160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2649 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2649  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  100 
 
 
151 aa  308  1e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000442413  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3614  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  50.37 
 
 
137 aa  134  5e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0184881  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3208  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  48.55 
 
 
143 aa  132  9.999999999999999e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4634  rrf2 family protein  47.14 
 
 
143 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4403  rrf2 family protein  47.14 
 
 
143 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4243  Rrf2 family protein; transcriptional regulator  47.14 
 
 
143 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.112784  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4255  Rrf2 family protein; transcriptional regulator  47.14 
 
 
143 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4743  rrf2 family protein  47.14 
 
 
143 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4616  rrf2 family protein  47.14 
 
 
143 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4636  rrf2 family protein  47.14 
 
 
143 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0619  rrf2 family protein  47.14 
 
 
143 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4620  rrf2 family protein  47.14 
 
 
143 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4336  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  46.43 
 
 
143 aa  130  5e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2001  rrf2 family protein  47.1 
 
 
143 aa  123  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.301895  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0680  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  42.75 
 
 
140 aa  122  2e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00302729  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1779  rrf2 family protein  45.65 
 
 
143 aa  121  3e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000236415  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1758  RRF2 family protein  45.65 
 
 
143 aa  121  3e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1736  RRF2 family protein  45.65 
 
 
143 aa  121  3e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.582231  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1917  rrf2 family protein  45.65 
 
 
143 aa  121  3e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0431103  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2022  rrf2 family protein  45.65 
 
 
143 aa  121  3e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000169778  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3422  rrf2 family protein  45.65 
 
 
143 aa  121  3e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000049923 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1921  rrf2 family protein  45.65 
 
 
143 aa  121  3e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.581876  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1953  rrf2 family protein  45.65 
 
 
143 aa  121  3e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000194706 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1791  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  45.65 
 
 
143 aa  117  3.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000874227  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1447  RRF2 family protein  44.12 
 
 
138 aa  116  9.999999999999999e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0587227  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0676  hypothetical protein  40.74 
 
 
139 aa  114  5e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0801  hypothetical protein  39.71 
 
 
144 aa  110  9e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1321  Rrf2 family protein  43.88 
 
 
149 aa  109  1.0000000000000001e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26060  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  44.03 
 
 
146 aa  109  1.0000000000000001e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.523636  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1225  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  44.44 
 
 
148 aa  106  1e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0259707  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0848  transcriptional regulator superfamily  39.86 
 
 
137 aa  106  1e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.264832  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2073  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  45.65 
 
 
144 aa  100  5e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.163094  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2093  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  43.8 
 
 
144 aa  94.4  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0872269  normal  0.332036 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2464  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  36.57 
 
 
146 aa  94  6e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000267209  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1056  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  39.55 
 
 
150 aa  93.6  9e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3037  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  43.61 
 
 
140 aa  91.3  5e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0850205  normal  0.0637493 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1586  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  40.74 
 
 
151 aa  89.4  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0540164 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1079  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  39.42 
 
 
136 aa  88.6  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.7621  normal  0.359746 
 
 
-
 
NC_003296  RS00405  hypothetical protein  42.75 
 
 
143 aa  87.4  6e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00113675  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2124  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  40.71 
 
 
148 aa  87.4  6e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1606  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  44.44 
 
 
151 aa  86.7  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2863  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  45.19 
 
 
151 aa  85.9  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.858803 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2417  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  37.32 
 
 
141 aa  84.7  4e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.229432 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0939  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  44.12 
 
 
148 aa  84.3  5e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1756  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  44.7 
 
 
164 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1784  Rrf2 family protein  44.85 
 
 
153 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.121065  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1505  Rrf2 family protein  44.85 
 
 
153 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.080544  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1174  Rrf2 family protein  44.85 
 
 
153 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.246229  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1372  putative transcriptional regulator  44.85 
 
 
153 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.102116  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1376  putative transcriptional regulator  44.85 
 
 
153 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.135782  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0457  Rrf2 family protein  44.85 
 
 
153 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2098  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  44.12 
 
 
151 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.607265  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0725  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  42.86 
 
 
151 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.241075  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1205  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  42.86 
 
 
151 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2862  Rrf2 family protein  43.38 
 
 
154 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.246618  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1178  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  42.14 
 
 
151 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000716661  normal  0.224139 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1088  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  43.38 
 
 
151 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.683076  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0097  putative transcriptional regulator  39.78 
 
 
106 aa  77.8  0.00000000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1088  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  42.65 
 
 
151 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1746  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  31.85 
 
 
139 aa  75.9  0.0000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.488716  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4313  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  41.91 
 
 
151 aa  75.1  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0000750143  normal  0.208214 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2648  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  43.24 
 
 
150 aa  73.9  0.0000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.68692 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0694  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  32.84 
 
 
146 aa  72.8  0.000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0238705  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0695  Rrf2 family protein  46.09 
 
 
141 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000561607  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5127  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  32.58 
 
 
141 aa  71.2  0.000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2406  hypothetical protein  43.38 
 
 
148 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.888596  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1726  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  32.87 
 
 
135 aa  68.6  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.992938 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2051  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  32.43 
 
 
138 aa  68.9  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.482177 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2538  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  30.07 
 
 
137 aa  63.9  0.0000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000724795  normal  0.769901 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4008  protein of unknown function UPF0074  31.85 
 
 
187 aa  63.2  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5965  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  35 
 
 
151 aa  62.8  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0284344 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5019  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  28.26 
 
 
135 aa  62  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0401266  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18410  predicted transcriptional regulator  34.96 
 
 
152 aa  62.4  0.000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.199021  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09960  hypothetical protein  31.65 
 
 
142 aa  60.8  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0924  hypothetical protein  31.65 
 
 
142 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.945125  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7110  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  32.86 
 
 
151 aa  59.7  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0147621  normal  0.1046 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2547  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  36.44 
 
 
163 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.922047  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2816  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  29.63 
 
 
136 aa  58.9  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2591  transcriptional regulator  31.85 
 
 
156 aa  58.9  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00374583 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5306  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  32.37 
 
 
146 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1052  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  30.94 
 
 
155 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.816275  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3119  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  30.22 
 
 
165 aa  58.2  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0368  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  31.25 
 
 
152 aa  57.4  0.00000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.172949 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3180  transcriptional regulator  31.11 
 
 
137 aa  57.4  0.00000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0130627  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2256  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  38.1 
 
 
136 aa  57.4  0.00000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.214948  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3487  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  32.37 
 
 
146 aa  57  0.00000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.740376  hitchhiker  0.00818158 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4329  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  37.89 
 
 
147 aa  57  0.00000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4541  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  30.94 
 
 
161 aa  57  0.00000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.417251  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2516  putative DNA-binding protein  32.76 
 
 
571 aa  57  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4766  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  37.07 
 
 
145 aa  56.6  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.32913 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3265  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  29.29 
 
 
173 aa  56.6  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3108  transcriptional regulator  31.11 
 
 
137 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3572  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  34.75 
 
 
159 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0421402  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3948  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  34.75 
 
 
137 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.915994  normal  0.554541 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3419  rrf2 family protein  30.37 
 
 
137 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3200  rrf2 family protein  30.37 
 
 
137 aa  54.7  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0491107  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3453  rrf2 family protein  30.37 
 
 
137 aa  54.7  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.756851  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1334  DNA-binding protein  29.33 
 
 
153 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.172988  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1311  hypothetical protein  30 
 
 
153 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1261  transcriptional regulator  30 
 
 
153 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.62551  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>