178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1753 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_1753  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 140 aa  291  2e-78  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0624  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  50.37 
 
 		 154 aa  140  5e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0198257  normal  0.570271 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3431  rrf2 family protein  29.5 
 
 		 137 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2538  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 137 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000724795  normal  0.769901 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1837  rrf2 family protein  29.5 
 
 		 137 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.886033  normal  0.370465 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2816  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  29.2 
 
 		 136 aa  67  0.00000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3409  rrf2 family protein  30.22 
 
 		 137 aa  67  0.00000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000108147  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3421  rrf2 family protein  28.78 
 
 		 137 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.194081  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3108  transcriptional regulator  28.78 
 
 		 137 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3200  rrf2 family protein  28.78 
 
 		 137 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0491107  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3180  transcriptional regulator  28.78 
 
 		 137 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0130627  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3453  rrf2 family protein  28.78 
 
 		 137 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.756851  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1422  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 156 aa  65.1  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.968203 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3419  rrf2 family protein  28.78 
 
 		 137 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5019  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 135 aa  63.9  0.0000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0401266  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4008  protein of unknown function UPF0074  30.28 
 
 		 187 aa  60.5  0.000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7110  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  29.55 
 
 		 151 aa  60.5  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0147621  normal  0.1046 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18410  predicted transcriptional regulator  33.6 
 
 		 152 aa  59.7  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.199021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5965  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  29.55 
 
 		 151 aa  58.2  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0284344 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0801  hypothetical protein  28.68 
 
 		 144 aa  57.4  0.00000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2093  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 144 aa  57  0.00000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0872269  normal  0.332036 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09960  hypothetical protein  28.06 
 
 		 142 aa  57  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1726  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  29.63 
 
 		 135 aa  57  0.00000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.992938 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2073  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.163094  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0924  hypothetical protein  28.03 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.945125  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2648  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  29.79 
 
 		 150 aa  55.1  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.68692 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3119  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 165 aa  54.3  0.0000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3952  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 146 aa  53.9  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.274037  normal  0.692006 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1586  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 151 aa  53.9  0.0000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0540164 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1079  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  28.36 
 
 		 136 aa  52.8  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.7621  normal  0.359746 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3948  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 137 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.915994  normal  0.554541 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2417  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 141 aa  52  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.229432 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3572  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  33 
 
 		 159 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0421402  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00405  hypothetical protein  40.3 
 
 		 143 aa  52  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00113675  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3487  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  34 
 
 		 146 aa  52  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.740376  hitchhiker  0.00818158 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3442  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  28.32 
 
 		 152 aa  50.8  0.000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.11487  hitchhiker  0.00712317 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3614  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  32.61 
 
 		 137 aa  50.8  0.000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0184881  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2094  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 136 aa  50.4  0.000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.65276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3567  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 152 aa  50.4  0.000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00720162 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3037  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  29.71 
 
 		 140 aa  50.1  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0850205  normal  0.0637493 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5127  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 141 aa  49.7  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6236  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  26.47 
 
 		 165 aa  49.7  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2269  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  27.13 
 
 		 174 aa  49.7  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0641  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 174 aa  49.3  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.974192 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01980  Rrf2 family protein  33.02 
 
 		 152 aa  49.3  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.491455  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2124  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 148 aa  49.3  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0281  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  29.93 
 
 		 158 aa  48.1  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0328  iron-responsive transcriptional regulator  36.17 
 
 		 154 aa  48.1  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.069835 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5306  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  33 
 
 		 146 aa  47.4  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0730  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 153 aa  47.4  0.00006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0970  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 154 aa  47.4  0.00006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.794962 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20720  rrf2 family protein, putative transcriptional regulator  42.25 
 
 		 169 aa  47.4  0.00007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2591  transcriptional regulator  30.71 
 
 		 156 aa  47  0.00008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00374583 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1893  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 159 aa  46.2  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2165  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 152 aa  46.2  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00710337  normal  0.480622 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1268  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  36.36 
 
 		 137 aa  46.2  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000462831  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3584  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 154 aa  47  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.855129  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0341  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  33.75 
 
 		 152 aa  46.6  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0800800000000001e-33 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0360  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  33.75 
 
 		 152 aa  46.6  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000032246  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0421  iron-responsive transcriptional regulator  36.92 
 
 		 160 aa  46.2  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0531604  hitchhiker  0.00267682 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3015  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  35.06 
 
 		 136 aa  45.8  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2547  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  30 
 
 		 163 aa  46.2  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.922047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4418  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  28.46 
 
 		 154 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1940  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 141 aa  45.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.107659  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3335  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  25.98 
 
 		 147 aa  45.8  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.659852  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0098  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  25 
 
 		 153 aa  45.4  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.35302  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3516  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 180 aa  45.8  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00768714  normal  0.63331 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0618  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  25.17 
 
 		 146 aa  45.4  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0633  hypothetical protein  25.17 
 
 		 146 aa  45.4  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0819  hypothetical protein  39.73 
 
 		 153 aa  45.4  0.0003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2001  rrf2 family protein  28.36 
 
 		 143 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.301895  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1311  hypothetical protein  26.32 
 
 		 153 aa  44.7  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0651  hypothetical protein  32.29 
 
 		 153 aa  45.1  0.0004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0635  hypothetical protein  29.77 
 
 		 153 aa  45.1  0.0004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0939  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  32.37 
 
 		 148 aa  44.7  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2051  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 138 aa  45.1  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.482177 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1943  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 150 aa  45.1  0.0004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3285  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  44.07 
 
 		 273 aa  44.7  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.794723  normal  0.278795 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0567  transcriptional regulator  26.32 
 
 		 153 aa  44.7  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1000  transcriptional regulator  26.32 
 
 		 153 aa  44.7  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.360873  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0389  iron-responsive transcriptional regulator  29.21 
 
 		 160 aa  44.7  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00187363  normal  0.229909 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0676  hypothetical protein  29.55 
 
 		 139 aa  44.3  0.0005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2510  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  32.69 
 
 		 166 aa  44.3  0.0005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2022  rrf2 family protein  30.88 
 
 		 143 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000169778  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1921  rrf2 family protein  30.88 
 
 		 143 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.581876  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2256  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 136 aa  44.3  0.0005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.214948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4530  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  28.46 
 
 		 154 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.193986  normal  0.482079 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2120  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 179 aa  44.3  0.0005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1334  DNA-binding protein  26.32 
 
 		 153 aa  44.7  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.172988  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3156  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  39.44 
 
 		 180 aa  44.7  0.0005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.22058 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0243  hypothetical protein  24.11 
 
 		 140 aa  44.3  0.0006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1779  rrf2 family protein  30.88 
 
 		 143 aa  44.3  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000236415  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1758  RRF2 family protein  30.88 
 
 		 143 aa  44.3  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1736  RRF2 family protein  30.88 
 
 		 143 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.582231  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1917  rrf2 family protein  30.88 
 
 		 143 aa  44.3  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0431103  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1002  transcriptional regulator, TrmB  48.08 
 
 		 151 aa  43.9  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.283031 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3163  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 166 aa  44.3  0.0006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.878205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0293  transcriptional regulator  26.32 
 
 		 172 aa  44.3  0.0006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0135694  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1261  transcriptional regulator  26.32 
 
 		 153 aa  44.3  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.62551  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0351  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 137 aa  44.3  0.0006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000160691  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>