More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1586 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1586  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  100 
 
 		 151 aa  296  6e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0540164 
 
 
-
 
NC_003296  RS00405  hypothetical protein  50.36 
 
 		 143 aa  118  3e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00113675  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1606  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  51.47 
 
 		 151 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2863  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  50 
 
 		 151 aa  110  6e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.858803 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2073  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 144 aa  110  8.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.163094  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3037  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  46.62 
 
 		 140 aa  109  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0850205  normal  0.0637493 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1756  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 164 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2862  Rrf2 family protein  49.26 
 
 		 154 aa  108  3e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.246618  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1088  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  50 
 
 		 151 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.683076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1088  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  50 
 
 		 151 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4313  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  50 
 
 		 151 aa  106  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0000750143  normal  0.208214 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1953  rrf2 family protein  40.3 
 
 		 143 aa  105  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000194706 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2022  rrf2 family protein  40.3 
 
 		 143 aa  105  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000169778  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1921  rrf2 family protein  40.3 
 
 		 143 aa  105  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.581876  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1779  rrf2 family protein  40.3 
 
 		 143 aa  105  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000236415  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1758  RRF2 family protein  40.3 
 
 		 143 aa  105  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1736  RRF2 family protein  40.3 
 
 		 143 aa  105  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.582231  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1784  Rrf2 family protein  48.53 
 
 		 153 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.121065  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1505  Rrf2 family protein  48.53 
 
 		 153 aa  105  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.080544  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1917  rrf2 family protein  40.3 
 
 		 143 aa  105  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0431103  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1376  putative transcriptional regulator  48.53 
 
 		 153 aa  105  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.135782  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0457  Rrf2 family protein  48.53 
 
 		 153 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1372  putative transcriptional regulator  48.53 
 
 		 153 aa  105  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.102116  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1174  Rrf2 family protein  48.53 
 
 		 153 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.246229  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2098  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  48.53 
 
 		 151 aa  104  3e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.607265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1178  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  48.53 
 
 		 151 aa  104  4e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000716661  normal  0.224139 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0725  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  48.53 
 
 		 151 aa  104  4e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.241075  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1205  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  48.53 
 
 		 151 aa  104  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0680  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  36.96 
 
 		 140 aa  104  5e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00302729  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2001  rrf2 family protein  39.55 
 
 		 143 aa  103  6e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.301895  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2093  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 144 aa  103  7e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0872269  normal  0.332036 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4634  rrf2 family protein  44.62 
 
 		 143 aa  102  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4403  rrf2 family protein  44.62 
 
 		 143 aa  102  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0619  rrf2 family protein  44.62 
 
 		 143 aa  102  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4243  Rrf2 family protein; transcriptional regulator  44.62 
 
 		 143 aa  102  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.112784  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4255  Rrf2 family protein; transcriptional regulator  44.62 
 
 		 143 aa  102  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4620  rrf2 family protein  44.62 
 
 		 143 aa  102  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4743  rrf2 family protein  44.62 
 
 		 143 aa  102  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4616  rrf2 family protein  44.62 
 
 		 143 aa  102  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4636  rrf2 family protein  44.62 
 
 		 143 aa  102  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3422  rrf2 family protein  39.55 
 
 		 143 aa  101  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000049923 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1791  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  39.55 
 
 		 143 aa  101  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000874227  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3208  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  41.55 
 
 		 143 aa  100  8e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4336  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 143 aa  99.8  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1321  Rrf2 family protein  43.51 
 
 		 149 aa  99.8  1e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2124  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  40.69 
 
 		 148 aa  99  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2417  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  39.23 
 
 		 141 aa  98.6  3e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.229432 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3614  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  42.54 
 
 		 137 aa  98.6  3e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0184881  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1447  RRF2 family protein  39.57 
 
 		 138 aa  95.5  2e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0587227  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2648  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  43.18 
 
 		 150 aa  94  6e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.68692 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0695  Rrf2 family protein  48.39 
 
 		 141 aa  92  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000561607  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2816  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  33.8 
 
 		 136 aa  92.4  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0939  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  39.71 
 
 		 148 aa  91.3  4e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0801  hypothetical protein  37.41 
 
 		 144 aa  90.9  5e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1746  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 139 aa  90.5  6e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.488716  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2649  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  40.74 
 
 		 151 aa  89.4  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000442413  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1056  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  38.35 
 
 		 150 aa  89.4  2e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0848  transcriptional regulator superfamily  37.4 
 
 		 137 aa  87  7e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.264832  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0676  hypothetical protein  37.14 
 
 		 139 aa  85.1  3e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6236  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  37.58 
 
 		 165 aa  85.1  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1726  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  36.22 
 
 		 135 aa  83.6  9e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.992938 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1079  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  35.61 
 
 		 136 aa  83.2  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.7621  normal  0.359746 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5127  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  39.23 
 
 		 141 aa  81.6  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2406  hypothetical protein  41.91 
 
 		 148 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.888596  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2628  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  37.12 
 
 		 153 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.106068 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1225  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 148 aa  77.8  0.00000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0259707  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2464  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  32.12 
 
 		 146 aa  77.4  0.00000000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000267209  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4008  protein of unknown function UPF0074  35.77 
 
 		 187 aa  77  0.00000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2165  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 152 aa  76.3  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00710337  normal  0.480622 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2591  transcriptional regulator  33.81 
 
 		 156 aa  76.3  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00374583 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1000  transcriptional regulator  34.85 
 
 		 153 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.360873  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1311  hypothetical protein  34.85 
 
 		 153 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0293  transcriptional regulator  34.85 
 
 		 172 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0135694  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0567  transcriptional regulator  34.85 
 
 		 153 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1334  DNA-binding protein  34.85 
 
 		 153 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.172988  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1261  transcriptional regulator  34.85 
 
 		 153 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.62551  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2516  putative DNA-binding protein  34.85 
 
 		 571 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1478  transcriptional regulator family protein  33.33 
 
 		 172 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.113614  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1052  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 155 aa  74.3  0.0000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.816275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2256  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 136 aa  74.3  0.0000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.214948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26060  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  38.97 
 
 		 146 aa  72  0.000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.523636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4541  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 161 aa  72  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.417251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3572  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 159 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0421402  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7110  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  33.33 
 
 		 151 aa  70.9  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0147621  normal  0.1046 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5965  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  33.33 
 
 		 151 aa  70.9  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0284344 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4418  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  34.42 
 
 		 154 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5306  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  40.31 
 
 		 146 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3487  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  40.31 
 
 		 146 aa  70.9  0.000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.740376  hitchhiker  0.00818158 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4048  hypothetical protein  34.42 
 
 		 154 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.267038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0368  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 152 aa  68.9  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.172949 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4530  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  34.51 
 
 		 154 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.193986  normal  0.482079 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5019  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 135 aa  69.3  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0401266  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2051  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 138 aa  69.3  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.482177 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4329  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 147 aa  68.6  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0694  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 146 aa  68.6  0.00000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0238705  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3948  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  38.97 
 
 		 137 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.915994  normal  0.554541 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3265  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 173 aa  67.4  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18410  predicted transcriptional regulator  35.34 
 
 		 152 aa  67  0.00000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.199021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3895  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  36.96 
 
 		 151 aa  66.2  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.146711  normal  0.812213 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3567  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 152 aa  65.9  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00720162 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>