79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0183 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0183  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  100 
 
 		 106 aa  217  3.9999999999999997e-56  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1746  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 139 aa  80.5  0.000000000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.488716  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0694  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 146 aa  80.1  0.000000000000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0238705  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0848  transcriptional regulator superfamily  37.36 
 
 		 137 aa  67.8  0.00000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.264832  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3614  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  37.63 
 
 		 137 aa  64.3  0.0000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0184881  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26060  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  34.78 
 
 		 146 aa  63.9  0.0000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.523636  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0801  hypothetical protein  38.3 
 
 		 144 aa  60.5  0.000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0680  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  36.56 
 
 		 140 aa  60.1  0.000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00302729  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1447  RRF2 family protein  34.44 
 
 		 138 aa  60.1  0.00000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0587227  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3208  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 143 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1225  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 148 aa  59.7  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0259707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1756  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 164 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4336  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 143 aa  57.4  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3037  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  36.96 
 
 		 140 aa  57.4  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0850205  normal  0.0637493 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2648  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  37.78 
 
 		 150 aa  56.6  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.68692 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2863  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.858803 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4255  Rrf2 family protein; transcriptional regulator  32.26 
 
 		 143 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4403  rrf2 family protein  32.26 
 
 		 143 aa  55.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4243  Rrf2 family protein; transcriptional regulator  32.26 
 
 		 143 aa  55.5  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.112784  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4636  rrf2 family protein  32.26 
 
 		 143 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4616  rrf2 family protein  32.26 
 
 		 143 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0676  hypothetical protein  37.93 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4743  rrf2 family protein  32.26 
 
 		 143 aa  55.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1726  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  41.67 
 
 		 135 aa  55.8  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.992938 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0619  rrf2 family protein  32.26 
 
 		 143 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4634  rrf2 family protein  32.26 
 
 		 143 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4620  rrf2 family protein  32.26 
 
 		 143 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1606  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  35.29 
 
 		 151 aa  53.9  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1779  rrf2 family protein  32.99 
 
 		 143 aa  52.4  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000236415  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1736  RRF2 family protein  32.99 
 
 		 143 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.582231  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1758  RRF2 family protein  32.99 
 
 		 143 aa  52.4  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2022  rrf2 family protein  32.99 
 
 		 143 aa  52  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000169778  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1921  rrf2 family protein  32.99 
 
 		 143 aa  52  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.581876  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1917  rrf2 family protein  32.99 
 
 		 143 aa  52.4  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0431103  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1953  rrf2 family protein  32.99 
 
 		 143 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000194706 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3422  rrf2 family protein  32.99 
 
 		 143 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000049923 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2098  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 151 aa  52  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.607265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1321  Rrf2 family protein  31.87 
 
 		 149 aa  51.6  0.000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2862  Rrf2 family protein  38.16 
 
 		 154 aa  51.2  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.246618  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2001  rrf2 family protein  31.96 
 
 		 143 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.301895  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0725  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 151 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.241075  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1205  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 151 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1178  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 151 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000716661  normal  0.224139 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2124  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 148 aa  50.1  0.000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1056  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 150 aa  50.1  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5127  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 141 aa  49.7  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0457  Rrf2 family protein  38.16 
 
 		 153 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1376  putative transcriptional regulator  38.16 
 
 		 153 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.135782  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1372  putative transcriptional regulator  38.16 
 
 		 153 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.102116  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1505  Rrf2 family protein  38.16 
 
 		 153 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.080544  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1784  Rrf2 family protein  38.16 
 
 		 153 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.121065  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0695  Rrf2 family protein  38.16 
 
 		 141 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000561607  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1174  Rrf2 family protein  38.16 
 
 		 153 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.246229  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0097  putative transcriptional regulator  30 
 
 		 106 aa  49.3  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2649  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  32.61 
 
 		 151 aa  49.3  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000442413  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2854  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  33.33 
 
 		 147 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0230  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  38.04 
 
 		 166 aa  48.9  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4313  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 151 aa  48.1  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0000750143  normal  0.208214 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0939  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  37.78 
 
 		 148 aa  47.8  0.00006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1088  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 151 aa  47.4  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1088  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 151 aa  47.4  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.683076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1586  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 151 aa  47.4  0.00008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0540164 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0200  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  38 
 
 		 166 aa  46.2  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.234084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1791  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 143 aa  46.6  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000874227  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2406  hypothetical protein  41.11 
 
 		 148 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.888596  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2093  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 144 aa  45.4  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0872269  normal  0.332036 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2628  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 153 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.106068 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18410  predicted transcriptional regulator  30.1 
 
 		 152 aa  43.9  0.0008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.199021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2073  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 144 aa  43.9  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.163094  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00405  hypothetical protein  28.09 
 
 		 143 aa  43.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00113675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2509  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  30 
 
 		 145 aa  42.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000001253  normal  0.0938271 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0320  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 180 aa  42.4  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0695521  normal  0.0912799 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0872  transcriptional regulator  47.62 
 
 		 168 aa  42  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0670352  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2417  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 141 aa  41.6  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.229432 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2054  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 169 aa  41.2  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3061  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  29.73 
 
 		 162 aa  41.2  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.325314  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1591  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  28.87 
 
 		 151 aa  40.8  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0376428 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0909  hypothetical protein  45.24 
 
 		 168 aa  40  0.01  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0967  hypothetical protein  45.24 
 
 		 168 aa  40  0.01  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>