146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_5019 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_5019  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  100 
 
 		 135 aa  275  2e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0401266  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1079  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  48.15 
 
 		 136 aa  137  6e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.7621  normal  0.359746 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1726  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  47.76 
 
 		 135 aa  136  7.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.992938 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2124  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 148 aa  87  8e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3037  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  37.14 
 
 		 140 aa  87  9e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0850205  normal  0.0637493 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1225  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 148 aa  83.6  8e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0259707  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00405  hypothetical protein  34.71 
 
 		 143 aa  83.6  9e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00113675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3208  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 143 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4634  rrf2 family protein  34.59 
 
 		 143 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4616  rrf2 family protein  34.59 
 
 		 143 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4403  rrf2 family protein  34.59 
 
 		 143 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4243  Rrf2 family protein; transcriptional regulator  34.59 
 
 		 143 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.112784  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4255  Rrf2 family protein; transcriptional regulator  34.59 
 
 		 143 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4620  rrf2 family protein  34.59 
 
 		 143 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4636  rrf2 family protein  34.59 
 
 		 143 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4743  rrf2 family protein  34.59 
 
 		 143 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0619  rrf2 family protein  34.59 
 
 		 143 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4336  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 143 aa  78.2  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2093  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 144 aa  77.8  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0872269  normal  0.332036 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2073  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 144 aa  76.6  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.163094  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1791  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 143 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000874227  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1779  rrf2 family protein  32.56 
 
 		 143 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000236415  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1758  RRF2 family protein  32.56 
 
 		 143 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1736  RRF2 family protein  32.56 
 
 		 143 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.582231  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1917  rrf2 family protein  32.56 
 
 		 143 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0431103  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1921  rrf2 family protein  37.14 
 
 		 143 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.581876  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2022  rrf2 family protein  37.14 
 
 		 143 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000169778  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1953  rrf2 family protein  32.56 
 
 		 143 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000194706 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3422  rrf2 family protein  37.14 
 
 		 143 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000049923 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2001  rrf2 family protein  31.78 
 
 		 143 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.301895  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1756  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 164 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26060  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  29.32 
 
 		 146 aa  72.8  0.000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.523636  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1784  Rrf2 family protein  33.85 
 
 		 153 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.121065  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1505  Rrf2 family protein  33.85 
 
 		 153 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.080544  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3614  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  32.33 
 
 		 137 aa  72.8  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0184881  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1174  Rrf2 family protein  33.85 
 
 		 153 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.246229  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1372  putative transcriptional regulator  33.85 
 
 		 153 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.102116  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1376  putative transcriptional regulator  33.85 
 
 		 153 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.135782  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0457  Rrf2 family protein  33.85 
 
 		 153 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0848  transcriptional regulator superfamily  33.59 
 
 		 137 aa  72  0.000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.264832  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2862  Rrf2 family protein  33.08 
 
 		 154 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.246618  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1606  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  33.59 
 
 		 151 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1088  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 151 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1321  Rrf2 family protein  32.33 
 
 		 149 aa  69.7  0.00000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2816  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  27.61 
 
 		 136 aa  68.9  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1586  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 151 aa  69.3  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0540164 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18410  predicted transcriptional regulator  32.81 
 
 		 152 aa  69.3  0.00000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.199021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2098  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 151 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.607265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1088  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 151 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.683076  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4313  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 151 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0000750143  normal  0.208214 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0725  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 151 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.241075  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1205  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 151 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1178  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 151 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000716661  normal  0.224139 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2863  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 151 aa  67  0.00000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.858803 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2648  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  27.69 
 
 		 150 aa  67  0.00000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.68692 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4530  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  28.24 
 
 		 154 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.193986  normal  0.482079 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0680  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  30.6 
 
 		 140 aa  64.7  0.0000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00302729  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4418  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  28.24 
 
 		 154 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3421  rrf2 family protein  31.01 
 
 		 137 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.194081  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1753  putative transcriptional regulator  26.67 
 
 		 140 aa  63.9  0.0000000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4048  hypothetical protein  27.48 
 
 		 154 aa  63.5  0.0000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.267038  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3200  rrf2 family protein  30.23 
 
 		 137 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0491107  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3108  transcriptional regulator  30.23 
 
 		 137 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3453  rrf2 family protein  30.23 
 
 		 137 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.756851  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3431  rrf2 family protein  30.23 
 
 		 137 aa  62.8  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3419  rrf2 family protein  30.23 
 
 		 137 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3180  transcriptional regulator  30.23 
 
 		 137 aa  62.8  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0130627  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2649  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  28.26 
 
 		 151 aa  62  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000442413  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3567  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 152 aa  62.4  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00720162 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3584  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 154 aa  62.8  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.855129  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2417  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 141 aa  62  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.229432 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1837  rrf2 family protein  29.46 
 
 		 137 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.886033  normal  0.370465 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0939  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  26.12 
 
 		 148 aa  61.2  0.000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3409  rrf2 family protein  29.46 
 
 		 137 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000108147  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0695  Rrf2 family protein  32.52 
 
 		 141 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000561607  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0676  hypothetical protein  28.89 
 
 		 139 aa  60.1  0.00000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0801  hypothetical protein  29.1 
 
 		 144 aa  59.7  0.00000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2628  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 153 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.106068 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1447  RRF2 family protein  28.79 
 
 		 138 aa  59.7  0.00000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0587227  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0624  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  26.87 
 
 		 154 aa  59.7  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0198257  normal  0.570271 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4329  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 147 aa  59.3  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0970  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  25.98 
 
 		 154 aa  59.3  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.794962 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1052  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  25.19 
 
 		 155 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.816275  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4008  protein of unknown function UPF0074  26.12 
 
 		 187 aa  58.5  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5965  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  27.07 
 
 		 151 aa  58.2  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0284344 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6236  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  26.77 
 
 		 165 aa  57.8  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3265  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  22.9 
 
 		 173 aa  57.4  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1422  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 156 aa  57  0.00000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.968203 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1478  transcriptional regulator family protein  23.66 
 
 		 172 aa  57  0.00000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.113614  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2051  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 138 aa  56.6  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.482177 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0368  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 152 aa  56.6  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.172949 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7110  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  26.32 
 
 		 151 aa  56.6  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0147621  normal  0.1046 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1311  hypothetical protein  23.66 
 
 		 153 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0293  transcriptional regulator  23.66 
 
 		 172 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0135694  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0567  transcriptional regulator  23.66 
 
 		 153 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1334  DNA-binding protein  23.66 
 
 		 153 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.172988  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1000  transcriptional regulator  23.66 
 
 		 153 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.360873  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5306  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 146 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1746  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 139 aa  55.1  0.0000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.488716  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1261  transcriptional regulator  23.66 
 
 		 153 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.62551  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>