281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0641 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_0641  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  100 
 
 		 174 aa  357  4e-98  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.974192 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4008  protein of unknown function UPF0074  26.92 
 
 		 187 aa  65.5  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1586  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 151 aa  65.1  0.0000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0540164 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2417  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 141 aa  64.3  0.0000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.229432 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0939  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  35.48 
 
 		 148 aa  62.4  0.000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3037  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  28.89 
 
 		 140 aa  60.1  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0850205  normal  0.0637493 
 
 
-
 
NC_003296  RS00405  hypothetical protein  35.65 
 
 		 143 aa  58.5  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00113675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1447  RRF2 family protein  35.23 
 
 		 138 aa  58.5  0.00000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0587227  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2124  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 148 aa  58.2  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1591  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  30.85 
 
 		 151 aa  57.4  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0376428 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2093  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0872269  normal  0.332036 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2073  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 144 aa  55.5  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.163094  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1056  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 150 aa  55.5  0.0000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2275  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  29.82 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0449901  hitchhiker  0.00000363705 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1594  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 159 aa  54.7  0.0000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.202596  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5127  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 141 aa  54.3  0.0000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0763  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 149 aa  53.1  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000222775  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3422  rrf2 family protein  27.74 
 
 		 143 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000049923 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2001  rrf2 family protein  28.37 
 
 		 143 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.301895  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1779  rrf2 family protein  27.74 
 
 		 143 aa  52.8  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000236415  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1758  RRF2 family protein  27.74 
 
 		 143 aa  52.8  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1736  RRF2 family protein  27.74 
 
 		 143 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.582231  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1917  rrf2 family protein  27.74 
 
 		 143 aa  52.8  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0431103  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1206  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 139 aa  53.1  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00151678  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1953  rrf2 family protein  27.74 
 
 		 143 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000194706 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1784  Rrf2 family protein  31.58 
 
 		 153 aa  52.4  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.121065  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1505  Rrf2 family protein  31.58 
 
 		 153 aa  52.4  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.080544  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2022  rrf2 family protein  27.74 
 
 		 143 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000169778  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1376  putative transcriptional regulator  31.58 
 
 		 153 aa  52.4  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.135782  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1372  putative transcriptional regulator  31.58 
 
 		 153 aa  52.4  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.102116  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0457  Rrf2 family protein  31.58 
 
 		 153 aa  52.4  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1921  rrf2 family protein  27.74 
 
 		 143 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.581876  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1174  Rrf2 family protein  31.58 
 
 		 153 aa  52.4  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.246229  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4634  rrf2 family protein  29.01 
 
 		 143 aa  52  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0619  rrf2 family protein  29.01 
 
 		 143 aa  52  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4403  rrf2 family protein  29.01 
 
 		 143 aa  52  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4243  Rrf2 family protein; transcriptional regulator  29.01 
 
 		 143 aa  52  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.112784  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4255  Rrf2 family protein; transcriptional regulator  29.01 
 
 		 143 aa  52  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4636  rrf2 family protein  29.01 
 
 		 143 aa  52  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0224  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 199 aa  52  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4620  rrf2 family protein  29.01 
 
 		 143 aa  52  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4743  rrf2 family protein  29.01 
 
 		 143 aa  52  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4616  rrf2 family protein  29.01 
 
 		 143 aa  52  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2876  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  27.15 
 
 		 159 aa  52  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2752  DNA-binding transcriptional regulator IscR  31.68 
 
 		 164 aa  51.6  0.000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0761985  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26060  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  32.06 
 
 		 146 aa  51.6  0.000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.523636  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4135  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  29.13 
 
 		 145 aa  51.6  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.255829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2863  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 151 aa  51.6  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.858803 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0848  transcriptional regulator superfamily  28.03 
 
 		 137 aa  51.6  0.000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.264832  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1756  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 164 aa  51.2  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2932  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  30.56 
 
 		 143 aa  51.2  0.000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000242173  normal  0.835381 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2964  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 137 aa  51.2  0.000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00065561  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4336  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 143 aa  50.8  0.000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0320  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  24.63 
 
 		 180 aa  50.4  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0695521  normal  0.0912799 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3208  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 143 aa  50.4  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1653  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 150 aa  50.8  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.408134  hitchhiker  0.00610014 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1048  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 177 aa  50.8  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1237  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 161 aa  50.1  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00337607  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3628  DNA-binding transcriptional regulator IscR  31.68 
 
 		 164 aa  50.8  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000895499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1746  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 139 aa  50.4  0.00001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.488716  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01355  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  31.68 
 
 		 161 aa  50.8  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0210581  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0676  hypothetical protein  35.71 
 
 		 139 aa  50.1  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2779  rrf2 family protein  23.93 
 
 		 133 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1366  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  38.2 
 
 		 159 aa  50.1  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3032  DNA-binding transcriptional regulator IscR  30.69 
 
 		 164 aa  50.1  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.178839  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0152  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 134 aa  49.7  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  unclonable  0.00000000000241671  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0194  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 146 aa  49.7  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0680  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  31.91 
 
 		 140 aa  49.7  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00302729  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1265  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  38.2 
 
 		 160 aa  50.1  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2009  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  31.25 
 
 		 142 aa  50.1  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1243  DNA-binding transcriptional regulator IscR  30.69 
 
 		 164 aa  50.1  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.510917  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2591  transcriptional regulator  33.72 
 
 		 156 aa  49.7  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00374583 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2649  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  30.66 
 
 		 151 aa  50.1  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000442413  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1103  DNA-binding transcriptional regulator IscR  30.69 
 
 		 164 aa  50.1  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00126529  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1606  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  34.83 
 
 		 151 aa  49.3  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1558  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 148 aa  48.9  0.00003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0562  iron-responsive transcriptional regulator  35.37 
 
 		 153 aa  49.3  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.23721  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4808  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  33.75 
 
 		 159 aa  49.3  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1753  putative transcriptional regulator  29.13 
 
 		 140 aa  48.9  0.00003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0829  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  29.57 
 
 		 164 aa  48.9  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.282987 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2862  Rrf2 family protein  32.26 
 
 		 154 aa  49.3  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.246618  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2256  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 136 aa  49.3  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.214948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1557  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 151 aa  49.3  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0237413  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1168  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 134 aa  49.3  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000039809  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2098  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 151 aa  48.9  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.607265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2583  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 159 aa  48.9  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.293791  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1079  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  25.77 
 
 		 136 aa  48.9  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.7621  normal  0.359746 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4147  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  50 
 
 		 151 aa  48.9  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2732  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 158 aa  48.9  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000154261  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1277  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  27.34 
 
 		 144 aa  48.5  0.00005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1270  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  30.53 
 
 		 186 aa  48.5  0.00005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0346563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1277  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 158 aa  48.1  0.00006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1715  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  25.61 
 
 		 150 aa  48.1  0.00006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000168476  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0725  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 151 aa  48.1  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.241075  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1178  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 151 aa  48.1  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000716661  normal  0.224139 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1205  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 151 aa  48.1  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2051  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 138 aa  47.8  0.00007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.482177 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0528  iron-responsive transcriptional regulator  35.37 
 
 		 153 aa  47.8  0.00007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1791  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 143 aa  47.8  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000874227  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2272  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 154 aa  47.8  0.00008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.257031  normal  0.323507 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>