442413  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1321  Rrf2 family protein  44.93 
 
 
149 aa  119  1.9999999999999998e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2124  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  43.66 
 
 
148 aa  117  6e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0801  hypothetical protein  38.73 
 
 
144 aa  115  1.9999999999999998e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1225  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  39.85 
 
 
148 aa  113  8.999999999999998e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0259707  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0848  transcriptional regulator superfamily  40.88 
 
 
137 aa  110  8.000000000000001e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.264832  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3037  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  39.71 
 
 
140 aa  108  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0850205  normal  0.0637493 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0676  hypothetical protein  41.01 
 
 
139 aa  106  1e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1447  RRF2 family protein  40.58 
 
 
138 aa  106  1e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0587227  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1586  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  39.55 
 
 
151 aa  103  6e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0540164 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26060  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  39.86 
 
 
146 aa  99  2e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.523636  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1056  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  39.29 
 
 
150 aa  97.8  4e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00405  hypothetical protein  43.66 
 
 
143 aa  97.1  7e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00113675  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2093  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  39.29 
 
 
144 aa  96.7  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0872269  normal  0.332036 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1606  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  38.73 
 
 
151 aa  93.2  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1088  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  38.56 
 
 
151 aa  93.2  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.683076  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2073  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  38.3 
 
 
144 aa  92.4  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.163094  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1756  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  44.62 
 
 
164 aa  92.4  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1088  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  37.91 
 
 
151 aa  91.7  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1178  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  40.43 
 
 
151 aa  91.7  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000716661  normal  0.224139 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0725  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  40.43 
 
 
151 aa  91.3  4e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.241075  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1205  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  40.43 
 
 
151 aa  91.3  4e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2098  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  40.43 
 
 
151 aa  91.3  4e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.607265  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1746  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  38.13 
 
 
139 aa  90.9  5e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.488716  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2863  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  44.36 
 
 
151 aa  89.7  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.858803 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2862  Rrf2 family protein  42.22 
 
 
154 aa  87.4  5e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.246618  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2464  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  37.14 
 
 
146 aa  86.7  9e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000267209  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4313  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  39.01 
 
 
151 aa  86.3  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0000750143  normal  0.208214 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1784  Rrf2 family protein  42.42 
 
 
153 aa  85.5  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.121065  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1505  Rrf2 family protein  42.42 
 
 
153 aa  85.5  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.080544  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1174  Rrf2 family protein  42.42 
 
 
153 aa  85.5  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.246229  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1372  putative transcriptional regulator  42.42 
 
 
153 aa  85.5  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.102116  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1376  putative transcriptional regulator  42.42 
 
 
153 aa  85.5  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.135782  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0457  Rrf2 family protein  42.42 
 
 
153 aa  85.5  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2648  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  35.97 
 
 
150 aa  84.3  6e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.68692 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1079  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  35.11 
 
 
136 aa  82.4  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.7621  normal  0.359746 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0939  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  37.41 
 
 
148 aa  82  0.000000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3108  transcriptional regulator  33.58 
 
 
137 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3200  rrf2 family protein  33.58 
 
 
137 aa  80.9  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0491107  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3453  rrf2 family protein  33.58 
 
 
137 aa  80.9  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.756851  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3419  rrf2 family protein  33.58 
 
 
137 aa  80.9  0.000000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3421  rrf2 family protein  33.58 
 
 
137 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.194081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3180  transcriptional regulator  32.84 
 
 
137 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0130627  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2417  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  34.97 
 
 
141 aa  79.7  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.229432 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3431  rrf2 family protein  33.58 
 
 
137 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3409  rrf2 family protein  33.58 
 
 
137 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000108147  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1837  rrf2 family protein  32.84 
 
 
137 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.886033  normal  0.370465 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7110  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  34.48 
 
 
151 aa  79  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0147621  normal  0.1046 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5965  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  33.79 
 
 
151 aa  76.3  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0284344 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5019  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  31.78 
 
 
135 aa  73.2  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0401266  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0368  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  34.81 
 
 
152 aa  73.2  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.172949 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1726  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  33.33 
 
 
135 aa  71.6  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.992938 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6236  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  33.33 
 
 
165 aa  71.6  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18410  predicted transcriptional regulator  32.84 
 
 
152 aa  71.6  0.000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.199021  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3265  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  32.17 
 
 
173 aa  71.2  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2538  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  34.81 
 
 
137 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000724795  normal  0.769901 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0097  putative transcriptional regulator  35.05 
 
 
106 aa  69.7  0.00000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5127  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  29.41 
 
 
141 aa  69.7  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2406  hypothetical protein  38.52 
 
 
148 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.888596  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3952  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  31.85 
 
 
146 aa  68.6  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.274037  normal  0.692006 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2591  transcriptional regulator  31.34 
 
 
156 aa  69.3  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00374583 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1311  hypothetical protein  35.17 
 
 
153 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1478  transcriptional regulator family protein  32.17 
 
 
172 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.113614  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0293  transcriptional regulator  35.17 
 
 
172 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0135694  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0567  transcriptional regulator  35.17 
 
 
153 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1334  DNA-binding protein  33.57 
 
 
153 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.172988  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1000  transcriptional regulator  35.17 
 
 
153 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.360873  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1052  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  28.87 
 
 
155 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.816275  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5306  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  31.91 
 
 
146 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0695  Rrf2 family protein  41.67 
 
 
141 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000561607  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1261  transcriptional regulator  35.17 
 
 
153 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.62551  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4541  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  30.2 
 
 
161 aa  67.8  0.00000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.417251  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2628  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  30.56 
 
 
153 aa  67.4  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.106068 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3487  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  31.91 
 
 
146 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.740376  hitchhiker  0.00818158 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2516  putative DNA-binding protein  35.17 
 
 
571 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3572  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  32.39 
 
 
159 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0421402  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3335  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  31.11 
 
 
147 aa  66.6  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.659852  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>