241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_1206 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_1206  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  100 
 
 
139 aa  282  1.0000000000000001e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00151678  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0154  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  36.79 
 
 
168 aa  66.2  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.461852 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0320  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  34.23 
 
 
180 aa  64.3  0.0000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0695521  normal  0.0912799 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3516  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  30.88 
 
 
180 aa  62.8  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00768714  normal  0.63331 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2791  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  31.86 
 
 
162 aa  62.4  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.506463 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3156  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  34.78 
 
 
180 aa  60.5  0.000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.22058 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2779  rrf2 family protein  29.41 
 
 
133 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0200  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  32.11 
 
 
166 aa  59.3  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.234084  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2582  rrf2 family protein  29.41 
 
 
133 aa  58.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0122402  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0647  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  34.86 
 
 
146 aa  58.9  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2769  rrf2 family protein  29.41 
 
 
133 aa  58.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2571  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  30.88 
 
 
133 aa  59.3  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.184725  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10320  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  28.97 
 
 
167 aa  58.5  0.00000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0848  transcriptional regulator superfamily  31.88 
 
 
137 aa  58.2  0.00000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.264832  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2520  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  33.63 
 
 
162 aa  58.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.747102  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0230  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  33.64 
 
 
166 aa  58.2  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1406  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  27.83 
 
 
155 aa  57.8  0.00000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0735684  normal  0.656716 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2975  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  32.74 
 
 
184 aa  57.4  0.00000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.672436  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0224  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  27.59 
 
 
167 aa  57.4  0.00000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.997359 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2514  rrf2 family protein  28.68 
 
 
133 aa  57  0.00000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0618059 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2093  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  30.71 
 
 
144 aa  56.6  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0872269  normal  0.332036 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1225  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  34.91 
 
 
148 aa  56.2  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0259707  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4003  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  29.93 
 
 
177 aa  55.8  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1447  RRF2 family protein  33.09 
 
 
138 aa  55.5  0.0000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0587227  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2958  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  31.3 
 
 
179 aa  56.2  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.128614 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1513  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  30.15 
 
 
146 aa  55.5  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.334315 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3365  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  33.04 
 
 
188 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.312723  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0194  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  42.37 
 
 
146 aa  55.1  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1295  rrf2 family protein  34.48 
 
 
137 aa  55.1  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1748  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  25.9 
 
 
142 aa  55.5  0.0000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1232  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  35.58 
 
 
155 aa  55.1  0.0000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.618772  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1586  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  31.25 
 
 
151 aa  54.7  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0540164 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1071  hypothetical protein  26.17 
 
 
168 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0872  transcriptional regulator  26.17 
 
 
168 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0670352  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20720  rrf2 family protein, putative transcriptional regulator  28.1 
 
 
169 aa  54.3  0.0000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2776  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  30.97 
 
 
162 aa  54.3  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.959481 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3187  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  31.48 
 
 
153 aa  54.3  0.0000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2876  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  26.77 
 
 
159 aa  54.3  0.0000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2937  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  30.36 
 
 
173 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.675377  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1607  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  35.45 
 
 
144 aa  53.9  0.0000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.690617  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0676  hypothetical protein  31.69 
 
 
139 aa  53.1  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4580  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  27.68 
 
 
161 aa  53.1  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.36381 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0538  hypothetical protein  30.39 
 
 
136 aa  53.1  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.209147  normal  0.581853 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1002  transcriptional regulator, TrmB  43.64 
 
 
151 aa  53.1  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.283031 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0226  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  33.01 
 
 
162 aa  53.1  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1900  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  30.1 
 
 
171 aa  53.1  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0819  hypothetical protein  44.64 
 
 
153 aa  53.5  0.000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0641  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  34.04 
 
 
174 aa  53.1  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.974192 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4583  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  27.68 
 
 
164 aa  53.1  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.870421 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0909  hypothetical protein  25.5 
 
 
168 aa  52.8  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0967  hypothetical protein  25.5 
 
 
168 aa  52.8  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0485  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  37.1 
 
 
145 aa  52.4  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0373904  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2648  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  35.96 
 
 
150 aa  52.4  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.68692 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0281  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  30.08 
 
 
158 aa  52  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1973  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  35.14 
 
 
150 aa  52  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5030  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  33.02 
 
 
145 aa  51.2  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4312  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  31.53 
 
 
191 aa  51.6  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.784229  normal  0.0976927 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2054  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  30.43 
 
 
169 aa  51.2  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2124  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  28.15 
 
 
148 aa  51.2  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4008  protein of unknown function UPF0074  33.75 
 
 
187 aa  51.2  0.000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0730  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  42.86 
 
 
153 aa  50.8  0.000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3494  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  31.25 
 
 
183 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.915426 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0437  transcriptional repressor NsrR  30.77 
 
 
141 aa  50.8  0.000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.900839  unclonable  0.0000000282304 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0801  hypothetical protein  33.33 
 
 
144 aa  50.4  0.000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04045  predicted DNA-binding transcriptional regulator  29.81 
 
 
141 aa  50.4  0.000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.58974  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4737  transcriptional repressor NsrR  29.81 
 
 
141 aa  50.4  0.000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4421  transcriptional repressor NsrR  29.81 
 
 
141 aa  50.4  0.000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3835  transcriptional repressor NsrR  29.81 
 
 
141 aa  50.4  0.000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.678572  hitchhiker  0.00000129464 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04007  hypothetical protein  29.81 
 
 
141 aa  50.4  0.000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.7208  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2899  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  25.87 
 
 
162 aa  50.4  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.386533  normal  0.572673 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01670  rrf2 family protein, putative transcriptional regulator  27.01 
 
 
156 aa  49.7  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.207254 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2073  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  28.7 
 
 
144 aa  50.1  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.163094  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0494  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  31.19 
 
 
143 aa  49.7  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.371305  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2009  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  34.15 
 
 
142 aa  49.7  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2120  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  29.46 
 
 
179 aa  49.7  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0787  transcriptional repressor NsrR  31.73 
 
 
141 aa  49.7  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.959014  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3815  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  29.81 
 
 
141 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5694  transcriptional repressor NsrR  29.81 
 
 
141 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.883582  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2361  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  30.36 
 
 
179 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.55927  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4649  transcriptional repressor NsrR  29.81 
 
 
141 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.317237 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4709  transcriptional repressor NsrR  29.81 
 
 
141 aa  48.9  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0675  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  42.62 
 
 
166 aa  48.9  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.329049 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0830  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  29.17 
 
 
137 aa  48.9  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.6836  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3446  transcriptional repressor NsrR  31.73 
 
 
141 aa  48.9  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0328  iron-responsive transcriptional regulator  34.29 
 
 
154 aa  48.9  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.069835 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1943  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  30.43 
 
 
150 aa  48.5  0.00003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0930  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  29.81 
 
 
150 aa  48.5  0.00003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.276668  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2964  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  33.7 
 
 
137 aa  48.5  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00065561  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00405  hypothetical protein  30.56 
 
 
143 aa  48.1  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00113675  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0224  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  30.56 
 
 
199 aa  48.1  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1594  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  29.36 
 
 
159 aa  48.1  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.202596  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0766  transcriptional repressor NsrR  31.73 
 
 
141 aa  48.1  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.61103  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0606  Rrf2 family protein  35.24 
 
 
165 aa  47.8  0.00005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2830  Rrf2 family protein  31.3 
 
 
162 aa  47.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0612  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  28.32 
 
 
155 aa  47.8  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.430519 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2406  Rrf2 family protein  31.3 
 
 
162 aa  47.8  0.00005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2223  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  29.13 
 
 
151 aa  47.8  0.00005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.339527  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2710  putative transcriptional regulator  31.3 
 
 
162 aa  47.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2768  putative transcriptional regulator  31.3 
 
 
162 aa  47.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.356622  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4808  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  29.06 
 
 
159 aa  47.8  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>