More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0230 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_0230  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  100 
 
 
166 aa  332  1e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0200  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  90.96 
 
 
166 aa  310  7.999999999999999e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.234084  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0154  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  69.09 
 
 
168 aa  223  9e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.461852 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2054  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  59.26 
 
 
169 aa  185  2e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4003  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  46.72 
 
 
177 aa  128  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2791  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  44.93 
 
 
162 aa  122  2e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.506463 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2876  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  47.89 
 
 
159 aa  119  9.999999999999999e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2520  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  44.53 
 
 
162 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.747102  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01670  rrf2 family protein, putative transcriptional regulator  43.97 
 
 
156 aa  119  1.9999999999999998e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.207254 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2899  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  45.59 
 
 
162 aa  119  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.386533  normal  0.572673 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2776  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  43.8 
 
 
162 aa  118  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.959481 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4808  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  44.2 
 
 
159 aa  117  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0281  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  39.86 
 
 
158 aa  111  4.0000000000000004e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4583  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  41.67 
 
 
164 aa  109  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.870421 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4580  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  41.67 
 
 
161 aa  109  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.36381 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0612  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  41.84 
 
 
155 aa  107  7.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.430519 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0872  transcriptional regulator  40.38 
 
 
168 aa  103  9e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0670352  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0224  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  40.58 
 
 
167 aa  103  9e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.997359 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20720  rrf2 family protein, putative transcriptional regulator  37.67 
 
 
169 aa  103  1e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3061  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  41.01 
 
 
162 aa  103  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.325314  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1071  hypothetical protein  40.38 
 
 
168 aa  102  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0909  hypothetical protein  39.74 
 
 
168 aa  102  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0967  hypothetical protein  39.74 
 
 
168 aa  102  3e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5746  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  40.88 
 
 
160 aa  100  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.596706 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3223  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  41.61 
 
 
169 aa  99  3e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10320  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  39.29 
 
 
167 aa  95.1  4e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0320  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  41.91 
 
 
180 aa  93.6  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0695521  normal  0.0912799 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1261  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  40.18 
 
 
136 aa  90.9  8e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0453217  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9039  putative transcriptional regulator  37.96 
 
 
157 aa  89.7  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3516  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  38.46 
 
 
180 aa  87  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00768714  normal  0.63331 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2958  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  39.44 
 
 
179 aa  85.9  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.128614 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3156  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  37.59 
 
 
180 aa  83.6  0.000000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.22058 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2514  rrf2 family protein  34.53 
 
 
133 aa  82  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0618059 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0683  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  36.17 
 
 
164 aa  81.6  0.000000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000630574  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2779  rrf2 family protein  33.81 
 
 
133 aa  81.3  0.000000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1375  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  35.61 
 
 
165 aa  80.9  0.000000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2582  rrf2 family protein  33.81 
 
 
133 aa  80.5  0.000000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0122402  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2769  rrf2 family protein  33.81 
 
 
133 aa  80.5  0.000000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2571  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  32.61 
 
 
133 aa  79  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.184725  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2975  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  36.62 
 
 
184 aa  78.2  0.00000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.672436  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2937  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  37.76 
 
 
173 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.675377  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2964  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  42.39 
 
 
137 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00065561  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3967  transcriptional regulator  36.5 
 
 
174 aa  75.9  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4312  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  34.72 
 
 
191 aa  75.5  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.784229  normal  0.0976927 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2932  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  36.64 
 
 
143 aa  73.9  0.0000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000242173  normal  0.835381 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29300  putative transcriptional regulator  35.04 
 
 
174 aa  73.9  0.0000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.976463  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0579  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  33.57 
 
 
156 aa  73.2  0.000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000125855  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0494  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  32.67 
 
 
143 aa  72.4  0.000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.371305  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2120  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  35.17 
 
 
179 aa  72.4  0.000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0779  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  33.33 
 
 
132 aa  71.6  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.133557  normal  0.384095 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0838  iron-responsive transcriptional regulator  38.32 
 
 
156 aa  67.4  0.00000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2361  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  35 
 
 
179 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.55927  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0818  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  30.66 
 
 
126 aa  66.6  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2271  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  33.8 
 
 
179 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.448582  normal  0.516915 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3932  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  33.1 
 
 
200 aa  65.1  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0339289 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0421  iron-responsive transcriptional regulator  33.33 
 
 
160 aa  62.8  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0531604  hitchhiker  0.00267682 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0647  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  33.04 
 
 
146 aa  62.8  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1943  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  27.08 
 
 
150 aa  63.2  0.000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3617  iron-responsive transcriptional regulator  32.06 
 
 
153 aa  62.8  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.973931  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0830  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  33.94 
 
 
137 aa  62  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.6836  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0562  iron-responsive transcriptional regulator  31.39 
 
 
153 aa  62  0.000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.23721  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0528  iron-responsive transcriptional regulator  31.39 
 
 
153 aa  62  0.000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2094  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  28.99 
 
 
136 aa  61.6  0.000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.65276  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2009  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  28.46 
 
 
142 aa  61.6  0.000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0389  iron-responsive transcriptional regulator  32.58 
 
 
160 aa  60.8  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00187363  normal  0.229909 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0538  hypothetical protein  35.87 
 
 
136 aa  60.5  0.000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.209147  normal  0.581853 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0540  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  34.11 
 
 
150 aa  59.7  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0485  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  28.47 
 
 
145 aa  58.9  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0373904  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1300  hypothetical protein  32.61 
 
 
186 aa  58.5  0.00000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1206  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  33.64 
 
 
139 aa  58.2  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00151678  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2768  putative transcriptional regulator  30.66 
 
 
162 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.356622  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2830  Rrf2 family protein  30.66 
 
 
162 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0725  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  33.33 
 
 
133 aa  57.8  0.00000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.0000720218  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2710  putative transcriptional regulator  30.66 
 
 
162 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0676  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  33.33 
 
 
137 aa  57.8  0.00000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0439993 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2406  Rrf2 family protein  30.66 
 
 
162 aa  57.8  0.00000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0606  Rrf2 family protein  30.66 
 
 
165 aa  57.4  0.00000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1940  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  39.53 
 
 
141 aa  57.8  0.00000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.107659  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2014  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  28.95 
 
 
156 aa  57.4  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1790  Rrf2 family protein  29.93 
 
 
164 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.034935  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1023  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  41.18 
 
 
154 aa  57  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2002  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  29.79 
 
 
154 aa  57  0.0000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.200484  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2259  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  39.39 
 
 
154 aa  55.8  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1648  Iron-sulphur cluster assembly transcription factor IscR  35 
 
 
166 aa  56.2  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.223295  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2989  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  36.67 
 
 
154 aa  56.6  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  2.2519e-18  normal  0.394533 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2883  Rrf2 family protein  29.93 
 
 
162 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1719  putative transcriptional regulator  29.93 
 
 
162 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.149273  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1607  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  28.26 
 
 
144 aa  56.6  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.690617  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1204  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  30.7 
 
 
173 aa  56.2  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.351528  normal  0.116676 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1002  transcriptional regulator, TrmB  43.66 
 
 
151 aa  55.8  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.283031 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2010  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  30.77 
 
 
144 aa  55.8  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0534  Rrf2 family protein  36.67 
 
 
154 aa  55.8  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000152989  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0819  hypothetical protein  44.44 
 
 
153 aa  55.5  0.0000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2510  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  34.21 
 
 
166 aa  55.8  0.0000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0224  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  33.67 
 
 
199 aa  55.5  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2963  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  43.55 
 
 
142 aa  55.1  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000000472349  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3163  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  34.21 
 
 
166 aa  55.5  0.0000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.878205  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0328  iron-responsive transcriptional regulator  31.62 
 
 
154 aa  54.7  0.0000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.069835 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1326  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  33.7 
 
 
159 aa  53.9  0.0000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0470001  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1205  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  31.86 
 
 
188 aa  53.9  0.0000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.262259  normal  0.12537 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>