210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1225 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1225  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  100 
 
 		 148 aa  291  1e-78  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0259707  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4634  rrf2 family protein  41.3 
 
 		 143 aa  114  3e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4620  rrf2 family protein  41.3 
 
 		 143 aa  114  3e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4403  rrf2 family protein  41.3 
 
 		 143 aa  114  3e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4243  Rrf2 family protein; transcriptional regulator  41.3 
 
 		 143 aa  114  3e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.112784  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4255  Rrf2 family protein; transcriptional regulator  41.3 
 
 		 143 aa  114  3e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0619  rrf2 family protein  41.3 
 
 		 143 aa  114  3e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4743  rrf2 family protein  41.3 
 
 		 143 aa  114  3e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4616  rrf2 family protein  41.3 
 
 		 143 aa  114  3e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4636  rrf2 family protein  41.3 
 
 		 143 aa  114  3e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1791  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 143 aa  114  5e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000874227  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3422  rrf2 family protein  39.85 
 
 		 143 aa  114  6e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000049923 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3208  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 143 aa  113  6.9999999999999995e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2001  rrf2 family protein  39.85 
 
 		 143 aa  113  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.301895  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4336  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 143 aa  113  8.999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1779  rrf2 family protein  41.94 
 
 		 143 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000236415  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1758  RRF2 family protein  41.94 
 
 		 143 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1736  RRF2 family protein  41.94 
 
 		 143 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.582231  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1917  rrf2 family protein  41.94 
 
 		 143 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0431103  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2022  rrf2 family protein  41.94 
 
 		 143 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000169778  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1921  rrf2 family protein  41.94 
 
 		 143 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.581876  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1953  rrf2 family protein  41.94 
 
 		 143 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000194706 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3037  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  42.03 
 
 		 140 aa  107  8.000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0850205  normal  0.0637493 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2649  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  44.44 
 
 		 151 aa  106  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000442413  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3614  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  36.09 
 
 		 137 aa  105  2e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0184881  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0676  hypothetical protein  39.55 
 
 		 139 aa  104  5e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1746  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 139 aa  102  2e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.488716  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1784  Rrf2 family protein  49.63 
 
 		 153 aa  100  7e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.121065  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1505  Rrf2 family protein  49.63 
 
 		 153 aa  100  7e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.080544  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1174  Rrf2 family protein  49.63 
 
 		 153 aa  100  7e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.246229  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1372  putative transcriptional regulator  49.63 
 
 		 153 aa  100  7e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.102116  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1376  putative transcriptional regulator  49.63 
 
 		 153 aa  100  7e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.135782  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0457  Rrf2 family protein  49.63 
 
 		 153 aa  100  7e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2862  Rrf2 family protein  48.89 
 
 		 154 aa  100  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.246618  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1321  Rrf2 family protein  36.03 
 
 		 149 aa  99.4  1e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0680  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  30.94 
 
 		 140 aa  98.2  4e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00302729  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00405  hypothetical protein  45.52 
 
 		 143 aa  97.8  5e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00113675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4313  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 151 aa  97.1  7e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0000750143  normal  0.208214 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2863  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  45.93 
 
 		 151 aa  96.3  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.858803 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1088  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  47.41 
 
 		 151 aa  96.3  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1079  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  39.85 
 
 		 136 aa  95.9  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.7621  normal  0.359746 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1088  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  47.41 
 
 		 151 aa  95.9  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.683076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2124  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  42.75 
 
 		 148 aa  95.1  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0725  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  45.99 
 
 		 151 aa  94.4  5e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.241075  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1205  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  45.99 
 
 		 151 aa  94.4  5e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2098  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 151 aa  94  6e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.607265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1756  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  41.78 
 
 		 164 aa  93.6  7e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1447  RRF2 family protein  34.85 
 
 		 138 aa  93.6  8e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0587227  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1606  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  44.44 
 
 		 151 aa  93.6  8e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1178  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  45.26 
 
 		 151 aa  93.2  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000716661  normal  0.224139 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2073  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  44.03 
 
 		 144 aa  92  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.163094  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0801  hypothetical protein  31.88 
 
 		 144 aa  91.3  4e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1056  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  35.88 
 
 		 150 aa  90.5  6e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26060  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  39.69 
 
 		 146 aa  89.4  2e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.523636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2093  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  42.54 
 
 		 144 aa  88.2  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0872269  normal  0.332036 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0695  Rrf2 family protein  48.41 
 
 		 141 aa  88.2  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000561607  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2648  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  39.72 
 
 		 150 aa  88.6  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.68692 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5019  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 135 aa  83.6  8e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0401266  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18410  predicted transcriptional regulator  39.39 
 
 		 152 aa  82.8  0.000000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.199021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2417  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  37.69 
 
 		 141 aa  82  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.229432 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1726  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  36.57 
 
 		 135 aa  82.4  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.992938 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2464  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  33.09 
 
 		 146 aa  82  0.000000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000267209  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0848  transcriptional regulator superfamily  30.53 
 
 		 137 aa  80.9  0.000000000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.264832  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4008  protein of unknown function UPF0074  37.5 
 
 		 187 aa  79.3  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0939  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  40 
 
 		 148 aa  78.6  0.00000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1586  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 151 aa  77.8  0.00000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0540164 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2591  transcriptional regulator  32.12 
 
 		 156 aa  69.3  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00374583 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2406  hypothetical protein  39.85 
 
 		 148 aa  67  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.888596  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5127  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 141 aa  66.6  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3421  rrf2 family protein  28.68 
 
 		 137 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.194081  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3200  rrf2 family protein  27.94 
 
 		 137 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0491107  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3453  rrf2 family protein  27.94 
 
 		 137 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.756851  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3419  rrf2 family protein  27.94 
 
 		 137 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3108  transcriptional regulator  27.94 
 
 		 137 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2256  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 136 aa  63.2  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.214948  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3180  transcriptional regulator  27.21 
 
 		 137 aa  62.4  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0130627  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0097  putative transcriptional regulator  35.79 
 
 		 106 aa  62.4  0.000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3409  rrf2 family protein  27.21 
 
 		 137 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000108147  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1837  rrf2 family protein  27.21 
 
 		 137 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.886033  normal  0.370465 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3431  rrf2 family protein  27.21 
 
 		 137 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2816  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  25 
 
 		 136 aa  60.5  0.000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5965  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  31.3 
 
 		 151 aa  60.5  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0284344 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2165  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 152 aa  60.1  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00710337  normal  0.480622 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7110  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  31.43 
 
 		 151 aa  60.1  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0147621  normal  0.1046 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0183  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 106 aa  59.7  0.00000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0970  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 154 aa  58.9  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.794962 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2628  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 153 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.106068 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3492  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 150 aa  59.3  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0328  iron-responsive transcriptional regulator  32.09 
 
 		 154 aa  58.9  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.069835 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1206  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 139 aa  56.2  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00151678  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0743  hypothetical protein  31.06 
 
 		 150 aa  55.8  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.798727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1476  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 165 aa  55.8  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0550713 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0098  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  37.04 
 
 		 153 aa  55.5  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.35302  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2538  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 137 aa  54.3  0.0000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000724795  normal  0.769901 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1478  transcriptional regulator family protein  32.31 
 
 		 172 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.113614  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1052  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 155 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.816275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0838  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 146 aa  53.9  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.253971  hitchhiker  0.0000000059552 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0838  iron-responsive transcriptional regulator  30.37 
 
 		 156 aa  53.1  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4048  hypothetical protein  30.83 
 
 		 154 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.267038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09960  hypothetical protein  28.12 
 
 		 142 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>