264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCB4264_A3409 on replicon NC_011725
Organism: Bacillus cereus B4264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011725  BCB4264_A3409  rrf2 family protein  100 
 
 
137 aa  288  2e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000108147  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3421  rrf2 family protein  97.08 
 
 
137 aa  283  7e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.194081  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1837  rrf2 family protein  97.81 
 
 
137 aa  283  8e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.886033  normal  0.370465 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3200  rrf2 family protein  96.35 
 
 
137 aa  281  2.0000000000000002e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0491107  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3419  rrf2 family protein  96.35 
 
 
137 aa  281  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3453  rrf2 family protein  96.35 
 
 
137 aa  281  2.0000000000000002e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.756851  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3108  transcriptional regulator  95.62 
 
 
137 aa  280  5.000000000000001e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3431  rrf2 family protein  95.62 
 
 
137 aa  278  2e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3180  transcriptional regulator  94.89 
 
 
137 aa  278  3e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0130627  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2816  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  47.01 
 
 
136 aa  136  8.999999999999999e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3208  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  35.34 
 
 
143 aa  82  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1791  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  33.09 
 
 
143 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000874227  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2648  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  35 
 
 
150 aa  80.9  0.000000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.68692 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4336  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  34.59 
 
 
143 aa  81.3  0.000000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4634  rrf2 family protein  34.59 
 
 
143 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0619  rrf2 family protein  34.59 
 
 
143 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4616  rrf2 family protein  34.59 
 
 
143 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4403  rrf2 family protein  34.59 
 
 
143 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4243  Rrf2 family protein; transcriptional regulator  34.59 
 
 
143 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.112784  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4255  Rrf2 family protein; transcriptional regulator  34.59 
 
 
143 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4636  rrf2 family protein  34.59 
 
 
143 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4743  rrf2 family protein  34.59 
 
 
143 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4620  rrf2 family protein  34.59 
 
 
143 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2001  rrf2 family protein  33.58 
 
 
143 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.301895  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1779  rrf2 family protein  31.65 
 
 
143 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000236415  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1758  RRF2 family protein  31.65 
 
 
143 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1736  RRF2 family protein  31.65 
 
 
143 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.582231  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1917  rrf2 family protein  31.65 
 
 
143 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0431103  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1953  rrf2 family protein  31.65 
 
 
143 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000194706 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2124  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  34.35 
 
 
148 aa  79.3  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1921  rrf2 family protein  31.65 
 
 
143 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.581876  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2022  rrf2 family protein  31.65 
 
 
143 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000169778  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3422  rrf2 family protein  31.65 
 
 
143 aa  77  0.00000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000049923 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2591  transcriptional regulator  32.03 
 
 
156 aa  76.6  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00374583 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3614  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  31.62 
 
 
137 aa  75.1  0.0000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0184881  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3037  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  33.85 
 
 
140 aa  74.3  0.0000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0850205  normal  0.0637493 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0624  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  31.85 
 
 
154 aa  73.2  0.000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0198257  normal  0.570271 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2256  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  30.47 
 
 
136 aa  68.6  0.00000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.214948  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1753  putative transcriptional regulator  30.22 
 
 
140 aa  67  0.00000000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1056  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  28.47 
 
 
150 aa  65.1  0.0000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0680  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  34.09 
 
 
140 aa  65.1  0.0000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00302729  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0939  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  31.34 
 
 
148 aa  63.9  0.0000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1225  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  27.21 
 
 
148 aa  62.4  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0259707  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1586  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  28.15 
 
 
151 aa  61.6  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0540164 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5019  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  29.46 
 
 
135 aa  60.8  0.000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0401266  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1079  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  30.77 
 
 
136 aa  60.1  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.7621  normal  0.359746 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1756  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  32.14 
 
 
164 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1447  RRF2 family protein  28.68 
 
 
138 aa  58.9  0.00000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0587227  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1321  Rrf2 family protein  38.18 
 
 
149 aa  58.5  0.00000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0676  hypothetical protein  30.77 
 
 
139 aa  58.2  0.00000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4008  protein of unknown function UPF0074  27.14 
 
 
187 aa  58.2  0.00000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2417  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  27.07 
 
 
141 aa  57.4  0.00000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.229432 
 
 
-
 
NC_003296  RS00405  hypothetical protein  30.71 
 
 
143 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00113675  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0848  transcriptional regulator superfamily  31.25 
 
 
137 aa  56.2  0.0000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.264832  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2093  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  28.03 
 
 
144 aa  56.6  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0872269  normal  0.332036 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00085  YhdE (NsrR)  27.48 
 
 
150 aa  56.2  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2098  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  31.43 
 
 
151 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.607265  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0631  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family protein  28.12 
 
 
147 aa  56.6  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1726  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  28.68 
 
 
135 aa  55.5  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.992938 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1900  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  30.11 
 
 
171 aa  56.2  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5306  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  34.57 
 
 
146 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2165  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  35.53 
 
 
152 aa  54.3  0.0000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00710337  normal  0.480622 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2649  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  30.37 
 
 
151 aa  54.3  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000442413  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3572  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  29.91 
 
 
159 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0421402  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3335  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  27.21 
 
 
147 aa  53.5  0.0000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.659852  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1445  iron-responsive transcriptional regulator  27.69 
 
 
153 aa  53.5  0.0000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1606  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  30.71 
 
 
151 aa  52.8  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0243  hypothetical protein  21.58 
 
 
140 aa  53.1  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1178  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  30 
 
 
151 aa  52.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000716661  normal  0.224139 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3286  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  27.94 
 
 
159 aa  53.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3948  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  30.91 
 
 
137 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.915994  normal  0.554541 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2547  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  29.06 
 
 
163 aa  52.8  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.922047  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09960  hypothetical protein  26.87 
 
 
142 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0801  hypothetical protein  26.47 
 
 
144 aa  52.8  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18410  predicted transcriptional regulator  25 
 
 
152 aa  52.4  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.199021  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1311  hypothetical protein  30.77 
 
 
153 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5127  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  26.72 
 
 
141 aa  52.4  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1861  putative Fe-S cluster regulator protein  24 
 
 
147 aa  52.4  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  5.34065e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0567  transcriptional regulator  30.77 
 
 
153 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1261  transcriptional regulator  30.77 
 
 
153 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.62551  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1000  transcriptional regulator  30.77 
 
 
153 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.360873  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1334  DNA-binding protein  30.77 
 
 
153 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.172988  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0725  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  30 
 
 
151 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.241075  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1205  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  30 
 
 
151 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1513  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  26.62 
 
 
146 aa  52.8  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.334315 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7110  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  27.78 
 
 
151 aa  52  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0147621  normal  0.1046 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0293  transcriptional regulator  30.77 
 
 
172 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0135694  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2516  putative DNA-binding protein  30.1 
 
 
571 aa  52  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1088  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  30.22 
 
 
151 aa  52  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.683076  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3487  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  33.33 
 
 
146 aa  51.6  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.740376  hitchhiker  0.00818158 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0924  hypothetical protein  26.87 
 
 
142 aa  52  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.945125  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1375  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  29.45 
 
 
165 aa  52  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26060  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  30.3 
 
 
146 aa  51.6  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.523636  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3119  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  25.19 
 
 
165 aa  51.6  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1478  transcriptional regulator family protein  29.21 
 
 
172 aa  51.2  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.113614  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3608  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  27.21 
 
 
159 aa  51.6  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1906  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  26.92 
 
 
137 aa  51.2  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000482606  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0098  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  25.58 
 
 
153 aa  51.2  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.35302  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2051  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  30.95 
 
 
138 aa  50.8  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.482177 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1268  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  34.04 
 
 
137 aa  51.2  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000462831  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>